| VP40 | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Гексамер матричного белка VP40, вирус Эбола | ||||||||
| Идентификаторы | ||||||||
| Символ | VP40 | |||||||
| Pfam | PF07447 | |||||||
| ИнтерПро | IPR008986 | |||||||
| SCOP2 | 1h2c / SCOPe / SUPFAM | |||||||
| ||||||||
В молекулярной биологии VP40 - это вирусный матричный белок . Чаще всего он обнаруживается в вирусе Эбола (EBOV) [1], типе несегментированного РНК- вируса с отрицательной цепью . Вирус Эбола вызывает серьезную и часто фатальную геморрагическую лихорадку в организме человека , известную как Эбола вирус болезнь . Белок вирусного матрикса VP40 является основным структурным белком, который играет центральную роль в сборке вируса и его почковании на плазматической мембране инфицированных клеток . Белки VP40работают, связываясь с клеточными мембранами, взаимодействуя с цитоплазматическими хвостами гликопротеинов и связываясь с рибонуклеопротеидным комплексом . [ необходима цитата ]
Структура [ править ]
Мономер VP40 состоит из двух белковых доменов , N-концевого домена олигомеризации и C-концевого мембранно-связывающего домена, соединенных гибким линкером. Оба N- и C-концевых домена складываются в бета-сэндвич- структуры схожей топологии. [2] Внутри N-концевого домена находятся два перекрывающихся L-домена с последовательностями PTAP и PPEY на остатках с 7 по 13, которые необходимы для эффективного отпочкования. [3] Считается, что L-домены опосредуют свою функцию в почковании через взаимодействие со специфическими клеточными белками хозяина, такими какTSG101 и vps-4. [4]
Функция [ править ]
VP40 координирует многочисленные функции в жизненном цикле вируса Эбола . К ним относятся: регуляция вирусной транскрипции , морфогенеза , упаковки и почкования зрелых вирионов. [5]
VP40 проходит через промежуточные состояния сборки (например, октамеры). Было отмечено, что белки, кодируемые EBOV (VP30, VP35 и VP40), действуют независимо как супрессоры молчания РНК , указывая на то, что вирус активно сопротивляется клеточной РНКи во время репликации. [5]
Значение VP40 [ править ]
Изучение матричного протеина VP40 важно из-за высокой смертности от вируса Эбола, который внесен в список ВОЗ патогенов группы риска 4, выбранным агентом HHS , приоритетным патогеном категории A NIH / NIAID, агентом биотерроризма категории A CDC . , а также биологический агент для экспортного контроля Австралийской группы . [5]
Экспрессии матричного белка VP40 достаточно для образования вирусоподобных частиц ( без вирусного генетического материала ) в организме-хозяине- млекопитающем , которые с морфологической точки зрения заметно неотличимы от живого вируса. [5]
Вспышка вируса Эбола в Западной Африке [ править ]
Во время и после 2014–2016 годов проводился поиск вариантов лечения эпидемии вируса Эбола в Западной Африке ; среди них был матричный белок VP40 как мишень для возможных исследований, которые могут ( а могут и не привести) привести к варианту лечения. [6] [7]
Ссылки [ править ]
- ^ Дессен, Андреа; Волчков Виктор; Дольник, Ольга; Кленк, Ханс-Дитер; Вайссенхорн, Винфрид (15 августа 2000 г.). «Кристаллическая структура матричного белка VP40 вируса Эбола» . Журнал EMBO . 19 (16): 4228–4236. DOI : 10.1093 / emboj / 19.16.4228 . ISSN 0261-4189 . PMC 302032 . PMID 10944105 .
- ^ Дессен А, Волчков В, Дольник О, Klenk HD, Вайсенхорн Вт (август 2000 г.). «Кристаллическая структура матричного белка VP40 вируса Эбола» . EMBO J . 19 (16): 4228–36. DOI : 10.1093 / emboj / 19.16.4228 . PMC 302032 . PMID 10944105 .
- ^ Тимминса Дж, Schoehn G, Рикар-Блюм S, S Scianimanico, Вернэ Т, Ruigrok RW, Вайсенхорн Вт (февраль 2003 г.). «Взаимодействие матричного белка вируса Эбола VP40 с человеческими клеточными факторами Tsg101 и Nedd4». J. Mol. Биол . 326 (2): 493–502. DOI : 10.1016 / S0022-2836 (02) 01406-7 . PMID 12559917 .
- ^ Ликат JM, Симпсон-Холл М, Райт NT, Хан Z, J Paragas, Харти РН (февраль 2003 г.). «Перекрывающиеся мотивы (PTAP и PPEY) в белке VP40 вируса Эбола функционируют независимо как домены позднего почкования: участие белков-хозяев TSG101 и VPS-4» . J. Virol . 77 (3): 1812–9. DOI : 10.1128 / jvi.77.3.1812-1819.2003 . PMC 140960 . PMID 12525615 .
- ^ a b c d Silva LP, Vanzile M, Bavari S, Aman JM, Schriemer DC (2012). «Сборка матричного протеина вируса Эбола VP40 регулируется защелкивающими свойствами N- и C-концевых хвостов» . PLoS ONE . 7 (7): e39978. Bibcode : 2012PLoSO ... 739978S . DOI : 10.1371 / journal.pone.0039978 . PMC 3390324 . PMID 22792204 .
- ^ Мадара, Джонатан Дж; Хан, Цзыин; Рутел, Гордон; Фридман, Брюс Д; Харти, Рональд Н. (2017-02-05). «Многофункциональный матричный белок VP40 вируса Эбола является многообещающей терапевтической мишенью» . Будущая вирусология . 10 (5): 537–546. DOI : 10,2217 / fvl.15.6 . ISSN 1746-0794 . PMC 4480923 . PMID 26120351 .
- ^ Балмит, Марисса; Солиман, Махмуд Э.С. (01.02.2017). «VP40 вируса Эбола в качестве мишени для терапии EboV: всеобъемлющий ландшафт конформации и связывания ингибиторов на основе ускоренной молекулярной динамики». Биохимия и биофизика клетки . 75 (1): 65–78. DOI : 10.1007 / s12013-017-0783-8 . ISSN 1559-0283 . PMID 28144904 . требуется подписка
