• цитоплазма • комплекс факторов транскрипции ATF1-ATF4 • комплекс факторов транскрипции ATF4-CREB1 • комплекс регуляторов транскрипции • дендритная мембрана • ядро клетки • ядро тельца Леви • периферия ядра • мембрана • клеточная мембрана • нуклеоплазма • центр организации микротрубочек • проекция нейрона • цитоскелет • Комплекс CHOP-ATF4 • центросома • макромолекулярный комплекс • комплекс факторов транскрипции РНК-полимераза II
Биологический процесс
• сигнальный путь гамма-аминомасляной кислоты • глюконеогенез • регуляция транскрипции по шаблону ДНК • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на стресс эндоплазматического ретикулума • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • негативная регуляция индуцированного окислительным стрессом гибель нейронов • клеточный ответ на аминокислотное голодание • транскрипция мРНК с промотора РНК-полимеразы II • циркадная регуляция экспрессии генов • ответ на стресс эндоплазматического ретикулума • опосредованный PERK ответ развернутого белка • ответ на стресс эндоплазматического ретикулума, индуцированный марганцем • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • позитивная регуляция апоптотического процесса нейронов • внутренний апоптотический сигнальный путь в ответ на стресс эндоплазматического ретикулума • позитивная регуляция экспрессии генов • позитивная регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II промотор в ответ на окислительный стресс • циркадный ритм • негативная регуляция транспорта ионов калия • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на вещество, содержащее мышьяк • клеточный ответ на голодание по глюкозе • отрицательная регуляция инициации трансляции в ответ на стресс • ритмический процесс • клеточный ответ на УФ • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на стресс • клеточный метаболический процесс аминокислот • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция по ДНК-шаблону • позитивная регуляция апоптотического процесса • позитивная регуляция продукции фактора роста эндотелия сосудов • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы I • клеточный ответ на дофамин • ответ на токсическое вещество • дифференцировка нейронов • клеточный ответ на кислородно-глюкозную депривацию • позитивная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути, вызванного стрессом эндоплазматического ретикулума • клеточный гомеостаз ионов кальция • положительная регуляция развития биоминеральной ткани • негативная регуляция термогенеза, вызванного холодом • позитивная регуляция связанного с сосудом процесса апоптоза гладкомышечных клеток • позитивная регуляция натрий-зависимого транспорта фосфата
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
468
11911
Ансамбль
ENSG00000128272
ENSMUSG00000042406
UniProt
P18848
Q06507
RefSeq (мРНК)
NM_182810 NM_001675
NM_001287180 NM_009716
RefSeq (белок)
NP_001666 NP_877962
NP_001274109 NP_033846
Расположение (UCSC)
Chr 22: 39,52 - 39,52 Мб
Chr 15: 80.26 - 80.26 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Активация фактора транскрипции 4 (налоговый реагирующий энхансер В67) , также известный как ATF4 , является белком , который в организме человека кодируется ATF4 геном . [5] [6]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
2 Перевод
3 См. Также
4 ссылки
5 Дальнейшее чтение
6 Внешние ссылки
Функция [ править ]
Этот ген кодирует фактор транскрипции, который первоначально был идентифицирован как широко экспрессируемый ДНК-связывающий белок млекопитающих, который может связывать чувствительный к налогам энхансерный элемент в LTR HTLV-1. Кодируемый белок также был выделен и охарактеризован как белок 2, связывающий элемент цАМФ-ответа ( CREB-2 ). Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству ДНК-связывающих белков, которое включает семейство факторов транскрипции AP-1, белки, связывающие элемент цАМФ ( CREB ) и CREB-подобные белки. Эти факторы транскрипции имеют общую область лейциновой молнии, которая участвует в межбелковых взаимодействиях и расположена на С-конце.к ряду основных аминокислот, который функционирует как ДНК-связывающий домен . Были описаны два альтернативных транскрипта, кодирующих один и тот же белок. Два псевдогена расположены на Х-хромосоме по адресу q28 в области, содержащей большую инвертированную дупликацию. [7]
Также известно, что фактор транскрипции ATF4 играет роль в дифференцировке остеобластов вместе с RUNX2 и остериксом . [8] Терминальная дифференцировка остеобластов, представленная минерализацией матрикса, значительно ингибируется инактивацией JNK . Инактивация JNK подавляет экспрессию ATF-4 и, как следствие, минерализацию матрикса. [9] Белок IMPACT регулирует ATF4 у C. elegans, увеличивая продолжительность жизни. [10]
Перевод [ править ]
Трансляция ATF4 зависит от восходящих открытых рамок считывания, расположенных в 5'UTR . [11] Расположение второй uORF, метко названного uORF2, перекрывается с открытой рамкой считывания ATF4 . В нормальных условиях uORF1 транслируется, а затем трансляция uORF2 происходит только после повторного получения eIF2-TC. Трансляция uORF2 требует, чтобы рибосомы прошли через ORF ATF4 , стартовый кодон которой расположен внутри uORF2. Это приводит к его подавлению. Однако в стрессовых условиях рибосома 40S будет обходить uORF2 из-за снижения концентрации eIF2-TC, что означает, что рибосома не приобретает его вовремя, чтобы транслировать uORF2. Вместо ATF4переведено. [11]
См. Также [ править ]
Активирующий фактор транскрипции
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000128272 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042406 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Цудзимото А, Nyunoya Н, Морита Т, Т Сато, Shimotohno К (март 1991 года). «Выделение кДНК для ДНК-связывающих белков, которые специфически связываются с чувствительным к налогам элементом энхансера в длинном концевом повторе вируса Т-клеточного лейкоза человека типа I» . Журнал вирусологии . 65 (3): 1420–6. DOI : 10,1128 / JVI.65.3.1420-1426.1991 . PMC 239921 . PMID 1847461 .
^ Карпинский Б.А., Морло GD, Huggenvik J, Uhler MD, Leiden JM (июнь 1992). «Молекулярное клонирование человеческого CREB-2: фактор транскрипции ATF / CREB, который может отрицательно регулировать транскрипцию из элемента ответа цАМФ» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (11): 4820–4. Bibcode : 1992PNAS ... 89.4820K . DOI : 10.1073 / pnas.89.11.4820 . PMC 49179 . PMID 1534408 .
^ «Энтрез Ген: ATF4, активирующий фактор транскрипции 4 (чувствительный к налогам элемент энхансера B67)» .
↑ Franceschi RT, Ge C, Xiao G, Roca H, Jiang D (2009). «Транскрипционная регуляция остеобластов» . Клетки Тканевые Органы . 189 (1–4): 144–52. DOI : 10.1159 / 000151747 . PMC 3512205 . PMID 18728356 .
^ Matsuguchi T, Chiba N, Bandow K, Kakimoto K, Масуда A, Ohnishi T (март 2009). «Активность JNK важна для экспрессии Atf4 и дифференцировки остеобластов на поздней стадии». Журнал исследований костей и минералов . 24 (3): 398–410. DOI : 10,1359 / jbmr.081107 . PMID 19016586 .
^ Ferraz RC, Камара H, De Souza-EA, Pinto S, Pinca AP, Silva RC, Сато В.Н., Castilho Б.А., Mori MA (октябрь 2016). «IMPACT - это ингибитор GCN2, ограничивающий продолжительность жизни Caenorhabditis elegans» . BMC Biology . 14 (1): 87. DOI : 10,1186 / s12915-016-0301-2 . PMC 5054600 . PMID 27717342 .
^ a b Somers J, Pöyry T, Willis AE (август 2013 г.). «Перспективы функции открытой рамки считывания у млекопитающих» . Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 45 (8): 1690–700. DOI : 10.1016 / j.biocel.2013.04.020 . PMC 7172355 . PMID 23624144 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Рутковски Д.Т., Кауфман Р.Дж. (апрель 2003 г.). «Все дороги ведут в ATF4». Клетка развития . 4 (4): 442–4. DOI : 10.1016 / S1534-5807 (03) 00100-X . PMID 12689582 .
Нисидзава М., Нагата С. (март 1992 г.). «клоны кДНК, кодирующие белки лейциновой молнии, которые взаимодействуют с белком, связывающим промоторный элемент 1 гена G-CSF» . Письма FEBS . 299 (1): 36–8. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (92) 80094-W . PMID 1371974 . S2CID 34097395 .
Карпинский Б.А., Морле Г.Д., Хуггенвик Дж., Улер М.Д., Лейден Дж. М. (июнь 1992 г.). «Молекулярное клонирование человеческого CREB-2: фактор транскрипции ATF / CREB, который может отрицательно регулировать транскрипцию из элемента ответа цАМФ» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (11): 4820–4. Bibcode : 1992PNAS ... 89.4820K . DOI : 10.1073 / pnas.89.11.4820 . PMC 49179 . PMID 1534408 .
Хай Т., Курран Т. (май 1991 г.). «Межсемейная димеризация факторов транскрипции Fos / Jun и ATF / CREB изменяет специфичность связывания ДНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (9): 3720–4. Bibcode : 1991PNAS ... 88.3720H . DOI : 10.1073 / pnas.88.9.3720 . PMC 51524 . PMID 1827203 .
Цудзимото А., Нюноя Х, Морита Т., Сато Т., Шимотохно К. (март 1991 г.). «Выделение кДНК для ДНК-связывающих белков, которые специфически связываются с чувствительным к налогам элементом энхансера в длинном концевом повторе вируса Т-клеточного лейкоза человека типа I» . Журнал вирусологии . 65 (3): 1420–6. DOI : 10,1128 / JVI.65.3.1420-1426.1991 . PMC 239921 . PMID 1847461 .
Хай Т.В., Лю Ф., Coukos WJ, Грин М.Р. (декабрь 1989 г.). «Клоны кДНК фактора транскрипции ATF: обширное семейство белков лейциновой молнии, способных избирательно образовывать ДНК-связывающие гетеродимеры» . Гены и развитие . 3 (12B): 2083–90. DOI : 10,1101 / gad.3.12b.2083 . PMID 2516827 .
Кокаме К., Като Х, Мията Т. (ноябрь 1996 г.). «Гены-респонденты гомоцистеина в эндотелиальных клетках сосудов, идентифицированные с помощью дифференциального анализа дисплея. GRP78 / BiP и новые гены» . Журнал биологической химии . 271 (47): 29659–65. DOI : 10.1074 / jbc.271.47.29659 . PMID 8939898 .
Reddy TR, Tang H, Li X, Wong-Staal F (июнь 1997 г.). «Функциональное взаимодействие трансактиватора HTLV-1 Tax с активирующим фактором транскрипции-4 (ATF4)» . Онкоген . 14 (23): 2785–92. DOI : 10.1038 / sj.onc.1201119 . PMID 9190894 .
Лян Г., Хай Т. (сентябрь 1997 г.). «Характеристика человеческого активирующего фактора транскрипции 4, активатора транскрипции, который взаимодействует с множеством доменов белка, связывающего цАМФ-чувствительный элемент-связывающий белок (CREB)» . Журнал биологической химии . 272 (38): 24088–95. DOI : 10.1074 / jbc.272.38.24088 . PMID 9295363 .
Кавай Т., Мацумото М., Такеда К., Санджо Х., Акира С. (март 1998 г.). «ZIP-киназа, новая серин / треониновая киназа, которая опосредует апоптоз» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (3): 1642–51. DOI : 10.1128 / mcb.18.3.1642 . PMC 108879 . PMID 9488481 .
Оутинен П.А., Суд С.К., Пфайфер С.И., Памиди С., Подор Т.Дж., Ли Дж., Вайц Д.И., Остин Р.К. (август 1999 г.). «Вызванный гомоцистеином стресс эндоплазматического ретикулума и остановка роста приводят к специфическим изменениям в экспрессии генов в эндотелиальных клетках сосудов человека». Кровь . 94 (3): 959–67. DOI : 10.1182 / blood.V94.3.959.415k20_959_967 . PMID 10419887 .
Подуст Л.М., Крезель А.М., Ким Й. (январь 2001 г.). «Кристаллическая структура CCAAT-бокса / связывающего энхансера белка бета, активирующего фактор транскрипции-4 основного гетеродимера лейциновой молнии в отсутствие ДНК» . Журнал биологической химии . 276 (1): 505–13. DOI : 10.1074 / jbc.M005594200 . PMID 11018027 .
Мерфи П., Колстё А. (октябрь 2000 г.). «Экспрессия фактора транскрипции bZIP TCF11 и его потенциальных партнеров по димеризации во время развития». Механизмы развития . 97 (1–2): 141–8. DOI : 10.1016 / S0925-4773 (00) 00413-5 . PMID 11025215 . S2CID 17474070 .
White JH, McIllhinney RA, Wise A, Ciruela F, Chan WY, Emson PC, Billinton A, Marshall FH (декабрь 2000 г.). «Рецептор GABAB напрямую взаимодействует с родственными факторами транскрипции CREB2 и ATFx» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (25): 13967–72. Bibcode : 2000PNAS ... 9713967W . DOI : 10.1073 / pnas.240452197 . PMC 17684 . PMID 11087824 .
He CH, Gong P, Hu B, Stewart D, Choi ME, Choi AM, Alam J (июнь 2001 г.). «Идентификация активирующего фактора транскрипции 4 (ATF4) как белка, взаимодействующего с Nrf2. Влияние на регуляцию гена гемоксигеназы-1» . Журнал биологической химии . 276 (24): 20858–65. DOI : 10.1074 / jbc.M101198200 . PMID 11274184 .
Siu F, Bain PJ, LeBlanc-Chaffin R, Chen H, Kilberg MS (июль 2002 г.). «ATF4 является медиатором пути реакции, связанной с восприятием питательных веществ, которая активирует ген аспарагинсинтетазы человека» . Журнал биологической химии . 277 (27): 24120–7. DOI : 10.1074 / jbc.M201959200 . PMID 11960987 .
Бауэрс А.Дж., Скалли С., Бойлан Дж. Ф. (май 2003 г.). «SKIP3, новый ортолог Drosophila tribbles, сверхэкспрессируется в опухолях человека и регулируется гипоксией» . Онкоген . 22 (18): 2823–35. DOI : 10.1038 / sj.onc.1206367 . PMID 12743605 .
Со Дж., Фортуно Е.С., Су Дж. М., Стенсен Д., Тан В., Паркс Е. Дж., Адамс К. М., Таунс Т., Графф Дж. М. (ноябрь 2009 г.). «Atf4 регулирует ожирение, гомеостаз глюкозы и расход энергии» . Диабет . 58 (11): 2565–73. DOI : 10,2337 / db09-0335 . PMC 2768187 . PMID 19690063 .
Эберт, С.М., Буллард, С.А., Басисты, Н., Маркотт, Г.Р., Скопец, З.П., Дирдорф, Дж. М., ... и Бодин, СК (2020). «Активирующий фактор транскрипции 4 (ATF4) способствует атрофии скелетных мышц за счет образования гетеродимера с регулятором транскрипции C / EBPβ». Журнал биологической химии, 295 (9), 2787–2803. DOI : 10,1074 / jbc.RA119.012095 PMC 7049960 PMID 31953319
Внешние ссылки [ править ]
ATF4 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
Расположение генома человека ATF4 и страница сведений о гене ATF4 в браузере генома UCSC .
PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческого циклического AMP-зависимого фактора транскрипции ATF-4.
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .
