Кишинёвская епа́рхия (рум. Eparhia de Chișinău) — епархия Русской православной церкви с центром в городе Кишинёв, входящая в состав Православной церкви Молдовы. Объединяет приходы и монастыри на территории центральной Молдавии. Кафедральный собор — Собор Рождества Христова. Епархия разделена на 31 благочиннический округ.
Во время Русско-турецких войн 1787—1792 и 1806—1812 годов русская армия занимала Молдавию и Валахию, временно учреждая в них духовное управление — Молдовлахийский экзархат, главой которого стал экзарх Молдавии, Валахии и Бессарабии Гавриил (Бэнулеску-Бодони).
После 1812 года, когда по условиям мирного договора к России отошла Бессарабия, экзарху Гавриилу было поручено организовать её церковную жизнь. В конце сентября 1812 года митрополит Гавриил со всем штатом духовного управления прибыл из Ясс в Кишинёв. В 1813 году Кишиневская епархия была учреждена официально, и ей присвоены титулы митрополии и экзархии.
В 1918 году после аннексии Бессарабии Румынией румынские власти без согласования с Русской церковью потребовали от духовенства и паствы присоединиться к Румынской православной церкви. Архиепископ Кишинёвский Анастасий (Грибановский) и его викарии, отказавшиеся подчиниться требованию властей о переходе в Румынский патриархат, были вынуждены покинуть пределы епархии, а 14 июня 1918 года Священный синод Румынской церкви назначил «заместителем местоблюстителя архиепископа» на Кишиневскую кафедру епископа Хушского Никодима (Мунтяну), образовав таким образом Бессарабскую митрополию Румынской церкви. Патриарх Московский и всея Руси Тихон в октябре 1918 года выразил синоду Румынской православной церкви протест.
После вхождения Бессарабии в состав СССР Московский патриархат возобновил духовное управление ею: в декабре 1940 года епископ Тульский Алексий (Сергеев) был назначен временно управляющим Кишинёвской епархией, а в мае 1941 года — её правящим архиереем.
После занятия Бессарабии румынскими войсками в 1941 году и до 1944 года здесь вновь существовала Бессарабской митрополии Румынской церкви. В 1944 году Бессарабия вновь занята советскими войсками, и деятельность Кишинёвской епархии Московского патриархата возобновилась.