Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Данио ( Danio rerio ) является пресноводной рыбой , принадлежащей к гольян семье ( карповы ) из порядка Cypriniformes . Родом из Южной Азии , это популярная аквариумная рыба , часто продаваемая под торговым названием зебра данио [2] (и поэтому ее часто называют « тропической рыбой », хотя и тропической, и субтропической ).

Рыбки данио являются важным и широко используемым модельным организмом позвоночных в научных исследованиях, например, при разработке лекарств , в частности в доклинической разработке . [3] Он также отличается своими регенеративными способностями [4] и был модифицирован исследователями для получения многих трансгенных штаммов. [5] [6] [7]

Таксономия [ править ]

Рыбка данио является производным членом рода Brachydanio из семейства Cyprinidae . Он имеет сестринские отношения с Danio aesculapii . [8] Данио-рерио также тесно связаны с родом Devario , что демонстрирует филогенетическое древо близких видов. [9] Рыбок данио часто называют «Danio rerio», [10] но более поздние молекулярные исследования показали, что они должны принадлежать к роду Brachydanio , как Brachydanio rerio . [11]

Диапазон [ править ]

Рыба данио родом из пресноводных местообитаний в Южной Азии, где он встречается в Индии , Пакистане , Бангладеш , Непале и Бутане . [1] [12] [13] [14] Северная граница находится в Южных Гималаях , от бассейна реки Сатледж в пакистано-индийском пограничном регионе до штата Аруначал-Прадеш на северо-востоке Индии. [1] [13] Его ареал сосредоточен в бассейнах рек Ганг и Брахмапутра , и вид был впервые описан из реки Коси.(нижняя часть бассейна Ганга) Индии. Его диапазон южнее более локален, с разбросанными записями из регионов Западных и Восточных Гатов . [14] [15] [16] Часто говорят, что это происходит в Мьянме (Бирма), но это полностью основано на записях до 1930 года и, вероятно, относится к близким родственникам, описанным только позже, особенно к Данио кьяхиту . [14] [17] [18] [19] Точно так же старые [ требующие разъяснения ] записи из Шри-Ланки весьма сомнительны и остаются неподтвержденными. [17]

Рыбки данио были завезены в Калифорнию , Коннектикут , Флориду и Нью-Мексико в Соединенных Штатах, предположительно, путем преднамеренного выпуска аквариумистами или бегством с рыбных ферм . Население Нью-Мексико было истреблено к 2003 году, и неясно, выживут ли остальные, поскольку последние опубликованные записи были десятки лет назад. [20] В другом месте вид был завезен в Колумбию и Малайзию . [13] [21]

Хабитат [ править ]

Данио обычно населяют чистую воду от умеренно проточной до стоячей на довольно небольшой глубине в ручьях, каналах, канавах, старицах , прудах и рисовых полях . [14] [15] [21] [22] Обычно есть какая-то растительность, либо затопленная, либо свисающая с берегов, а дно песчаное, илистое или илистое, часто смешанное с галькой или гравием. При обследовании мест обитания рыбок данио на большей части территории его распространения в Бангладеш и Индии, вода имела pH от почти нейтрального до несколько щелочного, а температура в основном колебалась от 16,5 до 34 ° C (61,7–93,2 ° F). [14] [15] [23]Одно необычно холодное место было всего 12,3 ° C (54,1 ° F), а другое необычно теплое - 38,6 ° C (101,5 ° F), но рыбки данио все еще выглядели здоровыми. Необычно низкая температура была в одном из самых высоких известных мест обитания рыбок данио на высоте 1 576 м (5 171 фут) над уровнем моря, хотя вид был зарегистрирован на высоте 1795 м (5 889 футов). [14] [15]

Описание [ править ]

Рыбка данио названа в честь пяти однородных пигментированных горизонтальных синих полос по бокам тела, которые напоминают полосы зебры и доходят до конца хвостового плавника . Его форма веретеновидная, сжатая с боков, устье направлено вверх. Самец торпедообразный , с золотыми полосами между синими полосами; у самки более крупный белесый живот и серебряные полосы вместо золотых. У взрослых самок перед началом анального плавника имеется небольшой половой сосочек . Рыба данио может достигать 4–5 см (1,6–2,0 дюйма) в длину [18].хотя в дикой природе они обычно составляют 1,8–3,7 см (0,7–1,5 дюйма) с некоторыми вариациями в зависимости от местоположения. [15] Продолжительность жизни в неволе составляет около двух-трех лет, хотя в идеальных условиях она может быть увеличена до более чем пяти лет. [22] [24] В дикой природе это, как правило, однолетний вид. [1]

Психология [ править ]

В 2015 году было опубликовано исследование способности рыбок данио к эпизодической памяти . Люди показали способность запоминать контекст относительно объектов, мест и событий (что, когда, где). Эпизодическая память - это емкость явных систем памяти, обычно связанных с сознательным опытом . [25]

Воспроизведение [ править ]

Этапы развития рыбок данио. Фотографии в масштабе, кроме взрослых, длина которых составляет около 2,5 см (1 дюйм).

Примерное время генерации для Danio rerio составляет три месяца. Для овуляции и нереста должен присутствовать самец . Самки могут нереститься с интервалом в два-три дня, откладывая сотни яиц в каждой кладке . После выпуска начинается эмбриональное развитие; при отсутствии сперматозоидов рост прекращается после нескольких первых делений клеток. Оплодотворенные яйца почти сразу становятся прозрачными, что делает D. rerio удобной моделью для исследования . [22]

Эмбрион рыбок данио развивается быстро, причем предшественники всех основных органов появляются в течение 36 часов после оплодотворения. Эмбрион начинается с желтка с одной огромной клеткой наверху (см. Изображение, панель 0 h), который делится на две (панель 0,75 h) и продолжает делиться, пока не появятся тысячи маленьких клеток (панель 3,25 h). Затем клетки мигрируют по сторонам желтка (8-часовая панель) и начинают формировать голову и хвост (16-часовая панель). Затем хвост растет и отделяется от тела (24-часовая панель). Желток со временем сжимается, потому что рыба использует его в пищу по мере созревания в течение первых нескольких дней (72-часовая панель). Через несколько месяцев взрослая рыба достигает репродуктивной зрелости (нижняя панель).

Чтобы стимулировать нерест рыб, некоторые исследователи используют аквариум с выдвижной вставкой на дне, которая уменьшает глубину бассейна, чтобы имитировать берег реки. Рыбки данио лучше всего нерестятся утром из-за их циркадных ритмов . С помощью этого метода исследователям удалось собрать 10 000 эмбрионов за 10 минут. [26] В частности, одна пара взрослых рыб способна отложить 200–300 яиц за одно утро примерно за 5–10 часов. [27] Кроме того, известно, что самцы данио реагируют на более выраженные отметины на самках, т. Е. На «хорошие полосы», но в группе самцы будут спариваться с теми самками, которых они смогут найти. Что привлекает женщин, в настоящее время не известно. Наличие растений, даже пластиковых, также, по-видимому, способствует нересту.[26]

Воздействие экологически значимых концентраций диизононилфталата (DINP), обычно используемого в большом количестве пластмассовых изделий, нарушает работу эндоканнабиноидной системы и тем самым влияет на репродуктивную функцию в зависимости от пола. [28]

Кормление [ править ]

Рыбы данио всеядны , в основном питаются зоопланктоном , фитопланктоном , насекомыми и личинками насекомых , хотя они могут есть и другие продукты, например червей и мелких ракообразных , если их предпочтительные источники пищи недоступны. [22]

Согласно исследованиям, взрослых рыбок данио часто кормят рассольными креветками или парамециями . [29]

В аквариуме [ править ]

Данио - выносливая рыба и считается хорошей рыбой для начинающих. Их непреходящая популярность объясняется их игривым нравом [30], а также их быстрым размножением, эстетикой, низкой ценой и широкой доступностью. Они также хорошо в школах или косяки из шести или более, и хорошо взаимодействуют с другими видами рыб в аквариуме. Однако они восприимчивы к оодиниуму или бархатной болезни, микроспоридиям ( нейрофилия псевдолома ) и микобактериям.разновидность. Если есть такая возможность, взрослые особи поедают вылупившихся птенцов, которых можно защитить, разделив две группы сеткой, ящиком для размножения или отдельным резервуаром. В неволе данио живут примерно сорок два месяца. У некоторых содержащихся в неволе рыбок данио может развиться искривленный позвоночник. [31]

Зебра данио также использовалась для производства генетически модифицированной рыбы и была первой разновидностью, продаваемой как GloFish (флуоресцентно окрашенная рыба).

Штаммы [ править ]

В конце 2003 года трансгенные рыбки данио, которые экспрессируют зеленые , красные и желтые флуоресцентные белки, стали коммерчески доступны в США. Флуоресцентные штаммы имеют торговое название GloFish ; К другим культивируемым сортам относятся «золотой», «песчаный», «длинноперый» и «леопард».

Леопарда данио, ранее известный как Danio frankei , является пятнистый цвет морф из данио, возникшей из - за мутации пигмента. [32] Ксантистические формы узора зебры и леопарда, а также подвиды с длинными плавниками были получены с помощью программ селекции для аквариумной торговли. [33]

Различные трансгенные и мутантные штаммы рыбок данио хранились в Китайском ресурсном центре по рыбам данио (CZRC), некоммерческой организации , которую совместно поддерживали Министерство науки и технологий Китая и Китайская академия наук . [ необходима цитата ]

Штаммы дикого типа [ править ]

Информационная Сеть рерио ( ZFIN ) предоставляет самую свежую информацию о текущих известных дикого типа (WT) штаммов D. rerio , некоторые из которых перечислены ниже. [34]

  • AB (AB)
  • AB / C32 (AB / C32)
  • AB / TL (AB / TL)
  • AB / Тюбинген (AB / TU)
  • C32 (C32)
  • Кельн (KOLN)
  • Дарджилинг (ДАР)
  • Экквилл (EKW)
  • HK / AB (HK / AB)
  • HK / Sing (HK / SING)
  • Гонконг (HK)
  • Индия (IND)
  • Индонезия (INDO)
  • Надя (NA)
  • RIKEN WT (RW)
  • Сингапур (ПОЕСТЬ)
  • SJA (SJA)
  • SJD (SJD)
  • SJD / C32 (SJD / C32)
  • Тюбинген (TU)
  • Длинный плавник Tupfel (TL)
  • Перламутр Tupfel длинный плавник (TLN)
  • WIK (WIK)
  • WIK / AB (WIK / AB)

Гибриды [ править ]

Гибриды между разными видами данио могут быть плодовитыми: например, между D. rerio и D. nigrofasciatus . [9]

Научные исследования [ править ]

Рыбок данио хроматофоры , показанные здесь посреднический фон адаптации , широко изучаются учеными.
Пигментный мутант рыбок данио (внизу), полученный инсерционным мутагенезом . [9] Эмбрион дикого типа (вверху) показан для сравнения. У мутанта отсутствует черный пигмент в меланоцитах, потому что он не может должным образом синтезировать меланин .

D. rerio - обычная и полезная научная модель организма для изучения развития позвоночных и функций генов . Его использование в качестве лабораторного животного было впервые предложено американским молекулярным биологом Джорджем Стрейзингером и его коллегами из Университета Орегона в 1970-х и 1980-х годах; Данио Streisinger в клонах были одними из первых успешных позвоночных животных клонов , созданных. [35] Его важность была подтверждена успешными крупномасштабными передовыми генетическими скринингами.(обычно называемые экранами Тюбингена / Бостона). У рыб есть специальная онлайн-база данных генетической, геномной информации и информации о развитии, Информационная сеть по рыбкам данио (ZFIN). Международный ресурсный центр по рыбкам данио (ZIRC) - это хранилище генетических ресурсов с 29 250 аллелями, доступными для распространения среди исследовательского сообщества. D. rerio также является одним из немногих видов рыб, которые были отправлены в космос .

Исследования с D. rerio привели к успехам в области биологии развития , онкологии , [36] токсикологии , [37] [38] [39] репродуктивных исследований, тератологии , генетики , нейробиологии , наук об окружающей среде , исследований стволовых клеток , регенеративной медицины , [40] [41] мышечные дистрофии [42] и эволюционная теория . [9]

Рыбки данио использовались в исследованиях увеличения продолжительности жизни. Данио, выращенные в более прохладной воде, живут на 71% дольше. [ссылка]

Характеристики модели [ править ]

В качестве модельной биологической системы рыбки данио обладают множеством преимуществ для ученых. Его геном был полностью секвенирован , и она имеет хорошо изученные, легко наблюдаемые и проверяемые поведения развития. Его эмбриональное развитие очень быстрое, а его эмбрионы относительно большие, крепкие и прозрачные, и могут развиваться вне своей матери. [43] Кроме того, легко доступны хорошо изученные мутантные штаммы.

Другие преимущества включают почти постоянный размер вида на раннем этапе развития, что позволяет использовать простые методы окрашивания , и тот факт, что его двухклеточный эмбрион может быть слит в одну клетку для создания гомозиготного эмбриона. Рыбы данио также явно похожи на модели млекопитающих и людей в тестах на токсичность и демонстрируют дневной цикл сна, сходный с поведением во сне млекопитающих. [44] Однако рыбки данио не являются универсальной идеальной исследовательской моделью; их научное использование имеет ряд недостатков, таких как отсутствие стандартной диеты [45] и наличие небольших, но важных различий между рыбками данио и млекопитающими в ролях некоторых генов, связанных с заболеваниями человека. [46][47]

Он также используется в моделировании и теоретических исследованиях из-за своей относительно простой геометрии, например, при исследовании роли VEGFC в лимфангиогенезе . [48]

Регенерация [ править ]

Рыбки данио обладают способностью регенерировать свои сердечные и волосковые клетки боковой линии на личиночной стадии. [49] [50] В 2011 году Британский фонд сердца провел рекламную кампанию, пропагандируя свое намерение изучить применимость этой способности к людям, заявив, что он стремится привлечь 50 миллионов фунтов стерлингов на финансирование исследований. [51] [52]

Было также обнаружено, что рыбки данио регенерируют фоторецепторные клетки и нейроны сетчатки после повреждения, которое, как было показано, опосредовано дедифференцировкой и пролиферацией мюллеровой глии . [53] Исследователи часто ампутируют спинной и брюшной хвостовые плавники и анализируют их рост, чтобы проверить наличие мутаций. Было обнаружено, что деметилирование гистонов происходит в месте ампутации, переводя клетки рыбок данио в «активное», регенеративное состояние, подобное стволовым клеткам. [54] В 2012 году австралийские ученые опубликовали исследование, показывающее, что рыбки данио используют специальный белок , известный как фактор роста фибробластов., чтобы обеспечить заживление спинного мозга без рубцевания глии после травмы. [4] Кроме того, было обнаружено , что волосковые клетки задней боковой линии регенерируют после повреждения или нарушения развития. [50] [55] Изучение экспрессии генов во время регенерации позволило идентифицировать несколько важных сигнальных путей, участвующих в процессе, таких как передача сигналов Wnt и фактор роста фибробластов . [55] [56]

При исследовании расстройств нервной системы, включая нейродегенеративные заболевания, двигательные расстройства, психические расстройства и глухоту, исследователи используют рыбок данио, чтобы понять, как генетические дефекты, лежащие в основе этих состояний, вызывают функциональные нарушения в головном и спинном мозге человека и органах чувств. [57] [58] [59] [60] Исследователи также изучили данио , чтобы получить новое понимание сложности заболеваний опорно - двигательного аппарата человека, таких как мышечная дистрофия . [61] Еще одна цель исследований рыбок данио - понять, как ген под названием Hedgehog , биологический сигнал, лежащий в основе ряда видов рака у человека, контролирует рост клеток.

Генетика [ править ]

Фон генетика [ править ]

Инбредные линии и традиционные беспородные поголовья не были разработаны для лабораторных рыбок данио, а генетическая изменчивость линий дикого типа среди учреждений может способствовать кризису репликации в биомедицинских исследованиях. [62] Генетические различия в линиях дикого типа среди популяций, поддерживаемых в различных исследовательских учреждениях, были продемонстрированы с использованием как однонуклеотидных полиморфизмов [63], так и микросателлитного анализа. [64]

Экспрессия гена [ править ]

Из-за их быстрого и короткого жизненного цикла и относительно большого размера кладки D. rerio или рыбки данио являются полезной моделью для генетических исследований. Общий обратная генетика метод заключается в снижении экспрессии гена или модифицировать сплайсинг , используя морфолина антисмысловую технологию. Морфолино олигонуклеотиды (MO) являются стабильными, синтетические макромолекулы , которые содержат одни и те же основы , как ДНК или РНК; связываясь с комплементарными последовательностями РНК, они могут снижать экспрессиюопределенных генов или блокировать другие процессы на РНК. МО можно вводить в одну клетку эмбриона после 32-клеточной стадии, снижая экспрессию генов только в клетках, произошедших от этой клетки. Однако клетки в раннем эмбрионе (менее 32 клеток) проницаемы для больших молекул, [65] [66] обеспечивая диффузию между клетками. Рекомендации по использованию морфолино у рыбок данио описывают соответствующие стратегии контроля. [67] Морфолино обычно вводят микро-инъекциями в объеме 500 мкл непосредственно в 1-2-клеточные эмбрионы рыбок данио. Морфолино способен интегрироваться в большинство клеток эмбриона. [68]

Известная проблема с геном нокдаунов является то , что, поскольку геном подвергся дублирования после дивергенции лучеперые рыб и лепестка-ребристых рыб , это не всегда легко заглушить активность одного из двух генов паралогов надежно за счет комплементации с помощью другой паралог. [69] Несмотря на сложности генома рыбок данио , существует ряд коммерчески доступных глобальных платформ для анализа как экспрессии генов с помощью микрочипов, так и регуляции промоторов с использованием ChIP-on-chip . [70]

Секвенирование генома [ править ]

Wellcome Trust Sanger институт начал данио секвенирования генома проекта в 2001 году, и полная последовательность генома эталонного штамма Тюбинген общедоступна в Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) 's данио Genome Page . Данио последовательность генома ссылки помечаются как часть Ensembl проекта , и поддерживается в ссылочном Консорциуме генома . [71]

В 2009 году исследователи из Института геномики и интегративной биологии в Дели , Индия, объявили о секвенировании генома дикого штамма рыбок данио, содержащего примерно 1,7 миллиарда генетических букв. [72] [73] Геном диких рыбок данио секвенировали с 39-кратным охватом. Сравнительный анализ с эталонным геномом рыбок данио выявил более 5 миллионов вариаций одиночных нуклеотидов и более 1,6 миллиона вариаций вставок и делеций. Эталонная последовательность генома рыбок данио размером 1,4 ГБ и более 26000 генов, кодирующих белок, была опубликована Kerstin Howe et al. в 2013 году. [74]

Митохондриальная ДНК [ править ]

В октябре 2001 года исследователи из Университета Оклахомы опубликовали полную последовательность митохондриальной ДНК D. rerio . [75] Его длина составляет 16 596 пар оснований. Это в пределах 100 пар оснований от других родственных видов рыб, и примечательно, что это всего на 18 пар длиннее, чем у золотой рыбки ( Carassius auratus ), и на 21 пара длиннее, чем у карпа ( Cyprinus carpio ). Порядок и содержание его генов идентичны митохондриальной ДНК у позвоночных . Он содержит 13 генов, кодирующих белок, и некодирующую контрольную область, содержащую источник репликации.для тяжелой пряди. Между группировкой из пяти генов тРНК обнаруживается последовательность, напоминающая начало репликации легкой цепи позвоночных. Трудно делать эволюционные выводы, потому что трудно определить, имеют ли изменения пары оснований адаптивное значение, путем сравнения с нуклеотидными последовательностями других позвоночных . [75]

Гены пигментации [ править ]

В 1999 году мутация перламутра была идентифицирована в ортологе транскрипционного фактора MITF млекопитающих у рыбок данио . [76] Мутации в человеческом MITF приводят к дефектам глаз и потере пигмента, типу синдрома Ваарденбурга . В декабре 2005 года исследование золотого штамма идентифицировало ген, ответственный за его необычную пигментацию, как SLC24A5 , растворенный носитель, который, по-видимому, необходим для выработки меланина , и подтвердил его функцию с помощью нокдауна морфолино. ортологичнымиЗатем ген был охарактеризован у людей, и было обнаружено, что разница в одну пару оснований сильно разделяет светлокожих европейцев и темнокожих африканцев. [77] Рыбки данио с мутацией перламутра были с тех пор скрещены с рыбами с мутацией roy orbison (roy), чтобы получить рыб, не имеющих меланофоров или иридофоров, и прозрачных во взрослой жизни. Для этих рыб характерны равномерно пигментированные глаза и полупрозрачная кожа. [6]

Трансгенез [ править ]

Трансгенез - популярный подход к изучению функции генов у рыбок данио. Конструировать трансгенных рыбок данио достаточно просто с помощью метода, использующего систему транспозонов Tol2 . Элемент Tol2, который кодирует ген полностью функциональной транспозазы, способной катализировать транспозицию в зародышевой линии рыбок данио. Tol2 является единственным естественным мобильным элементом ДНК у позвоночных, от которого был идентифицирован автономный член. [78]

Прозрачные тела взрослых [ править ]

В 2008 году исследователи из Бостонской детской больницы разработали новый вид рыбок данио по имени Каспер, чьи взрослые тела имели прозрачную кожу. [6] Это позволяет детально визуализировать клеточную активность, кровообращение, метастазирование и многие другие явления. [6] В 2019 году исследователи опубликовали результаты скрещивания штаммов prkdc - / - и IL2rga - / -, которые дали прозрачное иммунодефицитное потомство, лишенное естественных клеток-киллеров, а также B- и T-клеток . Этот штамм может быть адаптирован к теплой воде 37 ° C, а отсутствие иммунной системы заставляет использовать полученные от пациентоввозможны ксенотрансплантаты . [79] В январе 2013 года японские ученые генетически модифицировали образец прозрачной рыбы данио, чтобы производить видимое свечение в периоды интенсивной мозговой активности. [7]

В январе 2007 года китайские исследователи из Университета Фудань генетически модифицировали рыбок данио для обнаружения загрязнения озер и рек эстрогеном , которое связано с мужским бесплодием. Исследователи клонировали гены, чувствительные к эстрогену, и ввели их в оплодотворенные яйца рыбок данио. Модифицированная рыба становилась зеленой, если помещать ее в воду, загрязненную эстрогеном. [5]

Сплайсинг РНК [ править ]

В 2015 году исследователи из Университета Брауна обнаружили, что 10% генов рыбок данио не должны полагаться на белок U2AF2, чтобы инициировать сплайсинг РНК . Эти гены имеют пары оснований ДНК AC и TG как повторяющиеся последовательности на концах каждого интрона . На 3'ss (3'-сайт сплайсинга) пары оснований аденин и цитозин чередуются и повторяются, а на 5'ss (5'-сайт сплайсинга) их дополняют тимин и гуанин.чередовать и повторять тоже. Они обнаружили, что белок U2AF2 меньше полагался на белок, чем у людей, у которых белок необходим для возникновения процесса сплайсинга. Паттерн повторяющихся пар оснований вокруг интронов, который изменяет вторичную структуру РНК, был обнаружен у других костистых , но не у четвероногих . Это указывает на то, что эволюционное изменение четвероногих, возможно, привело к тому, что люди полагались на белок U2AF2 для сплайсинга РНК, тогда как эти гены у рыбок данио подвергаются сплайсингу независимо от присутствия белка. [80]

Инбридинговая депрессия [ править ]

Когда близкие родственники спариваются, потомство может проявлять пагубные последствия инбридинговой депрессии . Инбридинговая депрессия преимущественно вызывается гомозиготной экспрессией рецессивных вредных аллелей. [81] Для рыбок данио инбридинговая депрессия может быть более серьезной в стрессовой среде, в том числе вызванной антропогенным загрязнением . Воздействие на рыбок зебры экологического стресса, вызванного химическим веществом клотримазол, имидазольным фунгицидом, используемым в сельском хозяйстве, ветеринарии и медицине, усилило влияние инбридинга на ключевые репродуктивные признаки. [82] Жизнеспособность эмбрионов была значительно снижена у инбредных рыб, подвергшихся воздействию, и у инбредных самцов наблюдалась тенденция давать меньше потомства.

Открытие и разработка лекарств [ править ]

В исследовании FDA использовалась рыба данио, чтобы показать влияние кетамина на неврологическое развитие.

Рыбки данио и личинки рыбок данио являются подходящими модельными организмами для открытия и разработки лекарств. Как позвоночное животное с 70% генетической гомологией с людьми [74], оно может предсказывать здоровье и болезнь человека, в то время как его небольшой размер и быстрое развитие облегчают эксперименты в более крупных и более быстрых масштабах, чем при более традиционных исследованиях in vivo , включая разработку автоматизированных средств расследования с высокой пропускной способностью. [83] [84] Как показали текущие исследовательские программы, модель рыбок данио позволяет исследователям не только идентифицировать гены, которые могут лежать в основе болезней человека, но и разрабатывать новые терапевтические агенты в программах открытия лекарств. [85]Эмбрионы рыбок данио оказались быстрой, рентабельной и надежной моделью тератологического анализа. [86]

Скрины с наркотиками [ править ]

Скрининг лекарств у рыбок данио можно использовать для выявления новых классов соединений с биологическим действием или для перепрофилирования существующих лекарств для новых применений; примером последнего может быть скрининг, который обнаружил, что обычно используемый статин ( розувастатин ) может подавлять рост рака простаты . [87] На сегодняшний день проведено 65 скринингов на малые молекулы, и по крайней мере один из них привел к клиническим испытаниям. [88] В рамках этих экранов еще предстоит решить многие технические проблемы, в том числе разные скорости абсорбции лекарств, приводящие к уровням внутреннего воздействия, которые не могут быть экстраполированы на основе концентрации воды, и высокие уровни естественных вариаций между отдельными животными. [88]

Токсико-фармакокинетика [ править ]

Для понимания эффектов лекарств необходимо внутреннее воздействие лекарств, так как оно определяет фармакологический эффект. Для перевода результатов экспериментов с рыбок данио на высших позвоночных (например, людей) требуются зависимости «концентрация-эффект», которые могут быть получены из фармакокинетического и фармакодинамического анализа. [3] Однако из-за небольшого размера очень сложно количественно оценить внутреннее воздействие наркотиков. Традиционно для характеристики профиля концентрации лекарственного средства во времени брали несколько образцов крови, но этот метод еще предстоит разработать. На сегодняшний день разработана только одна фармакокинетическая модель парацетамола для личинок рыбок данио. [89]

Вычислительный анализ данных [ править ]

Используя интеллектуальные методы анализа данных, можно понять патофизиологические и фармакологические процессы и впоследствии передать их на высших позвоночных, включая человека. [3] [90] Примером может служить использование системной фармакологии , которая представляет собой интеграцию системной биологии и фармакометрии . Системная биология характеризует организм (часть) с помощью математического описания всех соответствующих процессов. Это могут быть, например, различные пути передачи сигнала, которые при определенном сигнале приводят к определенному ответу. Количественно оценивая эти процессы, можно понять и спрогнозировать их поведение как в здоровых, так и в болезненных условиях. Pharmacometrics использует данные доклинических экспериментов и клинических испытаний.для характеристики фармакологических процессов, лежащих в основе взаимосвязи между дозой лекарства и его ответом или клиническим исходом. Это может быть, например, абсорбция лекарственного средства или его клиренс.от тела, или его взаимодействие с целью для достижения определенного эффекта. Количественно оценивая эти процессы, их поведение после разных доз или у разных пациентов можно понять и спрогнозировать для новых доз или пациентов. Интегрируя эти две области, системная фармакология может улучшить понимание взаимодействия лекарственного средства с биологической системой посредством математической количественной оценки и последующего прогнозирования новых ситуаций, таких как новые лекарства, новые организмы или пациенты. С использованием этих вычислительных методов ранее упомянутый анализ внутреннего воздействия парацетамола на личинок рыбок данио показал разумную корреляцию между клиренсом парацетамола у рыбок данио и высших позвоночных, включая человека. [89]

Медицинское исследование [ править ]

Рак [ править ]

Рыбки данио использовались для создания нескольких трансгенных моделей рака, включая меланому , лейкемию , рак поджелудочной железы и гепатоцеллюлярную карциному . [91] [92] У рыбок данио, экспрессирующих мутированные формы онкогенов BRAF или NRAS, развивается меланома при помещении на фон с дефицитом р53. Гистологически эти опухоли сильно напоминают человеческое заболевание, полностью трансплантируемы и демонстрируют крупномасштабные геномные изменения. Модель меланомы BRAF была использована в качестве платформы для двух экранов, опубликованных в марте 2011 года в журнале Nature.. В одном исследовании модель использовалась в качестве инструмента для понимания функциональной важности генов, которые, как известно, амплифицируются и сверхэкспрессируются в меланоме человека. [93] Один ген, SETDB1, заметно ускорял образование опухолей в системе рыбок данио, демонстрируя его важность как нового онкогена меланомы. Это было особенно важно, потому что SETDB1, как известно, участвует в эпигенетической регуляции, которая все больше и больше считается центральной в биологии опухолевых клеток.

В другом исследовании была предпринята попытка терапевтического воздействия на генетическую программу, присутствующую в клетке нервного гребня опухоли, с использованием метода химического скрининга. [94] Это показало, что ингибирование белка DHODH (небольшой молекулой, называемой лефлуномидом) предотвращает развитие стволовых клеток нервного гребня, которые в конечном итоге вызывают меланому через вмешательство в процесс удлинения транскрипции. Поскольку этот подход направлен на выявление «идентичности» клетки меланомы, а не на единственную генетическую мутацию, лефлуномид может быть полезен при лечении меланомы человека. [95]

Сердечно-сосудистые заболевания [ править ]

В сердечно - сосудистых исследованиях, данио был использован для модели свертывания крови , развития кровеносных сосудов , сердечной недостаточности, а также врожденного заболевания сердца и почек . [96]

Иммунная система [ править ]

В программах исследования острого воспаления , основного процесса, лежащего в основе многих заболеваний, исследователи создали модель воспаления у рыбок данио и ее разрешение. Этот подход позволяет детально изучить генетический контроль воспаления и возможность выявления потенциальных новых лекарств. [97]

Рыбки данио широко использовались в качестве модельных организмов для изучения врожденного иммунитета позвоночных. Врожденная иммунная система способна проявлять фагоцитарную активность через 28–30 часов после оплодотворения (hpf) [98], в то время как адаптивный иммунитет не становится функционально зрелым, по крайней мере, через 4 недели после оплодотворения. [99]

Инфекционные болезни [ править ]

Поскольку иммунная система рыбок данио и людей относительно консервативна, многие инфекционные заболевания человека можно моделировать на рыбках данио. [100] [101] [102] [103] Прозрачные ранние стадии жизни хорошо подходят для визуализации in vivo и генетического анализа взаимодействий хозяин-патоген. [104] [105] [106] [107] Модели рыбок данио для широкого спектра бактериальных, вирусных и паразитарных патогенов уже созданы; например, модель рыбок данио для туберкулеза обеспечивает фундаментальное понимание механизмов патогенеза микобактерий. [108] [109] [110] [111]Кроме того, была разработана роботизированная технология для высокопроизводительного скрининга противомикробных препаратов с использованием моделей инфекции рыбок данио. [112] [113]

Восстановление повреждений сетчатки [ править ]

Развитие одиночной сетчатки у рыбок данио зафиксировано на световом микроскопе ок. каждые 12 часов от 1,5 дней до 3,5 дней после рождения эмбриона.

Другой примечательной особенностью рыбок данио является то, что они обладают четырьмя типами колбочек , причем чувствительные к ультрафиолету клетки дополняют подтипы красных, зеленых и синих клеток колбочек, встречающиеся у людей. Таким образом, данио может наблюдать очень широкий спектр цветов. Этот вид также изучается, чтобы лучше понять развитие сетчатки; в частности, как клетки колбочек сетчатки объединяются в так называемую «мозаику колбочек». Рыбки данио, в дополнение к некоторым другим костистым рыбам, особенно известны своей исключительной точностью расположения колбочек. [114]

Это исследование характеристик сетчатки рыбок данио также было экстраполировано на медицинские исследования. В 2007 году исследователи из Университетского колледжа Лондона вырастили взрослые стволовые клетки рыбок данио, обнаруженные в глазах рыб и млекопитающих, которые развиваются в нейроны сетчатки. Их можно вводить в глаз для лечения заболеваний, повреждающих нейроны сетчатки - почти всех заболеваний глаза, включая дегенерацию желтого пятна , глаукому и слепоту, связанную с диабетом . Исследователи изучили глиальные клетки Мюллера.в глазах людей в возрасте от 18 месяцев до 91 года и смогли развить их во все типы нейронов сетчатки. Они также смогли легко выращивать их в лаборатории. Стволовые клетки успешно мигрировали в сетчатку больных крыс и приобрели характеристики окружающих нейронов. Команда заявила, что они намеревались разработать такой же подход на людях. [115]

Мышечные дистрофии [ править ]

Мышечные дистрофии (МД) представляют собой гетерогенную группу генетических заболеваний, вызывающих мышечную слабость, аномальные сокращения и мышечное истощение, часто приводящее к преждевременной смерти. Рыбки данио широко используются в качестве модельных организмов для изучения мышечных дистрофий. [116] Например, мутант sapje ( sap ) является ортологом у рыбок данио мышечной дистрофии Дюшенна (МДД) человека. [117] Мачука-Цили и его сотрудники применили рыбок данио, чтобы определить роль альтернативного фактора сплайсинга, MBNL, в патогенезе миотонической дистрофии 1 типа (DM1). [118]Совсем недавно Тодд и др. описали новую модель рыбок данио, разработанную для изучения влияния экспрессии повторов CUG во время раннего развития болезни DM1. [119] Рыбы данио также являются отличной моделью на животных для изучения врожденных мышечных дистрофий, включая CMD типа 1 A (CMD 1A), вызванные мутацией в гене ламинина α2 человека (LAMA2). [120] Рыбки данио, благодаря своим преимуществам, описанным выше, и, в частности, способности эмбрионов рыбок данио поглощать химические вещества, стали предпочтительной моделью при скрининге и тестировании новых лекарств против мышечных дистрофий. [121]

Физиология и патология костей [ править ]

Рыбки данио использовались в качестве модельных организмов для костного метаболизма, тканевого обновления и резорбционной активности. Эти процессы в значительной степени сохраняются эволюционно. Они использовались для изучения остеогенеза (формирования кости), оценки дифференциации, активности отложения матрикса и перекрестного взаимодействия скелетных клеток, для создания и выделения мутантов, моделирующих заболевания костей человека, и тестирования новых химических соединений на способность восстанавливать дефекты костей. [122] [123] Личинки могут использоваться для отслеживания образования новых ( de novo ) остеобластов во время развития костей. Они начинают минерализацию костных элементов уже через 4 дня после оплодотворения. В последнее время взрослых рыбок данио используют для изучения сложных возрастных заболеваний костей, таких как остеопороз инесовершенный остеогенез . [124] (Элазмоидная) чешуя рыбок данио функционирует как защитный внешний слой и представляет собой маленькие костные пластинки, образованные остеобластами. Эти экзоскелетные структуры образованы костным матриксом, откладывающим остеобласты, и реконструируются остеокластами. Чешуя также является основным хранилищем кальция в рыбе. Их можно культивировать ex vivo (сохранять живыми вне организма) в многолуночном планшете, что позволяет манипулировать лекарствами и даже проводить скрининг новых лекарств, которые могут изменить метаболизм костей (между остеобластами и остеокластами). [124] [125] [126]

Диабет [ править ]

Развитие поджелудочной железы у рыбок данио очень похоже на развитие поджелудочной железы у млекопитающих, таких как мыши. Сигнальные механизмы и функции поджелудочной железы очень похожи. В поджелудочной железе есть эндокринный отсек, который содержит множество клеток. Клетки PP поджелудочной железы, которые продуцируют полипептиды, и β-клетки, которые продуцируют инсулин, являются двумя примерами таких клеток. Эта структура поджелудочной железы вместе с системой гомеостаза глюкозы полезна при изучении заболеваний, связанных с поджелудочной железой, таких как диабет. Модели функции поджелудочной железы, такие как флуоресцентное окрашивание белков, полезны для определения процессов гомеостаза глюкозы и развития поджелудочной железы. Тесты на толерантность к глюкозе были разработаны с использованием рыбок данио и теперь могут использоваться для тестирования непереносимости глюкозы или диабета у людей.Функция инсулина также проверяется на рыбках данио, что в дальнейшем будет способствовать развитию медицины. Большая часть работы, связанной с изучением гомеостаза глюкозы, была получена в результате работы с рыбками данио, переданными людям.[127]

Ожирение [ править ]

Рыбки данио использовались в качестве модельной системы для изучения ожирения с исследованиями как генетического ожирения, так и ожирения, вызванного перееданием. У тучных рыбок данио, как и у тучных млекопитающих, наблюдается нарушение регуляции метаболических путей, контролирующих липиды, что приводит к увеличению веса без нормального метаболизма липидов. [127] Также, как и у млекопитающих, рыбки данио накапливают избыток липидов во висцеральных, внутримышечных и подкожных жировых отложениях. Эти и другие причины делают рыбок данио хорошими моделями для изучения ожирения у людей и других видов. Генетическое ожирение обычно изучается у трансгенных или мутировавших рыбок данио с генами, вызывающими ожирение. Например, трансгенный зербафиш со сверхэкспрессией AgRP, эндогенного антагониста мелакортина, показал повышенную массу тела и отложение жира во время роста. [127]Хотя гены рыбок данио могут не совпадать с генами человека, эти тесты могут дать важную информацию о возможных генетических причинах и методах лечения генетического ожирения человека. [127] Модели рыбок данио с ожирением, вызванным диетой, полезны, поскольку диету можно изменять с самого раннего возраста. Как диеты с высоким содержанием жиров, так и диеты с общим перекармливанием показывают быстрое увеличение жировых отложений, увеличение ИМТ, гепатостеатоз и гипертриглицеридемию. [127] Однако образцы с нормальным жиром, перекормленные, по-прежнему метаболически здоровы, а образцы с высоким содержанием жиров - нет. [127] Понимание различий между типами ожирения, вызванного кормлением, может оказаться полезным при лечении людей с ожирением и связанными с ним заболеваниями. [127]

Экологическая токсикология [ править ]

Рыбки данио использовались в качестве модельной системы в исследованиях экологической токсикологии . [27]

Эпилепсия [ править ]

Рыбки данио использовались в качестве модельной системы для изучения эпилепсии. Приступы у млекопитающих могут быть воспроизведены на молекулярном, поведенческом и электрофизиологическом уровне с использованием части ресурсов, необходимых для экспериментов на млекопитающих. [128]

См. Также [ править ]

  • Японская рисовая рыба или медака, другая рыба, используемая для генетических, биомедицинских и генетических исследований.
  • Список видов пресноводных аквариумных рыб
  • ZebraBox , специализированный контейнер для научных исследований рыбок данио

Ссылки [ править ]

  1. ^ а б в г Вишванат, W. (2010). "Данио рерио" . Красный список исчезающих видов МСОП . 2010 : e.T166487A6219667. DOI : 10.2305 / IUCN.UK.2010-4.RLTS.T166487A6219667.en . Проверено 15 января 2018 .
  2. ^ "Разведение данио (Zebra danios)" .
  3. ^ a b c Ван Вейк Р.С., Крекельс Э.Х., Ханкемайер Т., Спанек Х.П., Ван дер Грааф PH (2017). «Системная фармакология метаболизма в печени у личинок рыбок данио» . Открытие лекарств сегодня: модели болезней . 22 : 27–34. DOI : 10.1016 / j.ddmod.2017.04.003 .
  4. ^ a b Goldshmit Y, Sztal TE, Jusuf PR, Hall TE, Nguyen-Chi M, Currie PD (май 2012 г.). «Fgf-зависимые мостики глиальных клеток способствуют регенерации спинного мозга у рыбок данио» (PDF) . Журнал неврологии . 32 (22): 7477–92. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.0758-12.2012 . PMC 6703582 . PMID 22649227 . Краткое содержание - Sci-News.com (1 июня 2012 г.).   
  5. ^ a b «Ученые Фудань превращают рыбу в оповещения об эстрогене» . Синьхуа . 12 января 2007 г. Проверено 15 ноября 2012 г.
  6. ^ a b c d Уайт Р.М., Сесса А., Берк С., Боуман Т., Леблан Дж., Сеол С., Бурк С., Дови М., Гесслинг В., Бернс К.Э., Зон Л.И. (февраль 2008 г.). «Прозрачные взрослые рыбки данио как инструмент для анализа трансплантации in vivo» . Стволовая клетка . 2 (2): 183–9. DOI : 10.1016 / j.stem.2007.11.002 . PMC 2292119 . PMID 18371439 . Краткое содержание - LiveScience (6 февраля 2008 г.).  
  7. ^ a b «Исследователи фиксируют мыслительный процесс рыбок данио на видео» . Популярная наука . 31 января 2013 . Проверено 4 февраля 2013 года .
  8. McCluskey BM, Postlethwait JH (март 2015 г.). «Филогения рыбок данио,« модельный вид »внутри Данио ,« модельный род » » . Молекулярная биология и эволюция . 32 (3): 635–52. DOI : 10.1093 / molbev / msu325 . PMC 4327152 . PMID 25415969 .  
  9. ^ a b c d Паричи Д.М. (сентябрь 2006 г.). «Эволюция развития пигментного рисунка данио» . Наследственность . 97 (3): 200–10. DOI : 10.1038 / sj.hdy.6800867 . PMID 16835593 . 
  10. ^ "Книга данио" . ZFIN . Проверено 3 июля 2013 года .
  11. ^ Kottelat M (ноябрь 2013). «Рыбы внутренних вод Юго-Восточной Азии: каталог и основная библиография рыб, обитающих в пресных водах, мангровых зарослях и эстуариях» . Бюллетень зоологических добавок Raffles . 27 (1): 1–663. ISBN 978-2-8399-1344-7.
  12. Петр, Т. (1999). «Холодноводная рыба и рыболовство в Бутане» . ФАО . Проверено 28 марта 2019 .
  13. ^ a b c Притчард, VL (январь 2001 г.). Поведение и морфология данио, данио рерио(Кандидатская диссертация). Университет Лидса.
  14. ^ Б с д е е Engeszer, RE; Л. Б. Паттерсон; AA Rao; KD.M. Паричи (2007). «Данио в дикой природе: Обзор естествознания и новые заметки с мест» . Данио . 4 (1): 21–39. DOI : 10.1089 / zeb.2006.9997 . PMID 18041940 . S2CID 34342799 .  
  15. ^ a b c d e Аруначалам, Мутукумарасами; Раджа, Маникам; Виджаякумар, Чинниан; Малайаммал, Пунниям; Мейден, Ричард Л. (март 2013 г.). «Естественная история данио ( Danio rerio ) в Индии». Данио . 10 (1): 1–14. DOI : 10.1089 / zeb.2012.0803 . PMID 23590398 . 
  16. ^ "Данио в естественной среде" . Университет Отаго . Проверено 28 марта 2019 .
  17. ^ a b Спенс Р. (декабрь 2006 г.), Поведение и экология рыбок данио, Данио рерио., Университет Лестера
  18. ^ a b "Brachydanio rerio (Гамильтон, 1822)" . Серьезно, рыба . Проверено 28 марта 2019 .
  19. Перейти ↑ Fang, F. (1998). «Данио кьятит, новый вид карповых из Мьиткины, север Мьянмы». Ихтиологические исследования пресных вод . 8 (3): 273–280.
  20. ^ "Данио рерио" . Неаборигенные водные виды . Геологическая служба США . 14 июня 2013 . Проверено 3 июля 2013 года .
  21. ^ a b Froese, Rainer and Pauly, Daniel, eds. (2019). « Данио рерио » в FishBase . Версия от марта 2019 г.
  22. ^ a b c d Спенс Р., Герлах Г., Лоуренс С., Смит С. (февраль 2008 г.). «Поведение и экология рыбок данио, Данио рерио ». Биологические обзоры Кембриджского философского общества . 83 (1): 13–34. DOI : 10.1111 / j.1469-185X.2007.00030.x . hdl : 2381/27758 . PMID 18093234 . 
  23. ^ Спенс R, Fatema MK, Рейхард M, Huq К.А., Вахаб М.А., Ахмед ZF, Smith C (2006). «Распространение и предпочтения среды обитания рыбок данио в Бангладеш». Журнал биологии рыб . 69 (5): 1435–1448. DOI : 10.1111 / j.1095-8649.2006.01206.x .
  24. ^ Gerhard GS, Kauffman EJ, Ван X, Стюарт R, Мур JL, Kasales CJ, Демиденко E, Ченг KC (2002). «Продолжительность жизни и стареющие фенотипы у двух штаммов рыбок данио ( Danio rerio )». Экспериментальная геронтология . 37 (8–9): 1055–68. DOI : 10.1016 / s0531-5565 (02) 00088-8 . PMID 12213556 . S2CID 25092240 .  
  25. ^ Гамильтон, Тревор Дж .; Myggland, Эллисон; Дюперро, Эрика; Мэй, Закникте; Гэллап, Джошуа; Пауэлл, Рассел А .; Шаломон, Мелике; Дигвид, Шеннон М. (15 июля 2016 г.). «Эпизодическая память у рыбок данио». Познание животных . 19 (6): 1071–1079. DOI : 10.1007 / s10071-016-1014-1 . PMID 27421709 . S2CID 2552608 .  
  26. ^ a b Доксер A (13 января 2012 г.). «Птицы делают это, пчелы делают это, даже рыбки данио делают это - слишком мало» . Wall Street Journal . Проверено 11 февраля 2012 года .
  27. ^ а б Хилл, Адриан Дж .; Тераока, Хироки; Хайдеман, Уоррен; Петерсон, Ричард Э. (1 июля 2005 г.). «Данио как модель позвоночного животного для исследования химической токсичности» . Токсикологические науки . 86 (1): 6–19. DOI : 10.1093 / toxsci / kfi110 . ISSN 1096-6080 . 
  28. ^ Форнер-Пикер, Изабель; Сантанджели, Стефания; Марадонна, Франческа; Раббито, Алессандро; Пискителли, Фабиана; Habibi, Hamid R .; Ди Марцо, Винченцо; Карневали, Олиана (октябрь 2018 г.). «Нарушение эндоканнабиноидной системы гонад у рыбок данио, подвергшихся воздействию диизононилфталата». Загрязнение окружающей среды . 241 : 1–8. DOI : 10.1016 / j.envpol.2018.05.007 . PMID 29793103 . 
  29. ^ Westerfield M (2007). Книга о рыбках данио : Руководство по лабораторному использованию рыбок данио ( Данио Рерио ) . Университет штата Орегон Press.
  30. Перейти Gerhard GS, Cheng KC (декабрь 2002 г.). «Призыв к плавникам! Данио как геронтологическая модель» . Ячейка старения . 1 (2): 104–11. DOI : 10.1046 / j.1474-9728.2002.00012.x . PMID 12882339 . 
  31. ^ «Данио - Данио рерио - Детали - Энциклопедия жизни» . Энциклопедия жизни .
  32. ^ Watanabe M, Iwashita M, Ишии M, Kurachi Y, Каваками A, S Kondo, Окада N (сентябрь 2006). «Точечный рисунок леопарда данио вызван мутацией в гене коннексина 41.8 рыбок данио » . EMBO Reports . 7 (9): 893–7. DOI : 10.1038 / sj.embor.7400757 . PMC 1559663 . PMID 16845369 .  
  33. Перейти ↑ Mills D (1993). Справочник очевидца: аквариумные рыбки . Харпер Коллинз. ISBN 978-0-7322-5012-6.[ требуется страница ]
  34. ^ "ZFIN: Строки дикого типа: Сводный список" . zfin.org . Проверено 17 июня 2019 .
  35. ^ "Памяти Джорджа Страйзингера," отца-основателя "исследований развития и генетики рыбок данио" . Университет Орегона . Проверено 23 сентября 2015 года .
  36. ^ Сян Дж, Ян Х, Че Ц, Цзоу Х, Ян Х, Вэй Y, Цюань Дж, Чжан Х, Ян З, Лин S (2009). Исалан М (ред.). «Идентификация ингибиторов роста опухолевых клеток комбинаторной химией и анализами рыбок данио» . PLOS ONE . 4 (2): e4361. Bibcode : 2009PLoSO ... 4.4361X . DOI : 10.1371 / journal.pone.0004361 . PMC 2633036 . PMID 19194508 .  
  37. Hill AJ, Teraoka H, ​​Heideman W, Peterson RE (июль 2005 г.). «Данио как модель позвоночного животного для исследования химической токсичности» . Токсикологические науки . 86 (1): 6–19. DOI : 10.1093 / toxsci / kfi110 . PMID 15703261 . 
  38. ^ Бугель SM, Tanguay RL, Planchart A (сентябрь 2014). "токсикология века" . Текущие отчеты о состоянии окружающей среды . 1 (4): 341–352. DOI : 10.1007 / s40572-014-0029-5 . PMC 4321749 . PMID 25678986 .  
  39. ^ Dubińska-Magiera М, Daczewska М, Lewicka А, Migocka-Patrzałek М, Niedbalska-Тарновск Дж, Jagla К (ноябрь 2016). «Данио: модель для изучения токсикантов, влияющих на развитие и функцию мышц» . Международный журнал молекулярных наук . 17 (11): 1941. DOI : 10,3390 / ijms17111941 . PMC 5133936 . PMID 27869769 .  
  40. ^ Майор RJ, Poss KD (2007). «Регенерация сердца у рыбок данио как модель восстановления сердечной ткани» . Открытие лекарств сегодня: модели болезней . 4 (4): 219–225. DOI : 10.1016 / j.ddmod.2007.09.002 . PMC 2597874 . PMID 19081827 .  
  41. ^ «Исследования стволовых клеток взрослых избегают этических проблем» . Голос Америки. 19 мая 2010 . Проверено 21 июня 2013 года .
  42. ^ Plantié E, Migocka-Patrzałek M, Daczewska M, Jagla K (апрель 2015). «Модельные организмы в борьбе с мышечной дистрофией: уроки дрозофилы и данио» . Молекулы . 20 (4): 6237–53. DOI : 10,3390 / молекулы20046237 . PMC 6272363 . PMID 25859781 .  
  43. ^ Dahm R (2006). «Разоблаченный данио» . Американский ученый . 94 (5): 446–53. DOI : 10.1511 / 2006.61.446 .
  44. ^ Джонс R (октябрь 2007 г.). «Пусть лежат спящие данио: новая модель для изучения сна» . PLOS Биология . 5 (10): e281. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0050281 . PMC 2020498 . PMID 20076649 .  
  45. ^ Penglase S, M Морен, Hamre K (ноябрь 2012). «Лабораторные животные: стандартизируйте диету для модели рыбок данио» . Природа . 491 (7424): 333. Bibcode : 2012Natur.491..333P . DOI : 10.1038 / 491333a . PMID 23151568 . 
  46. ^ Jurynec MJ, Xia R, Mackrill JJ, Гюнтер D, Кроуфорд T, Flanigan KM, Абрамсон JJ, Howard MT, Grunwald DJ (август 2008). «Селенопротеин N необходим для активности канала высвобождения кальция рецептора рианодина в мышцах человека и рыбок данио» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (34): 12485–90. Bibcode : 2008PNAS..10512485J . DOI : 10.1073 / pnas.0806015105 . PMC 2527938 . PMID 18713863 .  
  47. ^ Rederstorff М, Castets Р, S Арбогаст, LAINE Дж, Vassilopoulos S, Beuvin М, Dubourg О, Vignaud А, Ферри А, Крол А, Allamand В, Guicheney Р, Феррейро А, Lescure А (2011). «Повышенная чувствительность к стрессу мышц, вызванная инактивацией селенопротеина N у мышей: модель млекопитающих миопатии, связанной с SEPN1» . PLOS ONE . 6 (8): e23094. Bibcode : 2011PLoSO ... 623094R . DOI : 10.1371 / journal.pone.0023094 . PMC 3152547 . PMID 21858002 .  
  48. ^ Wertheim, Kenneth Y .; Русе, Тийна (23 февраля 2017 г.). «Математическая модель лимфангиогенеза в эмбрионе рыбок данио» . Вестник математической биологии . 79 (4): 693–737. DOI : 10.1007 / s11538-017-0248-7 . PMC 5501200 . PMID 28233173 .  
  49. Уэйд, Николас (24 марта 2010 г.). «Исследование предлагает ключ к разгадке того, как сердца могут восстанавливаться у некоторых видов» . Нью-Йорк Таймс .
  50. ^ a b Lush ME, Piotrowski T (октябрь 2014 г.). «Регенерация сенсорных волосковых клеток в боковой линии рыбок данио» . Динамика развития . 243 (10): 1187–202. DOI : 10.1002 / dvdy.24167 . PMC 4177345 . PMID 25045019 .  
  51. ^ «Восстановление разбитых сердец (2011), телевизионная реклама Британского фонда сердца» . British Heart Foundation через YouTube . 31 января 2011 . Проверено 15 ноября 2012 года .
  52. ^ "British Heart Foundation - наука, стоящая за обращением" . Bhf.org.uk. 16 февраля 2007 года Архивировано из оригинала 10 марта 2012 года . Проверено 15 ноября 2012 года .
  53. ^ Bernardos RL, Бартель LK, Meyers JR, Raymond PA (июнь 2007). «Нейрональные предшественники на поздних стадиях в сетчатке - это радиальная глия Мюллера, которая функционирует как стволовые клетки сетчатки» . Журнал неврологии . 27 (26): 7028–40. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.1624-07.2007 . PMC 6672216 . PMID 17596452 .  
  54. ^ Stewart S, Tsun ZY, Izpisua Бельмонте JC (ноябрь 2009). «Гистоновая деметилаза необходима для регенерации у рыбок данио» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (47): 19889–94. Bibcode : 2009PNAS..10619889S . DOI : 10.1073 / pnas.0904132106 . JSTOR 25593294 . PMC 2785262 . PMID 19897725 . Краткое содержание - Science Daily (2 ноября 2009 г.).   
  55. ^ a b Head JR, Gacioch L, Pennisi M, Meyers JR (июль 2013 г.). «Активация канонической передачи сигналов Wnt / β-catenin стимулирует пролиферацию в невромастах в задней боковой линии рыбок данио» . Динамика развития . 242 (7): 832–46. DOI : 10.1002 / dvdy.23973 . PMID 23606225 . 
  56. Перейти ↑ Steiner AB, Kim T, Cabot V, Hudspeth AJ (апрель 2014 г.). «Динамическая экспрессия генов предполагаемыми предшественниками волосковых клеток во время регенерации в боковой линии рыбок данио» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (14): E1393–401. Bibcode : 2014PNAS..111E1393S . DOI : 10.1073 / pnas.1318692111 . PMC 3986164 . PMID 24706895 .  
  57. Kizil C (январь 2018). "Механизмы индуцированной патологией пластичности нервных стволовых клеток и нейронной регенерации в мозге взрослых рыбок данио" . Текущие отчеты о патобиологии . 6 (1): 71–7. DOI : 10.1007 / s40139-018-0158-х . PMC 5978899 . PMID 29938129 .  
  58. ^ Cosacak М.И., Bhattarai P, S Reinhardt, Петцольд A, Dahl A, Zhang Y, кизил С (апрель 2019). "Анализ клеточной транскриптомики неоднородности нервных стволовых клеток и контекстуальной пластичности в модели мозга рыбок данио амилоидной токсичности" . Сотовые отчеты . 27 (4): 1307–18. DOI : 10.1016 / j.celrep.2019.03.090 . PMID 31018142 . 
  59. ^ Бхаттари Р, Cosacak М.И., Mashkaryan В, Демир С, Попова Д., ГОВИНДАРАДЖАН Н, Брандт К, Чжан У, Чанг Вт, Ampatzis К, кизил С (январь 2020). «Взаимодействие нейрона и глии через ось серотонин-BDNF-NGFR делает возможной регенеративный нейрогенез в модели мозга взрослых рыбок данио по модели Альцгеймера» . PLOS Биология . 18 (1): e3000585. DOI : 10.1371 / journal.pbio.3000585 . PMC 6964913 . PMID 31905199 .  
  60. Xi Y, Noble S, Ekker M (июнь 2011 г.). «Моделирование нейродегенерации у рыбок данио» . Curr Neurol Neurosci Rep . 11 (3): 274–82. DOI : 10.1007 / s11910-011-0182-2 . PMC 3075402 . PMID 21271309 .  
  61. Перейти ↑ Bassett DI, Currie PD (октябрь 2003 г.). «Рыбки данио как модель мышечной дистрофии и врожденной миопатии» . Молекулярная генетика человека . 12 (спец. № 2): R265–70. DOI : 10,1093 / HMG / ddg279 . PMID 14504264 . 
  62. ^ Крим MJ, Лоуренс С. «Рыба - это не мышь: понимание различий в фоновой генетике имеет решающее значение для воспроизводимости». Лабораторное животное . DOI : 10.1038 / s41684-020-00683-х . PMID 33268901 . 
  63. ^ Уайтли А.Р., Бхат А, ЕР Мартинса, Mayden RL, Аруначала М, Уусите-Хейккил S Ахмед AT, Шрест J, Кларк М, Стемпл D, Bernatchez L (2011). «Популяционная геномика диких и лабораторных рыбок данио ( Danio rerio . Молекулярная экология . 20 (20): 4259–4276. DOI : 10.1111 / j.1365-294X.2011.05272.x . PMC 3627301 . PMID 21923777 .  
  64. Перейти ↑ Coe TS, Hamilton PB, Griffiths AM, Hodgson DJ, Wahab MA, Tyler CR (2009). «Генетическая изменчивость штаммов рыбок данио ( Danio rerio ) и значение для исследований экотоксикологии». Экотоксикология (18): 144–150. DOI : 10.1007 / s10646-008-0267-0 . PMID 18795247 . 
  65. ^ Kimmel CB, Закон RD (март 1985). «Клеточная линия бластомеров рыбок данио. I. Образец расщепления и цитоплазматические мостики между клетками». Биология развития . 108 (1): 78–85. DOI : 10.1016 / 0012-1606 (85) 90010-7 . PMID 3972182 . 
  66. ^ Kimmel CB, Закон RD (март 1985). «Клеточная линия бластомеров рыбок данио. III. Клональные анализы стадий бластулы и гаструлы». Биология развития . 108 (1): 94–101. DOI : 10.1016 / 0012-1606 (85) 90012-0 . PMID 3972184 . 
  67. ^ Stainier DY, Raz E, Lawson ND, Ekker SC, Burdine RD, Eisen JS и др. (Октябрь 2017 г.). «Рекомендации по использованию морфолино у рыбок данио» . PLOS Genetics . 13 (10): e1007000. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1007000 . PMC 5648102 . PMID 29049395 .  
  68. Розен Дж. Н., Суини М. Ф., Мабли Дж. Д. (март 2009 г.). «Микроинъекции эмбрионов рыбок данио для анализа функции генов» . Журнал визуализированных экспериментов (25). DOI : 10.3791 / 1115 . PMC 2762901 . PMID 19274045 .  
  69. ^ Леонг, Ивоне Ун Сан; Лань, Чуань-Цзин; Скиннер, Джонатан Р .; Артобстрел, Андрей Н .; Любовь, Дональд Р. (2012). «Тестирование in vivo нокдауна микроРНК-опосредованного гена у рыбок данио» . Журнал биомедицины и биотехнологии . Хиндави. 2012 : 1–7. DOI : 10.1155 / 2012/350352 . PMC 3303736 . PMID 22500088 .  
  70. Tan PK, Downey TJ, Spitznagel EL, Xu P, Fu D, Dimitrov DS, Lempicki RA, Raaka BM, Cam MC (октябрь 2003 г.). «Оценка измерений экспрессии генов с коммерческих платформ микрочипов» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (19): 5676–84. DOI : 10.1093 / NAR / gkg763 . PMC 206463 . PMID 14500831 .  
  71. ^ "Консорциум ссылок на геном" . GRC . Проверено 23 октября 2012 года .
  72. ^ «Расшифровка тайны генома» . Индийский экспресс . 5 июля, 2009. Проверено 5 февраля, 2013.
  73. ^ FishMap Zv8 . Институт геномики и интегративной биологии (IGIB). Проверено 7 июня 2012 года.
  74. ^ а б Хоу К., Кларк М.Д., Торроха К.Ф., Торранс Дж., Бертло С., Маффато М. и др. (Апрель 2013). «Эталонная последовательность генома рыбок данио и ее связь с геномом человека» . Природа . 496 (7446): 498–503. Bibcode : 2013Natur.496..498H . DOI : 10,1038 / природа12111 . PMC 3703927 . PMID 23594743 .  
  75. ^ a b Broughton RE, Milam JE, Roe BA (ноябрь 2001 г.). «Полная последовательность митохондриального генома рыбок данио ( Danio rerio ) и эволюционные паттерны в митохондриальной ДНК позвоночных» . Геномные исследования . 11 (11): 1958–67. DOI : 10.1101 / gr.156801 . PMC 311132 . PMID 11691861 .  
  76. ^ Lister JA, Robertson CP, Лепаж T, Johnson SL, Raible DW (сентябрь 1999). «перламутр кодирует белок, связанный с микрофтальмией рыбок данио, который регулирует судьбу пигментных клеток, происходящих из нервного гребня». Развитие . 126 (17): 3757–67. PMID 10433906 . 
  77. ^ Lamason RL, Mohideen MA, Mest JR, Wong AC, Norton HL, Aros MC, Jurynec MJ, Mao X, Humphreville VR, Humbert JE, Sinha S, Moore JL, Jagadeeswaran P, Zhao W, Ning G, Makalowska I, McKeigue PM, O'donnell D, Kittles R, Parra EJ, Mangini NJ, Grunwald DJ, Shriver MD, Canfield VA, Cheng KC (декабрь 2005 г.). «SLC24A5, предполагаемый катионообменник, влияет на пигментацию у рыбок данио и людей» . Наука . 310 (5755): 1782–6. Bibcode : 2005Sci ... 310.1782L . DOI : 10.1126 / science.1116238 . PMID 16357253 . S2CID 2245002 .  
  78. Перейти ↑ Kawakami K, Takeda H, Kawakami N, Kobayashi M, Matsuda N, Mishina M (июль 2004 г.). «Подход с опосредованной транспозоном ловушкой генов позволяет идентифицировать гены, регулируемые развитием у рыбок данио». Клетка развития . 7 (1): 133–44. DOI : 10.1016 / j.devcel.2004.06.005 . PMID 15239961 . 
  79. ^ Лангенау, Дэвид М .; Ролз, Джон Ф .; Haber, Daniel A .; Дайсон, Ник Дж .; Махешваран, Шьямала; Iafrate, John A .; Sgroi, Dennis C .; Флетчер, Джонатан А .; Карабакак, Мурат Н. (13.06.2019). «Визуализация привитого рака человека и терапевтических реакций у рыбок данио с иммунодефицитом» . Cell . 177 (7): 1903–1914. e14. DOI : 10.1016 / j.cell.2019.04.004 . ISSN 0092-8674 . PMC 6570580 . PMID 31031007 .   
  80. ^ Lin CL, Taggart AJ, Lim KH, Cygan KJ, Ferraris L, Creton R, Huang YT, Fairbrother WG (январь 2016). «Структура РНК заменяет потребность в U2AF2 при сплайсинге» . Геномные исследования . 26 (1): 12–23. DOI : 10.1101 / gr.181008.114 . PMC 4691745 . PMID 26566657 .  
  81. ^ Charlesworth D, Уиллис JH (ноябрь 2009 г.). «Генетика инбридинговой депрессии». Природа Обзоры Генетики . 10 (11): 783–96. DOI : 10.1038 / nrg2664 . PMID 19834483 . S2CID 771357 .  
  82. ^ Bickley LK, Brown AR, Hosken DJ, Гамильтон PB, Le Page G, Полл GC, Owen SF, Тайлер CR (февраль 2013 г. ). «Интерактивные эффекты инбридинга и эндокринных нарушений на воспроизводство у модельной лабораторной рыбы» . Эволюционные приложения . 6 (2): 279–89. DOI : 10.1111 / j.1752-4571.2012.00288.x . PMC 3689353 . PMID 23798977 .  
  83. ^ Мартин, В. Кайл; Теннант, Алан Х .; Конолли, Рори Б.; Князь, Катя; Стивенс, Джоуи С; ДеМарини, Дэвид М .; Мартин, Брэнди Л .; Томпсон, Лесли С.; Гилмор, М. Ян; Cascio, Wayne E .; Хейс, Майкл Д .; Hazari, Mehdi S .; Падилья, Стефани; Фаррадж, Эймен К. (15 января 2019 г.). «Высокопроизводительная обработка видео ответов о частоте сердечных сокращений у нескольких эмбриональных рыбок данио дикого типа на каждое поле изображения» . Научные отчеты . 9 (1): 145. Bibcode : 2019NatSR ... 9..145M . DOI : 10.1038 / s41598-018-35949-5 . PMC 6333808 . PMID 30644404 .  
  84. ^ Тейксидо, Элизабет; Кислинг, Тобиас Р.; Крупп, Эккарт; Кеведо, Селия; Муриана, Аранца; Шольц, Стефан (февраль 2019 г.). «Автоматическая оценка морфологических характеристик для экранов токсичности развития эмбрионов рыбок данио» . Токсикологические науки . 167 (2): 438–449. DOI : 10.1093 / toxsci / kfy250 . PMC 6358258 . PMID 30295906 .  
  85. ^ "Рыба для науки" . Университет Шеффилда. 2011 . Проверено 19 марта 2011 года .
  86. ^ Brannen KC, Панцика-Келли JM, Danberry TL, Augustine-Раух KA (февраль 2010). «Разработка анализа тератогенности эмбрионов рыбок данио и модели количественного прогнозирования». Исследование врожденных дефектов, часть B: токсикология развития и репродуктивной системы . 89 (1): 66–77. DOI : 10.1002 / bdrb.20223 . PMID 20166227 . 
  87. ^ Rennekamp AJ, Петерсон RT (февраль 2015). «15 лет химического скрининга рыбок данио» . Текущее мнение в химической биологии . 24 : 58–70. DOI : 10.1016 / j.cbpa.2014.10.025 . PMC 4339096 . PMID 25461724 .  
  88. ^ a b MacRae CA, Peterson RT (октябрь 2015 г.). «Данио как инструменты для открытия лекарств». Обзоры природы. Открытие наркотиков . 14 (10): 721–31. DOI : 10.1038 / nrd4627 . PMID 26361349 . S2CID 1979653 .  
  89. ^ a b Kantae V, Krekels EH, Ordas A, González O, van Wijk RC, Harms AC, Racz PI, van der Graaf PH, Spaink HP, Hankemeier T (декабрь 2016 г.). «Фармакокинетическое моделирование захвата и очистки парацетамола у личинок рыбок данио: расширение аллометрической шкалы у позвоночных на пять порядков величины» . Данио . 13 (6): 504–510. DOI : 10.1089 / zeb.2016.1313 . PMC 5124745 . PMID 27632065 .  
  90. ^ Schulthess P, Ван Вейк RC, Krekels EH, Йейтс TW, Spaink HP, Ван дер Граафа PH (2018). «Фармакология внешних систем сочетает инновационные вычислительные методы с высокопроизводительными исследованиями позвоночных» . CPT: Фармакометрия и системная фармакология . 7 (5): 285–287. DOI : 10.1002 / psp4.12297 . PMC 5980533 . PMID 29693322 .  
  91. Перейти ↑ Liu S, Leach SD (2011). «Модели рыбок данио для лечения рака». Ежегодный обзор патологии . 6 : 71–93. DOI : 10,1146 / annurev-патол-011110-130330 . PMID 21261518 . 
  92. ^ "Модель данио меланомы человека показывает новый ген рака" . Science Daily . 23 марта 2011 . Проверено 28 апреля 2014 года .
  93. ^ Ceol CJ, Houvras Y, Джейн Вальбуэна Дж, Bilodeau S, Орландо Д.А., Баттисти В, Фрич л, Лин WM, Холлман TJ, Ферре F, Бурк С, Берк CJ, Тернер л, Уонг А, Джонсон Л.А., Beroukhim Р , Mermel CH, Loda M, Ait-Si-Ali S, Garraway LA, Young RA, Zon LI (март 2011 г.). «Гистон-метилтрансфераза SETDB1 периодически усиливается в меланоме и ускоряет ее начало» . Природа . 471 (7339): 513–7. Bibcode : 2011Natur.471..513C . DOI : 10,1038 / природа09806 . PMC 3348545 . PMID 21430779 .  
  94. ^ Белый RM, Чех J, Ratanasirintrawoot S, Lin CY, Rahl PB, Burke CJ, Langdon E, Tomlinson ML, Mosher J, Kaufman C, Chen F, Long HK, Kramer M, Datta S, Neuberg D, Granter S, Young Р.А., Моррисон С., Уилер Г.Н., Зон Л.И. (март 2011 г.). «ДГОДГ модулирует удлинение транскрипции в нервном гребне и меланоме» . Природа . 471 (7339): 518–22. Bibcode : 2011Natur.471..518W . DOI : 10,1038 / природа09882 . PMC 3759979 . PMID 21430780 .  
  95. ^ «Препарат от артрита может помочь победить меланомный рак кожи, результаты исследования» . Science Daily . 24 марта 2011 . Проверено 15 ноября 2012 года .
  96. ^ Драммонд И. А. (февраль 2005 г.). «Развитие почек и болезни у рыбок данио» . Журнал Американского общества нефрологов . 16 (2): 299–304. DOI : 10,1681 / ASN.2004090754 . PMID 15647335 . 
  97. ^ «Исследование воспалительных заболеваний с помощью рыбок данио» . Рыба для науки . Проверено 15 ноября 2012 года .
  98. ^ Ле Guyader Д, Redd МДж, Колуччи-Гийон Е, Мурояма Е, Кисса К, Briolat В, Mordelet Е, Сапата А, Shinomiya Н, Herbomel Р (январь 2008). «Происхождение и нетрадиционное поведение нейтрофилов у рыбок данио» . Кровь . 111 (1): 132–41. DOI : 10.1182 / кровь-2007-06-095398 . PMID 17875807 . S2CID 8853409 .  
  99. ^ Novoa В, Фигуэрас А (2012-01-01). Ламбрис Дж. Д., Хаджишенгаллис Дж. (Ред.). Актуальные темы врожденного иммунитета II . Успехи экспериментальной медицины и биологии. 946 . Springer Нью-Йорк. С. 253–275. DOI : 10.1007 / 978-1-4614-0106-3_15 . hdl : 10261/44975 . ISBN 9781461401056. PMID  21948373 .
  100. ^ Meeker ND, Trede NS (2008). «Иммунология и данио: порождение новых моделей болезней человека». Развитие и сравнительная иммунология . 32 (7): 745–57. DOI : 10.1016 / j.dci.2007.11.011 . PMID 18222541 . 
  101. ^ Реншоу SA, Trede NS (январь 2012). «Модель, создаваемая 450 миллионов лет назад: иммунитет рыбок данио и позвоночных» . Модели и механизмы заболеваний . 5 (1): 38–47. DOI : 10,1242 / dmm.007138 . PMC 3255542 . PMID 22228790 .  
  102. ^ Мейера AH, Spaink HP (июнь 2011). «Взаимодействие хозяин-патоген стало прозрачным с помощью модели рыбок данио» . Текущие целевые показатели по лекарствам . 12 (7): 1000–17. DOI : 10,2174 / 138945011795677809 . PMC 3319919 . PMID 21366518 .  
  103. ^ van der Vaart M, Spaink HP, Meijer AH (2012). «Распознавание патогенов и активация врожденного иммунного ответа у рыбок данио» . Достижения в гематологии . 2012 : 1–19. DOI : 10.1155 / 2012/159807 . PMC 3395205 . PMID 22811714 .  
  104. Benard EL, van der Sar AM, Ellett F, Lieschke GJ, Spaink HP, Meijer AH (март 2012 г.). «Заражение эмбрионов рыбок данио внутриклеточными бактериальными патогенами» . Журнал визуализированных экспериментов (61). DOI : 10.3791 / 3781 . PMC 3415172 . PMID 22453760 .  
  105. ^ Мейера AH, ван дер Ваарт М Spaink HP (январь 2014). «Визуализация в реальном времени и генетическое изучение взаимодействий микробов и хозяев у рыбок данио» . Клеточная микробиология . 16 (1): 39–49. DOI : 10.1111 / cmi.12236 . PMID 24188444 . 
  106. ^ Torraca В, С Масуд, Spaink HP, Мейер АГИ (июль 2014). «Взаимодействие макрофагов и патогенов при инфекционных заболеваниях: новые терапевтические идеи на основе модели хозяина рыбок данио» . Модели и механизмы заболеваний . 7 (7): 785–97. DOI : 10,1242 / dmm.015594 . PMC 4073269 . PMID 24973749 .  
  107. ^ Levraud ДП, Palha Н, С Ланжевена, Баудинот Р (сентябрь 2014). «Через зеркало: наблюдение взаимодействия вируса-хозяина у рыбок данио». Тенденции в микробиологии . 22 (9): 490–7. DOI : 10.1016 / j.tim.2014.04.014 . PMID 24865811 . 
  108. Перейти ↑ Ramakrishnan L (2013). «Взгляд внутрь рыбок данио, чтобы понять туберкулезную гранулему». Новая парадигма иммунитета к туберкулезу . Успехи экспериментальной медицины и биологии. 783 . С. 251–66. DOI : 10.1007 / 978-1-4614-6111-1_13 . ISBN 978-1-4614-6110-4. PMID  23468113 .
  109. Перейти ↑ Ramakrishnan L (2013). «Справочник рыбок данио по иммунитету и лечению туберкулеза» . Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по количественной биологии . 78 : 179–92. DOI : 10.1101 / sqb.2013.78.023283 . PMID 24643219 . 
  110. ^ Кронан MR, Тобин DM (июль 2014). «Пригоден для употребления в пищу: данио как модель туберкулеза» . Модели и механизмы заболеваний . 7 (7): 777–84. DOI : 10,1242 / dmm.016089 . PMC 4073268 . PMID 24973748 .  
  111. ^ Мейера АХ (март 2016). «Защита и патология при туберкулезе: обучение на модели рыбок данио» . Семинары по иммунопатологии . 38 (2): 261–73. DOI : 10.1007 / s00281-015-0522-4 . PMC 4779130 . PMID 26324465 .  
  112. ^ Спанек Х.П., Цуй С, Вивегер М.И., Янсен Х.Дж., Венеман В.Дж., Марин-Хуэс Р., де Сонневиль Дж., Ордас А, Торрака В., Ван дер Энт В., Лендерс В.П., Мейер А.Х., Снаар-Ягальска Б.Е., Диркс Р.П. ( Август 2013). «Роботизированная инъекция эмбрионов рыбок данио для высокопроизводительного скрининга на моделях болезней» . Методы . 62 (3): 246–54. DOI : 10.1016 / j.ymeth.2013.06.002 . PMID 23769806 . 
  113. ^ Венеман WJ, Марин-Хуэс R, де Сонневиль J, Ордас A, Йонг-Раадсен S, Мейер AH, Spaink HP (июнь 2014 г.). «Создание и оптимизация высокопроизводительной установки для изучения Staphylococcus epidermidis и Mycobacterium marinum в качестве модели для открытия лекарств» . Журнал визуализированных экспериментов . 88 (88): e51649. DOI : 10.3791 / 51649 . PMC 4206090 . PMID 24998295 .  
  114. ^ Allison WT, Бартель LK, Skebo KM, Такэти M, S КАВАМУРА, Raymond PA (октябрь 2010). «Онтогенез мозаики фоторецепторов колбочек у рыбок данио» (PDF) . Журнал сравнительной неврологии . 518 (20): 4182–95. DOI : 10.1002 / cne.22447 . PMC 3376642 . PMID 20878782 .   
  115. ^ Лоуренс JM, Singhal S, Bhatia B, Киган DJ, Reh Т.А., Luthert PJ, Khaw PT, Limb GA (август 2007). «Клетки MIO-M1 и аналогичные линии глиальных клеток Мюллера, полученные из сетчатки взрослого человека, обладают характеристиками нервных стволовых клеток» . Стволовые клетки . 25 (8): 2033–43. DOI : 10.1634 / стволовые клетки.2006-0724 . PMID 17525239 . Краткое содержание - Почта Китая (3 августа 2007 г.). 
  116. ^ Plantié E, Migocka-Patrzałek M, Daczewska M, Jagla K (апрель 2015). «Модельные организмы в борьбе с мышечной дистрофией: уроки дрозофилы и данио» . Молекулы . 20 (4): 6237–53. DOI : 10,3390 / молекулы20046237 . PMC 6272363 . PMID 25859781 .  
  117. ^ Кункеля LM, Бахрах E, Bennett RR, Гийон J, L Штеффен (май 2006). «Диагностика и клеточная терапия мышечной дистрофии Дюшенна у людей, мышей и рыбок данио» . Журнал генетики человека . 51 (5): 397–406. DOI : 10.1007 / s10038-006-0374-9 . PMC 3518425 . PMID 16583129 .  
  118. ^ Мачука-Tzili LE, Бакстон S, Thorpe A, Timson CM, Wigmore P, Лютер П.К., Брук JD (май 2011). «У рыбок данио с дефицитом Muscleblind-like 2 проявляются признаки миотонической дистрофии» . Модели и механизмы заболеваний . 4 (3): 381–92. DOI : 10,1242 / dmm.004150 . PMC 3097459 . PMID 21303839 .  
  119. ^ Тодд П.К., Акалл FY, Hur J, Шарма К., Полсон Х.Л., Даулинг JJ (январь 2014 г.). «Транскрипционные изменения и аномалии развития у рыбок данио модели миотонической дистрофии 1 типа» . Модели и механизмы заболеваний . 7 (1): 143–55. DOI : 10,1242 / dmm.012427 . PMC 3882056 . PMID 24092878 .  
  120. Перейти ↑ Jones KJ, Morgan G, Johnston H, Tobias V, Ouvrier RA, Wilkinson I, North KN (октябрь 2001 г.). «Расширяющийся фенотип аномалий цепи ламинина альфа2 (мерозина): серия случаев и обзор» . Журнал медицинской генетики . 38 (10): 649–57. DOI : 10.1136 / jmg.38.10.649 . PMC 1734735 . PMID 11584042 .  
  121. ^ Maves L (сентябрь 2014 г.). «Последние достижения в использовании животных моделей рыбок данио для открытия лекарств от болезней мышц» . Мнение эксперта об открытии лекарств . 9 (9): 1033–45. DOI : 10.1517 / 17460441.2014.927435 . PMC 4697731 . PMID 24931439 .  
  122. ^ Виттен, ЧП; Hansen, A .; Холл, Б.К. (2001). «Особенности одноядерных и многоядерных клеток, резорбирующих костную ткань рыбок данио Danio rerio, и их вклад в развитие, ремоделирование и рост скелета». Журнал морфологии . 250 (3): 197–207. DOI : 10.1002 / jmor.1065 . PMID 11746460 . 
  123. ^ Карновали, Марта; Банфи, Джузеппе (2019). «Модели данио-рерио скелетных заболеваний человека: плавают эмбрионы и взрослые вместе» . BioMed Research International . 20 : 1253710. DOI : 10,1155 / 2019/1253710 . PMC 6886339 . PMID 31828085 .  
  124. ^ а б Берген, Дилан JM; Каге, Эрика; Хаммонд, Крисси Л. (2019). «Рыбки данио как новая модель остеопороза: платформа для первичного тестирования новых остеоактивных соединений» . Границы эндокринологии . 10 : 6. DOI : 10,3389 / fendo.2019.00006 . ISSN 1664-2392 . PMC 6361756 . PMID 30761080 .   
  125. ^ де Вриз, E .; ван Кессель, MAHJ; Питерс, HM; Spanings, FAT; Flik, ​​G .; Мец, младший (1 февраля 2014 г.). «Преднизолон вызывает фенотип, подобный остеопорозу, в регенерирующих чешуях рыбок данио». Osteoporosis International . 25 (2): 567–578. DOI : 10.1007 / s00198-013-2441-3 . ISSN 1433-2965 . PMID 23903952 . S2CID 21829206 .   
  126. ^ де Вриз, Эрик; Зетхоф, Ян; Шульте-Меркер, Стефан; Флик, Герт; Мец, Джуриаан Р. (01.05.2015). «Идентификация новых остеогенных соединений с помощью ex-vivo sp7: анализа шкалы люциферазы рыбок данио» . Кость . 74 : 106–113. DOI : 10.1016 / j.bone.2015.01.006 . ISSN 8756-3282 . PMID 25600250 .  
  127. ^ Б с д е е г Занг L, L, Маддисон Chen W (20 августа 2018). «Данио как модель ожирения и диабета» . Границы клеточной биологии и биологии развития . 6 (91): 6, 7. DOI : 10,3389 / fcell.2018.00091 . PMC 6110173 . PMID 30177968 .  
  128. Чо, Сон Джун; Парк, Евгений; Бейкер, Эндрю; Рейд, Айлин Ю. (10.09.2020). "Возрастной сдвиг в моделях эпилепсии у рыбок данио: чему мы можем научиться у старых рыб?" . Границы клеточной биологии и биологии развития . 8 . DOI : 10.3389 / fcell.2020.573303 . ISSN 2296-634X . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Ламберт DJ (1997). Пресноводные аквариумные рыбки . Эдисон, Нью-Джерси: Chartwell Books. п. 19 . ISBN 978-0-7858-0867-1.
  • Шарп С. "Зебра Данио" . Ваш путеводитель по пресноводным аквариумам . Проверено 15 декабря 2004 года .
  • Кочер Т.Д., Джеффри В.Р., Паричи Д.М., Пейчел С.Л., Стрелман Дж.Т., Торгаард Г.Х. (2005). «Особенность - круглый стол. Модели рыб для изучения адаптивной эволюции и видообразования» . Данио . 2 (3): 147–56. DOI : 10.1089 / zeb.2005.2.147 . PMID  18248189 . S2CID  18940475 .
  • Брэдбери Дж (май 2004 г.). «Рыбка, большая наука» . PLOS Биология . 2 (5): E148. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0020148 . PMC  406403 . PMID  15138510 .
  • Вестерфилд М (2007). Книга о рыбках данио. Руководство по лабораторному использованию рыбок данио (Danio rerio) (5-е изд.). Юджин, штат Орегон: Университет штата Орегон Press.
  • Гаттридж Н. (2012). «Целенаправленная модификация генов может переписать ДНК рыбок данио». Природа . DOI : 10.1038 / nature.2012.11463 . S2CID  87708919 .
  • «Точка зрения: муха, рыба, мышь и червь» . BBC News . BBC. 14 июня 2013 . Проверено 15 июня 2013 года .

Внешние ссылки [ править ]

  • Британская ассоциация разведения рыбок данио
  • Международное общество рыбок данио (IZFS)
  • Европейское общество моделей рыб в биологии и медицине (EuFishBioMed)
  • Информационная сеть по рыбкам данио (ZFIN)
  • Международный ресурсный центр по рыбкам данио (ZIRC)
  • Европейский ресурсный центр по рыбам данио (EZRC)
  • Китайский ресурсный центр по рыбам данио (CZRC)
  • Проект секвенирования генома рыбок данио в Институте Сэнгера Wellcome Trust
  • FishMap: обозреватель геномики сообщества рыбок данио в Институте геномики и интегративной биологии (IGIB)
  • WebHome Zebrafish GenomeWiki Beta Preview на IGIB
  • Инициатива по секвенированию генома в IGIB
  • Данио рерио на Danios.info
  • Ресурсы по мутации рыбок данио Сангера
  • Геном рыбок данио через Ensembl
  • FishforScience.com - использование рыбок данио для медицинских исследований
  • FishForPharma
  • Разведение данио
  • Просмотрите сборку генома danRer10 в браузере генома UCSC .