Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Тетранатрий трис (дисульфонат батофенантролина) рутений (II)
Тетранатрий трис (дисульфонат батофенантролина) рутений (II) .png
Идентификаторы
ECHA InfoCard100.120.143 Отредактируйте это в Викиданных
Характеристики
C 72 H 42 N 6 Na 4 O 18 Ru S 6
Молярная масса1 664 0,54  г · моль -1
Если не указано иное, данные приведены для материалов в их стандартном состоянии (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
контрольныйY проверить  ( что есть   ?)контрольныйY☒N
Ссылки на инфобоксы

Тетранатрий трис (дисульфонат батофенантролина) рутений (II) (Na 4 Ru (bps) 3 ) представляет собой натриевую соль координационного соединения . В этой форме он представляет собой соль из сульфоновой кислоты . Это соединение является продолжением фенантролинового ряда координационных соединений. Трис (дисульфонат батофенантролина) рутения (II), относящийся к анионному фрагменту, используется в качестве белкового красителя в биохимии для дифференциации и обнаружения различных белков в лабораторных условиях.

В последние годы двумерный электрофорез получил широкое распространение в качестве стандартной процедуры разделения сложных белковых смесей в протеомных исследованиях ( протеомика ). Визуализация белков с помощью трис (батофентролин дисульфоната) рутения (II) стала прочно установленным и широко используемым методом протеомного анализа [1] [2] [3] [4] [5] [6] [7] [8] [9 ] ] [10] [11] [12] [13] [14] [15] [16] и важный шаг в профилировании экспрессии генов.

Для обнаружения белков выгодно использовать флуоресцентные метки, содержащие хромофоры, которые имеют большую длину волны возбуждения и длину волны излучения, чем ароматические аминокислоты . Красители, используемые на этом важном этапе, должны сочетать такие атрибуты, как хорошее отношение сигнала к фону (контраст), широкий линейный динамический диапазон, широкий диапазон применения, фотохимическая стабильность и совместимость с методами идентификации белков, например масс-спектрометрией (МС) или вестерн-блоттингом .

Первоначально, рутений комплекс переходного металла , рутений (II) , трис (4,7-дифенил-1,10-фенантролин дисульфонкислого) также называют как рутений (II) , трис ( bathophentroline дисульфонкислого ) ( RuBPS ) был синтезирован Bannwarth [17] , как молекула предшественника для красителя , который был использован в качестве нерадиоактивных меток для ольих нуклеотидов . [18] Позже Rabilloud et al. [19] использовали RuBPS в качестве флуоресцентной метки для обнаружения белков в полиакриламидных гелях . [20] Тот факт, что RuBPS не только легко синтезировать, но и легко обрабатывать, стимулировал дальнейшие разработки в этой области.

Ламанда и др. улучшил протокол окрашивания RuBPS , избирательно обесцвечивая полиакриламидную матрицу, в то время как содержание белка оставалось неизменным . Этот новый метод имел ряд преимуществ, таких как сильные сигналы, улучшенное соотношение сигнал / фон, лучшая линейность и улучшенное разрешение базовой линии. [21]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Миллер, I .; Crawford, J .; Джанацца, Э. (октябрь 2006 г.). «Белковые красители для протеомных приложений: что, когда и почему ?». Протеомика . 6 (20): 5385–5408. DOI : 10.1002 / pmic.200600323 . PMID  16991193 .
  2. ^ Брайборн, Малин; Аднер, Микаэль; Карделл, Ларс-Олаф (2005). «Псориазин, один из нескольких новых белков, идентифицированных в жидкости для промывания носа у аллергиков и неаллергиков с помощью 2-мерного гель-электрофореза и масс-спектрометрии» . Респираторные исследования . 6 (1): 118. DOI : 10,1186 / 1465-9921-6-118 . PMC 1282590 . PMID 16236163 .  
  3. ^ Секретарь, Анджела; Каллингфорд, Тимоти Э .; Кемп, Тимоти Дж .; Кеннеди, Роберт А .; Сагден, Питер Х. (2005). «Регулирование экспрессии генов и белков при гипертрофии сердечных миоцитов и апоптозе». Достижения в регуляции ферментов . 45 (1): 94–111. DOI : 10.1016 / j.advenzreg.2005.02.007 . PMID 16084574 . 
  4. ^ Schaller, A .; Троллер, Р .; Molina, D .; Gallati, S .; Aebi, C .; Штутцманн Майер, П. (январь 2006 г.). «Быстрое типирование субпопуляций Moraxella catarrhalis на основе белков внешней мембраны с использованием масс-спектрометрии». Протеомика . 6 (1): 172–180. DOI : 10.1002 / pmic.200500086 . PMID 16317771 . 
  5. ^ Стасык, Т .; Morandell, S .; Бакры, Р .; Feuerstein, I .; Гек, CW; Stecher, G .; Бонн, Голландия; Хубер, Лос-Анджелес (июль 2005 г.). «Количественное определение фосфопротеинов путем комбинации двухмерного разностного гель-электрофореза и фосфоспецифического флуоресцентного окрашивания». Электрофорез . 26 (14): 2850–2854. DOI : 10.1002 / elps.200500026 . PMID 15966015 . 
  6. ^ Бергер, К .; Wissmann, D .; Ihling, C .; Kalkhof, S .; Beck-Sickinger, A .; Sinz, A .; Paschke, R .; Фюрер, Д. (ноябрь 2004 г.). «Количественный протеомный анализ при доброкачественной узловой болезни щитовидной железы с использованием флуоресцентного трис (дисульфоната батофенантролина) рутения II». Молекулярная и клеточная эндокринология . 227 (1-2): 21-30. DOI : 10.1016 / j.mce.2004.08.001 . PMID 15501581 . 
  7. ^ Görg, A .; Weiss, W .; Данн, MJ (декабрь 2004 г.). «Современные технологии двумерного электрофореза для протеомики». Протеомика . 4 (12): 3665–3685. DOI : 10.1002 / pmic.200401031 . PMID 15543535 . 
  8. ^ Смейкал, ГБ; Робинсон, MH; Лазарев, А. (август 2004 г.). «Сравнение флуоресцентных красителей: относительная фотостабильность и дифференциальное окрашивание белков в двумерных гелях». Электрофорез . 25 (15): 2511–2519. DOI : 10.1002 / elps.200406005 . PMID 15300770 . 
  9. ^ Junca, H .; Plumeier, I .; Hecht, HJR; Пипер, Д.Х. (декабрь 2004 г.). «Различие в кинетическом поведении вариантов катехол-2,3-диоксигеназы из загрязненной окружающей среды» . Микробиология . 150 (12): 4181–4187. DOI : 10.1099 / mic.0.27451-0 . PMID 15583170 . 
  10. ^ Тан, HY; Speicher, DW (июнь 2005 г.). «Комплексное префракционирование протеома с использованием изоэлектрофокусировки раствора в микромасштабе». Экспертный обзор протеомики . 2 (3): 295–306. DOI : 10.1586 / 14789450.2.3.295 . PMID 16000077 . 
  11. ^ Пьет, Андре; Деруо, Аделина; Геркенс, Паскаль; Ноенс, Эльке Э. Маццуккелли, Габриэль; Вион, Себастьен; Koerten, Henk K .; Титгемейер, Фриц; Де Пау, Эдвин; Лепринс, Пьер; van Wezel, Gilles P .; Галлени, Морено; Ригали, Себастьян (2005). «От покоящихся до прорастающих спор Streptomyces coelicolor A3 (2): новые перспективы от crp Null Mutant». Журнал протеомных исследований . 4 (5): 1699–1708. DOI : 10.1021 / pr050155b . PMID 16212423 . 
  12. ^ Куаглино, Даниэла; Боралди, Федерика; Бини, Лука; Вольпи, Никола (апрель 2004 г.). "Белковый профиль фибробластов: роль протеомики". Современная протеомика . 1 (2): 167. DOI : 10,2174 / 1570164043379424 .
  13. ^ Hjernø, K .; Alm, R .; Canbäck, BR; Matthiesen, R .; Трайковски, К .; Björk, L .; Roepstorff, P .; Эмануэльссон, К. (2006). «Снижение регуляции гомологичного аллергена клубники Bet v 1 во взаимодействии с путем биосинтеза флавоноидов у бесцветных мутантов клубники». Протеомика . 6 (5): 1574–1587. DOI : 10.1002 / pmic.200500469 . PMID 16447153 . 
  14. ^ Гербер, Исак Б .; Лаукенс, Крис; Виттерс, Эрвин; Дубери, Ян А. (2006). «Липополисахарид-чувствительные фосфопротеины в клетках Nicotiana tabacum ». Физиология и биохимия растений . 44 (5–6): 369–379. DOI : 10.1016 / j.plaphy.2006.06.015 . PMID 16889970 . 
  15. ^ Chevallet, M .; Димер, HLN; Luche, S .; Van Dorsselaer, A .; Rabilloud, T .; Лейз-Вагнер, Э. (2006). «Улучшенная совместимость с масс-спектрометрией обеспечивается аммиачным окрашиванием серебром» . Протеомика . 6 (8): 2350–2354. arXiv : q-bio / 0611083 . DOI : 10.1002 / pmic.200500567 . PMC 2797540 . PMID 16548061 .  
  16. ^ Ламанда, Андреас; Чеаиб, Зейнаб; Тургут, Мелек Дилек; Лусси, Адриан (2007). Имхоф, Аксель (ред.). «Буферизация белка в модельных системах и в цельной слюне человека» . PLoS ONE . 2 (2): e263. Bibcode : 2007PLoSO ... 2..263L . DOI : 10.1371 / journal.pone.0000263 . PMC 1803027 . PMID 17327922 .  
  17. ^ http://www.chemie.uni-freiburg.de/orgbio/w3bann/index.html
  18. ^ Bannwarth, W .; Schmidt, D .; Stallard, RL; Hornung, C .; Knorr, R .; Мюллер, Ф. (декабрь 1988 г.). «Комплексы батофенантролин-рутений (II) в качестве нерадиоактивных меток для олигонуклеотидов, которые могут быть измерены методами флуоресценции с временным разрешением». Helvetica Chimica Acta . 71 (8): 2085. DOI : 10.1002 / hlca.19880710826 .
  19. ^ Rabilloud, T .; Strub, JM; Luche, S .; Dorsselaer, A .; Лунарди, Дж. Л. (2001). «Сравнение Sypro Ruby и трис рутения II (дисульфонат батофенантролина) в качестве флуоресцентных красителей для обнаружения белка в гелях» (PDF) . Протеомика . 1 (5): 699–704. DOI : 10.1002 / 1615-9861 (200104) 1: 5 <699 :: АИД-PROT699> 3.0.CO; 2-С . PMID 11678039 . Архивировано из оригинального (PDF) 01.04.2010.  
  20. ^ "Архивная копия" . Архивировано из оригинала на 2011-05-29 . Проверено 26 апреля 2007 .CS1 maint: archived copy as title (link)
  21. ^ Lamanda, A .; Zahn, A .; Röder, D .; Ланген, Х. (март 2004 г.). «Улучшенный протокол окрашивания и обесцвечивания трис (дисульфонат батофенантролина) рутения II для лучшего отношения сигнал / фон и улучшенного разрешения исходного уровня». Протеомика . 4 (3): 599–608. DOI : 10.1002 / pmic.200300587 . PMID 14997483 . 

Внешние ссылки [ править ]

Более подробную информацию о окрашивании трис (батофенантролин дисульфонатом) рутения (II) можно найти на [1]