Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Термус термофильный
Научная классификация
Королевство:
Бактерии
Тип:
Deinococcus-Thermus
Класс:
Дейнококки
Заказ:
Термы
Семья:
Thermaceae
Род:
Thermus
Разновидность:
T. thermophilus
Биномиальное имя
Термус термофильный

Thermus thermophilus - это грамотрицательная бактерия, используемая в ряде биотехнологических приложений, в том числе в качестве модельного организма для генетических манипуляций , структурной геномики и системной биологии . Бактерия чрезвычайно теплолюбива , с оптимальной температурой роста около 65 ° C (149 ° F). Thermus thermophilus был первоначально выделен из тепловой вентиляции в горячем источнике в Идзу , Япония по Тайро Осима и Kazutomo Imahori. [1]Также было обнаружено, что этот организм играет важную роль в разложении органических материалов в термогенной фазе компостирования . [2] T. thermophilus подразделяется на несколько штаммов, из которых HB8 и HB27 наиболее часто используются в лабораторных условиях. Анализ генома этих штаммов был независимо завершен в 2004 г. [3]

Приложения [ править ]

ДНК-полимераза rTth - это рекомбинантная термостабильная ДНК-полимераза, полученная из Thermus thermophilus , с оптимальной активностью при 70-80 ° C, используемая в некоторых приложениях ПЦР . Фермент обладает эффективной обратной транскриптазы активности в присутствии марганца . [4]

Штаммы [ править ]

Двумя наиболее широко используемыми штаммами в лабораторных условиях являются HB27 и HB8. Штамм HB27 способен жить в аэробной или анаэробной среде . Он имеет геном, который состоит из основной хромосомы (длиной 1,89 МБ), а также мегаплазмиды, известной как pTT27 (длиной 0,23 МБ). [5] Хромосома HB27 содержит 1968 генов, кодирующих белок, причем 20% этих генов не имеют известной функции. В то время как мегаплазмида содержит 230 генов, кодирующих белок, при этом 39% этих генов не имеют известной функции. [6]

Штамм HB8 также является аэробным организмом и модельным организмом для системной биологии. Он имеет геном, состоящий из плазмиды, известной как pTT8 (длиной 9,3 КБ), которая связана с хромосомой (1,85 МБ), а также мегаплазмиды, также известной как pTT27 (0,26 МБ). Этот штамм оказался полиплоидным организмом с числом копий хромосом и мегаплазмид от четырех до пяти. [5]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Осима T, Imahori K (январь 1974). «Описание Thermus thermophilus (Yoshida and Oshima) comb. Nov., Термофильная бактерия, не имеющая споров, из японских термальных источников» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 24 (1): 102–12. DOI : 10.1099 / 00207713-24-1-102 .
  2. ^ Беффа Т, М Блан, Лион ПФ, Вогт О, Marchiani М, Фишер ДЛ, Aragno М (май 1996 г.). «Изоляция штаммов Thermus из горячих компостов (от 60 до 80 градусов С)» . Прикладная и экологическая микробиология . 62 (5): 1723–7. DOI : 10,1128 / AEM.62.5.1723-1727.1996 . PMC 167946 . PMID 8633870 .  
  3. ^ Henne A, Brüggemann H, Raasch C, Wiezer A, Hartsch T, Liesegang H и др. (Май 2004 г.). «Последовательность генома крайнего термофила Thermus thermophilus». Природа Биотехнологии . 22 (5): 547–53. DOI : 10.1038 / nbt956 . PMID 15064768 . 
  4. ^ Цай Д, Берманн О, Hufert Ж, Г - Дам, городской G (2018-01-02). «Способность полимеразы rTth обнаруживать РНК в присутствии различных ингибиторов» . PloS One . 13 (1): e0190041. DOI : 10.1371 / journal.pone.0190041 . PMC 5749758 . PMID 29293599 .  
  5. ^ a b Отани, Наото; Томита, Масару; Итая, Мицухиро (2010-10-15). «Экстремальный термофил, Thermus thermophilus, представляет собой полиплоидную бактерию» . Журнал бактериологии . 192 (20): 5499–5505. DOI : 10.1128 / JB.00662-10 . ISSN 0021-9193 . PMID 20729360 .  
  6. ^ Карр, Дженнифер Ф .; Данцигер, Майкл Э .; Хуанг, Афина Л .; Дальберг, Альберт Э .; Грегори, Стивен Т. (2015-03-15). «Разработка генома Thermus thermophilus с использованием контрселектируемого маркера» . Журнал бактериологии . 197 (6): 1135–1144. DOI : 10.1128 / JB.02384-14 . ISSN 0021-9193 . PMID 25605305 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • Страница генома Thermus thermophilus HB27.
  • Страница генома Thermus thermophilus HB8.
  • Структурно-биологический проект цельной клетки Thermus thermophilus HB8.
  • Выделение штаммов Thermus из горячих компостов (60 ° C-80 ° C)
  • Цельноклеточный проект Thermus thermophilus HB8: База данных
  • Типовой штамм Thermus thermophilus в Bac Dive - база метаданных по бактериальному разнообразию