40S рибосомный белок S3

RPS3

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1WH9 , 4UG0 , 4V6X , 5A2Q , 5AJ0 , 3J7P , 4UJE , 4D5L , 3J7R , 4UJD , 4V5Z , 5FLX , 4D61 , 4UJC

Идентификаторы

Псевдонимы

RPS3 , S3, рибосомный белок S3

Внешние идентификаторы

OMIM : 600454 MGI : 1350917 HomoloGene : 779 GeneCards : RPS3

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 11 (человека) ^[1]

Группа	11q13.4	Начинать	75 399 515 п.н. ^[1]
Группа	11q13.4	Конец	75 422 280 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 7 (мышь) ^[2]

Группа	7 E1 \| 7 54,07 см	Начинать	99 477 896 п.н. ^[2]
Группа	7 E1 \| 7 54,07 см	Конец	99 483 738 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• тубулин связывание • ДНК N-гликозилаза активности • небольшая рибосомальная субъединица рРНК связывания • железо-сера кластера связывания • транскрипционный фактор связывания • окисленной ДНК пуринового связывания • белка Hsp70 связывание • лиазой активности • связывания фермента • мРНК связывания • структурную составляющей рибосомы • повреждения Связывание с ДНК • Связывание с ферментом, конъюгированным с убиквитиноподобным белком • Связывание с белком GO: 0001948 • ДНК- (апуриновый или апиримидиновый сайт) лиазная активность • окисляются пиримидин связывания ДНК • endodeoxyribonuclease активность • протеинкиназы связывания • суперспирализована связывание ДНК • ДНК связывания • белка Hsp90 связывание • микротрубочек связывания • протеинкиназы связывания • связывания РНКА • киназы связывания • последовательности ДНК-специфическая РНК - полимераза регуляторной области II связывания • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса • ДНК- лиазная активность класса I (апуриновый или апиримидиновый сайт) • ДНК- лиазная активность класса III / IV (апуриновый или апиримидиновый сайт) • Повреждение окисленного пуринового азотистого основания ДНК Активность N-гликозилазы
Сотовый компонент	• цитоплазма • цитозоль • полисома • мембрана • очаговая адгезия • волнистая мембрана • митохондрия • цитоскелет • клеточное ядро • рибосома • ядрышко • внеклеточная экзосома • клеточная мембрана • веретено • митохондриальный матрикс • малая рибосомная субъединица • митотическое веретено • внутренняя мембрана митохондрий • цитозольная малая субъединица рибосомы • нуклеоплазма • внеклеточный матрикс • эндоплазматический ретикулум • комплекс NF-kappaB • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • рибонуклеопротеин • синапс
Биологический процесс	• сегрегация хромосом • позитивная регуляция активности эндодезоксирибонуклеазы • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • позитивная регуляция полимеризации микротрубочек • клеточный цикл • реакция на повреждение ДНК, обнаружение повреждения ДНК • апоптотический процесс • негативная регуляция трансляции • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • вирусная транскрипция • ответ на агонист TNF • позитивная регуляция апоптотического сигнального пути • ответ на окислительный стресс • транскрипция, ДНК-шаблон • SRP-зависимое нацеливание котрансляционного белка на мембрану • позитивная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующая в фазе выполнения апоптоза • позитивная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути в ответ на повреждение ДНК • позитивная регуляция активности ДНК N-гликозилазы • позитивная регуляция JUN киназная активность • транскрибируемый ядром мРНК катаболический процесс, нонсенс-опосредованный распад • отрицательная регуляция репарации ДНК • положительная регуляция репарации ДНК • положительная регуляция передачи сигналов NIK / NF-kappaB • деление клетки • сборка веретена • отрицательная регуляция убиквитинирования белка • позитивная регуляция экспрессии гена • инициация трансляции • регуляция трансляции • клеточный ответ на перекись водорода • биосинтез протеина • позитивная регуляция эксцизионной репарации оснований • репарация ДНК • регуляция апоптотического процесса • процессинг рРНК • цитоплазматическая трансляция • позитивная регуляция сборки белкового комплекса • позитивная регуляция продукции интерлейкина-2 • позитивная регуляция пролиферации активированных Т-клеток • положительная регуляция сигнального пути Т-клеточного рецептора • позитивная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • клеточный ответ на фактор некроза опухоли
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


6188


27050

Ансамбль


ENSG00000149273


ENSMUSG00000030744

UniProt


P23396


P62908

RefSeq (мРНК)


NM_001260507 NM_001005 NM_001256802 NM_001260506


NM_012052

RefSeq (белок)


NP_000996 NP_001243731 NP_001247435 NP_001247436


NP_036182

Расположение (UCSC)

Chr 11: 75,4 - 75,42 Мб

Chr 7: 99,48 - 99,48 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

40S рибосомных белков S3 , является белком , который в организме человека кодируется RPS3 гена . ^[5]^[6]^[7]

Функция [ править ]

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой 40S-субъединицы и большой 60S-субъединицы . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомный белок, который является компонентом субъединицы 40S, где он образует часть домена, в котором инициируется трансляция. Белок принадлежит к семейству рибосомных белков S3P. Исследования белков мышей и крыс показали, что белок играет экстрарибосомную роль в качестве эндонуклеазы, участвующей в восстановлении УФ-излучения.-индуцированное повреждение ДНК . Белок, по-видимому, находится как в цитоплазме, так и в ядре, но не в ядрышке . Наблюдались более высокие уровни экспрессии этого гена в аденокарциномах толстой кишки и аденоматозных полипах по сравнению с соседней нормальной слизистой оболочкой толстой кишки . Этот ген совместно расшифровано с небольшими ядрышковым РНКОМ гены U15A и U15B, которые расположены в его первых и пятой интронов, соответственно. Как типично для генов, кодирующих рибосомные белки, существует множество процессированных псевдогенов этого гена, рассредоточенных по геному. ^[7]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000149273 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030744 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Пог-Geile K, Гейзер JR, Shu M, Miller C, шерсть И.Г., Meisler А.И., Pipas JM (август 1991). «Гены рибосомных белков сверхэкспрессируются при колоректальном раке: выделение клона кДНК, кодирующего рибосомный белок S3 человека» . Мол. Клетка. Биол . 11 (8): 3842–9. DOI : 10,1128 / MCB.11.8.3842 . PMC 361167 . PMID 1712897 .
^ Polakiewicz RD, Манро DJ, Саит С.Н., Tycowski К.Т., Новак NJ, Шоу TB, Хаусман DE, страница DC (июль 1995). «Картирование рибосомного белка S3 и гена U15A, вложенного внутрь snoRNA, на хромосому человека 11q13.3-q13.5». Геномика . 25 (2): 577–80. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (95) 80063-R . PMID 7789996 .
^ a b «Ген Entrez: рибосомный белок S3 RPS3» .

Дальнейшее чтение [ править ]

Bommer UA, Lutsch G, Stahl J, Bielka H (1992). «Факторы инициации эукариот eIF-2 и eIF-3: взаимодействия, структура и локализация в комплексах инициации рибосом». Биохимия . 73 (7–8): 1007–19. DOI : 10.1016 / 0300-9084 (91) 90142-N . PMID 1742346 .
Шерсть И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомных белков млекопитающих». Биохим. Cell Biol . 73 (11–12): 933–47. DOI : 10.1139 / o95-101 . PMID 8722009 .
Чжан XT, Тан YM, Тан YH (1990). «Выделение кДНК, кодирующей человеческий рибосомный белок s3 40S» . Nucleic Acids Res . 18 (22): 6689. DOI : 10,1093 / NAR / 18.22.6689 . PMC 332635 . PMID 2129557 .
Ким Дж., Чубацу Л.С., Адмон А., Сталь Дж., Феллоус Р., Линн С. (1995). «Влияние рибосомного белка S3 млекопитающих в процессинг повреждений ДНК» . J. Biol. Chem . 270 (23): 13620–9. DOI : 10.1074 / jbc.270.23.13620 . PMID 7775413 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Tycowski KT, Shu MD, Steitz JA (1993). «Небольшая ядрышковая РНК процессируется из интрона человеческого гена, кодирующего рибосомный белок S3» . Genes Dev . 7 (7A): 1176–90. DOI : 10.1101 / gad.7.7a.1176 . PMID 8319909 .
Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г., Мусолямов А.К., Егоров Т.А., Тиде Б., Виттманн-Либольд Б., Отто А. (1996). «Характеристика белков малых рибосомных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования, а также масс-спектрометрии» . Евро. J. Biochem . 239 (1): 144–9. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1996.0144u.x . PMID 8706699 .
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Е., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж, округ Колумбия (1998). «Карта 75 генов рибосомных белков человека» . Genome Res . 8 (5): 509–23. DOI : 10.1101 / gr.8.5.509 . PMID 9582194 .
Йошихама М., Уэчи Т., Асакава С., Кавасаки К., Като С., Хига С., Маэда Н., Миносима С., Танака Т., Симидзу Н., Кенмоти Н. (2002). «Гены рибосомных белков человека: секвенирование и сравнительный анализ 73 генов» . Genome Res . 12 (3): 379–90. DOI : 10.1101 / gr.214202 . PMC 155282 . PMID 11875025 .
Ли CH, Ким SH, Чой Джи, Чой Джи, Ли CE, Ким Дж (2002). «Исследование электронного парамагнитного резонанса обнаруживает предполагаемый железо-серный кластер в человеческом белке rpS3». Мол. Ячейки . 13 (1): 154–6. PMID 11911468 .
Лим И, Ли С.М., Ким М., Ли Дж.Й., Moon EP, Ли Би Джей, Ким Дж (2002). «Полная геномная структура человеческого rpS3: идентификация функциональной мяРНК U15b в пятом интроне». Джин . 286 (2): 291–7. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (02) 00502-4 . PMID 11943484 .
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Штейн М.А., Бауэр А., Касари Дж., Дрюс Дж., Гэвин А.С., Джексон Д. Б., Джоберти Дж., Нойбауэр Дж., Рик Дж., Кустер Б., Суперти-Фурга Г. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Nat. Cell Biol . 6 (2): 97–105. DOI : 10.1038 / ncb1086 . PMID 14743216 . S2CID 11683986 .
Чан Си, Ли Джи, Ким Дж (2004). «RpS3, эндонуклеаза репарации ДНК и рибосомный белок, участвует в апоптозе» . FEBS Lett . 560 (1–3): 81–5. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (04) 00074-2 . PMID 14988002 . S2CID 27640563 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кантли Л.С., Гиги С.П. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . DOI : 10.1073 / pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .

Эта статья о гене в хромосоме 11 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000149273 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030744 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1712897-5] Пог-Geile K, Гейзер JR, Shu M, Miller C, шерсть И.Г., Meisler А.И., Pipas JM (август 1991). «Гены рибосомных белков сверхэкспрессируются при колоректальном раке: выделение клона кДНК, кодирующего рибосомный белок S3 человека» . Мол. Клетка. Биол . 11 (8): 3842–9. DOI : 10,1128 / MCB.11.8.3842 . PMC 361167 . PMID 1712897 .

[pmid7789996-6] Polakiewicz RD, Манро DJ, Саит С.Н., Tycowski К.Т., Новак NJ, Шоу TB, Хаусман DE, страница DC (июль 1995). «Картирование рибосомного белка S3 и гена U15A, вложенного внутрь snoRNA, на хромосому человека 11q13.3-q13.5». Геномика . 25 (2): 577–80. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (95) 80063-R . PMID 7789996 .

[entrez-7] «Ген Entrez: рибосомный белок S3 RPS3» .

[1]