Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлен с вируса Судан )
Перейти к навигации Перейти к поиску

Суданский эболавирус
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство :Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Негарнавирикота
Класс:Monjiviricetes
Заказ:Mononegavirales
Семья:Filoviridae
Род:Эболавирус
Разновидность:
Суданский эболавирус
Вирус участника

Суданский вирус (SUDV)

Виды ebolavirus Судана является вирусологическим таксоном включен в роде Ebolavirus , семейный Filoviridae , порядок Mononegavirales . Разновидность имеет один вирус элемент, вирус Судан (SUDV). [1] Представители этого вида называются суданскими эболавирусами. [1]

Номенклатура [ править ]

Название Sudan ebolavirus происходит от Судана (страны, в которой был впервые обнаружен суданский вирус) и таксономического суффикса ebolavirus (который обозначает вид эболавируса). [1]

Этот вид был интродуцирован в 1998 году как суданский вирус Эбола . [2] [3] В 2002 году название было изменено на Суданский эболавирус . [4] [5]

Вирус рода Ebolavirus является членом вида Sudan ebolavirus, если: [1]

  • это эндемик в Судане и / или Уганде.
  • у него есть геном с тремя перекрытиями генов ( VP35 / VP40 , GP / VP30 , VP24 / L )
  • его геномная последовательность отличается от вируса Эбола на ≥30%, но отличается от последовательности суданского вируса на <30%.

Суданский вирус (SUDV) - один из шести известных вирусов рода Ebolavirus и один из четырех вирусов , вызывающих болезнь, вызванную вирусом Эбола (БВВЭ), у людей и других приматов ; это единственный представитель вида Sudan ebolavirus . SUDV является избранным агентом , патоген Всемирной организации здравоохранения группы риска 4 (требующий защиты, эквивалентной четвертому уровню биобезопасности ), Национальные институты здравоохранения / Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний, приоритетный патоген категории A, Центры по контролю и профилактике заболеваний, Категория A, биотеррористический агент, и внесен в список в качестве биологического агента экспортного контроля Австралийской группой .

Первая известная вспышка БВВЭ произошла из-за суданского вируса в Южном Судане в период с июня по ноябрь 1976 г., заразив 284 человека и убив 151 человека, причем первый идентифицируемый случай произошел 27 июня 1976 г. [6] [7] [8]

Использование термина [ править ]

Суданский вирус (сокращенно SUDV) был впервые описан в 1977 году. [9] Это единственный представитель вида Sudan ebolavirus , который входит в род Ebolavirus , семейство Filoviridae , отряд Mononegavirales . [1] Название «Суданский вирус» происходит от названия Южного Судана (где он был впервые обнаружен до отделения Южного Судана от Судана [10] ) и таксономического суффикса вируса .

Предыдущие обозначения [ править ]

Суданский вирус был впервые представлен как новый «штамм» вируса Эбола в 1977 году. [9] Суданский вирус был описан как «геморрагическая лихорадка Эбола» в отчете ВОЗ 1978 года, описывающем вспышку в Судане в 1976 году. [11] В 2000 году он получил обозначение Суданский вирус Эбола [12] [13], а в 2002 году название было изменено на Суданский эболавирус. [4] [5] Предыдущие сокращения для вируса были EBOV-S (для вируса Эбола в Судане), а совсем недавно - SEBOV (для суданского вируса Эбола или суданского эболавируса). Окончательное название вирус получил в 2010 году, когда его переименовали в Суданский вирус (SUDV). [1]

Критерии включения вирусов [ править ]

Вирус вида Sudan ebolavirus является суданским вирусом (SUDV), если он обладает свойствами суданских эболавирусов и если его геном отличается от генома прототипа суданского вируса, варианта суданского вируса Boniface (SUDV / Bon), на ≤10% при нуклеотид уровень. [1]

Болезнь [ править ]

SUDV - один из четырех эболавирусов, вызывающих у людей болезнь, вызванную вирусом Эбола (БВВЭ) (в литературе также часто упоминается как геморрагическая лихорадка Эбола, EHF). БВВЭ, вызванный инфекцией SUDV, нельзя отличить от БВВЭ, вызванной другими эболавирусами, только на основании клинических наблюдений, поэтому клинические проявления и патология инфекций, вызванных всеми эболавирусами, представлены вместе на отдельной странице (см. Болезнь, вызванная вирусом Эбола ). В прошлом SUDV вызывал следующие вспышки БВВЭ: [ необходима цитата ]

Эбола вирусное заболевание (EVD) вспышки из - за вируса Судан (SUDV инфекция)
ГодГеографическое положениеСлучаи / смерти среди людей (летальность)
1976 г.Джуба , Мариди , Нзара и Тембура, Южный Судан284/151 (53%)
1979 г.Нзара , Южный Судан34/22 (65%)
2000–2001Районы Гулу , Мбарара и Масинди , Уганда425/224 (53%)
2004 г.Округ Ямбио, Южный Судан17/7 (41%)
2011 г.Округ Лувиро , Уганда1/1 (100%)
2014 г.Экваториальная , Конго [14]0/1 * два штамма, один Судан и один Судан / Заир гибрид на 24.08.2014 (0%)

Исследование [ править ]

Агентство общественного здравоохранения Канады разработало вакцину-кандидат от rVSV против суданского эболавируса ( rVSV-SUDV ). Merck разрабатывал его, но прекратил разработку. [15]

Экология [ править ]

Экология SUDV в настоящее время неясна, и ни один резервуар-хозяин еще не идентифицирован. Таким образом, остается неясным, как SUDV неоднократно вводился в человеческие популяции. Предполагается, что летучие мыши являются носителями вируса, поскольку от летучих мышей был выделен инфекционный вирус Марбург (MARV), отдаленно родственный филовирус [16], а также потому, что были обнаружены следы (но не инфекционные частицы) более близкого вируса Эбола (EBOV). у летучих мышей тоже. [17]

Молекулярная биология [ править ]

SUDV в основном не охарактеризован на молекулярном уровне. Однако его геномная последовательность, а вместе с ней и геномная организация и сохранение индивидуальных открытых рамок считывания аналогичны таковой у других четырех известных эболавирусов. Поэтому в настоящее время предполагается, что знания, полученные для EBOV, могут быть экстраполированы на SUDV и что все белки SUDV ведут себя аналогично белкам EBOV . [ необходима цитата ]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c d e f g Kuhn, Jens H .; Беккер, Стефан; Эбихара, Хидеки; Geisbert, Thomas W .; Джонсон, Карл М .; Каваока, Ёсихиро; Липкин, В. Ян; Негредо, Ана I; и другие. (2010). «Предложение по пересмотренной таксономии семейства Filoviridae: классификация, названия таксонов и вирусов, а также сокращения вирусов» . Архив вирусологии . 155 (12): 2083–103. DOI : 10.1007 / s00705-010-0814-х . PMC  3074192 . PMID  21046175 .
  2. ^ Нетесов, С.В. Feldmann, H .; Ярлинг, ПБ; Кленк, HD; Санчес, А. (2000). «Семейство Filoviridae». In van Regenmortel, MHV; Fauquet, CM; Бишоп, DHL; Карстенс, Э.Б. Estes, MK; Лимон, СМ; Maniloff, J .; Мэйо, Массачусетс; МакГеоч, диджей; Pringle, CR; Викнер, РБ (ред.). Таксономия вирусов - седьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов . Сан-Диего, США: Academic Press. С. 539–48. ISBN 978-0-12-370200-5.
  3. Перейти ↑ Pringle, CR (1998). «Таксономия вирусов - Сан-Диего 1998». Архив вирусологии . 143 (7): 1449–59. DOI : 10.1007 / s007050050389 . PMID 9742051 . S2CID 13229117 .  
  4. ^ a b Feldmann, H .; Geisbert, TW; Ярлинг, ПБ; Klenk, H.-D .; Нетесов С.В.; Питерс, CJ; Sanchez, A .; Swanepoel, R .; Волчков, В.Е. (2005). «Семейство Filoviridae». In Fauquet, CM; Мэйо, Массачусетс; Maniloff, J .; Desselberger, U .; Болл, Лос-Анджелес (ред.). Таксономия вирусов - восьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов . Сан-Диего, США: Elsevier / Academic Press. С. 645–653. ISBN 978-0-12-370200-5{{несогласованные цитаты}}CS1 maint: postscript ( ссылка )
  5. ^ а б Мэйо, Массачусетс (2002). «ICTV на парижском ICV: результаты пленарного заседания и биномиального голосования». Архив вирусологии . 147 (11): 2254–60. DOI : 10.1007 / s007050200052 . S2CID 43887711 . 
  6. ^ «Геморрагическая лихорадка Эбола в Судане, 1976» (PDF) . Архивировано из оригинального (PDF) 13 октября 2014 года.
  7. ^ Feldmann, H .; Гейсберт, TW (2011). «Геморрагическая лихорадка Эбола» . Ланцет . 377 (9768): 849–862. DOI : 10.1016 / S0140-6736 (10) 60667-8 . PMC 3406178 . PMID 21084112 .  
  8. ^ Hoenen Т, Groseth А, Фельдман Н (июль 2012). «Современные вакцины против Эболы» . Экспертное мнение Biol Ther . 12 (7): 859–72. DOI : 10.1517 / 14712598.2012.685152 . PMC 3422127 . PMID 22559078 .  
  9. ^ а б Боуэн, ETW; Lloyd, G .; Харрис, WJ; Platt, GS; Baskerville, A .; Велла, EE (1977). «Вирусная геморрагическая лихорадка в южном Судане и северном Заире, предварительные исследования этиологического агента». Ланцет . 309 (8011): 571–3. DOI : 10.1016 / s0140-6736 (77) 92001-3 . PMID 65662 . S2CID 3092094 .  
  10. ^ Нзар, Южный Судан
  11. ^ «Дом» (PDF) . Архивировано из оригинального (PDF) 13 октября 2014 года . Проверено 11 февраля 2015 года .
  12. ^ Нетесов, С.В. Feldmann, H .; Ярлинг, ПБ; Кленк, HD; Санчес, А. (2000). «Семейство Filoviridae». In van Regenmortel, MHV; Fauquet, CM; Бишоп, DHL; Карстенс, Э.Б. Estes, MK; Лимон, СМ; Maniloff, J .; Мэйо, Массачусетс; МакГеоч, диджей; Pringle, CR; Викнер, РБ (ред.). Таксономия вирусов - седьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов . Сан-Диего, США: Academic Press. С. 539–48. ISBN 978-0-12-370200-5{{несогласованные цитаты}}CS1 maint: postscript ( ссылка )
  13. Перейти ↑ Pringle, CR (1998). «Таксономия вирусов - Сан-Диего 1998». Архив вирусологии . 143 (7): 1449–59. DOI : 10.1007 / s007050050389 . PMID 9742051 . S2CID 13229117 .  
  14. ^ «Вспышка Эболы: ДР Конго подтверждает два случая смерти» . BBC. 24 августа 2014 г.
  15. ^ «Ответ MSF на политику CEPI в отношении равного доступа» . Кампания "Врачи без границ" .При разработке вакцины важен доступ к ноу-хау. Знания и опыт, включая, помимо прочего, методы очистки, клеточные линии, материалы, программные коды и их передачу альтернативным производителям в случае, если победитель прекращает разработку многообещающей вакцины, критически важны. Ярким тому примером является недавний отказ компании Merck от разработки вакцин против rVSV для Марбурга (rVSV-MARV) и для Судана-Эбола (rVSV-SUDV). Компания Merck продолжает сохранять жизненно важные ноу-хау на платформе rVSV, поскольку она разработала вакцину rVSV для Заир-Эбола (rVSV-ZEBOV) при финансовой поддержке ГАВИ. Хотя оно передало права на эти вакцины обратно Агентству общественного здравоохранения Канады,не существует механизма для обмена ноу-хау на платформе rVSV с другими разработчиками вакцин, которые хотели бы также использовать rVSV в качестве вектора против других патогенов.
  16. ^ Towner, JS; Амман, Бразилия; Сили, ТЗ; Кэрролл, ЮАР; Comer, JA; Kemp, A .; Swanepoel, R .; Paddock, CD; Балинанди, С .; Христова, М.Л .; Форменты, ПБ; Альбарино, CG; Миллер, DM; Рид, ЗД; Kayiwa, JT; Миллс, JN; Пушка, DL; Грир, П. В.; Byaruhanga, E .; Фарнон, ЕС; Atimnedi, P .; Okware, S .; Катонголе-Мбидде, Э .; Даунинг, Р.; Tappero, JW; Заки, SR; Ксязек, Т.Г .; Николай, СТ; Роллин, ЧП (2009). Фушье, Рон А.М. (ред.). «Выделение генетически разнообразных вирусов Марбург из египетских плодовых летучих мышей» . PLOS Патогены . 5 (7): e1000536. DOI : 10.1371 / journal.ppat.1000536 . PMC 2713404 . PMID  19649327 .
  17. ^ Лерой, EM; Kumulungui, B .; Pourrut, X .; Rouquet, P .; Хассанин, А .; Yaba, P .; Délicat, A .; Павеска, JT; Gonzalez, JP; Свейнпол, Р. (2005). «Летучие мыши как резервуары вируса Эбола». Природа . 438 (7068): 575–576. Bibcode : 2005Natur.438..575L . DOI : 10.1038 / 438575a . PMID 16319873 . S2CID 4403209 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • Файлы и обсуждения ICTV - дискуссионный форум и распространение файлов для Международного комитета по таксономии вирусов