| Эпоксидредуктаза витамина К (чувствительная к варфарину) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Реакция | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 1.17.4.4 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
| BRENDA | BRENDA запись | ||||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | Amigo / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Эпоксидредуктаза витамина К | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ВКОР | ||||||||
| Pfam | PF07884 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR012932 | ||||||||
| CATH | 3kp9 | ||||||||
| TCDB | 9.B.265 | ||||||||
| OPM суперсемейство | 18 | ||||||||
| Белок OPM | 3kp9 | ||||||||
| |||||||||
Эпоксидредуктаза витамина К ( VKOR ) - это фермент ( EC 1.17.4.4 ), который восстанавливает витамин К после того, как он окислился при карбоксилировании остатков глутаминовой кислоты в ферментах свертывания крови . VKOR является членом большого семейства предсказанных ферментов, которые присутствуют у позвоночных, дрозофилы , растений, бактерий и архей . [1] В некоторых растительных и бактериальных гомологах , то VKOR домен слит с доменами в тиоредоксинесемейство оксидоредуктаз . [1]
Четыре остатка цистеина и один остаток, который представляет собой серин или треонин, идентифицируются как вероятные остатки активного сайта . [1] Решенные бактериальные структуры VKOR позволили лучше понять каталитический механизм. Все VKOR являются трансмембранными белками с по крайней мере тремя спиралями TM в каталитическом ядре. Восстанавливаемый хинон связывается окислительно-восстановительным мотивом CXXC в С-концевых спиралях, подобно активному сайту DsbB . Два других цистеина на N-конце расположены в петле за пределами трансмембранной области; они передают электроны с окислительно-восстановительным белком (или, в случае бактериального гомолога, с его собственным слитым доменом). [2] [3]
Человеческий ген VKOR называется VKORC1 (субъединица 1 комплекса VKOR). Это цель антикоагулянта варфарина . Его партнер - окислительно-восстановительный белок с неизвестной идентичностью. [4] [5] Существует также похожий ген под названием VKORC1L1 .
Ссылки [ править ]
- ^ a b c Goodstadt L, Ponting CP (июнь 2004 г.). «Эпоксидредуктаза витамина К: гомология, активный центр и каталитический механизм». Направления биохимических наук . 29 (6): 289–92. DOI : 10.1016 / j.tibs.2004.04.004 . PMID 15276181 .
- ↑ Li W, Schulman S, Dutton RJ, Boyd D, Beckwith J, Rapoport TA (январь 2010 г.). «Структура бактериального гомолога эпоксидредуктазы витамина К» . Природа . 463 (7280): 507–12. Bibcode : 2010Natur.463..507L . DOI : 10,1038 / природа08720 . PMC 2919313 . PMID 20110994 .
- ^ Rishavy М.А., Usubalieva A, Холлгрен KW, Беркнер KL (март 2011). «Новое понимание механизма действия оксидоредуктазы витамина К (VKOR): электронное реле через Cys43 и Cys51 снижает VKOR, что позволяет уменьшить витамин K и облегчить витамин K-зависимое карбоксилирование белка» . Журнал биологической химии . 286 (9): 7267–78. DOI : 10.1074 / jbc.M110.172213 . PMC 3044983 . PMID 20978134 .
- ↑ Li T, Chang CY, Jin DY, Lin PJ, Khvorova A, Stafford DW (февраль 2004 г.). «Идентификация гена эпоксидредуктазы витамина К». Природа . 427 (6974): 541–4. Bibcode : 2004Natur.427..541L . DOI : 10,1038 / природа02254 . PMID 14765195 .
- ^ Рост S, Fregin А, Ivaškevičius В, Концельман Е, Hörtnagel К, Пелз HJ, Lappegard К, Сейфрид Е, Шаррер я, Tuddenham Е.Г., Мюллер CR, Стром ТМ, Ольденбург J (февраль 2004 г.). «Мутации в VKORC1 вызывают устойчивость к варфарину и множественный дефицит факторов свертывания крови типа 2». Природа . 427 (6974): 537–41. Bibcode : 2004Natur.427..537R . DOI : 10,1038 / природа02214 . PMID 14765194 .
