Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлен из Типовой местности (биология) )
Перейти к навигации Перейти к поиску
Типовой образец для Marocaster coronatus - Muséum de Toulouse

В биологии тип - это особый образец (или в некоторых случаях группа особей) организма, которому формально присвоено научное название этого организма. Другими словами, тип - это пример, который служит для закрепления или централизации определяющих признаков этого конкретного таксона . В более раннем использовании (до 1900 года в ботанике) тип был таксоном, а не экземпляром. [1]

Таксон - это научно названная группа организмов с другими подобными организмами, набор, который включает одни организмы и исключает другие, на основе подробного опубликованного описания (например, описания вида ) и предоставления типового материала, который обычно доступен для ученых для изучения в крупном исследовательском собрании музея или аналогичном учреждении. [1] [2]

Типовой образец [ править ]

Согласно точному набору правил, изложенных в Международном кодексе зоологической номенклатуры (ICZN) и Международном кодексе номенклатуры водорослей, грибов и растений (ICN), научное название каждого таксона почти всегда основано на одном конкретном экземпляре. , или в некоторых случаях образцы. Типы имеют большое значение для биологов, особенно для систематиков . Типы обычно представляют собой физические образцы, которые хранятся в исследовательской коллекции музея или гербария , но в противном случае изображение особи этого таксона иногда обозначается как тип. [3] Описание видов и определение типовых образцов является частьюнаучная номенклатура и альфа-таксономия .

При идентификации материала ученый пытается применить название таксона к образцу или группе образцов на основе его или ее понимания соответствующих таксонов [ требуется пояснение ] [ необходима ссылка ] , основываясь (по крайней мере) на прочтении описания типа ( s) [ необходима ссылка ], предпочтительно также на основе изучения всего типового материала всех соответствующих таксонов. Если существует несколько именованных типов, которые кажутся одним и тем же таксоном, то самое старое название имеет приоритет и считается правильным названием имеющегося материала. Если, с другой стороны, таксон, кажется, никогда не был назван, тогда ученый или другой квалифицированный эксперт выбирает типовой образец и публикует новое название и официальное описание. [ необходима цитата ]

Этот процесс имеет решающее значение для биологической систематики . Представления людей о том, как следует группировать живые существа, со временем меняются. Откуда мы знаем, что то, что мы называем Canis lupus, - это то же самое или примерно то же самое, что и то, что они будут называть Canis lupus через 200 лет? Это можно проверить, потому что в Швеции сохранился конкретный образец волка [4] [ требуется уточнение ], и все, кто использует это имя [ требуется пояснение ] [ необходима ссылка ] - независимо от того, что еще они могут под этим подразумевать - будут включать именно этот экземпляр. [ требуется уточнение] [ необходима ссылка ]

В зависимости от номенклатурного кода, применяемого к рассматриваемому организму, типом может быть образец, культура, иллюстрация или (в соответствии с бактериологическим кодом) описание. Некоторые коды считают типом подчиненный таксон, но в ботаническом коде типом всегда является образец или иллюстрация.

Например, в исследовательской коллекции Музея естественной истории в Лондоне есть экземпляр птицы под номером 1886.6.24.20. Это образец птицы, широко известной как пятнистый лунь , который в настоящее время носит научное название Circus assimilis . Этот конкретный экземпляр является голотипом этого вида; Название Circus assimilis по определению относится к виду этого особого экземпляра. Этот вид был назван и описан Джардином и Селби в 1828 году, а голотип был помещен в коллекцию музея, чтобы другие ученые могли обращаться к нему при необходимости.

Обратите внимание, что, по крайней мере, для типовых образцов нет требования об использовании «типичного» человека. Роды и семейства , особенно те, которые были установлены ранними систематиками, имеют тенденцию быть названы в честь видов, которые более «типичны» для них, но и здесь это не всегда так и не может быть из-за изменений в систематике . Следовательно, термин номенклатурный тип или ономатофор иногда используется для обозначения того факта, что биологические типы не определяют «типичные» особи или таксоны , а скорее фиксируют научное название для конкретной оперативной таксономической единицы.. Типовым образцам теоретически даже разрешается быть аберрантными или деформированными особями или вариациями окраски, хотя это делается редко, так как это затрудняет определение того, к какой популяции принадлежит особь. [1] [2] [5]

Использование термина « тип» несколько усложняется из-за разницы в его употреблении в ботанике и зоологии . В Филокоде определения, основанные на типах, заменены филогенетическими определениями .

Старая терминология [ править ]

В некоторых более старых таксономических трудах слово «тип» иногда использовалось иначе. Значение было аналогичным в первых законах ботанической номенклатуры , [6] [7], но имеет значение, более близкое к термину таксон в некоторых других работах: [8]

Ce seul caractère permet deferenceer ce type de toutes les autres espèces de la section. … Après Избиратели étudié ces diverses formes, j'en arrivai à les considérer com appartenant à un seul et même type spécifique.

Перевод: Этот единственный признак позволяет отличить этот тип от всех других видов секции ... Изучив различные формы, я пришел к выводу, что они принадлежат к одному и тому же конкретному типу.

В ботанике [ править ]

В ботанических номенклатуре , А тип ( Typus , номенклатурный типа ), «является то , что элемент , к которому название таксона постоянно прикреплен.» (статья 7.2) [9] В ботанике типом является образец или иллюстрация. Экземпляр - это реальное растение (или одна или несколько частей растения или множество мелких растений), мертвое и хранимое в безопасном месте, «под присмотром», в гербарии (или его эквиваленте для грибов). Примеры того, где иллюстрация может служить типом, включают:

  • Детальный рисунок, картина и т. Д., Изображающие растение, с первых дней систематики растений. Высушенное растение было трудно транспортировать, и его трудно сохранить в будущем; многие образцы из первых дней ботаники были потеряны или повреждены. Иногда к ботаникам привлекались высококвалифицированные художники-ботаники для создания точных и подробных иллюстраций. Некоторые из таких иллюстраций стали лучшей записью и были выбраны в качестве типа таксона.
  • Подробное изображение того, что можно увидеть только в микроскоп . Крошечное «растение» на предметном стекле микроскопа - плохой тип: предметное стекло микроскопа может быть потеряно или повреждено, или может быть очень трудно найти рассматриваемое «растение» среди всего остального на предметном стекле микроскопа. Иллюстрация является гораздо более надежным шрифтом (статья 37.5 Венского кодекса , 2006 г.).

Обратите внимание, что тип не определяет ограниченность таксона. Например, одуванчик обыкновенный является спорным таксоном: некоторые ботаники считают, что он состоит из более чем сотни видов, а другие рассматривают его как единый вид. Тип имени Taraxacum лекарственный то же самое , включает ли очертание вида всех этих мелких видов ( Одуванчик лекарственный является «большие» вида) или является ли очертание ограничивается только один мелких видов среди других ста ( Taraxacum лекарственный является «маленький» вид). Название Taraxacum officinaleто же самое, и тип имени такой же, но степень того, к чему это имя действительно применимо, сильно различается. Определение границ таксона выполняется систематиком в публикации.

Разные примечания:

  1. Только вид или внутривидовой таксон может иметь собственный тип. Для большинства новых таксонов (опубликованных 1 января 2007 г. или позднее, статья 37) в этих рангах тип не должен быть иллюстрацией.
  2. Род имеет тот же тип, что и один из ее видов (статья 10).
  3. Семья имеет тот же тип, что и один из его родов (статья 10).

ICN обеспечивает перечисление различных видов типа (статья 9 и Глоссарий), [9] , наиболее важным из которых является голотипом. Эти

  • голотип - единственный образец или иллюстрация, которые автор (ы) четко указал как номенклатурный тип имени
  • лектотип - образец или иллюстрация, обозначенная из исходного материала как номенклатурный тип, когда голотип не был указан или голотип был утерян или уничтожен
  • изотип - дубликат голотипа
  • синтип - любой образец (или иллюстрация), цитируемый в исходном описании, когда голотип отсутствует, или любой из двух или более экземпляров, одновременно обозначенных как типы
  • паратип - любой образец (или иллюстрация), процитированный в исходном описании, который не является голотипом, изотипом или одним из синтипов
  • неотип - образец или иллюстрация, выбранные для использования в качестве номенклатурного типа, если нет материала из исходного описания
  • эпитип - образец или иллюстрация, выбранные для использования в качестве интерпретирующего типа, обычно, когда другой тип типа не показывает критических характеристик, необходимых для идентификации

Обратите внимание, что слово «тип» появляется в ботанической литературе как часть некоторых старых терминов, не имеющих статуса согласно ICN : например, клонотип.

В зоологии [ править ]

Паутинка крыльями бабочки , Jamides elioti :
1) дорсальные и 2) вентральной аспект голотипом,
3) спинной и 4) вентральной аспект паратипа

В зоологической номенклатуре типом вида или подвида является образец или серия экземпляров. Тип рода или подрода - это вид. Тип надродового таксона (например, семейство и т. Д.) - это род. Имена выше ранга надсемейства не имеют типов. «Номенклатурный тип» - это образец или изображение, которое «обеспечивает объективный эталон, с помощью которого можно определить применение названия номинального таксона».

Определения [ править ]

  • Типовой образец - это общеупотребительный термин (а не формально определенный термин), обычно используемый для индивидуума или ископаемого, который является любым из различных типов, носящих имя, для вида . Например, типовым образцом для вида Homo neanderthalensis был образец «Неандерталец-1», обнаруженный Иоганном Карлом Фульроттом в 1856 году в Фельдхофере в долине Неандера в Германии, состоящий из тюбетейки , бедренных костей, части таза, некоторых ребер. , и некоторые кости рук и плеч. Может быть более одного типового экземпляра, но существует (по крайней мере, в наше время) только один голотип.
  • Типовой вид - это номинальный вид, который является номенклатурным типом номинального рода или подрода .
  • Типовой род - это номинальный род, который является номенклатурным типом номинального таксона группы семейства.
  • В серии типа все эти образцы , включенные автором в формальном описании таксона, если автор явно или неявно включает их как часть серии.

Использование типовых образцов [ править ]

Типовая иллюстрация Mormopterus aceabulosus

Хотя на самом деле биологи могут исследовать множество образцов (если таковые имеются) нового таксона, прежде чем писать официальное опубликованное описание вида, тем не менее, согласно формальным правилам наименования видов (Международный кодекс зоологической номенклатуры), один тип должен быть обозначен как часть опубликованного описания.

Описание типа должно включать диагноз (как правило, обсуждение сходства и отличия от близкородственных видов) и указание того, где типовой образец или образцы сданы для исследования. Географическое место, где был первоначально найден типовой образец, известно как его типовое местонахождение . В случае паразитов термин « тип-хозяин» (или симбиотип) используется для обозначения организма-хозяина, от которого был получен типовой образец. [10]

Зоологические коллекции хранятся в университетах и ​​музеях. Обеспечение того, чтобы типы содержались в хорошем состоянии и были доступны для изучения систематиками, - две важные функции таких коллекций. И хотя обозначен только один голотип , могут быть и другие «типовые» экземпляры, следующие из которых формально определены:

Голотип [ править ]

Если в первоначальном описании четко обозначен один экземпляр, он известен как голотип этого вида. Голотип обычно помещается в крупный музей или аналогичную известную публичную коллекцию, так что он находится в свободном доступе для последующего изучения другими биологами.

Paratype [ править ]

Когда в исходном описании был обозначен голотип, могут быть дополнительные экземпляры, которые автор определяет как дополнительных представителей того же вида, называемых паратипами. Это не именные типы .

Аллотип [ править ]

Аллотип - это особь противоположного пола голотипу, выделенный из числа паратипов. Слово также ранее использовалось для образца, который показывает особенности, не замеченные в голотипе окаменелости. [11] Срок не регулируется МКЗН .

Неотип [ править ]

Неотип - это образец, позже выбранный для использования в качестве образца единственного типа, когда исходный голотип был утерян или уничтожен или когда первоначальный автор никогда не цитировал образец.

Syntype [ править ]

Синтип - это любой из двух или более экземпляров, перечисленных в описании вида, где голотип не был обозначен; исторически синтипы часто явно обозначались как таковые, и согласно настоящему МКЗН это требование, но современные попытки опубликовать описание видов на основе синтипов обычно не одобряются практикующими систематиками, и большинство из них постепенно заменяются лектотипами. Существующие до сих пор считаются именными типами.

Лектотип [ править ]

Лектотип - это образец, позже выбранный для использования в качестве образца единственного типа для видов, первоначально описанных на основе набора синтипов . В зоологии лектотип - это разновидность номенклатурного типа . Когда вид был первоначально описан на основе номенклатурного типа, состоящего из нескольких экземпляров, один из них может быть обозначен как лектотип. Наличие единственного номенклатурного типа снижает вероятность путаницы, особенно с учетом того, что серия синтипов нередко содержит экземпляры более чем одного вида.

Ярким примером является предположение, что Карл Линней должен составлять лектотип вида Homo sapiens . [12]

Паралектотип [ править ]

Паралектотип - это любой дополнительный образец из набора синтипов после того, как из них был выделен лектотип. Это не именные типы. [13]

Гапантотип [ править ]

Особый случай у протистанцев, когда тип состоит из двух или более экземпляров «непосредственно связанных особей, представляющих различные стадии жизненного цикла»; все вместе они рассматриваются как единое целое, и лектотипы среди них не могут быть определены.

Iconotype [ править ]

Иллюстрация, на которой основан новый вид или подвид. Например, бирманский питон, Python bivittatus , это один из многих видов , которые основаны на иллюстрациях Albertus Себ (1734). [14] [15]

Эргатотип [ править ]

Эргатотип - это образец, выбранный для представления рабочего члена перепончатокрылых, которые имеют полиморфные касты. [11]

Альтернативы сохранившимся образцам [ править ]

Типовые иллюстрации также использовались зоологами, как в случае с попугаем Реюньон , который известен только из исторических иллюстраций и описаний. [16] : 24

Недавно были описаны некоторые виды, у которых типовой экземпляр был выпущен живым обратно в дикую природу, например, Bulo Burti boubou ( бушрайк ), описываемый как Laniarius liberatus , в описание которого включены последовательности ДНК из образцов крови и пера. Если предположить, что в будущем не возникнет вопросов относительно статуса такого вида, отсутствие типового образца не делает название недействительным, но в будущем может потребоваться обозначение неотипа для такого таксона, если возникнут какие-либо вопросы. Однако в случае с кустарником орнитологи утверждали, что этот экземпляр имел редкую и до сих пор неизвестную окраску.давно известного вида, используя только доступные образцы крови и перьев. Хотя до сих пор ведутся споры о необходимости депонирования реально убитых особей в качестве типовых образцов, можно заметить, что при надлежащем оформлении и хранении образцы тканей могут быть столь же ценными, если возникнут споры о пригодности вида.

Формализация системы типов [ править ]

Различные типы, перечисленные выше, необходимы [ необходима цитата ], потому что многие виды были описаны один или два столетия назад, когда единичный образец, голотип, часто не определялся. Кроме того, типы не всегда тщательно сохранялись, а промежуточные события, такие как войны и пожары, приводили к разрушению материала исходного типа. Достоверность названия вида часто зависит от наличия оригинальных типовых образцов; или, если тип не может быть найден или никогда не существовал, при ясности описания.

МКЗН существует только с 1961 года, когда была опубликована первая редакция Кодекса. МКЗН не всегда требует наличия типового образца для исторической достоверности вида, и существует множество «безтиповых» видов. Текущая редакция Кодекса, статья 75.3, запрещает обозначение неотипа, если нет «исключительной необходимости» в «уточнении таксономического статуса» вида (статья 75.2).

Есть много других перестановок и вариации на условиях , используя суффикс «-типа» (например, аллотипа , котип, topotype , generitype , изотипическим , isoneotype, isolectotype и т.д.) , но они формально не регулируются Кодексом, и очень много являются устаревшими и / или своеобразными. Однако некоторые из этих категорий могут потенциально применяться к подлинным типовым образцам, таким как неотип; например, изотипические / топотипические образцы предпочтительнее других образцов, если они доступны на момент выбора неотипа (поскольку они происходят из того же времени и / или места, что и исходный тип).

Термин «фиксация» используется Кодексом для объявления номенклатурного типа посредством первоначального или последующего обозначения.

Типовой вид [ править ]

Общая жаба , Bufo Bufo описывается Linnaeus , является видом типа для рода Bufo

Каждый род должен иметь определенный типовой вид (термин «генотип» когда-то использовался для этого, но от него отказались, потому что это слово стало гораздо более известным как термин для другой концепции в генетике ). Описание рода обычно основывается прежде всего на его типовом виде, модифицированном и расширенном за счет характеристик других включенных видов. Родовое название постоянно связано с номенклатурным типом своего типового вида.

В идеале типовой вид лучше всего отражает основные характеристики того рода, к которому он принадлежит, но это субъективно и, в конечном счете, технически не имеет значения, поскольку не является требованием Кодекса. Если при ближайшем рассмотрении окажется, что типовой вид принадлежит к ранее существовавшему роду (обычное явление), то все составляющие виды должны быть либо перемещены в уже существующий род, либо отделены от исходного типового вида и даны новое родовое имя; старое родовое название переходит в синонимию и от него отказываются, если только не возникает острой необходимости сделать исключение (решается в каждом конкретном случае через петицию в Международную комиссию по зоологической номенклатуре). [ необходима цитата ]

Тип рода [ править ]

Типовой род - это тот род, от которого образовано название семейства или подсемейства. Как и типовые виды, типовой род не обязательно является наиболее представительным, но обычно является самым ранним описанным, самым крупным или наиболее известным родом. Нередко название семейства основывается на названии типового рода, перешедшего в синонимию; фамилию в такой ситуации менять не нужно.

См. Также [ править ]

  • Архетип
  • Глоссарий научного нейминга
  • Nomen dubium (зоология)
  • Nomen nudum
  • Genetypes - данные генетической последовательности от типовых образцов
  • Патотип - разновидность внутриподвидового таксона патогенных бактерий.
  • Принцип типизации

Ссылки [ править ]

  1. ^ Б с Хичкоком, AS (1921), "Тип Концепция в систематической Ботанике", Американский журнал ботаники , 8 (5): 251-255, DOI : 10,2307 / 2434993 , JSTOR  2434993
  2. ^ a b Николсон, Дэн Х. «Ботаническая номенклатура, типы и стандартные справочники» . Смитсоновский национальный музей естественной истории, отдел ботаники . Проверено 17 ноября 2015 года .
  3. ^ Маршалл, Стивен А .; Evenhuis, Нил Л. (2015). «Новый вид без мертвых тел: случай для описания на основе фотографий, иллюстрированный поразительным новым видом Marleyimyia Hesse (Diptera, Bombyliidae) из Южной Африки» . ZooKeys (525): 117–127. DOI : 10.3897 / zookeys.525.6143 . ISSN 1313-2970 . PMC 4607853 . PMID 26487819 .   
  4. ^ «Архивная копия» (PDF) . Архивировано из оригинального (PDF) 24 сентября 2015 года . Проверено 2 июня 2015 . CS1 maint: заархивированная копия как заголовок ( ссылка )
  5. ^ «Названия растений - основное введение» . Австралийский национальный ботанический сад, Центр национальных исследований биоразнообразия Австралии . Проверено 17 ноября 2015 года .
  6. ^ де Кандоль, AP (1867). Ботаническая номенклатура, принятая в соответствии с Международным конгрессом ботаники в Париже после 1867 года, является уникальной историей введения и комментариями, которые сопровождают предварительную презентацию для участников . Genève et Bale: Ж.-Б. Baillière et fils.
  7. ^ Уэдделл (1868). "Законы ботанической номенклатуры, принятые Международным ботаническим конгрессом, состоявшимся в Париже в августе 1867 года; вместе с историческим введением и комментарием Альфонса де Кандолля, перевод с французского; перепечатано с английского перевода, опубликованного L. Reeve and Co., Лондон. , 1868 (с трехстраничным комментарием Асы Грея) » . Американский журнал науки и искусства . Серия II, том 46 (63–74, 75–77).
  8. ^ Крепен, Ф. (1886). "Rosa Synstylae: études sur les roses de la section Synstyleés" . Бюллетень Королевского ботанического общества Бельгии . 25 (2: Comptes-redus des séances de la Société Royale de Botanique de Belgique): 163–217.
  9. ^ a b McNeill, J .; Барри, Франция; Бак, WR; Демулин, В .; Greuter, W .; Хоксворт, DL; Herendeen, PS; Knapp, S .; Мархольд, К .; Prado, J .; Прюдом Ван Рейн, ВФ; Smith, GF; Wiersema, JH; Турланд, штат Нью-Джерси (2012). Международный кодекса ботанической номенклатуры (Мельбурн кодекс) , принятый на восемнадцатом Международном ботаническом конгресс Мельбурне, Австралия, июль 2011 года . Regnum Vegetabile 154. ARG Gantner Verlag KG. ISBN 978-3-87429-425-6.
  10. ^ Фрей, Дженнифер К .; Йейтс, Терри Л .; Duszynski, Donald W .; Гэннон, Уильям Л. и Гарднер, Скотт Л. (1992). «Обозначение и кураторское управление типовых образцов-хозяев (симбиотипов) для новых видов паразитов». Журнал паразитологии . 78 (5): 930–993. DOI : 10.2307 / 3283335 . JSTOR 3283335 . 
  11. ^ a b Хоксворт, DL (2010). Термины, используемые в биономенклатуре. Название организмов (и растительных сообществ) . Копенгаген: Глобальный информационный фонд по биоразнообразию. п. 216. ISBN. 978-87-92020-09-3.
  12. ^ Stearn, WT (1959-03-01). "Предпосылки вкладов Линнея в номенклатуру и методы систематической биологии" . Систематическая биология . 8 (1): 4–22. DOI : 10.2307 / sysbio / 8.1.4 . ISSN 1063-5157 . 
  13. ^ Хансен, Ганс V .; Себерг, Оле (1984). «Паралектотип - новый типовой термин в ботанике». Таксон . 33 (4): 707–711. DOI : 10.2307 / 1220790 . JSTOR 1220790 . 
  14. Себа, Альберт (1734). Locupletissimi Rerum naturalium Thesauri accurata Descriptio, et Iconibus artificiosissimus Expressio, per Universam Physices Historiam. Opus, cui in hoc Rerum Genere, nullum par exstitit . Амстердам: Janssonio-Waesbergios.
  15. ^ Бауэр, Аарон М. (2002). "Альберт Себа, Кабинет природных диковинок. Полное собрание цветных пластин, 1734-1765 гг. 2001". Международное общество истории и библиографии герпетологии . 3 .
  16. Хьюм, Джулиан Пендер (25 июня 2007 г.). «Повторная оценка попугаев (Aves: Psittacidae) с Маскаренских островов, с комментариями об их экологии, морфологии и родстве» (PDF) . Zootaxa . 1513 (1513): 1–76. DOI : 10.11646 / zootaxa.1513.1.1 . ISSN 1175-5334 . Проверено 13 января 2011 года .  

Внешние ссылки [ править ]

  • Кодекс ICZN : Международный кодекс зоологической номенклатуры , официальный сайт
  • Раздел глоссария Fishbase .
  • Сборник терминов
  • Номенклатура зоологических типов (Evenhuis)