ATG4A

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
2П82

Идентификаторы

Псевдонимы

ATG4A , APG4A, AUTL2, 4A цистеинпептидаза, связанная с аутофагией

Внешние идентификаторы

OMIM: 300663 MGI: 2147903 HomoloGene: 70873 Генные карты : ATG4A

Расположение гена (человек)

Chr.	Х-хромосома (человека) ^[1]

Группа	Xq22.3	Начинать	108 091 668 п.н. ^[1]
Группа	Xq22.3	Конец	108 154 671 п.н. ^[1]

Расположение гена (Мышь)

Chr.	Х-хромосома (мышь) ^[2]

Группа	Х \| Х F1	Начинать	140 956 907 п.н. ^[2]
Группа	Х \| Х F1	Конец	141 164 270 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• пептидазы активность • пептидаза активность цистеина типа • GO: 0001948 связывание белка • гидролазы активности • цистеин типа эндопептидаза
Сотовый компонент	• цитоплазма • цитозоль
Биологический процесс	• аутофагия • транспорт белка • аутофагия ядра • липидирование C-конца белка • делипидация белка • митофагия • сборка аутофагосомы • протеолиз • нацеливание белка на мембрану
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


115201


666468

Ансамбль


ENSG00000101844


ENSMUSG00000079418

UniProt


Q8WYN0


Q8C9S8

RefSeq (мРНК)

NM_052936 NM_178270 NM_178271 NM_001321287 NM_001321288
NM_001321289 NM_001321290


NM_174875

RefSeq (белок)

NP_001308216 NP_001308217 NP_001308218 NP_001308219 NP_443168
NP_840054 NP_840055


NP_777364 NP_001366610 NP_001366611 NP_001366612 NP_001366613

Расположение (UCSC)

Chr X: 108.09 - 108.15 Мб

Chr X: 140.96 - 141.16 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Цистеин протеазы ATG4A представляет собой фермент , который у человека кодируется ATG4A гена . ^[5]^[6]

Аутофагия - это процесс, при котором внутриклеточно разрушаются эндогенные белки и поврежденные органеллы . Постулируется, что аутофагия важна для гомеостаза и ремоделирования клеток во время дифференцировки , метаморфоза , неапоптотической гибели клеток и старения . Снижение уровня аутофагии было описано при некоторых злокачественных опухолях , и была предложена роль аутофагии в контроле нерегулируемого роста клеток, связанного с раком. Этот ген кодирует член аутофагина. семейство белков. Кодируемый белок также обозначается как член семейства цистеиновых протеаз C-54 . Были идентифицированы варианты транскриптов, которые кодируют разные изоформы . ^[6]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000101844 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000079418 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Шерц-Shouval R, Сагив Y, Шорер Н, Элазар Z (апрель 2003 г.). «COOH-конец GATE-16, модулятора транспорта внутри Гольджи, расщепляется цистеиновой протеазой человека HsApg4A» . J Biol Chem . 278 (16): 14053–8. DOI : 10.1074 / jbc.M212108200 . PMID 12473658 .
^ a b "Ген Entrez: ATG4A ATG4 родственный аутофагии 4 гомолог A (S. cerevisiae)" .

Внешние ссылки [ править ]

Расположение генома человека ATG4A и страница сведений о гене ATG4A в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение [ править ]

Scherz-Shouval R, Shvets E, Fass E, et al. (2007). «Реактивные формы кислорода необходимы для аутофагии и специфически регулируют активность Atg4» . EMBO J . 26 (7): 1749–60. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7601623 . PMC 1847657 . PMID 17347651 .
Росс М.Т., Графхэм Д.В., Коффи А.Дж. и др. (2005). «Последовательность ДНК Х-хромосомы человека» . Природа . 434 (7031): 325–37. DOI : 10,1038 / природа03440 . PMC 2665286 . PMID 15772651 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Кабея Ю., Мидзусима Н., Ямамото А. и др. (2005). «LC3, GABARAP и GATE16 локализуются на мембране аутофагосомы в зависимости от образования формы II» . J. Cell Sci . 117 (Pt 13): 2805–12. DOI : 10,1242 / jcs.01131 . PMID 15169837 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID 14702039 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .

Эта статья о гене в Х-хромосоме человека и / или связанном с ним белке является незавершенной . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000101844 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000079418 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid12473658-5] Шерц-Shouval R, Сагив Y, Шорер Н, Элазар Z (апрель 2003 г.). «COOH-конец GATE-16, модулятора транспорта внутри Гольджи, расщепляется цистеиновой протеазой человека HsApg4A» . J Biol Chem . 278 (16): 14053–8. DOI : 10.1074 / jbc.M212108200 . PMID 12473658 .

[entrez-6] "Ген Entrez: ATG4A ATG4 родственный аутофагии 4 гомолог A (S. cerevisiae)" .

[1]