Бурый Скалозуб , широко известный как японский Puffer , Тайгер Puffer или torafugu ( японский :虎河豚), является рыбу фугу в роде Takifugu . Он отличается очень маленьким геномом , который был полностью секвенирован из-за его использования в качестве модельного вида и широко используется в качестве эталона в геномике. [3]
Такифугу рубрипс | |
---|---|
Научная классификация | |
Королевство: | Animalia |
Тип: | Хордовые |
Класс: | Актиноптеригии |
Заказ: | Tetraodontiformes |
Семья: | Tetraodontidae |
Род: | Такифугу |
Разновидность: | T. rubripes |
Биномиальное имя | |
Такифугу рубрипс | |
Синонимы | |
|
Таксономия и этимология
Этот вид часто упоминается в литературе по геномике как Fugu rubripes . Род Fugu является синонимом предпочитаемого в настоящее время Takifugu . [4] Takifugu в переводе с японского означает фугу, а rubripes происходит от латинского ruber и pēs, что означает румяная ступня. [ необходима цитата ]
Распространение и среда обитания
Вид известен от Японского , Восточно-Китайского и Желтого морей к северу до южного Сахалина на глубинах 10–135 м (33–443 фута). Это придонный вид. Нерест происходит в эстуариях ; Молодые рыбы могут переносить широкий диапазон солености и остаются в устьях рек и лагунах, созревая в течение одного года, прежде чем навсегда мигрировать в открытый океан. [1]
Геном
Особенностью этого вида является то, что он имеет очень маленький геном , который используется в качестве «эталона» для идентификации генов и других элементов в геномах человека и других позвоночных. Геном был опубликован в 2002 году Международным консорциумом генома Fugu с помощью полногеномного секвенирования. Созданный в 1989 году, это был первый геном позвоночных после генома человека, который стал общедоступным. [5] Он остается одним из самых маленьких известных геномов позвоночных; его количество пар оснований составляет ~ 6%, а количество ранее известных генов, кодирующих белок, ~ 13% от человеческого генома, хотя количество хромосом (22) сравнимо с человеческим (23). Это делает его особенно полезным для сравнительных исследований. Текущие оценки показывают в общей сложности 392 376 244 пары оснований , 1138 известных и 18 093 новых гена, кодирующих белок , и 593 гена РНК . [6]
Токсичность
Как и некоторые другие иглобрюхи, некоторые органы японского иглобрюха содержат тетродотоксин и очень токсичны. Токсин сильно сконцентрирован в печени и яичниках, немного присутствует в кишечнике и плоти и отсутствует в коже и семенниках. [1]
Сохранение
Японский фугу классифицируется МСОП как находящийся под угрозой исчезновения . Это одна из самых ценных промысловых рыб в Японии, и хотя текущий улов (101 тонна / год в 2004 году, по сравнению с пиковым значением в 2000 тонн в 1987 году) невелик по сравнению с уловами многих других промысловых видов, таких как сардины и анчоусы , они кажутся неустойчивыми и препятствуют восстановлению вида после чрезмерной эксплуатации ранее. Ограничения орудий лова (большая часть уловов приходится на ярусный промысел ) и корректировка промысловых сезонов для защиты молоди были рекомендованы для содействия восстановлению. Вид широко выращивается в аквакультуре . [1]
Рекомендации
- ^ а б в г Шао, К., Лю, М., Цзин, Л., Харди, Г., Лейс, Дж. Л. и Мацуура, К. (2014). "Takifugu rubripes (японский иглобрюх)". Красный список видов, находящихся под угрозой исчезновения МСОП . 2014 : e.T193612A2247747. DOI : 10.2305 / IUCN.UK.2014-3.RLTS.T193612A2247747.en .CS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
- ^ «Стандартная страница отчета ITIS: Takifugu rubripes» . Itis.gov . 2004-05-13 . Проверено 5 мая 2016 .
- ^ Холмс, Боб (2018). «Мастер рассказчиков рыбных историй» . Известный журнал . DOI : 10,1146 / познаваем-050918-050001 .
- ^ Кейичи Мацуура (1990). «Род иглобрюхов Fugu Abe, 1952, младший субъективный синоним Takifugu Abe, 1949» . Бык. Natn. Sci. Mus., Tokyo, Ser. . 16 : 15–20.
- ^ «Проект генома фугу: IMCB, A * STAR, Сингапур» . www.fugu-sg.org . Архивировано из оригинала на 2001-10-26 . Проверено 5 декабря 2016 .
- ^ Кай, Ватару; Кикучи, Киёси; Тохари, Суманты; Chew, Ah Keng; Тай, Алиса; Фудзивара, Атуши; Хосоя, Шо; Суетакэ, Хироаки; Нарусэ, Киёси (01.01.2011). «Интеграция генетической карты и сборки генома Fugu облегчает понимание отличительных черт эволюции генома у костистых и млекопитающих» . Геномная биология и эволюция . 3 : 424–442. DOI : 10.1093 / GbE / evr041 . ISSN 1759-6653 . PMC 5654407 . PMID 21551351 .
Внешние ссылки
- Проект генома фугу
- Интерактивная карта сцепления хромосом
- Посмотреть геном фугу на Ensembl