Белок, связывающий промотор Squamosa

Эта статья может быть слишком технической, чтобы ее могло понять большинство читателей . Пожалуйста, помогите улучшить его, чтобы он был понятен неспециалистам , не удаляя технические детали. ( Август 2012 г. ) ( Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения )

SBP

Структура раствора ДНК-связывающего домена промотора Squamosa, связывающего белок-подобный 4

Идентификаторы

Условное обозначение

SBP

Pfam

PF03110

ИнтерПро

IPR004333

PROSITE

PDOC00798

SCOP2

2lao / SCOPe / SUPFAM

TCDB

3.A.1

Доступные белковые структуры:
Pfam	структуры / ECOD
PDB	RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsum	краткое изложение структуры

Семейство факторов транскрипции, относящееся к семейству факторов транскрипции, связанных с промотором SQUAMOSA, связывающим белок ( SBP или SPL ) , определяется специфичным для растений ДНК-связывающим доменом . Член-основатель семейства был идентифицирован на основании его специфического связывания in vitro с промотором гена SQUAMOSA львиного зева. ^[1] Белки SBP считаются активаторами транскрипции.

Функция [ править ]

Белки SPB играют роль в развитии листьев, изменении вегетативной фазы , развитии цветов и плодов, архитектуре растений, спорогенезе, передаче сигналов гибберелевой кислоты и ответе на токсины. ^[2]

Структура [ править ]

Домен содержит 10 консервативных цистеина и гистидиновых остатков , которые , вероятно , являются цинк лиганды . Домен SBP - это высококонсервативный ДНК-связывающий домен. Он имеет длину примерно 80 аминокислот и содержит мотив цинкового пальца с двумя сайтами связывания цинка: Cys-Cys-His-Cys и Cys-Cys-Cys-His. Он имеет трехцепочечный антипараллельный бета-лист . ^[3]

Ссылки [ править ]

^ Клейн Дж, Saedler Н, Huijser Р (январь 1996). «Новое семейство ДНК-связывающих белков включает предполагаемые регуляторы транскрипции гена идентичности цветочной меристемы Antirrhinum majus SQUAMOSA». Мол. Genet Genet . 250 (1): 7–16. DOI : 10.1007 / bf02191820 . PMID 8569690 . S2CID 20915344 .
Перейти ↑ Chen X, Zhang Z, Liu D, Zhang K, Li A, Mao L (2010). «Белковые факторы транскрипции, связывающие промотор SQUAMOSA: главные игроки роста и развития растений». J Integr Plant Biol . 52 (11): 946–51. DOI : 10.1111 / j.1744-7909.2010.00987.x . PMID 20977652 .
^ Ямасаки К., Кигава Т., Иноуэ М., Татено М., Ямасаки Т., Ябуки Т. и др. (2004). «Новый цинк-связывающий мотив, обнаруженный с помощью структур раствора ДНК-связывающих доменов транскрипционных факторов семейства SBP Arabidopsis». J Mol Biol . 337 (1): 49–63. DOI : 10.1016 / j.jmb.2004.01.015 . PMID 15001351 .

Внешние ссылки [ править ]

Семейство SBP в PlantTFDB: База данных факторов транскрипции растений

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR004333

Эта статья по молекулярной биологии - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid8569690-1] Клейн Дж, Saedler Н, Huijser Р (январь 1996). «Новое семейство ДНК-связывающих белков включает предполагаемые регуляторы транскрипции гена идентичности цветочной меристемы Antirrhinum majus SQUAMOSA». Мол. Genet Genet . 250 (1): 7–16. DOI : 10.1007 / bf02191820 . PMID 8569690 . S2CID 20915344 .

[pmid20977652-2] Перейти ↑ Chen X, Zhang Z, Liu D, Zhang K, Li A, Mao L (2010). «Белковые факторы транскрипции, связывающие промотор SQUAMOSA: главные игроки роста и развития растений». J Integr Plant Biol . 52 (11): 946–51. DOI : 10.1111 / j.1744-7909.2010.00987.x . PMID 20977652 .

[pmid15001351-3] Ямасаки К., Кигава Т., Иноуэ М., Татено М., Ямасаки Т., Ябуки Т. и др. (2004). «Новый цинк-связывающий мотив, обнаруженный с помощью структур раствора ДНК-связывающих доменов транскрипционных факторов семейства SBP Arabidopsis». J Mol Biol . 337 (1): 49–63. DOI : 10.1016 / j.jmb.2004.01.015 . PMID 15001351 .

[1]