Репликационный белок A1

RPA1

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1EWI , 1FGU , 1JMC , 1L1O , 2B29 , 2B3G , 4IJH , 4IJL , 4IPC , 4IPD , 4IPG , 4IPH , 4LUO , 4LUV , 4LUZ , 4LW1 , 4LWC , 4NB3 , 4O0A , 4R4C , 4R4I , 4R4O , 4R4Q , 4R4T , 5E7N , 5EAY

Идентификаторы

Псевдонимы

RPA1 , HSSB, MST075, REPA1, RF-A, RP-A, RPA70, белок репликации A1

Внешние идентификаторы

OMIM : 179835 MGI : 1915525 HomoloGene : 2208 GeneCards : RPA1

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 17 (человека) ^[1]

Группа	17p13.3	Начинать	1 829 702 п.н. ^[1]
Группа	17p13.3	Конец	1 900 082 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 11 (мышь) ^[2]

Группа	11 B5 \| 11 45,79 см	Начинать	75 298 166 п.н. ^[2]
Группа	11 B5 \| 11 45,79 см	Конец	75 348 324 п.н. ^[2]

Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание ДНК • ион металла связывание • одноцепочечной ДНК связывание • поврежденной ДНК - связывающая • GO: связывание белка 0001948 • нуклеиновой кислоты связывания • G-богатая цепь ДНК - связывающего теломерной • одноцепочечной ДНК теломера связывания • последовательность ДНК-специфическое связывание
Сотовый компонент	• Тело PML • нуклеоплазма • комплекс фактора репликации ДНК A • ядерная хромосома, теломерная область • ядро клетки • место повреждения ДНК
Биологический процесс	• репликации ДНК ДНК-зависимой • нуклеотид-эксцизионной репарации, заполнение зазора ДНК • рекомбинации ДНК • interstrand ремонт поперечных связей • безошибочное синтез translesion • G1 фазы • подвержены ошибкам синтеза translesion • клеточный ответ на повреждения ДНК стимул • репликации ДНК • регулирование клеточного ответа на тепло • ремонт рассогласования • translesion синтез • транскрипция в сочетании нуклеотида-эксцизионная репарация • ремонт нуклеотида-иссечение, рассечение ДНК • ответ повреждения ДНК, обнаружение повреждений ДНК • эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК, 3'-повреждение • эксцизионное восстановление нуклеотидов, разрез ДНК, 5'-повреждение • эксцизионная репарация нуклеотидов, стабилизация комплекса до разреза • эксцизионная репарация нуклеотидов • восстановление ДНК • эксцизионная репарация оснований • регулирование передачи сигнала с помощью класса p53 медиатора • двухцепочечного ремонта разрыва посредством гомологичной рекомбинации • репарации нуклеотидов-иссечения, preincision сложной сборки • локализации белка на хромосому • теломер обслуживание • теломер обслуживание через пол-консервативную репликацию • G1 / S переход митотического клеточного цикла • Раскручивание ДНК участвует в репликации ДНК • Поддержание теломер с помощью теломеразы • GO: 0007126 мейотический клеточный цикл
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


6117


68275

Ансамбль


ENSG00000132383


ENSMUSG00000000751

UniProt


P27694


Q8VEE4

RefSeq (мРНК)


NM_002945 NM_001355120 NM_001355121


NM_001164223 NM_026653

RefSeq (белок)


NP_002936 NP_001342049 NP_001342050


NP_001157695 NP_080929

Расположение (UCSC)

Chr 17: 1.83 - 1.9 Мб

Chr 11: 75,3 - 75,35 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Белок репликации A 70 кД ДНК-связывающий субъединица является белком , который в организме человека кодируется RPA1 геном . ^[5]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что белок репликации A1 взаимодействует с:

BRCA2 , ^[6]
BLM , ^[7]^[8]^[9]
MCM2 , ^[10]
MCM4 , ^[10]
MCM6 , ^[10]
MCM7 , ^[10]
МУТЫХ , ^[11]
ORC2L , ^[10]
ORC6L , ^[10]
P53 , ^[12]^[13]
RPA2 , ^[14]^[15]
RPA3 , ^[15]^[16]
ТИПИН , ^[17]
TP53BP1 , ^[18] и
XPA . ^[19]

См. Также [ править ]

Репликационный белок А
Репликационный белок А2
Репликационный белок A3
Одноцепочечный связывающий белок

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000132383 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000751 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Umbricht CB, Erdile LF, Jabs EW, Келли TJ (апрель 1993). «Клонирование, сверхэкспрессия и геномное картирование 14-кДа субъединицы человеческого белка репликации А». J Biol Chem . 268 (9): 6131–8. PMID 8454588 .
^ Wong JM, Ионеску D, Ingles CJ (январь 2003). «Взаимодействие между BRCA2 и репликационным белком А нарушено предрасполагающей к раку мутацией в BRCA2» . Онкоген . 22 (1): 28–33. DOI : 10.1038 / sj.onc.1206071 . PMID 12527904 .
^ Брош RM, Li JL, Кенни М.К., Karow JK, Купер MP, Kureekattil RP, Хиксон ID, Бор В. А. (август 2000). «Репликационный белок А физически взаимодействует с белком синдрома Блума и стимулирует его геликазную активность» . J. Biol. Chem . 275 (31): 23500–8. DOI : 10.1074 / jbc.M001557200 . PMID 10825162 .
^ Opresko PL, фон Коббе C, Laine JP, Harrigan J, Hickson ID, Bohr VA (октябрь 2002 г.). «Теломер-связывающий белок TRF2 связывает и стимулирует геликазы синдрома Вернера и Блума» . J. Biol. Chem . 277 (43): 41110–9. DOI : 10.1074 / jbc.M205396200 . PMID 12181313 .
^ Moens PB, Колас NK, Tarsounas M, Маркон E, Cohen PE, Spyropoulos B (апрель 2002). «Временной ход и хромосомная локализация белков, связанных с рекомбинацией, в мейозе у мышей совместимы с моделями, которые могут разрешить ранние взаимодействия ДНК-ДНК без реципрокной рекомбинации». J. Cell Sci . 115 (Pt 8): 1611–22. PMID 11950880 .
^ Б с д е е Kneissl М, клюшки V, Szalay А.А., Grummt F (март 2003 г.). «Взаимодействие и сборка мышиных пререпликативных сложных белков в клетках дрожжей и мышей». J. Mol. Биол . 327 (1): 111–28. DOI : 10.1016 / s0022-2836 (03) 00079-2 . PMID 12614612 .
Перейти ↑ Parker A, Gu Y, Mahoney W, Lee SH, Singh KK, Lu AL (февраль 2001 г.). «Человеческий гомолог белка репарации MutY (hMYH) физически взаимодействует с белками, участвующими в эксцизионной репарации длинных участков ДНК» . J. Biol. Chem . 276 (8): 5547–55. DOI : 10.1074 / jbc.M008463200 . PMID 11092888 .
↑ Романова Л.Ю., Виллерс Х., Благосклонный М.В., Пауэлл С.Н. (декабрь 2004 г.). «Взаимодействие р53 с репликационным белком А опосредует подавление гомологичной рекомбинации» . Онкоген . 23 (56): 9025–33. DOI : 10.1038 / sj.onc.1207982 . PMID 15489903 .
^ Рива Р, Zuco В, Винк А. А., Supino R, Проспери Е (декабрь 2001). «УФ-индуцированный разрез ДНК и рекрутирование ядерного антигена пролиферирующих клеток в сайты репарации происходят независимо от взаимодействия белка А репликации р53 в клетках дикого типа р53 и мутантных клетках карциномы яичника» . Канцерогенез . 22 (12): 1971-8. DOI : 10.1093 / carcin / 22.12.1971 . PMID 11751427 .
↑ Shao RG, Cao CX, Zhang H, Kohn KW, Wold MS, Pommier Y (март 1999 г.). «Опосредованное репликацией повреждение ДНК камптотецином вызывает фосфорилирование RPA ДНК-зависимой протеинкиназой и диссоциирует комплексы RPA: ДНК-PK» . EMBO J . 18 (5): 1397–406. DOI : 10.1093 / emboj / 18.5.1397 . PMC 1171229 . PMID 10064605 .
^ a b Бочкарева Э., Королев С, Лис-Миллер С.П., Бочкарев А (апрель 2002 г.). «Структура ядра тримеризации RPA и его роль в многоступенчатом ДНК-связывающем механизме RPA» . EMBO J . 21 (7): 1855–63. DOI : 10.1093 / emboj / 21.7.1855 . PMC 125950 . PMID 11927569 .
^ Бочкарева E, Frappier L, Эдвардс М., Бочкарев A (февраль 1998). «Субъединица RPA32 репликационного белка А человека содержит одноцепочечный ДНК-связывающий домен» . J. Biol. Chem . 273 (7): 3932–6. DOI : 10.1074 / jbc.273.7.3932 . PMID 9461578 .
^ Unsal-KAÇMAZ K, Честейн PD, Qu PP, Minoo P, Кордейру-Stone M, Sancar A, Kaufmann WK (апрель 2007). «Человеческий комплекс Тим / Типин координирует реакцию контрольной точки Intra-S на УФ, что замедляет смещение вилки репликации» . Мол. Клетка. Биол . 27 (8): 3131–42. DOI : 10.1128 / MCB.02190-06 . PMC 1899931 . PMID 17296725 .
↑ Yoo E, Kim BU, Lee SY, Cho CH, Chung JH, Lee CH (август 2005 г.). «53BP1 связан с репликационным белком А и необходим для гиперфосфорилирования RPA2 после повреждения ДНК» . Онкоген . 24 (35): 5423–30. DOI : 10.1038 / sj.onc.1208710 . PMID 15856006 .
^ Li L, Lu X, Peterson CA, Legerski RJ (октябрь 1995). «Взаимодействие между фактором репарации ДНК XPA и репликационным белком А, по-видимому, необходимо для эксцизионной репарации нуклеотидов» . Мол. Клетка. Биол . 15 (10): 5396–402. DOI : 10.1128 / mcb.15.10.5396 . PMC 230789 . PMID 7565690 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Ифтоде C, Даниэли Y, Боровец Я.А. (1999). «Репликационный белок А (RPA): эукариотический SSB». Крит. Rev. Biochem. Мол. Биол . 34 (3): 141–80. DOI : 10.1080 / 10409239991209255 . PMID 10473346 .
Бинц С.К., Шихан А.М., Уолд М.С. (2005). «Репликация протеина А и клеточный ответ на повреждение ДНК». Ремонт ДНК (Amst.) . 3 (8–9): 1015–24. DOI : 10.1016 / j.dnarep.2004.03.028 . PMID 15279788 .
Дорнрайтер I, Эрдил Л.Ф., Гилберт И.Ю., фон Винклер Д., Келли Т.Дж., Фаннинг Э. (1992). «Взаимодействие ДНК-полимеразы альфа-примазы с белком репликации клеток A и антигеном SV40 T» . EMBO J . 11 (2): 769–76. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05110.x . PMC 556510 . PMID 1311258 .
Эрдайл Л.Ф., Хейер В.Д., Колоднер Р., Келли Т.Дж. (1991). «Характеристика кДНК, кодирующей одноцепочечную ДНК-связывающую субъединицу 70 кДа человеческого белка репликации А, и роль белка в репликации ДНК». J. Biol. Chem . 266 (18): 12090–8. PMID 2050703 .
Ли Л., Лу Х, Петерсон, Калифорния, Легерски Р. Дж. (1995). «Взаимодействие между фактором репарации ДНК XPA и репликационным белком А, по-видимому, необходимо для эксцизионной репарации нуклеотидов» . Мол. Клетка. Биол . 15 (10): 5396–402. DOI : 10.1128 / mcb.15.10.5396 . PMC 230789 . PMID 7565690 .
Кешав К.Ф., Чен С., Датта А. (1995). «Rpa4, гомолог 34-килодальтонной субъединицы комплекса репликационного белка А» . Мол. Клетка. Биол . 15 (6): 3119–28. DOI : 10.1128 / mcb.15.6.3119 . PMC 230543 . PMID 7760808 .
Umbricht CB, Griffin CA, Hawkins AL, Grzeschik KH, O'Connell P, Leach R, Green ED, Kelly TJ (1994). «Геномное картирование с высоким разрешением трех генов человеческого белка репликации А (RPA1, RPA2 и RPA3)». Геномика . 20 (2): 249–57. DOI : 10.1006 / geno.1994.1161 . PMID 8020972 .
Гомес XV, Уолд М.С. (1996). «Функциональные домены 70-килодальтонной субъединицы человеческого белка репликации А.». Биохимия . 35 (32): 10558–68. DOI : 10.1021 / bi9607517 . PMID 8756712 .
Бочкарев A, Pfuetzner RA, Edwards AM, Frappier L (1997). «Структура одноцепочечного ДНК-связывающего домена репликационного белка А, связанного с ДНК». Природа . 385 (6612): 176–81. DOI : 10.1038 / 385176a0 . PMID 8990123 . S2CID 4288187 .
Amacker M, Hottiger M, Mossi R, Hübscher U (1997). «Белок нуклеокапсида ВИЧ-1 и белок репликации А влияют на синтез ДНК смещения цепи лентивирусной обратной транскриптазы». СПИД . 11 (4): 534–6. PMID 9084803 .
Cujec TP, Cho H, Maldonado E, Meyer J, Reinberg D, Peterlin BM (1997). «Трансактиватор вируса иммунодефицита человека Tat взаимодействует с холоферментом РНК-полимеразы II» . Мол. Клетка. Биол . 17 (4): 1817–23. DOI : 10,1128 / MCB.17.4.1817 . PMC 232028 . PMID 9121429 .
Loor G, Чжан SJ, Чжан P, Toomey NL, Lee MY (1998). «Идентификация белков репликации ДНК и клеточного цикла, которые взаимодействуют с PCNA» . Nucleic Acids Res . 25 (24): 5041–6. DOI : 10.1093 / NAR / 25.24.5041 . PMC 147130 . PMID 9396813 .
Бочкарева E, Frappier L, Edwards AM, Бочкарев A (1998). «Субъединица RPA32 репликационного белка А человека содержит одноцепочечный ДНК-связывающий домен» . J. Biol. Chem . 273 (7): 3932–6. DOI : 10.1074 / jbc.273.7.3932 . PMID 9461578 .
Голуб Э.И., Гупта Р.К., Хааф Т., Уолд М.С., Раддинг К.М. (1999). «Взаимодействие человеческого рекомбинационного белка rad51 с одноцепочечным ДНК-связывающим белком, RPA» . Nucleic Acids Res . 26 (23): 5388–93. DOI : 10.1093 / NAR / 26.23.5388 . PMC 148005 . PMID 9826763 .
Шао Р.Г., Цао С.Х., Чжан Х., Кон К.В., Уолд М.С., Помье Й. (1999). «Опосредованное репликацией повреждение ДНК камптотецином индуцирует фосфорилирование RPA ДНК-зависимой протеинкиназой и диссоциирует комплексы RPA: ДНК-PK» . EMBO J . 18 (5): 1397–406. DOI : 10.1093 / emboj / 18.5.1397 . PMC 1171229 . PMID 10064605 .
Брош Р.М., Оррен Д.К., Нелин Дж.О., Равн П.Х., Кенни М.К., Махве А., Бор В.А. (1999). «Функциональное и физическое взаимодействие между геликазой WRN и человеческим белком репликации А.» J. Biol. Chem . 274 (26): 18341–50. DOI : 10.1074 / jbc.274.26.18341 . PMID 10373438 .
Ким С.Т., Лим Д.С., Канман CE, Кастан МБ (2000). «Субстратные особенности и идентификация предполагаемых субстратов членов семейства киназ ATM» . J. Biol. Chem . 274 (53): 37538–43. DOI : 10.1074 / jbc.274.53.37538 . PMID 10608806 .
Brosh RM, Li JL, Kenny MK, Karow JK, Cooper MP, Kureekattil RP, Hickson ID, Bohr VA (2000). «Репликационный белок А физически взаимодействует с белком синдрома Блума и стимулирует его геликазную активность» . J. Biol. Chem . 275 (31): 23500–8. DOI : 10.1074 / jbc.M001557200 . PMID 10825162 .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000132383 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000751 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8454588-5] Umbricht CB, Erdile LF, Jabs EW, Келли TJ (апрель 1993). «Клонирование, сверхэкспрессия и геномное картирование 14-кДа субъединицы человеческого белка репликации А». J Biol Chem . 268 (9): 6131–8. PMID 8454588 .

[pmid12527904-6] Wong JM, Ионеску D, Ingles CJ (январь 2003). «Взаимодействие между BRCA2 и репликационным белком А нарушено предрасполагающей к раку мутацией в BRCA2» . Онкоген . 22 (1): 28–33. DOI : 10.1038 / sj.onc.1206071 . PMID 12527904 .

[pmid10825162-7] Брош RM, Li JL, Кенни М.К., Karow JK, Купер MP, Kureekattil RP, Хиксон ID, Бор В. А. (август 2000). «Репликационный белок А физически взаимодействует с белком синдрома Блума и стимулирует его геликазную активность» . J. Biol. Chem . 275 (31): 23500–8. DOI : 10.1074 / jbc.M001557200 . PMID 10825162 .

[pmid12181313-8] Opresko PL, фон Коббе C, Laine JP, Harrigan J, Hickson ID, Bohr VA (октябрь 2002 г.). «Теломер-связывающий белок TRF2 связывает и стимулирует геликазы синдрома Вернера и Блума» . J. Biol. Chem . 277 (43): 41110–9. DOI : 10.1074 / jbc.M205396200 . PMID 12181313 .

[pmid11950880-9] Moens PB, Колас NK, Tarsounas M, Маркон E, Cohen PE, Spyropoulos B (апрель 2002). «Временной ход и хромосомная локализация белков, связанных с рекомбинацией, в мейозе у мышей совместимы с моделями, которые могут разрешить ранние взаимодействия ДНК-ДНК без реципрокной рекомбинации». J. Cell Sci . 115 (Pt 8): 1611–22. PMID 11950880 .

[pmid12614612-10] Б с д е е Kneissl М, клюшки V, Szalay А.А., Grummt F (март 2003 г.). «Взаимодействие и сборка мышиных пререпликативных сложных белков в клетках дрожжей и мышей». J. Mol. Биол . 327 (1): 111–28. DOI : 10.1016 / s0022-2836 (03) 00079-2 . PMID 12614612 .

[pmid11092888-11] Перейти ↑ Parker A, Gu Y, Mahoney W, Lee SH, Singh KK, Lu AL (февраль 2001 г.). «Человеческий гомолог белка репарации MutY (hMYH) физически взаимодействует с белками, участвующими в эксцизионной репарации длинных участков ДНК» . J. Biol. Chem . 276 (8): 5547–55. DOI : 10.1074 / jbc.M008463200 . PMID 11092888 .

[pmid15489903-12] Романова Л.Ю., Виллерс Х., Благосклонный М.В., Пауэлл С.Н. (декабрь 2004 г.). «Взаимодействие р53 с репликационным белком А опосредует подавление гомологичной рекомбинации» . Онкоген . 23 (56): 9025–33. DOI : 10.1038 / sj.onc.1207982 . PMID 15489903 .

[pmid11751427-13] Рива Р, Zuco В, Винк А. А., Supino R, Проспери Е (декабрь 2001). «УФ-индуцированный разрез ДНК и рекрутирование ядерного антигена пролиферирующих клеток в сайты репарации происходят независимо от взаимодействия белка А репликации р53 в клетках дикого типа р53 и мутантных клетках карциномы яичника» . Канцерогенез . 22 (12): 1971-8. DOI : 10.1093 / carcin / 22.12.1971 . PMID 11751427 .

[pmid10064605-14] Shao RG, Cao CX, Zhang H, Kohn KW, Wold MS, Pommier Y (март 1999 г.). «Опосредованное репликацией повреждение ДНК камптотецином вызывает фосфорилирование RPA ДНК-зависимой протеинкиназой и диссоциирует комплексы RPA: ДНК-PK» . EMBO J . 18 (5): 1397–406. DOI : 10.1093 / emboj / 18.5.1397 . PMC 1171229 . PMID 10064605 .

[pmid11927569-15] Бочкарева Э., Королев С, Лис-Миллер С.П., Бочкарев А (апрель 2002 г.). «Структура ядра тримеризации RPA и его роль в многоступенчатом ДНК-связывающем механизме RPA» . EMBO J . 21 (7): 1855–63. DOI : 10.1093 / emboj / 21.7.1855 . PMC 125950 . PMID 11927569 .

[pmid9461578-16] Бочкарева E, Frappier L, Эдвардс М., Бочкарев A (февраль 1998). «Субъединица RPA32 репликационного белка А человека содержит одноцепочечный ДНК-связывающий домен» . J. Biol. Chem . 273 (7): 3932–6. DOI : 10.1074 / jbc.273.7.3932 . PMID 9461578 .

[pmid17296725-17] Unsal-KAÇMAZ K, Честейн PD, Qu PP, Minoo P, Кордейру-Stone M, Sancar A, Kaufmann WK (апрель 2007). «Человеческий комплекс Тим / Типин координирует реакцию контрольной точки Intra-S на УФ, что замедляет смещение вилки репликации» . Мол. Клетка. Биол . 27 (8): 3131–42. DOI : 10.1128 / MCB.02190-06 . PMC 1899931 . PMID 17296725 .

[pmid15856006-18] Yoo E, Kim BU, Lee SY, Cho CH, Chung JH, Lee CH (август 2005 г.). «53BP1 связан с репликационным белком А и необходим для гиперфосфорилирования RPA2 после повреждения ДНК» . Онкоген . 24 (35): 5423–30. DOI : 10.1038 / sj.onc.1208710 . PMID 15856006 .

[pmid7565690-19] Li L, Lu X, Peterson CA, Legerski RJ (октябрь 1995). «Взаимодействие между фактором репарации ДНК XPA и репликационным белком А, по-видимому, необходимо для эксцизионной репарации нуклеотидов» . Мол. Клетка. Биол . 15 (10): 5396–402. DOI : 10.1128 / mcb.15.10.5396 . PMC 230789 . PMID 7565690 .

[1]