База данных рибосомных РНК SILVA

Эта статья поднимает множество проблем. Пожалуйста, помогите улучшить его или обсудите эти проблемы на странице обсуждения . ( Узнайте, как и когда удалить эти сообщения-шаблоны )

Тема этой статьи может не соответствовать руководящим принципам Википедии для компаний и организаций . Пожалуйста, помогите продемонстрировать значимость темы, цитируя надежные вторичные источники , не зависящие от темы и обеспечивающие значительное ее освещение, помимо банального упоминания. Если не удается показать известность, вероятно, статья будет объединена , перенаправлена или удалена .
Найти источники: «База данных рибосомных РНК SILVA» - новости · газеты · книги · ученый · JSTOR (Ноябрь 2016 г. ) ( Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения )

Эта статья может чрезмерно полагаться на источники, слишком тесно связанные с предметом , что потенциально может помешать проверке и нейтральности статьи . Пожалуйста, помогите улучшить его , заменив их более подходящими ссылками на надежные, независимые сторонние источники . ( Ноябрь 2016 г. ) ( Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения )

( Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения )

SILVA - это база данных рибосомных РНК ^[1]^[2]^[3], созданная в сотрудничестве между группой микробной геномики Института морской микробиологии Макса Планка в Бремене, Германия, кафедрой микробиологии Технического университета Мюнхена и Ribocon . ^[4]^[5]

Выпуск 117 базы данных (январь 2014 г.) содержал более 4 000 000 последовательностей малых субъединиц (SSU - 16S / 18S) и 400 000 больших субъединиц (LSU - 23S / 28S). ^[6]^{[ неудачная проверка ]} Последовательности предоставляются в виде файлов для программной среды ARB. ^[4]

См. Также [ править ]

Список биологических баз данных # Базы данных РНК

Ссылки [ править ]

^ Кристиан Квост Эльмар Pruesse, Пелино Yilmaz, Ян Gerken, Тиая Schweer, Пабло Yarza, Йорг Peplies, Фрэнк Оливер Glöckner (2013). Проект базы данных генов рибосомных РНК SILVA: улучшенная обработка данных и веб-инструменты . Исследование нуклеиновых кислот 41 (D1): D590-D596. doi : 10.1093 / nar / gks1219 ^{[ необходим сторонний источник ]}
^ Пелин Йылмаз; Лаура Вегенер Парфри ; Пабло Ярза; Ян Геркен; Эльмар Прюссе; Кристиан Кваст; Тимми Швир; Йорг Пеплис; Вольфганг Людвиг; Фрэнк Оливер Глёкнер (2014). «Таксономические рамки SILVA и« Всевидового проекта живого дерева (LTP) » . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (D1): D643 – D648. DOI : 10.1093 / NAR / gkt1209 . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
^ Эльмар Pruesse, Кристиан Квост, Katrin Knittel, Бернхард М. Фукс, Вольфганг Людвиг, Йорг Peplies, Фрэнк Оливер Glöckner (2007). SILVA: всеобъемлющий онлайн-ресурс для проверенных и согласованных данных о последовательностях рибосомных РНК, совместимых с ARB . Исследование нуклеиновых кислот 35 (21): 7188-7196. doi : 10.1093 / nar / gkm864 ^{[ необходим сторонний источник ]}
^ а б Сильва . Ribocon GmbH. По состоянию на ноябрь 2016 г. ^{[ самостоятельно опубликованный источник? ]}
^ Экологическая биоинформатика . Группа микробной геномики и биоинформатики, Институт морской микробиологии Макса Планка. По состоянию на ноябрь 2016 г.^{[ необходим сторонний источник ]}
^ Марк П. Хёппнер, Ларс Э. Барквист, Пол П. Гарднер (2014). Введение в базы данных РНК . Методы молекулярной биологии 1097 : 107–123. DOI : 10.1007 / 978-1-62703-709-9_6 .

[nar-1] Кристиан Квост Эльмар Pruesse, Пелино Yilmaz, Ян Gerken, Тиая Schweer, Пабло Yarza, Йорг Peplies, Фрэнк Оливер Glöckner (2013). Проект базы данных генов рибосомных РНК SILVA: улучшенная обработка данных и веб-инструменты . Исследование нуклеиновых кислот 41 (D1): D590-D596. doi : 10.1093 / nar / gks1219 ^{[ необходим сторонний источник ]}

[nar2-2] Пелин Йылмаз; Лаура Вегенер Парфри ; Пабло Ярза; Ян Геркен; Эльмар Прюссе; Кристиан Кваст; Тимми Швир; Йорг Пеплис; Вольфганг Людвиг; Фрэнк Оливер Глёкнер (2014). «Таксономические рамки SILVA и« Всевидового проекта живого дерева (LTP) » . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (D1): D643 – D648. DOI : 10.1093 / NAR / gkt1209 . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )

[nar3-3] Эльмар Pruesse, Кристиан Квост, Katrin Knittel, Бернхард М. Фукс, Вольфганг Людвиг, Йорг Peplies, Фрэнк Оливер Glöckner (2007). SILVA: всеобъемлющий онлайн-ресурс для проверенных и согласованных данных о последовательностях рибосомных РНК, совместимых с ARB . Исследование нуклеиновых кислот 35 (21): 7188-7196. doi : 10.1093 / nar / gkm864 ^{[ необходим сторонний источник ]}

[self-4] а б Сильва . Ribocon GmbH. По состоянию на ноябрь 2016 г. ^{[ самостоятельно опубликованный источник? ]}

[mpi-5] Экологическая биоинформатика . Группа микробной геномики и биоинформатики, Институт морской микробиологии Макса Планка. По состоянию на ноябрь 2016 г.^{[ необходим сторонний источник ]}

[hoepp-6] Марк П. Хёппнер, Ларс Э. Барквист, Пол П. Гарднер (2014). Введение в базы данных РНК . Методы молекулярной биологии 1097 : 107–123. DOI : 10.1007 / 978-1-62703-709-9_6 .

[1]