Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Для семейства рибопереключателей см. Лидер Т-образной коробки .
Чтобы узнать о терминологии информатики, см. Tbox .
Т-образная коробка
1H6F.png
Кристаллографическая структура димера белка TBX3 (голубой и зеленый) в комплексе с ДНК (коричневый) на основе координат PDB : 1h6f .
Идентификаторы
СимволТ-образная коробка
PfamPF00907
ИнтерПроIPR001699
PROSITEPS50252
SCOP21xbr / SCOPe / SUPFAM
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumкраткое изложение структуры
PDB1h6f , 1xbr

Т-бокс относится к группе факторов транскрипции, участвующих в развитии конечностей и сердца эмбриона . [1] Каждый белок Т-бокса имеет относительно большой ДНК-связывающий домен, обычно составляющий около трети всего белка, который необходим и достаточен для связывания ДНК, специфичной для последовательности. Все члены семейства генов Т-бокса связываются с «Т-боксом», консенсусной последовательностью ДНК TCACACCT. [2]

Мутации в первой обнаруженной мутации вызывали короткие хвосты у мышей, и поэтому кодируемый белок был назван brachyury , что по-гречески означает «короткий хвост». У мышей этот ген называют «Т», а у людей - «ТВХТ». [3] [4] Brachyury был обнаружен у всех двунаправленных животных, прошедших скрининг, а также присутствует у cnidaria . [5]

Ген T мыши был клонирован [6] и доказал, что brachyury является фактором транскрипции ядра эмбриона с 436 аминокислотами . Brachyury связывается с Т-боксом через область на его N-конце.

Белковая активность [ править ]

Кодируемые белки Tbx5 и Tbx4 играют роль в развитии конечностей и, в частности, играют главную роль в инициации зачатков конечностей . [7] Например, у цыплят Tbx4 указывает состояние задних конечностей, а Tbx5 указывает состояние передних конечностей. [8] Активация этих белков генами Hox инициирует сигнальные каскады, которые включают сигнальный путь Wnt и сигналы FGF в зачатках конечностей. [7] В конечном итоге Tbx4 и Tbx5 приводят к развитию апикального эктодермального гребня (AER).и центры передачи сигналов зоны поляризующей активности (ZPA) в развивающейся зачатке конечности, которые определяют ориентацию роста развивающейся конечности. [7] Вместе Tbx5 и Tbx4 играют определенную роль в формировании паттерна мягких тканей (мышц и сухожилий) опорно - двигательного аппарата. [9]

Дефекты [ править ]

У людей и некоторых других животных дефекты экспрессии гена TBX5 ответственны за синдром Холта-Орама , который характеризуется по крайней мере одной аномальной костью запястья . Почти всегда поражаются другие кости руки, хотя степень тяжести может варьироваться в широких пределах, от полного отсутствия кости до только уменьшения длины кости. [10] [11] Семьдесят пять процентов пострадавших лиц также имеют дефектов сердца , чаще всего нет никакого разделения между левым и правым желудочком в сердце . [12]

TBX3 связан с локтевым и молочным синдромом у людей, но также отвечает за наличие или отсутствие серовато-коричневого цвета у лошадей и не имеет вредных эффектов, выраженных или нет. [13]

Гены Т-бокса [ править ]

Гены, кодирующие белки Т-бокса, включают:

  • TBXT ( TBXT ) первый обнаруженный (у мышей)
  • TBR1 ( TBR1 )
  • TBX1 ( TBX1 )
  • TBX2 ( TBX2 )
  • TBX3 ( TBX3 )
  • TBX4 ( TBX4 )
  • TBX5 ( TBX5 )
  • TBX6 ( TBX6 )
  • TBX10 ( TBX10 )
  • TBX15 ( TBX15 )
  • TBX18 ( TBX18 )
  • TBX19 ( TBX19 )
  • TBX20 ( TBX20 )
  • TBX21 ( TBX21 )
  • TBX22 ( TBX22 )

См. Также [ править ]

  • Брачуры , первый найденный
  • Homeobox
  • Гены развития растений: G-box , I-box , W-box , Z-box.

Ссылки [ править ]

  1. Перейти ↑ Wilson V, Conlon FL (2002). «Семейство Т-образных коробок» . Геномная биология . 3 (6): ОБЗОРЫ 3008. DOI : 10.1186 / GB-2002-3-6-reviews3008 . PMC  139375 . PMID  12093383 .
  2. ^ Мюллер, CW; Herrmann, BG (23 октября 1997 г.). «Кристаллографическая структура комплекса Т-домен-ДНК фактора транскрипции Brachyury». Природа . 389 (6653): 884–8. Bibcode : 1997Natur.389..884M . DOI : 10.1038 / 39929 . PMID 9349824 . S2CID 13138577 .  
  3. ^ «Энтрез Джин: Т» .
  4. ^ Эдвардс YH, Putt W, Lekoape KM, Stott D, Fox M, Hopkinson DA, Sowden J (март 1996). «Человеческий гомолог T гена T (Brachyury) мыши; структура гена, последовательность кДНК и отнесение к хромосоме 6q27» . Геномные исследования . 6 (3): 226–33. DOI : 10.1101 / gr.6.3.226 . PMID 8963900 . 
  5. ^ Scholz CB, Технау U (январь 2003). «Предковая роль Brachyury: экспрессия NemBra1 в базальных книдариях Nematostella vectensis (Anthozoa)». Гены развития и эволюция . 212 (12): 563–70. DOI : 10.1007 / s00427-002-0272-х . PMID 12536320 . S2CID 25311702 .  
  6. ^ Herrmann BG, Labeit S, Poustka A, король TR, Lehrach H (февраль 1990). «Клонирование гена Т, необходимое для образования мезодермы у мышей». Природа . 343 (6259): 617–22. Bibcode : 1990Natur.343..617H . DOI : 10.1038 / 343617a0 . PMID 2154694 . S2CID 4365020 .  
  7. ^ a b c Tickle C (октябрь 2015 г.). «Как эмбрион делает конечность: определение, полярность и идентичность» . Журнал анатомии . 227 (4): 418–30. DOI : 10.1111 / joa.12361 . PMC 4580101 . PMID 26249743 .  
  8. ^ Родригес-Эстебан С, Т Tsukui, Yonei S, Magallon Дж, Тамура К, Izpisua Бельмонте JC (апрель 1999 г.). «Гены Т-бокса Tbx4 и Tbx5 регулируют рост и идентичность конечностей». Природа . 398 (6730): 814–8. Bibcode : 1999Natur.398..814R . DOI : 10,1038 / 19769 . PMID 10235264 . S2CID 4330287 .  
  9. ^ Hasson P, DeLaurier A, M Bennett, Григорьевой E, Нейч Л.А., Papaioannou В.Е., Mohun TJ, Logan MP (январь 2010). «Tbx4 и tbx5, действующие в соединительной ткани, необходимы для формирования рисунка мышц конечностей и сухожилий» . Клетка развития . 18 (1): 148–56. DOI : 10.1016 / j.devcel.2009.11.013 . PMC 3034643 . PMID 20152185 .  
  10. ^ "Синдром Холта-Орама" . Домашний справочник по генетике . Национальная медицинская библиотека США. Июнь 2014 . Проверено 18 апреля 2018 года .
  11. ↑ McDermott DA, Fong JC, Basson CT. Синдром Холта-Орама. 20 июля 2004 г. [Обновлено 8 октября 2015 г.]. В редакциях Adam MP, Ardinger HH, Pagon RA и др. GeneReviews® [Интернет]. Сиэтл (Вашингтон): Вашингтонский университет, Сиэтл; 1993-2018 гг. Доступно по адресу : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1111/
  12. ^ Боссерт, Т; Вальтер, Т; Гуммерт, Дж; Hubald, R; Костелка, М; Мор, FW (октябрь 2002 г.). «Пороки развития сердца, связанные с синдромом Холта-Орама - отчет о семье и обзор литературы». Торакальный и сердечно-сосудистый хирург . 50 (5): 312–4. DOI : 10,1055 / с-2002-34573 . PMID 12375192 . 
  13. ^ Имсланд Ф., Макгоуэн К., Рубин С.Дж., Хенегар С., Сундстрём Э., Берглунд Дж. И др. (Февраль 2016 г.). «Регуляторные мутации в TBX3 нарушают асимметричную пигментацию волос, которая лежит в основе камуфляжного цвета Дун у лошадей» . Генетика природы . 48 (2): 152–8. DOI : 10.1038 / ng.3475 . PMC 4731265 . PMID 26691985 . Краткое содержание - Science Daily .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Мейслер MH (1997). «Наблюдение за мутациями: мышиные brachyury (T), семейство генов T-box и человеческие заболевания» . Геном млекопитающих . 8 (11): 799–800. DOI : 10.1007 / s003359900581 . ЛВП : 2027,42 / 42140 . PMID  9337389 . S2CID  12617264 .

Внешние ссылки [ править ]

  • T-Box + домен + белки в предметных заголовках медицинской тематики Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)


  • v
  • т
  • е