• клеточный процесс обмена веществ ароматического соединения • биосинтеза холестерина процесс • окислительно-восстановительный процесс • ответ на органическое вещество • процесс метаболизма холестерина • стерин процесс биосинтеза • регулирование процесса биосинтеза холестерина
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
6713
20775
Ансамбль
ENSG00000104549
ENSMUSG00000022351
UniProt
Q14534
P52019
RefSeq (мРНК)
NM_003129
NM_009270
RefSeq (белок)
NP_003120
NP_033296
Расположение (UCSC)
Chr 8: 125 - 125,02 Мб
Chr 15: 59.32 - 59.33 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Скваленмонооксигеназа (также называемая скваленэпоксидазой ) - это фермент, который использует НАДФН и молекулярный кислород для окисления сквалена до 2,3-оксидосквалена (эпоксид сквалена). Скваленэпоксидаза катализирует первую стадию оксигенации в биосинтезе стеролов и считается одним из ферментов, ограничивающих скорость в этом пути. [5] В организме человека скваленэпоксидаза кодируются SQLE ген . [6]
Несколько эукариотВ геномах отсутствует ген, кодирующий скваленмонооксигеназу, но вместо этого кодируется альтернативная скваленэпоксидаза, которая катализирует окисление сквалена . [7]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Механизм
2 ингибитора
3 Локализация
4 Дополнительные продукты
5 Модельные организмы
6 См. Также
7 ссылки
8 Дальнейшее чтение
9 Внешние ссылки
Механизм [ править ]
Каноническая сквален монооксигеназным является флавопротеином монооксигеназным . Флавопротеид монооксигеназной формы Flavin гидропероксидов на фермент активного сайте , который затем перевести терминал атом кислорода из гидропероксида к подложке . Скваленмонооксигеназа отличается от других флавинмонооксигеназ тем, что кислород вставлен как эпоксид, а не как гидроксильная группа. Скваленмонооксигеназа содержит слабо связанный флавин FAD и получает электроны от NADPH -редуктаза цитохрома P450 , а не связывание кофактора никотинамида НАДФН напрямую. Альтернативная скваленэпоксидаза принадлежит к суперсемейству гидроксилаз жирных кислот и получает электроны от цитохрома b5 . [7]
Ингибиторы [ править ]
Ингибиторы скваленэпоксидазы нашли применение в основном в качестве противогрибковых препаратов : [8]
бутенафин
нафтифин
тербинафин [9]
Поскольку скваленэпоксидаза участвует в биосинтетическом пути, ведущем к холестерину, ингибиторы этого фермента также могут найти применение при лечении гиперхолестеринемии . [10]
Локализация [ править ]
В дрожжах Saccharomyces cerevisiae скваленэпоксидаза локализована как в эндоплазматическом ретикулуме, так и в липидных каплях. Активен только белок, локализованный в ER.
Дополнительные продукты [ править ]
Скваленэпоксидаза также катализирует образование диэпоксисквалена (DOS). DOS превращается в 24 (S), 25-эпоксиланостерин под действием ланостеринсинтазы.
Модельные организмы [ править ]
Модельные организмы использовались при изучении функции SQLE. Линия условно нокаутных мышей под названием Sqle tm1a (EUCOMM) Wtsi была создана в Wellcome Trust Sanger Institute . [11] Самцы и самки животных прошли стандартизированный фенотипический скрининг [12] для определения эффектов делеции. [13] [14] [15] [16] Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование [17]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000104549 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022351 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Entrez Gene: SQLE скваленэпоксидаза" .
^ Нагай М, Сакакибар Дж, Wakui К, Фукусима Y, Игараши S, S Тсуджи, Аракав М, Т Оно (август 1997 г.). «Локализация гена скваленэпоксидазы (SQLE) в области хромосомы человека 8q24.1». Геномика . 44 (1): 141–3. DOI : 10.1006 / geno.1997.4825 . PMID 9286711 .
^ a b Pollier J, Vancaester E, Kuzhiumparambil U, Vickers CE, Vandepoele K, Goossens A, Fabris M (2019). «Широко распространенная альтернатива скваленэпоксидазе участвует в биосинтезе стероидов эукариот». Природная микробиология . 4 (2): 226–233. DOI : 10.1038 / s41564-018-0305-5 . PMID 30478288 . S2CID 53726187 .
Перейти ↑ Favre B, Ryder NS (февраль 1996). «Характеристика активности скваленэпоксидазы дерматофита Trichophyton rubrum и ее ингибирование тербинафином и другими антимикотическими средствами» . Противомикробные препараты и химиотерапия . 40 (2): 443–7. DOI : 10.1128 / AAC.40.2.443 . PMC 163131 . PMID 8834895 .
↑ Райдер NS (февраль 1992 г.). «Тербинафин: механизм действия и свойства ингибирования скваленэпоксидазы». Британский журнал дерматологии . 126 Дополнение 39: 2–7. DOI : 10.1111 / j.1365-2133.1992.tb00001.x . PMID 1543672 . S2CID 19780957 .
^ Чага A, Ray A, Гупта JB (январь 2003). «Пересмотр скваленэпоксидазы как мишени для гипохолестеринемического лекарства». Прогресс в исследованиях липидов . 42 (1): 37–50. DOI : 10.1016 / S0163-7827 (02) 00029-2 . PMID 12467639 .
^ Gerdin AK (2010). «Программа генетики мышей Сэнгера: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica . 88 : 925–7. DOI : 10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x . S2CID 85911512 .
^ a b «Международный консорциум по фенотипированию мышей» .
^ Skarnes туалет, Розен В, Уэст А.П., Koutsourakis М, Бушелл Вт, Ийер В, Мухика А.О., Томас М, борона Дж, Кокс Т, Джексон D, Северин Дж, Биггс Р, фу Дж, Нефедов М, де - Jong PJ, Стюарт А.Ф., Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс с условным нокаутом для полногеномного исследования функции генов мыши» . Природа . 474 (7351): 337–42. DOI : 10,1038 / природа10163 . PMC 3572410 . PMID 21677750 .
^ Долгин E (июнь 2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут" . Природа . 474 (7351): 262–3. DOI : 10.1038 / 474262a . PMID 21677718 .
^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (январь 2007). «Мышь по всем причинам». Cell . 128 (1): 9–13. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.12.018 . PMID 17218247 . S2CID 18872015 .
^ Белый Ю.К., Gerdin А.К., Карп Н.А., Райдера Е, Булян М, Bussell Ю.Н., Salisbury Дж, Clare S, Ингам штат Нью - Джерси, Podrini С, Houghton R, Estabel J, Боттомли JR, Мелвин Д.Г., Сунтер D, Адамс Северная Каролина, Таннахилл D, Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (июль 2013 г.). «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов» . Cell . 154 (2): 452–64. DOI : 10.1016 / j.cell.2013.06.022 . PMC 3717207 . PMID 23870131 .
^ a b «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)» .
Дальнейшее чтение [ править ]
Ма Дж., Демпси А.А., Стаматио Д., Маршалл К.В., Лью С.К. (март 2007 г.). «Идентификация паттернов экспрессии лейкоцитарных генов, связанных с уровнями липидов в плазме у людей». Атеросклероз . 191 (1): 63–72. DOI : 10.1016 / j.atherosclerosis.2006.05.032 . PMID 16806233 .
Ладен Б.П., Тан Й., Портер Т.Д. (февраль 2000 г.). «Клонирование, гетерологичная экспрессия и ферментологическая характеристика скваленмонооксигеназы человека». Архивы биохимии и биофизики . 374 (2): 381–8. DOI : 10.1006 / abbi.1999.1629 . PMID 10666321 .
Helms MW, Kemming D, Pospisil H, Vogt U, Buerger H, Korsching E, Liedtke C, Schlotter CM, Wang A, Chan SY, Brandt BH (сентябрь 2008 г.). «Скваленэпоксидаза, расположенная на хромосоме 8q24.1, активируется при раке груди 8q + и указывает на плохой клинический исход при I и II стадии болезни» . Британский журнал рака . 99 (5): 774–80. DOI : 10.1038 / sj.bjc.6604556 . PMC 2528137 . PMID 18728668 .
Нагай М., Сакакибара Дж., Накамура Ю., Геджио Ф., Оно Т. (июль 2002 г.). «SREBP-2 и NF-Y участвуют в регуляции транскрипции скваленэпоксидазы». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 295 (1): 74–80. DOI : 10.1016 / S0006-291X (02) 00623-X . PMID 12083769 .
Лю И, Сун В., Чжан К., Чжэн Х, Ма И, Линь Д., Чжан Х, Фенг Л., Лей В., Чжан З., Го С., Хан Н, Тонг В., Фенг Х, Гао И, Ченг С. (июнь 2007 г. ). «Идентификация генов, дифференциально экспрессируемых в первичной плоскоклеточной карциноме легких человека». Рак легких . 56 (3): 307–17. DOI : 10.1016 / j.lungcan.2007.01.016 . PMID 17316888 .
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Лу И, Долле М.Э., Имхольц С., Ван 'т Слот Р., Вершурен В.М., Вейменга С., Фескенс Э. Дж., Бур Дж. М. (декабрь 2008 г.). «Множественные генетические варианты вдоль возможных путей влияют на концентрацию холестерина липопротеинов высокой плотности в плазме» . Журнал липидных исследований . 49 (12): 2582–9. DOI : 10,1194 / jlr.M800232-JLR200 . PMID 18660489 .
Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D415-8. DOI : 10.1093 / NAR / gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 .
Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. DOI : 10.1101 / gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Накамура Ю., Сакакибара Дж., Изуми Т., Шибата А., Оно Т. (апрель 1996 г.). «Регуляция транскрипции скваленэпоксидазы стеринами и ингибиторами в клетках HeLa» . Журнал биологической химии . 271 (14): 8053–6. DOI : 10.1074 / jbc.271.14.8053 . PMID 8626488 .
Нагаи М., Сакакибара Дж., Вакуи К., Фукусима Ю., Игараси С., Цудзи С., Аракава М., Оно Т. (август 1997 г.). «Локализация гена скваленэпоксидазы (SQLE) в области хромосомы человека 8q24.1». Геномика . 44 (1): 141–3. DOI : 10.1006 / geno.1997.4825 . PMID 9286711 .
Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геномные исследования . 14 (10B): 2136–44. DOI : 10.1101 / gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
Внешние ссылки [ править ]
Сквален + монооксигеназа в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
