Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
ATF1
Белок ATF1 PDB 1dh3.png
Идентификаторы
ПсевдонимыATF1 , EWS-FUS / ATF-1, TREB36, активирующий фактор транскрипции 1
Внешние идентификаторыOMIM : 123803 MGI : 3037720 HomoloGene : 3790 GeneCard : ATF1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человека) [1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение ATF1
Геномное расположение ATF1
Группа12q13.12Начинать50 763 710 п.н. [1]
Конец50 821 162 п.н. [1]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE ATF1 222103 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывания ДНК
• последовательность-специфической ДНК связывания
• РНК - полимеразы регуляторной области ДНК последовательности специфических II связывания
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 ДНК-связывающий фактор активности транскрипции
• ГО: 0001077, ГО: 0001212 , ГО: 0001213, ГО: 0001211, ГО: 0001205 ДНК-связывающий активатора транскрипции , активность РНК - полимеразы II-специфического
• ГО: связывание 0001948 белок
• белок гетеродимеризация активность
• фактор транскрипции , активность РНК - полимеразы II дистальный энхансер последовательность-специфического связывания
• идентичную связывание с белками
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично
для РНК-полимеразы II • Связывание макромолекулярного комплекса GO: 0032403
Сотовый компонент• Комплекс фактора транскрипции ATF1-ATF4
• Комплекс регулятора транскрипции
• нуклеоплазма
• ядро клетки
Биологический процесс• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• ответ на органическое циклическое соединение
• транскрипция, шаблон ДНК
• положительная регуляция репликации ДНК
• позитивная регуляция развития проекции нейронов
• ответ на ион кобальта
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция от промотора РНК-полимеразы II
• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• сборка клеточного макромолекулярного комплекса
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

466

100040260

Ансамбль

ENSG00000123268

н / д

UniProt

P18846

н / д

RefSeq (мРНК)

NM_005171

н / д

RefSeq (белок)

NP_005162

н / д

Расположение (UCSC)Chr 12: 50,76 - 50,82 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Циклический АМФ-зависимый фактор транскрипции , ATF1 является белком , который в организме человека кодируется ATF1 геном .

Этот ген кодирует активирующий фактор транскрипции , который принадлежит к подсемейству ATF и семейству bZIP (основная область лейциновой молнии). Он влияет на клеточные физиологические процессы, регулируя экспрессию последующих генов-мишеней, которые связаны с ростом, выживанием и другой клеточной активностью. Этот белок фосфорилируется по серину 63 в его киназно-индуцируемом домене серин / треонинкиназами, цАМФ-зависимой протеинкиназой A, кальмодулин-зависимой протеинкиназой I / II, митоген- и стресс-активируемой протеинкиназой и циклин-зависимой киназой 3 ( cdk-3). Его фосфорилирование усиливает его трансактивационную и транскрипционную активность, а также усиливает трансформацию клеток. [4]

Клиническое значение [ править ]

Слияние этого гена и FUS на хромосоме 16 или EWSR1 на хромосоме 22, индуцированное транслокацией, генерирует химерные белки в ангиоматоидной фиброзной гистиоцитоме и светлоклеточной саркоме . Этот ген имеет псевдоген на хромосоме 6. [4] [5]

См. Также [ править ]

  • Активирующий фактор транскрипции

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что ATF1 взаимодействует с:

  • BRCA1 , [6]
  • CSNK2A2 , [7]
  • CSNK2A1 , [7] и
  • EWS. [8]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000123268 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ a b «Ген Entrez: ATF1, активирующий фактор транскрипции 1» .
  5. ^ Zucman Дж, Делаттр О, Desmaze С, Эпштейна А.Л., Стенман G, Speleman F, Fletchers компакт - диск, Aurias А, Томас G (ноябрь 1993 года). «Слияние генов EWS и ATF-1, вызванное транслокацией t (12; 22) в злокачественной меланоме мягких частей тела». Нат Жене . 4 (4): 341–5. DOI : 10.1038 / ng0893-341 . PMID 8401579 . S2CID 10944105 .  
  6. ^ Houvras Y, Benezra М, Чжан Н, Манфреди JJ, Вебер Б.Л., Лихт JD (ноябрь 2000 года). «BRCA1 физически и функционально взаимодействует с ATF1» . J. Biol. Chem . 275 (46): 36230–7. DOI : 10.1074 / jbc.M002539200 . PMID 10945975 . 
  7. ^ a b Ямагути Ю., Вада Т., Судзуки Ф., Такаги Т., Хасэгава Дж., Ханда Х (август 1998 г.). «Казеинкиназа II взаимодействует с доменами bZIP нескольких факторов транскрипции» . Nucleic Acids Res . 26 (16): 3854–61. DOI : 10.1093 / NAR / 26.16.3854 . PMC 147779 . PMID 9685505 .  
  8. ↑ Fujimura Y, Ohno T, Siddique H, Lee L, Rao VN, Reddy ES (январь 1996 г.). «Ген EWS-ATF-1, участвующий в злокачественной меланоме мягких частей тела с транслокацией t (12; 22) хромосомы, кодирует конститутивный активатор транскрипции». Онкоген . 12 (1): 159–67. PMID 8552387 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Fujimura Y, Ohno T, Siddique H, Lee L, Rao VN, Reddy ES (январь 1996 г.). «Ген EWS-ATF-1, участвующий в злокачественной меланоме мягких частей тела с транслокацией t (12; 22) хромосомы, кодирует конститутивный активатор транскрипции». Онкоген . 12 (1): 159–67. PMID  8552387 .
  • Fujimura Y, Siddique H, Lee L, Rao VN, Reddy ES (октябрь 2001 г.). «Химерный белок EWS-ATF-1 в светлоклеточной саркоме мягких тканей ассоциируется с CREB-связывающим белком и мешает р53-опосредованной функции трансактивации» . Онкоген . 20 (46): 6653–9. DOI : 10.1038 / sj.onc.1204684 . PMID  11709699 .
  • Рефусс Р.П., Уолтон К.М., Лорио М.М., Гудман Р.Х. (1991). «ЦАМФ-регулируемый энхансер-связывающий белок ATF-1 активирует транскрипцию в ответ на цАМФ-зависимую протеинкиназу А.». J. Biol. Chem . 266 (28): 18431–4. PMID  1655749 .
  • Йошимура Т., Фудзисава Дж., Йошида М. (1990). «Множественные клоны кДНК, кодирующие ядерные белки, которые связываются с такс-зависимым энхансером HTLV-1: все они содержат структуру лейциновой молнии и основной аминокислотный домен» . EMBO J . 9 (8): 2537–42. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1990.tb07434.x . PMC  552284 . PMID  2196176 .
  • Хай Т.В., Лю Ф., Кукос В.Дж., Грин М.Р. (1990). «Клоны кДНК фактора транскрипции ATF: обширное семейство белков лейциновой молнии, способных избирательно образовывать ДНК-связывающие гетеродимеры» . Genes Dev . 3 (12B): 2083–90. DOI : 10,1101 / gad.3.12b.2083 . PMID  2516827 .
  • Понгубала Дж. М., Атчисон М. Л. (1995). «Активация фактора транскрипции 1 и модулятора элемента ответа на циклический АМФ может модулировать активность энхансера иммуноглобулина каппа 3 '» . J. Biol. Chem . 270 (17): 10304–13. DOI : 10.1074 / jbc.270.17.10304 . PMID  7730336 .
  • Лю Ф., Томпсон М.А., Вагнер С. и др. (1993). «Активирующий фактор транскрипции-1 может опосредовать Са (2 +) - и цАМФ-индуцируемую активацию транскрипции». J. Biol. Chem . 268 (9): 6714–20. PMID  8384217 .
  • Дорси MJ, Tae HJ, Sollenberger KG и др. (1996). «B-ATF: новый человеческий белок bZIP, который ассоциируется с членами семейства факторов транскрипции AP-1». Онкоген . 11 (11): 2255–65. PMID  8570175 .
  • Сан П., Лу Л., Маурер Р.А. (1996). «Регулирование активации фактора транскрипции-1 и белка, связывающего элемент ответа цАМФ, с помощью Ca2 + / кальмодулин-зависимых протеинкиназ типа I, II и IV» . J. Biol. Chem . 271 (6): 3066–73. DOI : 10.1074 / jbc.271.6.3066 . PMID  8621702 .
  • Шимомура А., Огава Ю., Китани Т. и др. (1996). «Кальмодулин-зависимая протеинкиназа II усиливает активацию транскрипции за счет активации фактора транскрипции 1, но не белка, связывающего элемент ответа цАМФ» . J. Biol. Chem . 271 (30): 17957–60. DOI : 10.1074 / jbc.271.30.17957 . PMID  8663317 .
  • Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Genome Res . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID  8889548 .
  • Кобаяси М., Шимомура А., Хагивара М., Каваками К. (1997). «Фосфорилирование ATF-1 усиливает его связывание с ДНК и транскрипцию промотора гена альфа-1 субъединицы Na, K-АТФазы» . Nucleic Acids Res . 25 (4): 877–82. DOI : 10.1093 / NAR / 25.4.877 . PMC  146500 . PMID  9016641 .
  • Soubt MK, Marksitzer R, Menoud PA, Nagamine Y (1998). «Роль тканеспецифического фактора транскрипции LFB3 в циклическом AMP-чувствительном энхансере гена активатора плазминогена урокиназного типа в клетках LLC-PK1» . Мол. Клетка. Биол . 18 (8): 4698–706. DOI : 10.1128 / mcb.18.8.4698 . PMC  109056 . PMID  9671480 .
  • Ямагути Ю., Вада Т., Сузуки Ф. и др. (1998). «Казеинкиназа II взаимодействует с доменами bZIP нескольких факторов транскрипции» . Nucleic Acids Res . 26 (16): 3854–61. DOI : 10.1093 / NAR / 26.16.3854 . PMC  147779 . PMID  9685505 .
  • Пеллин А., Монтеагудо С., Лопес-Хинес С. и др. (1999). «Новый тип химерного продукта слияния генов EWS и ATFI при светлоклеточной саркоме (злокачественная меланома мягких частей тела)». Гены Хромосомы Рак . 23 (4): 358–60. DOI : 10.1002 / (SICI) 1098-2264 (199812) 23: 4 <358 :: AID-GCC11> 3.0.CO; 2-3 . PMID  9824209 .
  • Кабе Ю., Гото М., Шима Д. и др. (1999). «Роль человеческого MBF1 как транскрипционного коактиватора» . J. Biol. Chem . 274 (48): 34196–202. DOI : 10.1074 / jbc.274.48.34196 . PMID  10567391 .
  • Савада Дж., Симидзу Н., Сузуки Ф. и др. (2000). «Синергетическая активация транскрипции с помощью hGABP и избранных членов семейства белков, связывающих фактор транскрипции активации / элемент ответа цАМФ» . J. Biol. Chem . 274 (50): 35475–82. DOI : 10.1074 / jbc.274.50.35475 . PMID  10585419 .
  • Houvras Y, Benezra M, Zhang H и др. (2000). «BRCA1 физически и функционально взаимодействует с ATF1» . J. Biol. Chem . 275 (46): 36230–7. DOI : 10.1074 / jbc.M002539200 . PMID  10945975 .
  • Кнёфлер М., Салех Л., Бауэр С. и др. (2000). «Промоторные элементы и факторы транскрипции, участвующие в дифференцировочно-зависимой экспрессии рибонуклеиновой кислоты мессенджера хорионического гонадотропина-альфа человека в термических ворсинчатых трофобластах» . Эндокринология . 141 (10): 3737–48. DOI : 10.1210 / en.141.10.3737 . PMID  11014230 .
  • Артур Дж. С., Коэн П. (2000). «MSK1 необходим для фосфорилирования CREB в ответ на митогены в эмбриональных стволовых клетках мыши» . FEBS Lett . 482 (1–2): 44–8. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (00) 02031-7 . PMID  11018520 . S2CID  30094202 .
  • Андреуччи Дж. Дж., Грант Д., Кокс Д. М. и др. (2002). «Состав и функция комплексов транскрипции AP-1 во время дифференцировки мышечных клеток» . J. Biol. Chem . 277 (19): 16426–32. DOI : 10.1074 / jbc.M110891200 . PMID  11877423 .

Внешние ссылки [ править ]

  • ATF1 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • Расположение генома человека ATF1 и страница сведений о гене ATF1 в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .

  1. ^ Шимомура А, У Огава, Китани Т, Фудзисава Н, Хагивара М (июль 1996 года). «Кальмодулин-зависимая протеинкиназа II усиливает активацию транскрипции за счет активации фактора транскрипции 1, но не белка, связывающего элемент ответа цАМФ» . J. Biol. Chem . 271 (30): 17957–60. DOI : 10.1074 / jbc.271.30.17957 . PMID 8663317 .