Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Для использования в других целях, см Адар (значения) .
АДАР
Белок ADAR PDB 1qbj.png Сокристалл РНК ADAR2 дезаминазного домена PDB 5ED1.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1QBJ , 1QGP , 1XMK , 2ACJ , 2GXB , 2L54 , 2MDR , 3F21 , 3F22 , 3F23 , 3IRQ , 3IRR

Идентификаторы
ПсевдонимыADAR , ADAR1, AGS6, DRADA, DSH, DSRAD, G1P1, IFI-4, IFI4, K88DSRBP, P136, аденозиндезаминаза, РНК-специфическая, аденозиндезаминаза, РНК-специфическая, аденозиндезаминазная РНК-специфическая
Внешние идентификаторыOMIM : 146920 MGI : 1889575 HomoloGene : 9281 GeneCards : ADAR
Расположение гена ( человек )
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человека) [1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение ADAR
Геномное расположение ADAR
Группа1q21.3Начинать154 582 057 п.н. [1]
Конец154 628 013 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 3 (мышь)
Chr.Хромосома 3 (мышь) [2]
Хромосома 3 (мышь)
Геномное расположение ADAR
Геномное расположение ADAR
Группа3 | 3 F1Начинать89 715 022 п.н. [2]
Конец89 753 446 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• ДНК - связывающий
• связывание иона металла
• двухцепочечной РНК аденозиндезаминазы активность
• аденозиндезаминазы активность
• GO: связывание белка 0001948
• гидролазы активность
• связывания РНК
• связывание двухцепочечную РНК
• тРНК-специфические аденозиндезаминазы активность
Сотовый компонент• цитоплазма
• мембрана
• надсплицеосомный комплекс
• нуклеоплазма
• ядрышко
• ядро клетки
Биологический процесс• гомеостаз гемопоэтических стволовых клеток
• клеточный ответ на вирус
• загрузка miRNA на RISC, участвующая в подавлении гена с помощью miRNA
• процессинг РНК
• импорт белка в ядро
• процесс иммунной системы
• негативная регуляция опосредованного интерфероном сигнального пути I типа
• процессинг мРНК
• ответ на вирус
• преобразование оснований или редактирование замен
• негативная регуляция апоптотического процесса
• внутриутробное эмбриональное развитие
• процессинг пре-миРНК
• негативная регуляция репликации вирусного генома
• Ответ защиты к вирусу
• тип интерферона сигнального пути
• дифференцировки остеобластов
• гемопоэтических предшественников дифференцировки клеток
• экспортный белок из ядра
• ответ на интерферон-альфа
• негативной регуляции активности протеинкиназы путем регуляции фосфорилирования белка
• эритроцитов дифференциации
• соматической диверсификации иммунных рецепторов посредством соматической мутации
• дефинитивный гемопоэз
• позитивная регуляция репликации вирусного генома
• негативная регуляция РНК-интерференции
• молчание генов с помощью РНК
• врожденная иммунная система
• редактирование аденозина в инозин
• производство miRNA, участвующих в подавлении генов с помощью miRNA
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

103

56417

Ансамбль

ENSG00000160710

ENSMUSG00000027951

UniProt

P55265

Q99MU3

RefSeq (мРНК)
NM_001025107
NM_001111
NM_001193495
NM_015840
NM_015841

NM_001365045
NM_001365046
NM_001365047
NM_001365048
NM_001365049

NM_001038587
NM_001146296
NM_019655
NM_001357958

RefSeq (белок)

NP_001020278
NP_001102
NP_001180424
NP_056655
NP_056656

NP_001033676
NP_001139768
NP_062629
NP_001344887

Расположение (UCSC)Chr 1: 154.58 - 154.63 МбChr 3: 89,72 - 89,75 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Двухцепочечную РНК-специфические аденозиндезаминазы представляет собой фермент , который у человека кодируется ADAR геном (который обозначает аденозиндезаминазы , действующей на РНК ). [5] [6]

Аденозиндезаминазы, действующие на РНК (ADAR), представляют собой ферменты, ответственные за связывание с двухцепочечной РНК (дцРНК) и превращение аденозина (A) в инозин (I) путем дезаминирования . [7] Белок ADAR представляет собой РНК-связывающий белок, который участвует в редактировании РНК посредством посттранскрипционной модификации транскриптов мРНК путем изменения содержания нуклеотидов в РНК. [8] Преобразование из A в I в РНК нарушает нормальное спаривание A: U, что делает РНК нестабильной. Инозин структурно подобен гуанину (G), который приводит к связыванию I с цитозином (C). Инозин обычно имитирует гуанозин во время перевода. [9]Изменения кодонов могут возникнуть в результате редактирования, которое может привести к изменению кодирующих последовательностей белков и их функций. [10] Большинство сайтов редактирования находятся в некодирующих областях РНК, таких как нетранслируемые области (UTR), элементы Alu и длинные вкрапленные ядерные элементы (LINE). [11] Мутации в этом гене были связаны с симметричным наследственным дисхроматозом, а также с синдромом Айкарди – Гутьера. [12] Были охарактеризованы альтернативные варианты сплайсинга транскрипции, кодирующие разные изоформы. [8] ADAR также влияет на транскриптом независимыми от редактирования способами, вероятно, путем вмешательства в другие РНК-связывающие белки.[13]

Открытие [ править ]

Аденозиндезаминаза, действующая на РНК (ADAR), и ее ген были впервые обнаружены случайно в 1987 году в результате исследований Бренды Басс и Гарольда Вайнтрауба. [14] Эти исследователи использовали ингибирование антисмысловой РНК, чтобы определить, какие гены играют ключевую роль в развитии эмбрионов Xenopus laevis . Предыдущие исследования ооцитов Xenopus были успешными. Однако, когда Басс и Вайнтрауб применили идентичные протоколы к Xenopus эмбрионы, они не смогли определить гены развития эмбриона. В попытке понять, почему метод оказался неудачным, они начали сравнивать дуплексную РНК как в ооцитах, так и в эмбрионах. Это привело их к открытию, что деятельность, регулируемая развитием, денатурирует гибриды РНК: РНК в эмбрионах.

В 1988 году Рихард Вагнер и др. дополнительно изучили активность, проявляющуюся на эмбрионах Xenopus . [15] Они определили, что белок ответственен за раскручивание РНК из-за отсутствия активности после обработки протеиназой . Также было показано, что этот белок специфичен для двухцепочечной РНК, или дцРНК, и не требует АТФ . Кроме того, стало очевидно, что активность белка в отношении дцРНК изменяет его за пределами точки регибридизации, но не полностью денатурирует его. Наконец, исследователи определили, что это раскручивание связано с дезаминированием остатков аденозина до инозина.. Эта модификация приводит к неправильному спариванию оснований между инозином и уридином , что приводит к дестабилизации и раскручиванию дцРНК.

Функция и происхождение [ править ]

ADAR, действующие на РНК, являются одной из наиболее распространенных форм редактирования РНК и обладают как избирательной, так и неизбирательной активностью. [16] ADAR способен как модифицировать, так и регулировать выработку генного продукта, поскольку инозин интерпретируется клеткой как гуанозин . Было также установлено, что ADAR изменяет функциональность малых молекул РНК. Недавно были обнаружены ADAR как регулятор сплайсинга с их способностью редактировать или функцией связывания РНК. [17] [18] Считается, что ADAR произошел от ADAT (аденозиндезаминаза, действующая на тРНК), критического белка, присутствующего во всех эукариотах , в начале периода метазоа за счет добавления связывающего домена дцРНК.. Вероятно, это произошло в линии, ведущей к кроне Metazoa, когда дублированный ген ADAT был соединен с геном, кодирующим по крайней мере одно связывание двухцепочечной РНК. Семейство генов ADAR в значительной степени сохранилось за всю историю своего существования. Это, наряду с его присутствием в большинстве современных типов , указывает на то, что редактирование РНК является важным регуляторным геном для организмов многоклеточных. ADAR не был обнаружен у различных эукариот, не относящихся к метазоа, таких как растения , грибы и хоанофлагелляты .

Типы [ править ]

У млекопитающих существует три типа ADAR: ADAR (ADAR1), ADARB1 (ADAR2) и ADARB2 (ADAR3). [19] ADAR и ADARB1 обнаруживаются во многих тканях тела, в то время как ADARB2 обнаруживается только в головном мозге. [10] Известно, что ADAR и ADARB1 каталитически активны, в то время как ADARB2 считается неактивным. [10] ADAR имеет две известные изоформы, известные как ADAR1p150 и ADAR1p110. ADAR1p110 обычно находится только в ядре, в то время как ADAR1p150 перемещается между ядром и цитоплазмой и в основном присутствует в цитоплазме. [19]Хотя ADAR и ADARB1 имеют много общих функциональных доменов, а также общность с точки зрения паттерна экспрессии, структуры белка и требований к субстратам, имеющим структуры двухцепочечной РНК, они различаются по своей активности редактирования. [20]

Каталитическая активность [ править ]

Биохимическая реакция [ править ]

ADAR катализируют реакцию от A до I путем гидролитического дезаминирования . [7] Это достигается за счет использования активированной молекулы воды для нейтрофильной атаки. Это достигается добавлением воды к углероду 6 и удалением аммиака с помощью гидратированного промежуточного продукта.

ADAR1 Mechanism.png

  • схема превращения аденозина в инозин через ADAR

Активный сайт [ править ]

У человека активный сайт фермента имеет 2-3 амино-концевых домена связывания дцРНК (dsRBD) и один карбоксиконцевой каталитический домен дезаминазы. [19] В домене dsRBD присутствует консервативная конфигурация α-β-β-β-α. [10] ADAR1 содержит две области для связывания Z-ДНК, известные как Zα и Zβ. ADAR2 и ADAR3 имеют богатый аргинином связывающий домен одноцепочечной РНК (оцРНК). Решена кристаллическая структура ADAR2. [19] В активном центре фермента есть остаток глутаминовой кислоты (E396), который связывается водородом с водой. Существуют повторные исследования гистидина (H394) и двух цистеина (C451 и C516), которые координируют цинкион. Цинк активирует молекулу воды для нуцелофильного гидролитического дезаминирования. Внутри каталитического ядра находится гексакисфосфат инозита (IP6), который стабилизирует остатки аргинина и лизина .

Димеризация [ править ]

У млекопитающих было обнаружено, что преобразование A в I требует гомодимеризации ADAR1 и ADAR2, но не ADAR3. [10] Исследования in vivo пока не дали окончательных результатов, требуется ли связывание РНК для димеризации. Исследование с мутантами ADAR1 и 2, которые не были способны связываться с дцРНК, все еще были способны димеризоваться, показывая, что они могут связываться на основе белок-белковых взаимодействий [10] [21]

Модельные организмы [ править ]

Модельные организмы использовались при изучении функции ADAR. Линия условно нокаутных мышей, названная Adartm1a (EUCOMM) Wtsi [22] [23], была создана в рамках программы International Knockout Mouse Consortium - проекта высокопроизводительного мутагенеза для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых [24]. [25] [26] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения эффектов делеции. [27] [28]Двадцать пять тестов были проведены на мутантных мышах, и были обнаружены два значительных отклонения от нормы. [6] Во время беременности было идентифицировано несколько гомозиготных мутантных эмбрионов, и ни один из них не выжил до отъема. Остальные тесты проводились на гетерозиготных мутантных взрослых мышах, и у этих животных не наблюдалось никаких отклонений от нормы. [27]

Роль в болезни [ править ]

Синдром Айкарди – Гутьера и двусторонний стриарный некроз / дистония [ править ]

ADAR1 - один из нескольких генов, которые при мутации могут способствовать развитию синдрома Айкарди-Гутьера . [12] Это генетическое воспалительное заболевание, в первую очередь поражающее кожу и мозг, и оно характеризуется высоким уровнем IFN-α в спинномозговой жидкости. [29] Воспаление вызвано неправильной активацией генов, индуцируемых интерфероном, например, тех, которые активированы для борьбы с вирусными инфекциями. Мутация и потеря функции ADAR1 предотвращает дестабилизацию двухцепочечной РНК (дцРНК). Это накопление дцРНК стимулирует выработку IFN без вирусной инфекции, вызывая воспалительную реакцию и аутоиммунный ответ. [30]Фенотип у мышей с нокаутом Adar спасает форма p150 ADAR1, содержащая домен Zα, который специфически связывается с левосторонней двухцепочечной конформацией, обнаруженной в Z-ДНК и Z-РНК, но не изоформой p110, в которой отсутствует этот домен. [31] У людей мутация P193A в домене Zα является причиной синдрома Айкарди – Гутьера [12] и более тяжелого фенотипа, обнаруженного при двустороннем стриатальном некрозе / дистонии. [32] Полученные данные устанавливают биологическую роль левой конформации Z-ДНК. [33]

ВИЧ [ править ]

Исследования показали, что ADAR1 может быть как полезным, так и препятствием для способности клеток бороться с ВИЧ- инфекцией. Было показано, что уровни экспрессии белка ADAR1 повышаются во время ВИЧ-инфекции, и было высказано предположение, что он отвечает за мутации от A до G в геноме ВИЧ, ингибируя репликацию. [34] Авторы этого исследования также предполагают, что мутация генома ВИЧ с помощью ADAR1 может в некоторых случаях приводить к полезным вирусным мутациям, которые могут способствовать устойчивости к лекарствам.

Гепатоцеллюлярная карцинома [ править ]

Исследования образцов от пациентов с гепатоцеллюлярной карциномой (ГЦК) показали, что ADAR1 часто активируется, а ADAR2 часто подавляется при заболевании. Было высказано предположение, что это отвечает за нарушенный паттерн редактирования от A до I, наблюдаемый при HCC, и что ADAR1 действует как онкоген в этом контексте, в то время как ADAR2 обладает активностью супрессора опухолей. [35] Дисбаланс экспрессии ADAR может изменять частоту переходов от A к I в кодирующей белок области генов, что приводит к появлению мутировавших белков, которые вызывают заболевание. Нарушение регуляции ADAR1 и ADAR2 можно использовать как возможный плохой прогностический маркер.

Меланома [ править ]

В отличие от гепатоцеллюлярной карциномы, несколько исследований показали, что потеря ADAR1 способствует росту меланомы и метастазированию. Известно, что ADAR может действовать на микроРНК и влиять на ее биогенез, стабильность и / или ее мишень связывания. [36] Было высказано предположение, что ADAR1 подавляется белком, связывающим элемент cAMP-ответа (CREB), что ограничивает его способность действовать на miRNA. [37] Одним из таких примеров является miR-455-5p, редактируемая ADAR1. Когда ADAR подавляется CREB, неотредактированная miR-455-5p подавляет белок-супрессор опухоли, называемый CPEB1, способствуя прогрессированию меланомы в модели in vivo. [37]

Наследственный симметричный дисхроматоз (DSH1) [ править ]

Мутация Gly1007Arg в ADAR1, а также другие усеченные версии были вовлечены как причина в некоторых случаях DSH1. [38] Это заболевание, характеризующееся гиперпигментацией рук и ног, встречается в японских и китайских семьях.

Вирусная активность [ править ]

Антивирусное [ править ]

ADAR1 - это белок, индуцируемый интерфероном ( IFN ) (белок, выделяемый клеткой в ​​ответ на патоген или вирус), поэтому было бы разумно, что он будет способствовать иммунному пути клетки. Это, по-видимому, верно для репликона HCV , лимфоцитарного хориоменингита LCMV и полиомавируса [39]

Proviral [ править ]

Известно, что ADAR1 провирусен и при других обстоятельствах. Редактирование ADAR1 от A до I было обнаружено во многих вирусах, включая вирус кори, [40] [41] вирус гриппа, [42] вирус лимфоцитарного хориоменингита, [43] полиомавирус, [44] вирус гепатита дельта, [45] и вирус гепатита C. . [46] Хотя ADAR1 был замечен в других вирусах, он был тщательно изучен только в некоторых; один из них - вирус кори (МВ). Исследования, проведенные на MV, показали, что ADAR1 усиливает репликацию вируса. Это осуществляется с помощью двух различных механизмов: редактирования РНК и ингибирования активируемой дцРНК протеинкиназы ( PKR ). [39] В частности, считается, что вирусы используют ADAR1 в качестве положительного фактора репликации, избирательно подавляя зависимые от дцРНК и противовирусные пути. [47]

См. Также [ править ]

  • Редактирование РНК
  • Сигнал редактирования РНК калиевого канала
  • ADARB1
  • Z-ДНК

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000160710 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027951 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. Перейти ↑ Kim U, Wang Y, Sanford T, Zeng Y, Nishikura K (ноябрь 1994). «Молекулярное клонирование кДНК для двухцепочечной аденозиндезаминазы РНК, фермента-кандидата для редактирования ядерной РНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (24): 11457–61. DOI : 10.1073 / pnas.91.24.11457 . PMC 45250 . PMID 7972084 .  
  6. ^ «Энтрез Ген: Аденозиндезаминаза ADAR, действующая на РНК» .
  7. ^ а б Самуэль CE (2012). Аденозиндезаминазы, действующие на РНК (ADAR), и редактирование A-to-I . Гейдельберг: Springer. ISBN 978-3-642-22800-1.
  8. ^ а б «АДАР» . NCBI . Национальная медицинская библиотека США.
  9. ^ Licht К, М Hartl, Амман F, Anrather D, Janisiw MP, Янч MF (ноябрь 2018). «Инозин вызывает контекстно-зависимое перекодирование и задержку перевода» . Исследования нуклеиновых кислот . 47 (1): 3–14. DOI : 10.1093 / NAR / gky1163 . PMC 6326813 . PMID 30462291 .  
  10. ^ Б с д е е Nishikura К (7 июня 2010 г.). «Функции и регуляция редактирования РНК дезаминазами ADAR» . Ежегодный обзор биохимии . 79 (1): 321–49. DOI : 10.1146 / annurev-biochem-060208-105251 . PMC 2953425 . PMID 20192758 .  
  11. ^ Tajaddod M, Янч MF, Лихт K (март 2016). «Динамический эпитранскриптом: редактирование от А до Я модулирует генетическую информацию» . Хромосома . 125 (1): 51–63. DOI : 10.1007 / s00412-015-0526-9 . PMC 4761006 . PMID 26148686 .  
  12. ^ a b c Райс Г. И., Кашер П. Р., Форте Г. М., Маннион Н. М., Гринвуд С. М., Шинкевич М. и др. (Ноябрь 2012 г.). «Мутации в ADAR1 вызывают синдром Айкарди-Гутьера, связанный с сигнатурой интерферона I типа» . Генетика природы . 44 (11): 1243–8. DOI : 10.1038 / ng.2414 . PMC 4154508 . PMID 23001123 .  
  13. ^ Licht K, Jantsch MF (ноябрь 2017 г.). «Другое лицо редактора: функции ADAR1 независимыми от редактирования способами» . BioEssays . 39 (11): 1700129. DOI : 10.1002 / bies.201700129 . PMID 28960389 . 
  14. ↑ Самуэль CE (март 2011 г.). «Аденозиндезаминазы, действующие на РНК (ADAR), являются как противовирусными, так и провирусными» . Вирусология . 411 (2): 180–93. DOI : 10.1016 / j.virol.2010.12.004 . PMC 3057271 . PMID 21211811 .  
  15. ^ Wagner RW, Smith JE, Куперман Б., Nishikura K (1989). «Активность по раскручиванию двухцепочечной РНК вводит структурные изменения посредством превращений аденозина в инозин в клетках млекопитающих и яйцах Xenopus» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 86 (8): 2647–51. DOI : 10.1073 / pnas.86.8.2647 . PMC 286974 . PMID 2704740 .  
  16. ^ Грайс НЧ, Degnan ВМ (2015-01-29). «Происхождение семейства генов ADAR и редактирование РНК животных» . BMC Evolutionary Biology . 15 (1): 4. DOI : 10,1186 / s12862-015-0279-3 . PMC 4323055 . PMID 25630791 .  
  17. ^ Тан С.Дж., Шен Х, Ан О и др. (07.02.2020). «Цис- и транс-регуляция сплайсинга пре-мРНК ферментами редактирования РНК влияет на развитие рака» . Nat Commun . 11 : 799. DOI : 10.1038 / s41467-020-14621-5 . PMC 7005744 . PMID 32034135 .  
  18. ^ Hsiao YE, Bahn JH, Yang Y, et al. (2018). «Редактирование РНК в формирующейся РНК влияет на сплайсинг пре-мРНК» . Genome Res . 28 (6): 812–823. DOI : 10.1101 / gr.231209.117 . PMC 5991522 . PMID 29724793 .  
  19. ^ a b c d Савва Ю.А., Ридер Л.Е., Ринан Р.А. (2012). «Семейство белков ADAR» . Геномная биология . 13 (12): 252. DOI : 10,1186 / GB-2012-13-12-252 . PMC 3580408 . PMID 23273215 .  
  20. Перейти ↑ Higuchi M, Maas S, Single FN, Hartner J, Rozov A, Burnashev N, Feldmeyer D, Sprengel R, Seeburg PH (июль 2000 г.). «Точечная мутация в гене рецептора AMPA снижает летальность у мышей с дефицитом фермента, редактирующего РНК ADAR2». Природа . 406 (6791): 78–81. DOI : 10.1038 / 35017558 . PMID 10894545 . 
  21. ^ Cho DS, Ян W, Ли JT, Shiekhattar R, Мюррей JM, Nishikura K (май 2003). «Требование димеризации для активности редактирования РНК аденозиндезаминаз, действующих на РНК» . Журнал биологической химии . 278 (19): 17093–102. DOI : 10.1074 / jbc.M213127200 . PMID 12618436 . 
  22. ^ "Международный Консорциум Нокаут-Мышей" .
  23. ^ "Информатика генома мыши" .
  24. ^ Skarnes туалет, Розен В, Уэст А.П., Koutsourakis М, Бушелл Вт, Ийер В, Мухика А.О., Томас М, борона Дж, Кокс Т, Джексон D, Северин Дж, Биггс Р, фу Дж, Нефедов М, де - Jong PJ, Стюарт А.Ф., Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс с условным нокаутом для полногеномного исследования функции генов мыши» . Природа . 474 (7351): 337–42. DOI : 10,1038 / природа10163 . PMC 3572410 . PMID 21677750 .  
  25. ^ Долгин E (июнь 2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут" . Природа . 474 (7351): 262–3. DOI : 10.1038 / 474262a . PMID 21677718 . 
  26. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (январь 2007). «Мышь по всем причинам». Cell . 128 (1): 9–13. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.12.018 . PMID 17218247 . 
  27. ^ a b ГЕРДИН, АК (сентябрь 2010 г.). «Программа генетики мышей Сэнгера: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica . 88 : 0. дои : 10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x .
  28. ↑ van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма» . Геномная биология . 12 (6): 224. DOI : 10.1186 / GB-2011-12-6-224 . PMC 3218837 . PMID 21722353 .  
  29. ^ Ян А, Дэн П, Чжу Дж, Ван Г, Чжан Л., Чен А.Ф., Ван Т, Саркар С.Н., Биллиар Т.Р., Ван Ц. (октябрь 2014 г.). «Аденозиндезаминаза, действующая на РНК1, ограничивает обнаружение РНК RIG-I и подавляет продукцию IFN в ответ на вирусные и эндогенные РНК» . Журнал иммунологии . 193 (7): 3436–3445. DOI : 10.4049 / jimmunol.1401136 . PMC 4169998 . PMID 25172485 .  
  30. ^ Liddicoat BJ, Piskol R, Chalk AM, Ramaswami G, M Хигути, Hartner JC, Li JB, Seeburg PH, Walkley CR (сентябрь 2015). «Редактирование РНК с помощью ADAR1 не позволяет MDA5 воспринимать эндогенную дцРНК как чужую» . Наука . 349 (6252): 1115–20. DOI : 10.1126 / science.aac7049 . PMC 5444807 . PMID 26275108 .  
  31. ^ Ward SV, Джордж CX, Welcha MJ, Lioua LY, Hahma B, Lewickia H, Torrea JC, Сэмюэл CE, Олдстоун MB (январь 2011). «Фермент редактирования РНК аденозиндезаминаза является ограничивающим фактором для контроля репликации вируса кори, который также необходим для эмбриогенеза» . PNAS . 108 (1): 331–336. DOI : 10.1073 / pnas.1017241108 . PMC 3017198 . PMID 21173229 .  
  32. ^ Ливингстон Дж. Х., Лин Дж. П., Дейл Р. К., Гилл Д., Броган П., Мюнхен А. и др. (Февраль 2014). «Сигнатура интерферона типа I идентифицирует двусторонний стриарный некроз из-за мутаций в ADAR1». Журнал медицинской генетики . 51 (2): 76–82. DOI : 10.1136 / jmedgenet-2013-102038 . PMID 24262145 . 
  33. ^ Герберт A (июль 2019). «Менделирующая болезнь, вызванная вариантами, влияющими на распознавание Z-ДНК и Z-РНК доменом Zα фермента редактирования двухцепочечной РНК ADAR» . Европейский журнал генетики человека . 8 : 114–117. DOI : 10.1038 / s41431-019-0458-6 . PMC 6906422 . PMID 31320745 .  
  34. ↑ Weiden MD, Hoshino S, Levy DN, Li Y, Kumar R, Burke SA, Dawson R, Hioe CE, Borkowsky W, Rom WN, Hoshino Y (2014). «Аденозиндезаминаза, действующая на РНК-1 (ADAR1), ингибирует репликацию ВИЧ-1 в альвеолярных макрофагах человека» . PLOS ONE . 9 (10): e108476. DOI : 10.1371 / journal.pone.0108476 . PMC 4182706 . PMID 25272020 .  
  35. ^ Chan TH, Lin CH, Qi L, Fei J, Li Y, Yong KJ, Liu M, Song Y, Chow RK, Ng VH, Yuan YF, Tenen DG, Guan XY, Chen L (май 2014 г.). «Нарушение баланса редактирования РНК, опосредованное ADAR (аденозиндеаминазами, которые действуют на РНК) в гепатоцеллюлярной карциноме человека» . Кишечник . 63 (5): 832–43. DOI : 10.1136 / gutjnl-2012-304037 . PMC 3995272 . PMID 23766440 .  
  36. ^ Хил BS, Киган LP, McGurk L, Michlewski G, тигрового J, Stanton CM, Касерес JF, О'Коннелл MA (октябрь 2009). «Редактирование независимых эффектов ADAR на пути miRNA / siRNA» . Журнал EMBO . 28 (20): 3145–56. DOI : 10.1038 / emboj.2009.244 . PMC 2735678 . PMID 19713932 .  
  37. ^ a b Шошан Э, Мобли А. К., Брауэр Р. Р., Камия Т., Хуанг Л., Васкес М. Е., Саламе А., Ли Х. Дж., Ким С. Дж., Иван С., Веласкес-Торрес Г., Нип К. М., Чжу К., Брукс Д., Джонс С. Дж., Бирол И., Москеда М., Вен Й.Й., Этерович А.К., Суд А.К., Хву П., Гершенвальд Дж.Э., Робертсон А.Г., Калин Г.А., Маркель Г., Фидлер И.Дж., Бар-Эли М. (март 2015 г.). «Сниженное преобразование аденозина в инозин miR-455-5p способствует росту меланомы и метастазированию» . Природа клеточной биологии . 17 (3): 311–21. DOI : 10.1038 / ncb3110 . PMC 4344852 . PMID 25686251 .  
  38. ^ Тохо К, Sekijima У, Т Сузуки, Судзуки Н, Томита Y, Yoshida К, Т Хашимото, Ikeda S (сентябрь 2006 г.). «Дистония, умственное ухудшение и наследственный симметричный дисхроматоз в семье с мутацией ADAR1». Расстройства движения . 21 (9): 1510–3. DOI : 10.1002 / mds.21011 . PMID 16817193 . 
  39. ^ a b Gélinas JF, Clerzius G, Shaw E, Gatignol A (сентябрь 2011 г.). «Повышение репликации РНК-вирусов с помощью ADAR1 посредством редактирования РНК и ингибирования РНК-активированной протеинкиназы» . Журнал вирусологии . 85 (17): 8460–6. DOI : 10,1128 / JVI.00240-11 . PMC 3165853 . PMID 21490091 .  
  40. ^ Baczko К, Лампа Дж, Либерт UG, Бринкман U, V - тер Мейльно, Pardowitz I, H, Budka Косби SL, Isserte S, Рима BK (ноябрь 1993 года). «Клональная экспансия гипермутированного вируса кори в головном мозге SSPE». Вирусология . 197 (1): 188–95. DOI : 10.1006 / viro.1993.1579 . PMID 8212553 . 
  41. ↑ Каттанео (21 октября 1988 г.). «Предвзятая гипермутация и другие генетические изменения дефектных вирусов кори при инфекциях головного мозга человека» . Cell . 55 (2): 255–65. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (88) 90048-7 . PMC 7126660 . PMID 3167982 .  
  42. ^ Tenoever BR, Ng SL, Чуа М.А., McWhirter С.М., Гарсия-Састр A, Маниатис T (март 2007). «Множественные функции IKK-родственной киназы IKKepsilon в опосредованном интерфероном противовирусном иммунитете». Наука . 315 (5816): 1274–8. DOI : 10.1126 / science.1136567 . PMID 17332413 . 
  43. ^ Зан RC, Schelp I, O Utermöhlen, фон Лер D (январь 2007). «Гипермутация от A к G в геноме вируса лимфоцитарного хориоменингита» . Журнал вирусологии . 81 (2): 457–64. DOI : 10.1128 / jvi.00067-06 . PMC 1797460 . PMID 17020943 .  
  44. ↑ Кумар (15 апреля 1997 г.). «Ядерная антисмысловая РНК индуцирует обширные модификации аденозина и ядерное удержание транскриптов-мишеней» . Proc Natl Acad Sci USA . 94 (8): 3542–7. DOI : 10.1073 / pnas.94.8.3542 . PMC 20475 . PMID 9108012 .  
  45. ^ Ло GX, Чао М, Се С.Ю., Sureau С, Nishikura К, Тейлор J (1990). «Конкретный переход оснований происходит на реплицирующейся РНК вируса гепатита дельта» . Журнал вирусологии . 64 (3): 1021–7. PMC 249212 . PMID 2304136 .  
  46. ^ Тейлор ДР, Пучи М, Дарнеллы М, Михалик К, Feinstone СМ (2005). «Новый противовирусный путь, который опосредует чувствительность репликона вируса гепатита С к интерферону через ADAR1» . Журнал вирусологии . 79 (10): 6291–8. DOI : 10,1128 / JVI.79.10.6291-6298.2005 . PMC 1091666 . PMID 15858013 .  
  47. ↑ Toth AM, Li Z, Cattaneo R, Samuel CE (октябрь 2009 г.). «РНК-специфическая аденозиндезаминаза ADAR1 подавляет апоптоз, вызванный вирусом кори, и активацию протеинкиназы PKR» . Журнал биологической химии . 284 (43): 29350–6. DOI : 10.1074 / jbc.M109.045146 . PMC 2785566 . PMID 19710021 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Валенсуэла А., Бланко Дж., Каллебаут С., Жакото Е., Луис С., Ованесян А.Г., Франко Р. (1997). Gp120 оболочки ВИЧ-1 и вирусные частицы блокируют связывание аденозиндезаминазы с CD26 человека . Успехи экспериментальной медицины и биологии . 421 . С. 185–92. DOI : 10.1007 / 978-1-4757-9613-1_24 . ISBN 978-1-4757-9615-5. PMID  9330696 .
  • Wathelet MG, Szpirer J, Nols CB, Clauss IM, De Wit L, Islam MQ, Levan G, Horisberger MA, Content J, Szpirer C (сентябрь 1988 г.). «Клонирование и хромосомная локализация человеческих генов, индуцируемых интерфероном I типа». Соматическая клетка и молекулярная генетика . 14 (5): 415–26. DOI : 10.1007 / BF01534709 . PMID  3175763 .
  • Ван И, Цзэн Й, Мюррей Дж. М., Нишикура К. (ноябрь 1995 г.). «Геномная организация и хромосомное расположение гена аденозиндезаминазы человека дцРНК: фермент для редактирования РНК глутамат-активированного ионного канала». Журнал молекулярной биологии . 254 (2): 184–95. DOI : 10.1006 / jmbi.1995.0610 . PMID  7490742 .
  • Паттерсон Дж. Б., Сэмюэл К. Э. (октябрь 1995 г.). «Экспрессия и регуляция интерфероном двухцепочечной РНК-специфической аденозиндезаминазы из клеток человека: данные о двух формах дезаминазы» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (10): 5376–88. DOI : 10.1128 / mcb.15.10.5376 . PMC  230787 . PMID  7565688 .
  • Паттерсон Дж. Б., Томис, округ Колумбия, Ханс С. Л., Сэмюэл К. Э. (июль 1995 г.). «Механизм действия интерферона: двухцепочечная РНК-специфическая аденозиндезаминаза из клеток человека индуцируется альфа- и гамма-интерферонами». Вирусология . 210 (2): 508–11. DOI : 10.1006 / viro.1995.1370 . PMID  7618288 .
  • О'Коннелл М.А., Краузе С., Хигучи М., Сюань Дж.Дж., Тотти Н.Ф., Дженни А., Келлер В. (март 1995 г.). «Клонирование кДНК, кодирующих двухцепочечную РНК-специфичную аденозиндезаминазу млекопитающих» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (3): 1389–97. DOI : 10.1128 / mcb.15.3.1389 . PMC  230363 . PMID  7862132 .
  • Weier HU, Джордж CX, Greulich KM, Samuel CE (ноябрь 1995 г.). «Интерферон-индуцируемый ген двухцепочечной РНК-специфической аденозиндезаминазы (DSRAD) отображается на хромосоме 1q21.1-21.2 человека». Геномика . 30 (2): 372–5. DOI : 10.1006 / geno.1995.0034 . PMID  8586444 .
  • Лю Й., Джордж CX, Паттерсон Дж. Б., Сэмюэл С.Э. (февраль 1997 г.). «Функционально различные двухцепочечные РНК-связывающие домены, связанные с альтернативными вариантами сайтов сплайсинга интерферон-индуцируемой двухцепочечной РНК-специфической аденозиндезаминазы» . Журнал биологической химии . 272 (7): 4419–28. DOI : 10.1074 / jbc.272.7.4419 . PMID  9020165 .
  • Валенсуэла А., Бланко Дж., Каллебаут С., Жакото Е., Луис С., Ованесян А.Г., Франко Р. (апрель 1997 г.). «Связывание аденозиндезаминазы с CD26 человека ингибируется гликопротеином gp120 оболочки ВИЧ-1 и вирусными частицами». Журнал иммунологии . 158 (8): 3721–9. PMID  9103436 .
  • Герберт А., Альфкен Дж., Ким Ю. Г., Миан И. С., Нишикура К., Рич А. (август 1997 г.). «Связывающий домен Z-ДНК, присутствующий в редактирующем ферменте человека, двухцепочечной РНК-аденозиндезаминазе» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (16): 8421–6. DOI : 10.1073 / pnas.94.16.8421 . PMC  22942 . PMID  9237992 .
  • Лю Ю., Герберт А., Рич А., Сэмюэл К.Э. (июль 1998 г.) «Двухцепочечная РНК-специфическая аденозиндезаминаза: свойства связывания нуклеиновых кислот». Методы . 15 (3): 199–205. DOI : 10,1006 / meth.1998.0624 . PMID  9735305 .
  • Джордж CX, Сэмюэл CE (апрель 1999 г.). «Человеческие РНК-специфические транскрипты аденозиндезаминазы ADAR1 обладают альтернативными структурами экзона 1, которые инициируются разными промоторами, один из которых является конститутивно активным, а другой индуцируемым интерфероном» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (8): 4621–6. DOI : 10.1073 / pnas.96.8.4621 . PMC  16382 . PMID  10200312 .
  • Шварц Т., Рульд М.А., Ловенхаупт К., Герберт А., Рич А. (июнь 1999 г.). «Кристаллическая структура домена Zalpha редактирующего фермента человека ADAR1, связанного с левосторонней Z-ДНК». Наука . 284 (5421): 1841–5. DOI : 10.1126 / science.284.5421.1841 . PMID  10364558 .
  • Schade M, Turner CJ, Kühne R, Schmieder P, Lowenhaupt K, Herbert A, Rich A, Oschkinat H (октябрь 1999 г.). «Структура раствора Zalpha-домена фермента редактирования РНК человека ADAR1 показывает предполагаемую связывающую поверхность для Z-ДНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (22): 12465–70. DOI : 10.1073 / pnas.96.22.12465 . PMC  22950 . PMID  10535945 .
  • Бланко Дж., Валенсуэла А., Эррера С., Луис С., Ованесиан А.Г., Франко Р. (июль 2000 г.). «Gp120 ВИЧ-1 ингибирует связывание аденозиндезаминазы с CD26 с помощью механизма, модулируемого экспрессией CD4 и CXCR4» . Письма FEBS . 477 (1–2): 123–8. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (00) 01751-8 . PMID  10899322 .
  • Эррера С., Моримото С., Бланко Дж., Маллол Дж., Арензана Ф., Луис С., Франко Р. (июнь 2001 г.). «Комодуляция CXCR4 и CD26 в лимфоцитах человека» . Журнал биологической химии . 276 (22): 19532–9. DOI : 10.1074 / jbc.M004586200 . PMID  11278278 .
  • Вонг С.К., Сато С., Лазинский Д.В. (июнь 2001 г.). «Распознавание субстрата ADAR1 и ADAR2» . РНК . 7 (6): 846–58. DOI : 10.1017 / S135583820101007X . PMC  1370134 . PMID  11421361 .
  • Eckmann CR, Neunteufl A, Pfaffstetter L, Jantsch MF (июль 2001 г.). «У человека, но не у Xenopus-редактирующего РНК фермента ADAR1, есть атипичный сигнал ядерной локализации, и он проявляет характеристики челночного белка» . Молекулярная биология клетки . 12 (7): 1911–24. DOI : 10.1091 / mbc.12.7.1911 . PMC  55639 . PMID  11451992 .
  • Ян А., Дэн П., Чжу Дж., Ван Г, Чжан Л., Чен А.Ф., Ван Т., Саркар С.Н., Биллиар Т.Р., Ван Ц. (октябрь 2014 г.). «Аденозиндезаминаза, действующая на РНК1, ограничивает обнаружение РНК RIG-I и подавляет продукцию IFN в ответ на вирусные и эндогенные РНК» . Журнал иммунологии . 193 (7): 3436–3445. DOI : 10.4049 / jimmunol.1401136 . PMC  4169998 . PMID  25172485 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Записи OMIM о дисхроматозе Symmetrica Hereditaria 1
  • Местоположение человеческого гена ADAR в браузере генома UCSC .
  • Подробная информация о человеческих генах ADAR в браузере генома UCSC .