Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено из СУМО-1 )
Перейти к навигации Перейти к поиску
SUMO1
Белок SUMO1 PDB 1a5r.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

4WJQ , 1A5R , 1TGZ , 1WYW , 1Y8R , 1Z5S , 2ASQ , 2BF8 , 2G4D , 2IO2 , 2IY0 , 2IY1 , 2KQS , 2LAS , 2MW5 , 2PE6 , 2UYZ , 2VRR , 3KYC , 3KYD , 3RZW , 3UIP , 4WJN , 4WJO , 4WJP , 5АЭК , 2Н1В, 2Н1А

Идентификаторы
ПсевдонимыSUMO1 , DAP1, GMP1, OFC10, PIC1, SENP2, SMT3, SMT3C, SMT3H3, UBL1, малый убиквитиноподобный модификатор 1, малый убиквитиноподобный модификатор 1
Внешние идентификаторыOMIM : 601912 MGI : 1197010 HomoloGene : 2514 GeneCards : SUMO1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человека) [1]
Группа2q33.1Начинать202 206 180 п.н. [1]
Конец202 238 608 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Chr.Хромосома 1 (мышь) [2]
Группа1 | 1 C2Начинать59 586 558 п.н. [2]
Конец59 670 834 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК




Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание фактора транскрипции
• активность регулятора калиевого канала
• связывание с белком GO: 0001948
• белковая метка
• связывание убиквитиновой протеин-лигазы
• связывание РНК
• связывание корепрессора транскрипции
• связывание с С-концом протеина
• активность трансферазы SUMO
• связывание фермента
• активность адаптера белок-макромолекула
• Связывание с глюкокортикоидным рецептором
• Связывание с ферментом, активирующим небольшой белок
• Связывание с убиквитин-подобной протеинлигазой
Сотовый компонент• цитоплазма
• тело PML
• ядерное пятнышко
• ядерное тело
• ядерная мембрана
• мембрана
• комплекс потенциалзависимых калиевых каналов
• плазматическая мембрана
• синапс
• ядерная пора
• нуклеоплазма
• гетерохроматин
• XY тело
• дендрит
• ядрышко
• фибриллярный центр
• ядро
• ядерный стресс гранула
• комплекс активирующих ферментов SUMO
• ядерная оболочка
• цитозоль
Биологический процесс• развитие
нёба • регуляция транскрипции по шаблону ДНК
• регуляция стабильности протеина
• позитивная регуляция сборки протеинсодержащего комплекса
• локализация протеина в ядерной поре
• стабилизация протеина
• негативная регуляция потенциала действия
• негативная регуляция последовательности-специфической ДНК активность связывающего фактора транскрипции
• регуляция локализации белка
• регуляция сокращения клеток сердечной мышцы
• глобальная эксцизионная репарация генома
• организация тела PML
• регуляция интерферон-гамма-опосредованного сигнального пути
• Вирусный процесс GO: 0022415
• негативная регуляция транскрипции, ДНК-темплейт
• восстановление двухцепочечных разрывов посредством негомологичного соединения концов
• регуляция трансмембранного транспорта ионов кальция
• позитивная регуляция протеасомного убиквитин-зависимого белка катаболический процесс
• негативная регуляция активности калиевых каналов отсроченного выпрямителя
• позитивная регуляция активности трансмембранного переносчика кальция, связанного с АТФазой
• репарация ДНК
• негативная регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II
• клеточный ответ на тепло
• клеточный ответ на ион кадмия
• сумоилирование белков
• негативная регуляция связывания ДНК
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

7341

22218

Ансамбль

ENSG00000116030

ENSMUSG00000026021

UniProt

P63165

P63166

RefSeq (мРНК)

NM_003352
NM_001005781
NM_001005782

NM_009460

RefSeq (белок)
NP_001005781
NP_001005782
NP_003343
NP_001358321
NP_001358322

NP_001358323

NP_033486

Расположение (UCSC)Chr 2: 202.21 - 202.24 МбChr 1: 59.59 - 59.67 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Малый убиквитин связанных модификатор 1 представляет собой белок , который у человека кодируется SUMO1 гена . [5] [6]

Функция [ править ]

Этот ген кодирует белок, который является членом семейства белков SUMO (небольшой убиквитин-подобный модификатор). Это убиквитин-подобный белок, который действует аналогично убиквитину в том, что он связывается с белками-мишенями как часть системы посттрансляционной модификации . Однако, в отличие от убиквитина, который в первую очередь связан с белками, нацеленными на протеасомную деградацию , SUMO1 участвует во множестве клеточных процессов, таких как ядерный транспорт, регуляция транскрипции, апоптоз и стабильность белка. Он не активен, пока не будут отщеплены последние четыре аминокислоты на карбокси-конце . Несколько псевдогеновбыли зарегистрированы для этого гена. Были охарактеризованы альтернативные варианты сплайсинга транскрипции, кодирующие разные изоформы . [7]

Большинство генов расщелины имеют компонент сумоилирования . [8] Анализ хромосомных аномалий у пациентов привел к идентификации и подтверждению SUMO1 как локуса расщелины губы и неба . [9]

Взаимодействия [ править ]

Небольшой модификатор 1, связанный с убиквитином, взаимодействует с:

  • C22orf25 , [10]
  • DAXX , [11] [12] [13]
  • DNMT3B , [14]
  • P53 , [13] [15]
  • PIAS1 , [16] [17]
  • PML , [11] [18]
  • SAE2 , [19] [20]
  • SP1 , [21]
  • TDG , [15] [22]
  • TNFRSF1A , [6] [23]
  • TNFRSF6 , [6] [12]
  • TOP2A , [24]
  • TOP2B , [24] и
  • UBE2I , [15] [19] [25] [26]

Роль в сердце [ править ]

Сердечная недостаточность - это процесс, при котором перекачивающая способность сердца значительно ослабляется, так что тело не может получить адекватное кровообращение. Ослабленное сердце вызывает симптомы усталости, снижение толерантности к физическим нагрузкам и одышку. Пациенты с сердечной недостаточностью имеют значительно повышенный риск смерти по сравнению с людьми с нормальной функцией сердца. Сердечная недостаточность является серьезной проблемой общественного здравоохранения, поскольку ее заболеваемость растет во всем мире, и она является основной причиной смерти в развитых странах [27].

SUMO 1 является ключевым компонентом сердечной функции, поскольку он помогает регулировать гомеостаз кальция в митохондриях сердечных клеток. SUMO 1 связан с другим важным сердечным белком, называемым Ca2 + ATPase сарко / эндоплазматического ретикулума, или SERCA2A. SERCA - это трансмембранный белок, расположенный в саркоплазматическом ретикулуме сердечных клеток. Его основная функция - регулировать выделение и поглощение внутриклеточного кальция между цитозолем и просветом саркоплазматического ретикулума. Кальций является важным фактором для развития сокращения и расслабления сердечных миоцитов. Таким образом, управление гомеостазом внутриклеточного кальция с помощью SERCA2A имеет решающее значение для общей сердечной деятельности. [28]Обычно SUMO 1 активирует и стабилизирует SERCA2A путем связывания с лизиновыми остатками 480 и 585. Взаимодействие между SUMO 1 и SERCA2A имеет решающее значение для регулирования уровней кальция внутри сердечных миоцитов. Снижение уровня белка SUMO 1 снижает SERCA2A и, таким образом, способствует эффективному усвоению кальция у пациентов с сердечной недостаточностью. [29]

В качестве мишени для наркотиков [ править ]

SUMO 1 может быть важной терапевтической мишенью для улучшения сердечной деятельности у пациентов с сердечной недостаточностью. В модели на мышах введение SUMO 1 с помощью генной терапии было связано с улучшенной активностью SERCA2A, что привело к улучшению сердечной функции за счет увеличения сердечной сократимости. [29] Кроме того, сверхэкспрессия SUMO 1 приводит к ускоренному усвоению кальция, что дает дополнительные доказательства его важности для поддержания адекватного уровня кальция в клетках сердца. [29]

См. Также [ править ]

  • SENP6

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000116030 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026021 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Shen Z, Pardington-Purtymun PE, Comeaux JC, Moyzis RK, Chen DJ (сентябрь 1996). «UBL1, убиквитиноподобный белок человека, связанный с белками RAD51 / RAD52 человека» . Геномика . 36 (2): 271–9. DOI : 10.1006 / geno.1996.0462 . PMID 8812453 . 
  6. ^ a b c Okura T, Gong L, Kamitani T, Wada T, Okura I, Wei CF, Chang HM, Yeh ET (ноябрь 1996 г.). «Защита от гибели клеток, опосредованной Fas / APO-1 и фактором некроза опухоли, с помощью нового белка, сентрина». Журнал иммунологии . 157 (10): 4277–81. PMID 8906799 . 
  7. ^ "Entrez Gene: SUMO1 SMT3 супрессор mif two 3 гомолог 1 (S. cerevisiae)" .
  8. ^ Pauws E, Stanier P (декабрь 2007). «Передача сигналов FGF и модификация SUMO: новые игроки в этиологии заячьей губы и / или неба». Тенденции в генетике . 23 (12): 631–40. DOI : 10.1016 / j.tig.2007.09.002 . PMID 17981355 . 
  9. ^ Dixon MJ, Marazita ML, Бити TH, Мюррей JC (2011). «Расщелина губы и неба: понимание генетических влияний и факторов окружающей среды». Nature Reviews Genetics (12) 167-178.
  10. ^ "База данных молекулярного взаимодействия" . Архивировано из оригинала на 2006-05-06.
  11. ↑ a b Lin DY, Shih HM (июль 2002 г.). «Существенная роль белка микросфер весом 58 кДа в модуляции Daxx-зависимой репрессии транскрипции, что выявлено секвестрацией ядрышка» . Журнал биологической химии . 277 (28): 25446–56. DOI : 10.1074 / jbc.M200633200 . PMID 11948183 . 
  12. ↑ a b Ryu SW, Chae SK, Kim E (декабрь 2000 г.). «Взаимодействие Daxx, белка, связывающего Fas, с сентрином и Ubc9». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 279 (1): 6–10. DOI : 10.1006 / bbrc.2000.3882 . PMID 11112409 . 
  13. ^ a b Иванчук С.М., Мондал С, Рутка Ю.Т. (июнь 2008 г.). «p14ARF взаимодействует с DAXX: влияет на HDM2 и p53» . Клеточный цикл . 7 (12): 1836–50. DOI : 10.4161 / cc.7.12.6025 . PMID 18583933 . 
  14. Перейти ↑ Kang ES, Park CW, Chung JH (декабрь 2001 г.). «Dnmt3b, de novo ДНК-метилтрансфераза, взаимодействует с SUMO-1 и Ubc9 через свою N-концевую область и подлежит модификации с помощью SUMO-1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 289 (4): 862–8. DOI : 10.1006 / bbrc.2001.6057 . PMID 11735126 . 
  15. ^ a b c Minty A, Dumont X, Kaghad M, Caput D (ноябрь 2000 г.). «Ковалентная модификация p73alpha с помощью SUMO-1. Двухгибридный скрининг с p73 идентифицирует новые взаимодействующие с SUMO-1 белки и мотив взаимодействия SUMO-1» . Журнал биологической химии . 275 (46): 36316–23. DOI : 10.1074 / jbc.M004293200 . PMID 10961991 . 
  16. ↑ Lee BH, Yoshimatsu K, Maeda A, Ochiai K, Morimatsu M, Araki K, Ogino M, Morikawa S, Arikawa J (декабрь 2003 г.). «Ассоциация нуклеокапсидного белка хантавирусов Сеула и Хантаана с небольшими молекулами, родственными убиквитин-подобному модификатору-1». Вирусные исследования . 98 (1): 83–91. DOI : 10.1016 / j.virusres.2003.09.001 . PMID 14609633 . 
  17. ^ Kahyo Т, Т Нишиды, Ясуда Н (сентябрь 2001 г.). «Участие PIAS1 в сумоилировании опухолевого супрессора p53». Молекулярная клетка . 8 (3): 713–8. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (01) 00349-5 . PMID 11583632 . 
  18. ^ КАМИТАНИ T, Нгуен HP, Kito K, Фукуда-КАМИТАНИ T, Yeh ET (февраль 1998). «Ковалентная модификация PML семейством сентринов убиквитин-подобных белков» . Журнал биологической химии . 273 (6): 3117–20. DOI : 10.1074 / jbc.273.6.3117 . PMID 9452416 . 
  19. ^ a b Татхам М.Х., Ким С., Ю Би, Джафрей Э, Сонг Дж., Чжэн Дж., Родригес М.С., Хэй RT, Чен Й (август 2003 г.). «Роль N-концевого сайта Ubc9 в связывании и конъюгации SUMO-1, -2 и -3». Биохимия . 42 (33): 9959–69. DOI : 10.1021 / bi0345283 . PMID 12924945 . 
  20. ↑ Gong L, Li B, Millas S, Yeh ET (апрель 1999 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика человеческих AOS1 и UBA2, компонентов комплекса ферментов, активирующих сентрин» . Письма FEBS . 448 (1): 185–9. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (99) 00367-1 . PMID 10217437 . S2CID 7756078 .  
  21. ↑ Wang YT, Chuang JY, Shen MR, Yang WB, Chang WC, Hung JJ (июль 2008 г.). «Сумоилирование специфичного протеина 1 усиливает его деградацию, изменяя локализацию и увеличивая протеолитический процесс специфичности протеина 1». Журнал молекулярной биологии . 380 (5): 869–85. DOI : 10.1016 / j.jmb.2008.05.043 . PMID 18572193 . 
  22. ^ Hardeland U, Steinacher R, Jiricny J, Schär P (март 2002). «Модификация тимин-ДНК-гликозилазы человека убиквитин-подобными белками способствует ферментативному обмену» . Журнал EMBO . 21 (6): 1456–64. DOI : 10.1093 / emboj / 21.6.1456 . PMC 125358 . PMID 11889051 .  
  23. ^ Liou ML, Liou HC (апрель 1999). «Белок, гомологичный убиквитину, DAP-1, связывается с доменом смерти рецептора фактора некроза опухоли (p60) и индуцирует апоптоз» . Журнал биологической химии . 274 (15): 10145–53. DOI : 10.1074 / jbc.274.15.10145 . PMID 10187798 . 
  24. ^ а б Мао Y, Десаи С.Д., Лю Л.Ф. (август 2000 г.). «Конъюгация SUMO-1 с изоферментами топоизомеразы II ДНК человека» . Журнал биологической химии . 275 (34): 26066–73. DOI : 10.1074 / jbc.M001831200 . PMID 10862613 . 
  25. ^ Юинга Р. М., Чу Р, Р Elisma, Ли Н, Р Тейлор, Клими S, McBroom-Cerajewski л, Робинсон М. Д., О'Коннор л, Ли М, R Тейлор, Dharsee М, Хо У, Heilbut А, Мур л, Чжан С., Орнатский О., Бухман Ю.В., Этье М., Шенг Й., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж. П., Дьювель Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К, Колвилл К., Глэдвиш К., Маскат Б., Кинах Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. DOI : 10.1038 / msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .  
  26. ^ Shen Z, Pardington-Purtymun PE, Comeaux JC, Moyzis RK, Chen DJ (октябрь 1996). «Ассоциации UBE2I с белками RAD52, UBL1, p53 и RAD51 в дрожжевой двугибридной системе» . Геномика . 37 (2): 183–6. DOI : 10.1006 / geno.1996.0540 . PMID 8921390 . 
  27. ^ Schwartz RJ, Yeh ET (2012). «Взвешивание сердечной недостаточности: роль СУМОилирования SERCA2a» . Циркуляционные исследования . 110 (2): 198–9. DOI : 10.1161 / RES.0b013e318246f187 . PMID 22267837 . 
  28. ^ Periasamy МЫ, Huke S (2001). «Уровень помпы SERCA является решающим фактором гомеостаза Ca (2+) и сократимости сердца». Журнал молекулярной и клеточной кардиологии . 33 (6): 1053–63. DOI : 10,1006 / jmcc.2001.1366 . PMID 11444913 . 
  29. ^ a b c Хо С, Ли А., Чжон Д., О Дж. Дж., Чаанин А. Х., Кизана Е., Парк В. Дж., Хаджар Р. Дж. (2011). «SUMO1-зависимая модуляция SERCA2a при сердечной недостаточности» . Природа . 477 (7366): 601–5. DOI : 10,1038 / природа10407 . PMC 3443490 . PMID 21900893 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Cookson MR (январь 2003 г.). «Пути к паркинсонизму». Нейрон . 37 (1): 7–10. DOI : 10.1016 / S0896-6273 (02) 01166-2 . PMID  12526767 . S2CID  14513509 .
  • Бодди М.Н., Хоу К., Эткин Л.Д., Соломон Э., Фримонт П.С. (сентябрь 1996 г.). «PIC 1, новый убиквитиноподобный белок, который взаимодействует с компонентом PML мультипротеинового комплекса, который нарушается при остром промиелоцитарном лейкозе». Онкоген . 13 (5): 971–82. PMID  8806687 .
  • Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID  8889548 .
  • Шен З., Пардингтон-Пуртимун ЧП, Комо Дж. К., Мойзис Р. К., Чен Д. Д. (октябрь 1996 г.). «Ассоциации UBE2I с белками RAD52, UBL1, p53 и RAD51 в дрожжевой двугибридной системе» . Геномика . 37 (2): 183–6. DOI : 10.1006 / geno.1996.0540 . PMID  8921390 .
  • Матунис MJ, Coutavas E, Blobel G (декабрь 1996 г.). «Новая убиквитиноподобная модификация модулирует разделение Ran-GTPase-активирующего белка RanGAP1 между цитозолем и комплексом ядерных пор» . Журнал клеточной биологии . 135 (6 Pt 1): 1457–70. DOI : 10,1083 / jcb.135.6.1457 . PMC  2133973 . PMID  8978815 .
  • Махаджан Р., Дельфин С., Гуан Т., Джерас Л., Мельхиор Ф. (январь 1997 г.). «Небольшой убиквитин-родственный полипептид, участвующий в нацеливании RanGAP1 на белок комплекса ядерных пор RanBP2». Cell . 88 (1): 97–107. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81862-0 . PMID  9019411 . S2CID  17819277 .
  • Лапента В., Чиурацци П., ван дер Спек П., Пиццути А., Ханаока Ф., Браге С. (март 1997 г.). «SMT3A, человеческий гомолог гена SMT3 S. cerevisiae, картируется на хромосоме 21qter и определяет новое семейство генов». Геномика . 40 (2): 362–6. DOI : 10.1006 / geno.1996.4556 . PMID  9119407 .
  • Камитани Т., Нгуен Х.П., Йе ET (май 1997 г.). «Предпочтительная модификация ядерных белков новой убиквитиноподобной молекулой» . Журнал биологической химии . 272 (22): 14001–4. DOI : 10.1074 / jbc.272.22.14001 . PMID  9162015 .
  • Махаджан Р., Джерас Л., Мельхиор Ф. (январь 1998 г.). «Молекулярная характеристика модификации SUMO-1 RanGAP1 и ее роль в ассоциации ядерной оболочки» . Журнал клеточной биологии . 140 (2): 259–70. DOI : 10,1083 / jcb.140.2.259 . PMC  2132567 . PMID  9442102 .
  • Хау К., Уильямсон Дж., Бодди Н., Шир Д., Фримонт П., Соломон Э. (январь 1998 г.). «Ген PIC1, гомологичный убиквитину: характеристика генов и псевдогенов мыши (Pic1) и человека (UBL1)». Геномика . 47 (1): 92–100. DOI : 10.1006 / geno.1997.5091 . PMID  9465300 .
  • Байер П., Арндт А., Мецгер С., Махаджан Р., Мельхиор Ф., Янике Р., Беккер Дж. (Июль 1998 г.). «Определение структуры малого убиквитин-родственного модификатора SUMO-1». Журнал молекулярной биологии . 280 (2): 275–86. DOI : 10.1006 / jmbi.1998.1839 . PMID  9654451 .
  • Desterro JM, Rodriguez MS, Hay RT (август 1998 г.). «Модификация IkappaBalpha SUMO-1 ингибирует активацию NF-kappaB». Молекулярная клетка . 2 (2): 233–9. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80133-1 . PMID  9734360 .
  • Джо П., Куо С.Дж., Юань Дж., Бленис Дж. (Сентябрь 1998 г.). «Существенная потребность в каспазе-8 / FLICE в инициации Fas-индуцированного апоптотического каскада». Текущая биология . 8 (18): 1001–8. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (07) 00420-4 . PMID  9740801 . S2CID  18129508 .
  • Камитани Т., Кито К., Нгуен Х.П., Вада Х., Фукуда-Камитани Т., Йе ET (октябрь 1998 г.). «Идентификация трех основных сайтов сенторизации в PML» . Журнал биологической химии . 273 (41): 26675–82. DOI : 10.1074 / jbc.273.41.26675 . PMID  9756909 .
  • Duprez E, Saurin AJ, Desterro JM, Lallemand-Breitenbach V, Howe K, Boddy MN, Solomon E, de Thé H, Hay RT, Freemont PS (февраль 1999 г.). "Модификация SUMO-1 белка острой промиелоцитарной лейкемии PML: последствия для ядерной локализации". Журнал клеточной науки . 112 (Pt 3) (3): 381–93. PMID  9885291 .
  • Чен А., Маннен Х., Ли СС (декабрь 1998 г.). «Характеристика мышиных убиквитин-подобных кДНК SMT3A и SMT3B и генов / псевдогенов» . Международная биохимия и молекулярная биология . 46 (6): 1161–74. DOI : 10.1080 / 15216549800204722 . PMID  9891849 . S2CID  45939730 .
  • Okuma T, Honda R, Ichikawa G, Tsumagari N, Yasuda H (январь 1999 г.). «Модификация SUMO-1 in vitro требует двух ферментативных стадий, E1 и E2». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 254 (3): 693–8. DOI : 10.1006 / bbrc.1998.9995 . PMID  9920803 .
  • Лиу М.Л., Лиу Х.С. (апрель 1999 г.). «Белок, гомологичный убиквитину, DAP-1, связывается с доменом смерти рецептора фактора некроза опухоли (p60) и индуцирует апоптоз» . Журнал биологической химии . 274 (15): 10145–53. DOI : 10.1074 / jbc.274.15.10145 . PMID  10187798 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Расположение человеческого гена SUMO1 в браузере генома UCSC .
  • Подробная информация о человеческом гене SUMO1 в браузере генома UCSC .