Перейти к навигации Перейти к поиску
 | В этой статье отсутствует информация о том, что такое «стехиометрия белка» и чем она отличается от «химической стехиометрии». В цитатах отсутствует конкретная страница / строка, поэтому их невозможно проверить. ( Март 2021 г. ) |
Стехиометрия белка аналогична химической стехиометрии , откуда она и получила свое название. [1] [2] [3] В химической стехиометрии количество атомов и их зарядовые единицы сбалансированы по обе стороны уравнения химической скорости . В белковой стехиометрии белки сбалансированы [4] в соответствии с правилами Чаргаффа .
В 1950 году Чаргафф опубликовал, что количества аденина и тимина в ДНК примерно или примерно такие же, как и количества цитозина и гуанина . [5] Позже это стало известно как первое из правил Чаргаффа. Из-за этого правила для определения стехиометрии используются относительные единицы массы. Единицы массы можно подсчитать под микроскопом или проанализировать с помощью спектрометра, последний метод был впервые разработан Коэном с использованием декодирования изотопов .
Формулировка правил Чаргаффа выглядит следующим образом: [6]
- сумма пуринов (аденина и гуанина) равна сумме пиримидинов (цитозина и тимина);
- молярное отношение аденина на тимин равно 1;
- молярное отношение гуанина к цитозину равно 1.
И, как прямое следствие трех последних отношений,
- количество 6-аминогрупп (аденин и цитозин) такое же, как и у 6-кетогрупп (гуанин и тимин).
Как [ редактировать ]
Было разработано несколько методов стехиометрии белков, среди которых:
- Абсолютная количественная оценка (AQUA) [7]
- Мониторинг множественных реакций (MRM) [7]
- Флуоресцентная микроскопия [8]
- Шаг-накрест фотообесцвечивание из красителя меченных субъединиц (фотообесцвечивание) [9]
- Гидрофобный photolabeling (HyPLa) [10]
- масс-спектрометрия на основе пептидов [11]
- масс-спектрометрия на основе протеомики [12]
- слияние клеток и визуализация отдельных молекул [13]
- изотопно- кодированная масс-спектрометрия [14]
Ссылки [ править ]
- ^ Leake, Mark C .; Чендлер, Дженнифер Х .; Wadhams, Джордж Х .; Бай, Фань; Берри, Ричард М .; Армитаж, Джудит П. (2006). «Стехиометрия и оборот в единичных, функционирующих мембранных белковых комплексах». Природа . 443 (7109): 355–358. Bibcode : 2006Natur.443..355L . DOI : 10,1038 / природа05135 . PMID 16971952 . S2CID 4423771 .
- ^ Гэн, Jiefei; Баба, Мисузу; Наир, Уша; Клионский, Дэниел Дж. (2008). «Количественный анализ стехиометрии белков, связанных с аутофагией, с помощью флуоресцентной микроскопии» . Журнал клеточной биологии . 182 (1): 129–140. DOI : 10,1083 / jcb.200711112 . PMC 2447896 . PMID 18625846 .
- ^ Де, Мринмой; Рана, Субиной; Ротелло, Винсент М. (2009). «Никель-опосредованный ионами контроль стехиометрии His-меченных взаимодействий белок / наночастиц». Макромолекулярная бионаука . 9 (2): 174–178. DOI : 10.1002 / mabi.200800289 . PMID 19127602 .
- ^ "Анализ структуры белка с помощью масс-спектрометрии" . ThermoFisher Scientific . Дата обращения 9 марта 2020 .
- ^ Чаргафф, Эрвин; Стивен Заменгоф; Шарлотта Грин (май 1950 г.). «Состав человеческой дезоксипентозной нуклеиновой кислоты». Природа . 165 (4202): 756–7. Bibcode : 1950Natur.165..756C . DOI : 10.1038 / 165756b0 . PMID 15416834 . S2CID 33722052 .
- ↑ Вайнтрауб, Боб (сентябрь 2006 г.). "Эрвин Чаргафф и правила Чаргаффа" . Химия в Израиле - Бюллетень Израильского химического общества (22): 29–31.
- ^ а б Шмидт, Карла; Ленц, Кристоф; Гроте, Майкл; Люхрманн, Рейнхард; Урлауб, Хеннинг (2010). «Определение стехиометрии белков в составе белковых комплексов с использованием абсолютного количественного анализа и мониторинга множественных реакций». Аналитическая химия . 82 (7): 2784–2796. DOI : 10.1021 / ac902710k . PMID 20225856 .
- ^ Гэн, Jiefei; Клионский, Дэниел Дж. (2010). «Определение стехиометрии белка Atg в месте сборки фагофора с помощью флуоресцентной микроскопии» . Аутофагия . 6 (1): 144–147. DOI : 10,4161 / auto.6.1.10249 . PMC 2841983 . PMID 20131413 .
- ^ Das, Somes K .; Дарши, Манджула; Чели, Стивен; Уоллес, Марк I .; Бейли, Хэган (2007). «Стехиометрия мембранного протеина, определяемая поэтапным фотообесцвечиванием субъединиц, меченных красителем». ChemBioChem . 8 (9): 994–999. DOI : 10.1002 / cbic.200600474 . PMID 17503420 . S2CID 28971131 .
- ↑ Хиральдо, Ана Мария Вильямил; Кастелло, Пабло Рауль; Флеха, Ф. Луис Гонсалес; Moeller, Jesper V .; Дельфино, Хосе Мария; Росси, Хуан Пабло FC (2006). «Стехиометрия липид-белкового взаимодействия, оцениваемая с помощью гидрофобной фотомаркировки». Письма FEBS . 580 (2): 607–612. DOI : 10.1016 / j.febslet.2005.12.078 . PMID 16412439 . S2CID 43796110 .
- ^ Вольгемут, Инго; Ленц, Кристоф; Урлауб, Хеннинг (2015). «Изучение стехиометрии макромолекулярных комплексов с помощью масс-спектрометрии на основе пептидов» . Протеомика . 15 (5–6): 862–879. DOI : 10.1002 / pmic.201400466 . PMC 5024058 . PMID 25546807 .
- ^ Смитс, Арне Х .; Янсен, Паскаль ЦМТ; Позер, Инна; Хайман, Энтони А .; Вермёлен, Мишель (2013). «Стехиометрия хроматин-ассоциированных белковых комплексов, выявленная с помощью безметки количественной протеомики на основе масс-спектрометрии» . Исследования нуклеиновых кислот . 41 (1): e28. DOI : 10.1093 / NAR / gks941 . PMC 3592467 . PMID 23066101 .
- ^ Сингх, Автар; Ван Слайк, Александр Л .; Сиренко, Мария; Песня, Александр; Каммермайер, Пол Дж .; Зипфель, Уоррен Р. (2020). «Стехиометрический анализ белковых комплексов путем слияния клеток и визуализации отдельных молекул» . Научные отчеты . 10 (1): 14866. DOI : 10.1038 / s41598-020-71630-6 . PMC 7483473 . PMID 32913201 .
- ^ Hochleitner, Элизабет O .; Кастнер, Бертольд; Фрёлих, Томас; Шмидт, Александр; Люрманн, Рейнхард; Арнольд, Георг; Lottspeich, Фридрих (2005). "Белковая стехиометрия мультипротеинового комплекса, человеческий сплайсосомный малый ядерный рибонуклеопротеин U1" . Журнал биологической химии . 280 (4): 2536–2542. DOI : 10.1074 / jbc.M409587200 . PMID 15525645 . S2CID 20396018 .