Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
ADAMTS1
2JIH.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2JIH , 2V4B , 3Q2G , 3Q2H

Идентификаторы
ПсевдонимыМеталлопептидаза ADAMTS1 , C3-C5, METH1, ADAM с мотивом тромбоспондина 1 типа 1
Внешние идентификаторыOMIM : 605174 MGI : 109249 HomoloGene : 21381 GeneCards : ADAMTS1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 21 (человека)
Chr.Хромосома 21 (человека) [1]
Хромосома 21 (человека)
Геномное расположение ADAMTS1
Геномное расположение ADAMTS1
Группа21q21.3Начинать26 835 755 п.н. [1]
Конец26 845 409 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 16 (мышь)
Chr.Хромосома 16 (мышь) [2]
Хромосома 16 (мышь)
Геномное расположение ADAMTS1
Геномное расположение ADAMTS1
Группа16 C3.3 | 16 48,2 смНачинать85 793 827 п.н. [2]
Конец85 803 113 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE ADAMTS1 222162 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• гепаринсвязывающей
• ион цинк связывание
• иона металл связывание
• пептидазы активности
• metalloendopeptidase активности
• гидролазы активности
• metallopeptidase активность
Сотовый компонент• внеклеточная область
• базальная мембрана
• цитоплазматическая везикула
• внеклеточный матрикс
• внеклеточный матрикс, содержащий коллаген
Биологический процесс• овуляция из фолликула яичника
• образование сердечных трабекул
• развитие почек
• протеолиз
• интегрин-опосредованный сигнальный путь
• негативная регуляция пролиферации клеток
• позитивная регуляция перехода G1 / S митотического клеточного цикла
• позитивная регуляция пролиферации гладкомышечных клеток сосудов
• позитивная регуляция сосудистой миграции гладкомышечных клеток
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

9510

11504

Ансамбль

ENSG00000154734

ENSMUSG00000022893

UniProt

Q9UHI8

P97857

RefSeq (мРНК)

NM_006988

NM_009621

RefSeq (белок)

NP_008919

NP_033751

Расположение (UCSC)Chr 21: 26,84 - 26,85 МбChr 16: 85,79 - 85,8 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Дизинтегрин и металлопротеиназа с мотивами тромбоспондина 1 представляет собой фермент , который у человека кодируется ADAMTS1 геном . [5] [6]

Функция [ править ]

Этот ген кодирует член семейства белков ADAMTS ( дезинтегрин и металлопротеиназа с мотивом тромбоспондина ). Члены семейства имеют несколько общих белковых модулей, включая пропептидную область, домен металлопротеиназы , дезинтегрин-подобный домен и тромбоспондин.мотив типа 1 (TS). Отдельные члены этого семейства различаются по количеству C-концевых TS-мотивов, а некоторые имеют уникальные C-концевые домены. Белок, кодируемый этим геном, содержит две дезинтегриновые петли и три С-концевых TS-мотива и обладает антиангиогенной активностью. Экспрессия этого гена может быть связана с различными воспалительными процессами, а также с развитием раковой кахексии . Этот ген, вероятно, необходим для нормального роста, фертильности, морфологии и функции органов. [6]

Взаимодействия [ править ]

ADAMTS1 было показано, взаимодействует с сосудистым эндотелиальным фактором роста А . [7]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000154734 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022893 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ↑ Vazquez F, Hastings G, Ortega MA, Lane TF, Oikemus S, Lombardo M, Iruela-Arispe ML (сентябрь 1999 г.). «METH-1, человеческий ортолог ADAMTS-1, и METH-2 являются членами нового семейства белков с ангио-ингибирующей активностью» . J Biol Chem . 274 (33): 23349–57. DOI : 10.1074 / jbc.274.33.23349 . PMID 10438512 . 
  6. ^ a b «Ген Entrez: металлопептидаза ADAMTS1 ADAM с мотивом тромбоспондина 1 типа, 1» .
  7. ↑ Luque A, Carpizo DR, Iruela-Arispe ML (июнь 2003 г.). «ADAMTS1 / METH1 ингибирует пролиферацию эндотелиальных клеток путем прямого связывания и секвестрации VEGF165» . J. Biol. Chem . 278 (26): 23656–65. DOI : 10.1074 / jbc.M212964200 . PMID 12716911 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Тан Б.Л., Хонг В. (1999). «ADAMTS: новое семейство протеаз с доменом протеазы ADAM и повторами тромбоспондина 1» . FEBS Lett . 445 (2–3): 223–5. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (99) 00119-2 . PMID  10094461 . S2CID  37955930 .
  • Хирохата С. (2002). «[Семейство ADAMTS - новый фермент, разрушающий внеклеточный матрикс]». Сэйкагаку . 73 (11): 1333–7. PMID  11831030 .
  • Куно К., Канада Н., Накашима Э. и др. (1997). «Молекулярное клонирование гена, кодирующего новый тип белка семейства металлопротеиназ-дезинтегрин с тромбоспондиновыми мотивами в качестве гена, связанного с воспалением» . J. Biol. Chem . 272 (1): 556–62. DOI : 10.1074 / jbc.272.1.556 . PMID  8995297 .
  • Куно К., Мацусима К. (1998). «Белок ADAMTS-1 заякоривается во внеклеточном матриксе через мотивы тромбоспондина I типа и его спейсинговую область» . J. Biol. Chem . 273 (22): 13912–7. DOI : 10.1074 / jbc.273.22.13912 . PMID  9593739 .
  • Куно К., Терасима Ю., Мацусима К. (1999). «ADAMTS-1 - активная металлопротеиназа, связанная с внеклеточным матриксом» . J. Biol. Chem . 274 (26): 18821–6. DOI : 10.1074 / jbc.274.26.18821 . PMID  10373500 .
  • Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К.И. и др. (2000). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVI. Полные последовательности 150 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Res . 7 (1): 65–73. DOI : 10.1093 / dnares / 7.1.65 . PMID  10718198 .
  • Глинке Дж., Шмитт А.О., Пиларски С. и др. (2000). «Дифференциальная экспрессия генов эндотелиальными клетками в различных ангиогенных состояниях» . Евро. J. Biochem . 267 (9): 2820–30. DOI : 10.1046 / j.1432-1327.2000.01325.x . PMID  10785405 .
  • Шиндо Т., Курихара Х., Куно К. и др. (2000). «ADAMTS-1: металлопротеиназа-дезинтегрин, необходимый для нормального роста, фертильности, а также морфологии и функции органов» . J. Clin. Инвестируйте . 105 (10): 1345–52. DOI : 10.1172 / JCI8635 . PMC  315464 . PMID  10811842 .
  • Хаттори М., Фудзияма А., Тейлор Т.Д. и др. (2000). «Последовательность ДНК хромосомы 21 человека» . Природа . 405 (6784): 311–9. Bibcode : 2000Natur.405..311H . DOI : 10.1038 / 35012518 . PMID  10830953 .
  • Куно К., Окада Й., Кавасима Х. и др. (2000). «АДАМЦ-1 расщепляет протеогликан хряща аггрекан» . FEBS Lett . 478 (3): 241–5. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (00) 01854-8 . PMID  10930576 . S2CID  32699689 .
  • Сэнди Дж. Д., Вестлинг Дж., Кенаги Р. Д. и др. (2001). «Протеолиз Versican V1 в аорте человека in vivo происходит по связи Glu441-Ala442, сайту, который расщепляется рекомбинантными ADAMTS-1 и ADAMTS-4» . J. Biol. Chem . 276 (16): 13372–8. DOI : 10.1074 / jbc.M009737200 . PMID  11278559 .
  • Вэй П., Чжао Ю.Г., Чжуан Л. и др. (2002). «Белковая инженерия и свойства металлопротеиназы и тромбоспондина 1 человека». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 293 (1): 478–88. DOI : 10.1016 / S0006-291X (02) 00255-3 . PMID  12054626 .
  • Родригес-Манзанеке Дж. К., Вестлинг Дж., Тайский С. Н. и др. (2002). «ADAMTS1 расщепляет аггрекан по множеству сайтов и по-разному ингибируется ингибиторами металлопротеиназы». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 293 (1): 501–8. DOI : 10.1016 / S0006-291X (02) 00254-1 . PMID  12054629 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Луке А., Карпизо Д. Р., Ируэла-Ариспе М. Л. (2003). «ADAMTS1 / METH1 ингибирует пролиферацию эндотелиальных клеток путем прямого связывания и секвестрации VEGF165» . J. Biol. Chem . 278 (26): 23656–65. DOI : 10.1074 / jbc.M212964200 . PMID  12716911 .
  • Рассел Д.Л., Дойл К.М., Охснер С.А. и др. (2004). «Обработка и локализация ADAMTS-1 и протеолитическое расщепление версикана во время расширения матрикса кумулюса и овуляции» . J. Biol. Chem . 278 (43): 42330–9. DOI : 10.1074 / jbc.M300519200 . PMID  12907688 .
  • Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID  14702039 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Merops онлайновой базы данных для пептидазы и их ингибиторов: M12.222
  • ADAMTS1 в Атласе генетики и онкологии
  • Расположение генома человека ADAMTS1 и страница сведений о гене ADAMTS1 в браузере генома UCSC .
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9UHI8 (дезинтегрин и металлопротеиназа с тромбоспондиновыми мотивами 1) в PDBe-KB .



  • v
  • т
  • е