Белковая субъединица


В структурной биологии белковая субъединица представляет собой полипептидную цепь или одиночную белковую молекулу, которая собирается (или « совмещается ») с другими молекулами с образованием белкового комплекса . [1] [2] [3] Большие наборы белков, такие как вирусы , часто используют небольшое количество типов белковых субъединиц в качестве строительных блоков. [4]

Субъединицу часто называют греческой или латинской буквой, а номера субъединиц этого типа в белке обозначают нижним индексом. [5] Например, АТФ-синтаза имеет тип субъединицы, называемый α. Три из них присутствуют в молекуле АТФ-синтазы, что привело к обозначению α 3 . Также могут быть указаны более крупные группы субъединиц, такие как α 3 β 3 -гексамер и с-кольцо. [6]

Природные белки, имеющие относительно небольшое количество субъединиц, называются олигомерными . [7] Например, гемоглобин представляет собой симметричное расположение двух идентичных субъединиц α-глобина и двух идентичных субъединиц β-глобина. [3] [8] Более длинные мультимерные белки, такие как микротрубочки и другие белки цитоскелета , могут состоять из очень большого количества субъединиц. Например, динеин представляет собой мультимерный белковый комплекс, включающий две тяжелые цепи (DHC), две промежуточные цепи (IC), две легкие промежуточные цепи (LIC) и несколько легких цепей (LC). [9]

Субъединицы белкового комплекса могут быть идентичными, гомологичными или совершенно непохожими и выполнять разные задачи. [1] В некоторых белковых сборках одна субъединица может быть «каталитической субъединицей», которая ферментативно катализирует реакцию, тогда как «регуляторная субъединица» будет способствовать или ингибировать активность. [10] Хотя теломераза имеет теломеразную обратную транскриптазу в качестве каталитической субъединицы, регуляция осуществляется внешними факторами белка. [11]

Фермент, состоящий как из регуляторных, так и из каталитических субъединиц в сборе, часто называют холоферментом . Например, фосфоинозитид-3-киназа класса I состоит из каталитической субъединицы р110 и регуляторной субъединицы р85. [12] Одна субъединица состоит из одной полипептидной цепи. Полипептидная цепь имеет один кодирующий ее ген, а это означает, что белок должен иметь один ген для каждой уникальной субъединицы .


Рендеринг HLA-A11 , показывающий субъединицы α (продукт гена A * 1101) и β (микроглобулин бета-2) . Этот рецептор имеет связанный пептидкармане связывания ) гетерологичного происхождения, который также способствует функционированию.