Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
ALCAM
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

5A2F

Идентификаторы
ПсевдонимыALCAM , CD166, MEMD, молекула адгезии активированных лейкоцитов.
Внешние идентификаторыOMIM : 601662 MGI : 1313266 HomoloGene : 1229 GeneCards : ALCAM
Расположение гена ( человек )
Хромосома 3 (человек)
Chr.Хромосома 3 (человек) [1]
Хромосома 3 (человек)
Геномное местоположение для ALCAM
Геномное местоположение для ALCAM
Группа3к13.11Начинать105 366 909 п.н. [1]
Конец105 576 900 б.п. [1]
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание с белком GO: 0001948
• связывание с рецептором
• идентичное связывание с белком
Сотовый компонент• составной компонент мембраны
• выступ клетки
• мембрана
• очаговая адгезия
• внутренний компонент плазматической мембраны
• клеточная мембрана
• интегральный компонент плазматической мембраны
• рецепторный комплекс Т-клеток
• внеклеточная область
• аксон
• тело нейрональной клетки
• дендрит
• иммунологический синапс
• внеклеточная экзосома
• внешняя сторона плазматической мембраны
Биологический процесс• гетерофильных межклеточной адгезии с помощью адгезивных молекул с плазматической мембраной клеток
• адаптационная реакция иммунной
• иммунной системы процесс
• расширение проекции нейрон
• клеточной адгезии
• двигательный нейрон аксонов
• расширение аксона участвует в аксонов
• трансдукции сигнала
• сетчатки ганглиозных клеток аксонов
• аксона руководство
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

214

11658

Ансамбль

ENSG00000170017

ENSMUSG00000022636

UniProt

Q13740

Q61490

RefSeq (мРНК)

NM_001627
NM_001243280
NM_001243281
NM_001243283

NM_009655
NM_001331110

RefSeq (белок)

NP_001230209
NP_001230210
NP_001230212
NP_001618

NP_001318039
NP_033785

Расположение (UCSC)Chr 3: 105,37 - 105,58 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Антиген CD166 представляет собой трансмембранный гликопротеин типа I размером 100-105 кДа, который является членом суперсемейства белков иммуноглобулинов . В организме человека он кодируется ALCAM гена . [4] [5] Он также называется CD166 ( кластер дифференцировки 166), MEMD, [6] SC-1 / DM-GRASP / BEN у курицы и KG-CAM у крысы.

В некоторых литературных источниках он также упоминается как лиганд CD6 (CD6L). Он экспрессируется на активированных Т-клетках , активированных моноцитах , эпителиальных клетках, фибробластах , нейронах , клетках меланомы , а также в потовых и сальных железах. [ необходима цитата ] Сообщается, что экспрессия белка CD166 повышается в клеточной линии, происходящей от метастазирующей меланомы. [6] CD166 играет важную роль в обеспечении адгезионных взаимодействий между эпителиальными клетками тимуса и клетками CD6 + во время развития интратимических Т-клеток. [ необходима цитата ]

В последнее время CD166 также использовался в качестве потенциального маркера раковых стволовых клеток. [ необходима цитата ]


Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000170017 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ Bowen MA, Patel DD, Li X, Modrell B, Malacko AR, Wang WC, Marquardt H, Neubauer M, Pesando JM, Francke U, et al. (Июнь 1995 г.). «Клонирование, картирование и характеристика активированной молекулы адгезии лейкоцитов и клеток (ALCAM), лиганда CD6» . J Exp Med . 181 (6): 2213–20. DOI : 10,1084 / jem.181.6.2213 . PMC 2192054 . PMID 7760007 .  
  5. ^ «Ген Entrez: ALCAM активировала молекулу адгезии лейкоцитарных клеток» .
  6. ^ a b Degen WG, van Kempen LC, Gijzen EG, et al. (1998). «MEMD, новая молекула клеточной адгезии в метастазирующих клеточных линиях меланомы человека, идентична ALCAM (активированная молекула адгезии лейкоцитов)» . Являюсь. J. Pathol . 152 (3): 805–13. PMC 1858405 . PMID 9502422 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Уитни Г.С., Старлинг Г.С., Боуэн М.А. и др. (1995). «Богатый цистеином домен CD6, проксимальный к мембране рецептора скавенджера, содержит активированный сайт связывания молекулы адгезии лейкоцитов» . J. Biol. Chem . 270 (31): 18187–90. DOI : 10.1074 / jbc.270.31.18187 . PMID  7543097 .
  • Баджорат Дж., Боуэн М.А., Аруффо А (1996). «Молекулярная модель N-концевого рецептор-связывающего домена человеческого CD6-лиганда ALCAM» . Protein Sci . 4 (8): 1644–7. DOI : 10.1002 / pro.5560040822 . PMC  2143187 . PMID  8520490 .
  • Skonier JE, Bowen MA, Emswiler J, et al. (1996). «Распознавание различных белков членами суперсемейства иммуноглобулинов: определение участка связывания рецептора в человеческом лиганде CD6 ALCAM». Биохимия . 35 (38): 12287–91. DOI : 10.1021 / bi961038k . PMID  8823162 .
  • Певица Н.Г., Митра Р., Лиалиос Ф. и др. (1998). «CD6-зависимые взаимодействия Т-клеток и кератиноцитов: функциональные доказательства наличия второго лиганда CD6 на кератиноцитах, активированных гамма-интерфероном». Иммунол. Lett . 58 (1): 9–14. DOI : 10.1016 / S0165-2478 (97) 02707-7 . PMID  9436462 .
  • Degen WG, van Kempen LC, Gijzen EG, et al. (1998). «MEMD, новая молекула клеточной адгезии в метастазирующих клеточных линиях меланомы человека, идентична ALCAM (активированная молекула адгезии лейкоцитов)» . Являюсь. J. Pathol . 152 (3): 805–13. PMC  1858405 . PMID  9502422 .
  • Кортес Ф., Дешазо Ф., Учида Н. и др. (1999). «HCA, иммуноглобулиноподобная адгезионная молекула, присутствующая на самых ранних гемопоэтических клетках-предшественниках человека, также экспрессируется стромальными клетками в кроветворных тканях». Кровь . 93 (3): 826–37. DOI : 10.1182 / blood.V93.3.826 . PMID  9920831 .
  • Томита К., ван Боховен А., Янсен К.Ф. и др. (2000). «Координировать набор E-кадгерина и ALCAM для межклеточных контактов с помощью альфа-катенина». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 267 (3): 870–4. DOI : 10.1006 / bbrc.1999.2040 . PMID  10673383 .
  • van Kempen LC, Nelissen JM, Degen WG и др. (2001). «Молекулярная основа взаимодействия гомофильных активированных молекул адгезии лейкоцитов (ALCAM) -ALCAM» . J. Biol. Chem . 276 (28): 25783–90. DOI : 10.1074 / jbc.M011272200 . PMID  11306570 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Кристиансен Г., Пиларски С., Виссманн С. и др. (2003). «ALCAM / CD166 активируется при раке простаты низкой степени злокачественности и постепенно теряется при поражениях высокой степени». Простаты . 54 (1): 34–43. DOI : 10.1002 / pros.10161 . PMID  12481253 . S2CID  22749852 .
  • Чжан Х., Ли XJ, Мартин Д.Б., Эберсолд Р. (2003). «Идентификация и количественное определение N-связанных гликопротеинов с использованием химии гидразидов, метки стабильных изотопов и масс-спектрометрии». Nat. Biotechnol . 21 (6): 660–6. DOI : 10.1038 / nbt827 . PMID  12754519 . S2CID  581283 .
  • Фудзивара Х., Тацуми К., Косака К. и др. (2003). «Человеческие бластоцисты и эпителиальные клетки эндометрия экспрессируют активированную молекулу адгезии лейкоцитарных клеток (ALCAM / CD166)» . J. Clin. Эндокринол. Метаб . 88 (7): 3437–43. DOI : 10.1210 / jc.2002-021888 . PMID  12843199 .
  • Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID  14702039 .
  • ван Кемпен Л.С., Мейер Ф., Эгеблад М. и др. (2004). «Усечение активированной молекулы адгезии лейкоцитарных клеток: путь к метастазам меланомы» . J. Invest. Дерматол . 122 (5): 1293–301. DOI : 10.1111 / j.0022-202X.2004.22531.x . PMID  15140234 .
  • Циммерман А.В., Нелиссен Дж. М., ван Эмст-де Фрис С.Е. и др. (2005). «Цитоскелетные ограничения регулируют гомотипическую ALCAM-опосредованную адгезию через PKCalpha независимо от Rho-подобных GTPases» . J. Cell Sci . 117 (Pt 13): 2841–52. DOI : 10,1242 / jcs.01139 . PMID  15169840 .
  • Икеда К., Квертермус Т. (2005). «Молекулярная изоляция и характеристика растворимой изоформы активированной молекулы адгезии лейкоцитарных клеток, которая модулирует функцию эндотелиальных клеток» . J. Biol. Chem . 279 (53): 55315–23. DOI : 10.1074 / jbc.M407776200 . PMID  15496415 .
  • Верма А., Шукла Н.К., Део С.В. и др. (2005). «MEMD / ALCAM: потенциальный маркер инвазии опухоли и узловых метастазов при плоскоклеточном раке пищевода». Онкология . 68 (4–6): 462–70. DOI : 10.1159 / 000086989 . PMID  16024937 . S2CID  25355369 .
  • Лунтер П.С., ван Килсдонк Дж. В., ван Бик Х. и др. (2005). «Активированная молекула адгезии лейкоцитарных клеток (ALCAM / CD166 / MEMD), новый фактор инвазивного роста, контролирует активность матриксной металлопротеиназы» . Cancer Res . 65 (19): 8801–8. DOI : 10.1158 / 0008-5472.CAN-05-0378 . PMID  16204050 .
  • Лю Т., Цянь В.Дж., Гриценко М.А. и др. (2006). «Анализ N-гликопротеома плазмы человека методом иммуноаффинного вычитания, химии гидразидов и масс-спектрометрии» . J. Proteome Res . 4 (6): 2070–80. DOI : 10.1021 / pr0502065 . PMC  1850943 . PMID  16335952 .

Внешние ссылки [ править ]

  • ALCAM в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
  • Расположение генома человека ALCAM и страница сведений о гене ALCAM в браузере генома UCSC .


  • v
  • т
  • е