Из Википедии, свободной энциклопедии
  (Перенаправлено с RPS20 )
Перейти к навигации Перейти к поиску
RPS20
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

4UG0 , 4V6X , 5A2Q , 5AJ0 , 5FLX , 4D61 , 4KZY , 4KZX , 4UJC , 4D5L , 4UJE , 4V5Z , 4KZZ , 4UJD

Идентификаторы
ПсевдонимыRPS20 , S20, рибосомный белок S20, us10
Внешние идентификаторыOMIM : 603682 MGI : 1914677 HomoloGene : 37417 GeneCards : RPS20
Расположение гена ( человек )
Хромосома 8 (человек)
Chr.Хромосома 8 (человек) [1]
Хромосома 8 (человек)
Геномное расположение RPS20
Геномное расположение RPS20
Группа8q12.1Начинать56 067 254 п.н. [1]
Конец56 074 510 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 4 (мышь)
Chr.Хромосома 4 (мышь) [2]
Хромосома 4 (мышь)
Геномное расположение RPS20
Геномное расположение RPS20
Группа4 | 4 A1Начинать3 831 334 п.н. [2]
Конец3 835 665 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК


Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• структурная составляющая рибосомы
• связывание с белком GO: 0001948
• связывание с РНК
Сотовый компонент• цитозоль
• рибосома
• мембрана
• внутриклеточная
• малая цитозольная субъединица рибосомы
• малая субъединица рибосомы
• внеклеточная экзосома
• нуклеоплазма
• внеклеточный матрикс
• цитоплазма
• синапс
Биологический процесс• вирусная транскрипция
• SRP-зависимое нацеливание котрансляционного белка на мембрану
• инициация трансляции
• ядерно-транскрибируемый катаболический процесс мРНК, нонсенс-опосредованный распад
• биосинтез белка
• процессинг рРНК
• цитоплазматическая трансляция
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

6224

67427

Ансамбль

ENSG00000008988

ENSMUSG00000028234

UniProt

P60866

P60867

RefSeq (мРНК)

NM_001146227
NM_001023

NM_026147

RefSeq (белок)

NP_001014
NP_001139699

NP_080423

Расположение (UCSC)Chr 8: 56.07 - 56.07 МбChr 4: 3.83 - 3.84 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

40S рибосомных белков S20 представляет собой белок , который в организме человека кодируется RPS20 гена . [5] [6] [7]

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой 40S-субъединицы и большой 60S-субъединицы . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомный белок, который является компонентом субъединицы 40S. Белок принадлежит к семейству рибосомных белков S10P. Он находится в цитоплазме . Этот ген транскрибируется с геном небольшой ядрышковой РНК U54, который расположен во втором его интроне. Как типично для генов, кодирующих рибосомные белки, существует множество процессированных псевдогенов.этого гена рассредоточены по геному. [7]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000008988 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028234 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Kenmochi N, Кавагути T, Розен S, Davis E Гудман N, Hudson TJ, Tanaka T, Page DC (август 1998). «Карта 75 генов рибосомных белков человека» . Genome Res . 8 (5): 509–23. DOI : 10.1101 / gr.8.5.509 . PMID 9582194 . 
  6. ^ Chu W, Presky DH, Swerlick РА, Ожоги DK (май 1993). «Последовательность кДНК человеческого рибосомного белка S20» . Nucleic Acids Res . 21 (7): 1672 DOI : 10,1093 / NAR / 21.7.1672 . PMC 309385 . PMID 8479924 .  
  7. ^ a b «Ген Entrez: рибосомный белок S20 RPS20» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Шерсть И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомных белков млекопитающих». Биохим. Cell Biol . 73 (11–12): 933–47. DOI : 10.1139 / o95-101 . PMID  8722009 .
  • Като С., Секин С., О С.В. и др. (1995). «Конструирование банка полноразмерных кДНК человека». Джин . 150 (2): 243–50. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90433-2 . PMID  7821789 .
  • Kiss-László Z, Henry Y, Bachellerie JP, et al. (1996). "Сайт-специфическое метилирование рибозы прерибосомальной РНК: новая функция малых ядрышковых РНК". Cell . 85 (7): 1077–88. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81308-2 . PMID  8674114 . S2CID  10418885 .
  • Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г. и др. (1996). «Характеристика белков малых рибосомных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования, а также масс-спектрометрии» . Евро. J. Biochem . 239 (1): 144–9. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1996.0144u.x . PMID  8706699 .
  • Йошихама М., Уэчи Т., Асакава С. и др. (2002). «Гены рибосомных белков человека: секвенирование и сравнительный анализ 73 генов» . Genome Res . 12 (3): 379–90. DOI : 10.1101 / gr.214202 . PMC  155282 . PMID  11875025 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Ленер Б., Сандерсон С.М. (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека» . Genome Res . 14 (7): 1315–23. DOI : 10.1101 / gr.2122004 . PMC  442147 . PMID  15231747 .
  • Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта кДНК полной длины NIH: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
  • Ю Й, Джи Х, Дудна Дж. А., Лири Дж. А. (2005). «Масс-спектрометрический анализ субъединицы рибосомы 40S человека: нативные и связанные с IRES комплексы HCV» . Protein Sci . 14 (6): 1438–46. DOI : 10.1110 / ps.041293005 . PMC  2253395 . PMID  15883184 .
  • Де Бортоли М., Кастеллино Р.С., Лу XY и др. (2006). «Исход медуллобластомы отрицательно связан со сверхэкспрессией EEF1D, RPL30 и RPS20 на длинном плече хромосомы 8» . BMC Рак . 6 : 223. DOI : 10.1186 / 1471-2407-6-223 . PMC  1578584 . PMID  16968546 .
  • Ту LC, Ян X, Худ Л., Линь Б. (2007). «Протеомический анализ взаимодействия гена 1, регулируемого нижестоящим N-myc, и его взаимодействия с программой андрогенного ответа в клетках рака простаты» . Мол. Клетка. Протеомика . 6 (4): 575–88. DOI : 10.1074 / mcp.M600249-MCP200 . PMID  17220478 .
  • Фрам Р., Басби С.А., Рамамурти М. и др. (2007). «HDM2-связывающие партнеры: взаимодействие с фактором элонгации трансляции EF1alpha» . J. Proteome Res . 6 (4): 1410–7. DOI : 10.1021 / pr060584p . PMC  4626875 . PMID  17373842 .



  • v
  • т
  • е