• созревание SSU-рРНК из tricistronic рРНК транскриптов (SSU-рРНК, 5.8S рРНК, СМЛ-рРНК) • вирусной транскрипции • SRP-зависимого белка котрансляционная ориентации на мембраны • инициации трансляции • процесс катаболический ядерно-транскрибируется мРНК, нонсенс-опосредованного распада • биогенез малых субъединиц рибосом • биосинтез белков • процессинг рРНК • клеточный ответ на фактор ингибирования лейкемии • регенерация печени
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
6217
20055
Ансамбль
ENSG00000105193
ENSMUSG00000037563
UniProt
P62249
P14131
RefSeq (мРНК)
NM_001020 NM_001321111 NM_001363860
NM_013647
RefSeq (белок)
NP_001011 NP_001308040 NP_001350789
NP_038675
Расположение (UCSC)
Chr 19: 39.43 - 39.44 Мб
н / д
PubMed поиск
[2]
[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
40S рибосомных белков S16' представляет собой белок , который у человека кодируется RPS16 гена . [4] [5] [6]
Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой 40S-субъединицы и большой 60S-субъединицы . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомный белок, который является компонентом субъединицы 40S. Белок принадлежит к семейству рибосомных белков S9P. Он находится в цитоплазме . Как типично для генов, кодирующих рибосомные белки, существует множество процессированных псевдогенов этого гена, рассредоточенных по геному. [6]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что RPS16 взаимодействует с CDC5L . [7]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000105193 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Батра SK, Metzgar RS, Hollingsworth MA (май 1991). «Молекулярное клонирование и анализ последовательности человеческого рибосомного белка S16». J Biol Chem . 266 (11): 6830–3. PMID 2016298 .
^ Kenmochi N, Кавагути T, Розен S, Davis E Гудман N, Hudson TJ, Tanaka T, Page DC (август 1998). «Карта 75 генов рибосомных белков человека» . Genome Res . 8 (5): 509–23. DOI : 10.1101 / gr.8.5.509 . PMID 9582194 .
^ a b «Ген Entrez: рибосомный белок S16 RPS16» .
^ Ajuh, P; Kuster B; Панов К; Zomerdijk JC; Mann M; Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ человеческого комплекса CDC5L и идентификация его компонентов с помощью масс-спектрометрии» . EMBO J . АНГЛИЯ. 19 (23): 6569–81. DOI : 10.1093 / emboj / 19.23.6569 . ISSN 0261-4189 . PMC 305846 . PMID 11101529 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Шерсть И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомных белков млекопитающих». Биохим. Cell Biol . 73 (11–12): 933–47. DOI : 10.1139 / o95-101 . PMID 8722009 .
Като С., Секин С., О С.В. и др. (1995). «Конструирование банка полноразмерных кДНК человека». Джин . 150 (2): 243–50. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90433-2 . PMID 7821789 .
Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г. и др. (1996). «Характеристика белков малых рибосомных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования, а также масс-спектрометрии» . Евро. J. Biochem . 239 (1): 144–9. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1996.0144u.x . PMID 8706699 .
Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Genome Res . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Лей XH, Шен X, Сюй XQ, Бернштейн HS (2001). «Человеческий Cdc5, регулятор митотического входа, может действовать как сайт-специфический ДНК-связывающий белок». J. Cell Sci . 113, Пет. 24: 4523–31. PMID 11082045 .
Аджух П., Кустер Б., Панов К. и др. (2001). «Функциональный анализ человеческого комплекса CDC5L и идентификация его компонентов с помощью масс-спектрометрии» . EMBO J . 19 (23): 6569–81. DOI : 10.1093 / emboj / 19.23.6569 . PMC 305846 . PMID 11101529 .
Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол . 12 (1): 1–11. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9 . PMID 11790298 . S2CID 14132033 .
Йошихама М., Уэчи Т., Асакава С. и др. (2002). «Гены рибосомных белков человека: секвенирование и сравнительный анализ 73 генов» . Genome Res . 12 (3): 379–90. DOI : 10.1101 / gr.214202 . PMC 155282 . PMID 11875025 .
Каран Д., Келли Д.Л., Риццино А. и др. (2002). «Профиль экспрессии дифференциально регулируемых генов во время прогрессирования андроген-независимого роста клеток рака простаты человека» . Канцерогенез . 23 (6): 967–75. DOI : 10.1093 / carcin / 23.6.967 . PMID 12082018 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M . DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID 14702039 .
Бауместер Т., Баух А., Раффнер Х. и др. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала человеческого TNF-альфа / NF-каппа B». Nat. Cell Biol . 6 (2): 97–105. DOI : 10.1038 / ncb1086 . PMID 14743216 . S2CID 11683986 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Люнг А. К. и др. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005Natur.433 ... 77А . DOI : 10,1038 / природа03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
Ю Й, Джи Х, Дудна Дж. А., Лири Дж. А. (2005). «Масс-спектрометрический анализ субъединицы рибосомы 40S человека: нативные и связанные с IRES комплексы HCV» . Protein Sci . 14 (6): 1438–46. DOI : 10.1110 / ps.041293005 . PMC 2253395 . PMID 15883184 .
Ту LC, Ян X, Худ Л., Линь Б. (2007). «Протеомический анализ интерактома регулируемого ниже гена 1 N-myc и его взаимодействия с программой андрогенного ответа в клетках рака простаты» . Мол. Клетка. Протеомика . 6 (4): 575–88. DOI : 10.1074 / mcp.M600249-MCP200 . PMID 17220478 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии» . Мол. Syst. Биол . 3 (1): 89. DOI : 10.1038 / msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
