Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
TINF2
Белок TINF2 PDB 3BQO.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

3BQO , 3BU8

Идентификаторы
ПсевдонимыTINF2 , DKCA3, TIN2, TERF1 взаимодействующий ядерный фактор 2
Внешние идентификаторыOMIM: 604319 MGI: 107246 ГомолоГен: 8264 Генные карты : TINF2
Расположение гена (человек)
Хромосома 14 (человек)
Chr.Хромосома 14 (человека) [1]
Хромосома 14 (человек)
Геномное местоположение для TINF2
Геномное местоположение для TINF2
Группа14q12Начинать24 239 643 п.н. [1]
Конец24 242 674 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 14 (мышь)
Chr.Хромосома 14 (мышь) [2]
Хромосома 14 (мышь)
Геномное местоположение для TINF2
Геномное местоположение для TINF2
Группа14 C3 | 14 28,19 смНачинать55 674 689 п.н. [2]
Конец55 681 820 п.н. [2]
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание ДНК
• теломер ДНК связывания
• GO: 0001948 связывание белка
Сотовый компонент• ядерный комплекс крышки теломер
• ядерный матрикс
• перинуклеолярный хромоцентр
• нуклеоплазма
• хромосома
• шелтерин
• хромосома, теломерная область
• ядерная хромосома, теломерная область
• ядро клетки
• ядерное тело
Биологический процесс• локализация белка хромосом, теломерном области
• негативная регуляция пролиферации эпителиальных клеток
• теломеры сборки
• отрицательное регулирование белка АДФ-рибозилирование
• теломеры укупорки
• отрицательное регулирование теломер обслуживания через теломеразы
• регулирование теломер обслуживания с помощью удлинения теломер
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

26277

28113

Ансамбль

ENSG00000092330
ENSG00000284915

ENSMUSG00000007589

UniProt

Q9BSI4

Q9QXG9
Q8K1K3

RefSeq (мРНК)

NM_001099274
NM_012461
NM_001363668

NM_145705

RefSeq (белок)

NP_001092744
NP_036593
NP_001350597

NP_663751

Расположение (UCSC)Chr 14: 24.24 - 24.24 МбChr 14: 55.67 - 55.68 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

TERF1 взаимодействующие ядерный фактор 2 представляют собой белка , который у человека кодируется TINF2 геном . [5] [6] TIN2 является компонентом shelterin белкового комплекса , найденного в конце теломеров . [7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что TINF2 взаимодействует с ACD , [8] [9] POT1 [8] [9] [10] и TERF1 . [5] [9] [11]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c ENSG00000284915 GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000092330, ENSG00000284915 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000007589 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b Ким SH, Каминкер П., Кампизи Дж. (декабрь 1999 г.). «TIN2 - новый регулятор длины теломер в клетках человека» . Генетика природы . 23 (4): 405–12. DOI : 10.1038 / 70508 . PMC 4940194 . PMID 10581025 .  
  6. ^ «Энтрез Ген: TINF2 TERF1 (TRF1) -взаимодействующий ядерный фактор 2» .
  7. ^ Savage SA, Гири N, Baerlocher GM, Орр N, Лэнсдорп PM, Alter BP (февраль 2008). «TINF2, компонент комплекса защиты теломер шелтерина, мутирует при врожденном дискератозе» . Американский журнал генетики человека . 82 (2): 501–9. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2007.10.004 . PMC 2427222 . PMID 18252230 .  
  8. ^ Б Е. JZ, Hockemeyer D, Крутчинский А.Н., Лоайса D, Хупер С.М., Хаит BT, де Ланге T (Июль 2004). «POT1-взаимодействующий белок PIP1: регулятор длины теломер, который рекрутирует POT1 в комплекс TIN2 / TRF1» . Гены и развитие . 18 (14): 1649–54. DOI : 10,1101 / gad.1215404 . PMC 478187 . PMID 15231715 .  
  9. ^ a b c Лю Д., Сафари А., О'Коннор М.С., Чан Д.В., Лэгелер А., Цинь Дж., Сунъян З. (июль 2004 г.). «PTOP взаимодействует с POT1 и регулирует его локализацию в теломерах». Природа клеточной биологии . 6 (7): 673–80. DOI : 10.1038 / ncb1142 . PMID 15181449 . 
  10. ^ Loayza D, De Lange T (июнь 2003). «POT1 как конечный преобразователь контроля длины теломер TRF1». Природа . 423 (6943): 1013–8. DOI : 10,1038 / природа01688 . PMID 12768206 . 
  11. ^ Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E, Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W., Lehrach H, Wanker EE (сентябрь 2005 г.). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома» . Cell . 122 (6): 957–68. DOI : 10.1016 / j.cell.2005.08.029 . PMID 16169070 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Ли Б., Эстрайх С., де Ланге Т. (май 2000 г.). «Идентификация человеческого Rap1: значение для эволюции теломер» . Cell . 101 (5): 471–83. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80858-2 . PMID  10850490 .
  • Миньон-Равикс С., Депетрис Д., Делобель Б., Крокетт М.Ф., Маттей М.Г. (февраль 2002 г.). «Интерстициальные теломеры человека связываются in vivo со специфическими белками TRF2 и TIN2» . Европейский журнал генетики человека . 10 (2): 107–12. DOI : 10.1038 / sj.ejhg.5200775 . PMID  11938440 .
  • Ямада М., Цудзи Н., Накамура М., Мориаи Р., Кобаяши Д., Ягихаши А., Ватанабэ Н. (2003). «Подавление генов TRF1, TRF2 и TIN2 важно для поддержания теломерной ДНК при раке желудка». Противораковые исследования . 22 (6A): 3303–7. PMID  12530079 .
  • Лоайза Д., Де Ланге Т. (июнь 2003 г.). «POT1 как конечный преобразователь контроля длины теломер TRF1». Природа . 423 (6943): 1013–8. DOI : 10,1038 / природа01688 . PMID  12768206 .
  • Kim SH, Han S, You YH, Chen DJ, Campisi J (июль 2003 г.). «Человеческий теломерный белок TIN2 стимулирует взаимодействия между теломерными участками ДНК in vitro» . EMBO Reports . 4 (7): 685–91. DOI : 10.1038 / sj.embor.embor872 . PMC  1326318 . PMID  12835755 .
  • Лоайза Д., Парсонс Х., Донигиан Дж., Хок К., де Ланге Т. (март 2004 г.). «Особенности связывания ДНК человеческого POT1: нонамерный 5'-TAGGGTTAG-3 'минимальный сайт связывания, специфичность последовательности и внутреннее связывание с мультимерными сайтами» . Журнал биологической химии . 279 (13): 13241–8. DOI : 10.1074 / jbc.M312309200 . PMID  14715659 .
  • Ye JZ, de Lange T. (июнь 2004 г.). «TIN2 является модулятором PARP танкиразы 1 в комплексе контроля длины теломер TRF1» . Генетика природы . 36 (6): 618–23. DOI : 10.1038 / ng1360 . PMID  15133513 .
  • Лю Д., Сафари А., О'Коннор М.С., Чан Д.В., Лэгелер А., Цинь Дж., Сунъян З. (июль 2004 г.). «PTOP взаимодействует с POT1 и регулирует его локализацию в теломерах». Природа клеточной биологии . 6 (7): 673–80. DOI : 10.1038 / ncb1142 . PMID  15181449 .
  • Ye JZ, Hockemeyer D, Krutchinsky AN, Loayza D, Hooper SM, Chait BT, de Lange T (июль 2004 г.). «POT1-взаимодействующий белок PIP1: регулятор длины теломер, который рекрутирует POT1 в комплекс TIN2 / TRF1» . Гены и развитие . 18 (14): 1649–54. DOI : 10,1101 / gad.1215404 . PMC  478187 . PMID  15231715 .
  • Kim SH, Beausejour C, Davalos AR, Kaminker P, Heo SJ, Campisi J (октябрь 2004 г.). «TIN2 опосредует функции TRF2 на теломерах человека» . Журнал биологической химии . 279 (42): 43799–804. DOI : 10.1074 / jbc.M408650200 . PMID  15292264 .
  • Е Дж. З., Донигиан Дж. Р., ван Овербек М., Лоайза Д., Луо Й., Крутчинский А. Н., Чайт Б. Т., де Ланге Т. (ноябрь 2004 г.). «TIN2 связывает TRF1 и TRF2 одновременно и стабилизирует комплекс TRF2 на теломерах» . Журнал биологической химии . 279 (45): 47264–71. DOI : 10.1074 / jbc.M409047200 . PMID  15316005 .
  • Лю Д., О'Коннор М.С., Цинь Дж., Сунъян З. (декабрь 2004 г.). «Телосома, комплекс, связанный с теломерами млекопитающих, образованный множеством теломерных белков» . Журнал биологической химии . 279 (49): 51338–42. DOI : 10.1074 / jbc.M409293200 . PMID  15383534 .
  • О, Б.К., Ким Ю.Дж., Пак Си, Пак И.Н. (январь 2005 г.). «Повышение регуляции теломер-связывающих белков, TRF1, TRF2 и TIN2 связано с укорочением теломер во время многоступенчатого гепатоканцерогенеза человека» . Американский журнал патологии . 166 (1): 73–80. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 62233-X . PMC  1602303 . PMID  15632001 .
  • Kaminker P, Plachot C, Kim SH, Chung P, Crippen D, Petersen OW, Bissell MJ, Campisi J, Lelièvre SA (март 2005 г.). «Ядерная организация высшего порядка в остановке роста эпителиальных клеток молочной железы человека: новая роль теломер-ассоциированного белка TIN2» . Журнал клеточной науки . 118 (Pt 6): 1321–30. DOI : 10,1242 / jcs.01709 . PMC  2933191 . PMID  15741234 .

Внешние ссылки [ править ]

  • GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о врожденном дискератозе
  • PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческого TERF1-взаимодействующего ядерного фактора 2 (TINF2)