Atrophin-1 представляет собой белок , который у человека кодируется ATN1 гена . [5] Кодируемый белок включает сериновый повтор и область чередования кислотных и основных аминокислот, а также вариабельный глутаминовый повтор. [6] Функция Атрофина-1 еще не определена. [7] Исследования атрофина-1 на животных свидетельствуют о том, что он действует как ко-репрессор транскрипции . [7] Атрофин-1 можно найти в ядерном и цитоплазматическом компартментах нейронов. [7] Он выражен в нервной ткани . [8]
ATN1 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | ATN1 , B37, D12S755E, DRPLA, HRS, NOD, атрофин 1, CHEDDA | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 607462 MGI : 104725 HomoloGene : 1461 GeneCards : ATN1 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 12: 6.92 - 6.94 Мб | Chr 6: 124,74 - 124,76 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
Функция
Функция Атрофина-1 еще не определена. Широко распространено предположение, что Атрофин-1 функционирует как ко-репрессор транскрипции . [9] транскрипционный ко-репрессор представляет собой белок , который косвенным образом подавляет активность специфических генов, взаимодействуя с ДНК-связывающих белков . [9]
Клиническое значение
Ген ATN1 имеет сегмент ДНК, называемый тринуклеотидным повтором CAG. [9] Он состоит из цитозина, аденина и гуанина. [9] Количество повторов CAG в гене ATN1 у здорового человека будет колебаться от шести до тридцати пяти повторов. [9] Количество повторов CAG, превышающее тридцать пять, может вызывать мутацию с усилением функции в ATN1. [10] Исследования подтвердили идею о том, что мутировавший атрофин-1 собирается в нейронах и нарушает функцию клеток. [11] Последовательность гена ATN1 содержит сигнал ядерной локализации (NLS) и сигнал ядерного экспорта (NES). [11] Было показано, что мутация NES в ATN1 может изменить место локализации ATN1 и вызвать агрегацию в ядре. [11] Это может привести к увеличению клеточной токсичности. [11]
Мутации в ATN1 связаны с формой нарушения тринуклеотидных повторов, известной как « дентаторубрально-паллидолуизийская атрофия » или «дентаторубропаллидолуизийская атрофия». Дентаторубрально-паллидолизиальная атрофия (ДРПЛА) - редкое нейродегенеративное заболевание, характеризующееся мозжечковой атаксией , миоклонической эпилепсией , хореоатетозом и деменцией . [5] Заболевание связано с увеличением количества тринуклеотидного повтора в этом гене. [5] У пациентов с DRPLA усеченный ATN1 образует внутриядерные агрегаты, вызывающие гибель клеток. [11] Симптомы этого расстройства можно объяснить значительным сокращением тканей головного и спинного мозга, наблюдаемым у пациентов с DRPLA. [12] Существуют как юношеские, так и поздние взрослые варианты DRPLA, которые показывают разную степень тяжести конкретных симптомов. [12]
Взаимодействия
Было показано, что ATN1 взаимодействует с:
- BAIAP2 , [13]
- МАГИ1 , [14]
- МАГИ2 , [14]
- RERE , [15] и
- WWP2 . [14]
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000111676 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004263 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ а б в «Атрофин 1 ATN1 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 12 марта 2017 .
- ^ «Энтрез Ген: атрофин 1 ATN1» .
- ^ а б в Wood JD, Nucifora FC, Duan K, Zhang C, Wang J, Kim Y, Schilling G, Sacchi N, Liu JM, Ross CA (сентябрь 2000 г.). «Атрофин-1, продукт гена зубочелюстной и паллидо-луизийской атрофии, взаимодействует с ETO / MTG8 в ядерном матриксе и подавляет транскрипцию» . Журнал клеточной биологии . 150 (5): 939–48. DOI : 10,1083 / jcb.150.5.939 . PMC 2175251 . PMID 10973986 .
- ^ Шен Й, Петерсон А.С. (февраль 2009 г.). «Новые роли атрофинов в развитии и нейродегенеративных заболеваниях». Клеточные и молекулярные науки о жизни . 66 (3): 437–46. DOI : 10.1007 / s00018-008-8403-9 . PMID 18953689 . S2CID 11380927 .
- ^ а б в г д «Ген ATN1» . Домашний справочник по генетике . Проверено 21 февраля 2017 .
- ^ Шен Й, Ли Дж, Чхве Й, Золтевич Дж.С., Петерсон А.С. (февраль 2007 г.). «Функциональная архитектура атрофинов» . Журнал биологической химии . 282 (7): 5037–44. DOI : 10.1074 / jbc.M610274200 . PMID 17150957 .
- ^ а б в г д Судзуки Y, Ядзава I (апрель 2011 г.). «Патологическое накопление атрофина-1 при дентаторубралпаллидолуизийской атрофии» . Международный журнал клинической и экспериментальной патологии . 4 (4): 378–84. PMC 3093063 . PMID 21577324 .
- ^ а б «Дентаторубрально-паллидолуйская атрофия, ДРПЛА» . themedicalbiochemistrypage.org . Проверено 21 февраля 2017 .
- ^ Окамура-Охо Й, Мияшита Т., Оми К., Ямада М. (июнь 1999 г.). «Дентаторубрал-паллидолуизийский атрофический белок взаимодействует через богатую пролином область рядом с полиглутамином с SH3-доменом субстрата тирозинкиназы инсулинового рецептора» . Молекулярная генетика человека . 8 (6): 947–57. DOI : 10.1093 / HMG / 8.6.947 . PMID 10332026 .
- ^ а б в Вуд Дж. Д., Юань Дж., Марголис Р. Л., Коломер В., Дуан К., Куши Дж., Камински З., Клейдерлейн Дж. Дж., Шарп А. Х., Росс Калифорния (июнь 1998 г.). «Атрофин-1, продукт гена DRPLA, взаимодействует с двумя семействами белков, содержащих домен WW». Молекулярная и клеточная нейронауки . 11 (3): 149–60. DOI : 10.1006 / mcne.1998.0677 . PMID 9647693 . S2CID 20003277 .
- ^ Янагисава Х., Бандо М., Мияшита Т., Окамура-Охо Й., Тадокоро К., Токунага К., Ямада М. (май 2000 г.). «Связывание с белками семейства DRPLA посредством повторов дипептида аргинин-глутаминовая кислота усиливается удлиненным полиглутамином» . Молекулярная генетика человека . 9 (9): 1433–42. DOI : 10.1093 / HMG / 9.9.1433 . PMID 10814707 .
дальнейшее чтение
- Ван Л., Раджан Х., Питман Дж. Л., МакКаун М., Цай С.К. (март 2006 г.). «Белки атрофина, ассоциированные с гистон-деацетилазой, являются корепрессорами ядерных рецепторов» . Гены и развитие . 20 (5): 525–30. DOI : 10,1101 / gad.1393506 . PMC 1410805 . PMID 16481466 .
- Онодера О, Ояке М., Такано Х., Икеучи Т., Игараси С., Цудзи С. (ноябрь 1995 г.). «Молекулярное клонирование полноразмерной кДНК для dentatorubral-pallidoluysian атрофии и региональных экспрессий расширенных аллелей в ЦНС» . Американский журнал генетики человека . 57 (5): 1050–60. PMC 1801383 . PMID 7485154 .
- Ядзава И., Нукина Н., Хашида Х, Гото Дж., Ямада М., Канадзава И. (май 1995 г.). «Аномальный генный продукт, идентифицированный при наследственной дентаторубрально-паллидолизийской атрофии (DRPLA) головного мозга». Генетика природы . 10 (1): 99–103. DOI : 10.1038 / ng0595-99 . PMID 7647802 . S2CID 5850726 .
- Нагафути С., Янагисава Х., Осаки Э., Сираяма Т., Тадокоро К., Иноуэ Т., Ямада М. (октябрь 1994 г.). «Структура и экспрессия гена, ответственного за нарушение триплетных повторов, дентаторубральную и паллидолизианскую атрофию (DRPLA)». Генетика природы . 8 (2): 177–82. DOI : 10.1038 / ng1094-177 . PMID 7842016 . S2CID 2590882 .
- Берк Дж. Р., Вингфилд М. С., Льюис К. Э., Розес А. Д., Ли Дж. Э., Хьюлетт С., Перикак-Вэнс М. А., Вэнс Дж. М. (август 1994 г.). «Синдром Хау-Ривер: дентаторубропаллидолуизианская атрофия (DRPLA) в афроамериканской семье». Генетика природы . 7 (4): 521–4. DOI : 10.1038 / ng0894-521 . PMID 7951323 . S2CID 40759301 .
- Нагафути С., Янагисава Х, Сато К., Сираяма Т., Осаки Э., Бандо М., Такеда Т., Тадокоро К., Кондо И., Мураяма Н. (январь 1994 г.). «Дентаторубральная и паллидолуизийская атрофия нестабильного тринуклеотида CAG на хромосоме 12p». Генетика природы . 6 (1): 14–8. DOI : 10.1038 / ng0194-14 . PMID 8136826 . S2CID 19708585 .
- Коидэ Р., Икеучи Т., Онодера О, Танака Х., Игараси С., Эндо К., Такахаши Х., Кондо Р., Исикава А., Хаяси Т. (январь 1994 г.). «Нестабильное распространение CAG-повтора при наследственной дентаторубрально-паллидолуйзийской атрофии (DRPLA)». Генетика природы . 6 (1): 9–13. DOI : 10.1038 / ng0194-9 . PMID 8136840 . S2CID 27241147 .
- Ли С.Х., Макиннис М.Г., Марголис Р.Л., Антонаракис С.Е., Росс Калифорния (июнь 1993 г.). «Новый триплетный повтор, содержащий гены в человеческом мозге: клонирование, экспрессия и полиморфизмы длины». Геномика . 16 (3): 572–9. DOI : 10.1006 / geno.1993.1232 . PMID 8325628 .
- Ансари-Лари М.А., Музны Д.М., Лу Дж., Лу Ф., Лилли С.Э., Спанос С., Малли Т., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Богатый генами кластер между генами CD4 и триозофосфат-изомеразы на хромосоме 12p13 человека» . Геномные исследования . 6 (4): 314–26. DOI : 10.1101 / gr.6.4.314 . PMID 8723724 .
- Такано Т., Яманучи Ю., Нагафучи С., Ямада М. (февраль 1996 г.). «Отнесение гена дентаторубральной и паллидолизийской атрофии (DRPLA) к 12p 13.31 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Геномика . 32 (1): 171–2. DOI : 10.1006 / geno.1996.0100 . PMID 8786114 .
- Янагисава Х, Фуджи К., Нагафути С., Накахори Ю., Накагоме И., Аканэ А., Накамура М., Сано А., Комуре О, Кондо И., Джин Д. К., Соренсен С. А., Поттер Н. Т., Молодой СР, Накамура К., Нукина Н., Нагао Я. , Тадокоро К., Окуяма Т., Мияшита Т., Иноуэ Т., Канадзава И., Ямада М. (март 1996 г.). «Уникальный источник и многоэтапный процесс для генерации расширенных триплетных повторов DRPLA» . Молекулярная генетика человека . 5 (3): 373–9. DOI : 10.1093 / HMG / 5.3.373 . PMID 8852663 .
- Марголис Р.Л., Ли С.Х., Янг В.С., Вагстер М.В., Стайн О.К., Кидвай А.С., Эшворт Р.Г., Росс Калифорния (март 1996 г.). «Последовательность гена DRPLA (атрофина-1) и экспрессия мРНК в мозге человека». Исследование мозга. Молекулярное исследование мозга . 36 (2): 219–26. DOI : 10.1016 / 0169-328X (95) 00241-J . PMID 8965642 .
- Ансари-Лари М.А., Шен Й., Музны Д.М., Ли В., Гиббс Р.А. (март 1997 г.). «Крупномасштабное секвенирование хромосомы 12p13 человека: экспериментальное и расчетное определение структуры гена» . Геномные исследования . 7 (3): 268–80. DOI : 10.1101 / gr.7.3.268 . PMID 9074930 .
- Мияшита Т., Окамура-Охо Ю., Мито Ю., Нагафучи С., Ямада М. (ноябрь 1997 г.). «Белок стоматологической паллидолуизийской атрофии (DRPLA) расщепляется каспазой-3 во время апоптоза» . Журнал биологической химии . 272 (46): 29238–42. DOI : 10.1074 / jbc.272.46.29238 . PMID 9361003 .
- Wellington CL, Ellerby LM, Hackam AS, Margolis RL, Trifiro MA, Singaraja R, McCutcheon K, Salvesen GS, Propp SS, Bromm M, Rowland KJ, Zhang T, Rasper D, Roy S, Thornberry N, Pinsky L, Kakizuka A , Росс CA, Николсон Д.В., Бредесен Д.Е., Хайден М.Р. (апрель 1998 г.). «Расщепление каспазой продуктов гена, связанное с нарушениями триплетной экспансии, дает усеченные фрагменты, содержащие полиглутаминовый тракт» . Журнал биологической химии . 273 (15): 9158–67. DOI : 10.1074 / jbc.273.15.9158 . PMID 9535906 .
- Вуд Дж. Д., Юань Дж., Марголис Р. Л., Коломер В., Дуан К., Куши Дж., Камински З., Клейдерлейн Дж. Дж., Шарп А. Х., Росс Калифорния (июнь 1998 г.). «Атрофин-1, продукт гена DRPLA, взаимодействует с двумя семействами белков, содержащих домен WW». Молекулярная и клеточная нейронауки . 11 (3): 149–60. DOI : 10.1006 / mcne.1998.0677 . PMID 9647693 . S2CID 20003277 .
- Хаяси Ю., Какита А., Ямада М., Коидэ Р., Игараси С., Такано Х., Икеучи Т., Вакабаяси К., Эгава С., Цудзи С., Такахаши Х. (декабрь 1998 г.). «Наследственная dentatorubral-pallidoluysian атрофия: обнаружение широко распространенных убиквитинированных нейрональных и глиальных внутриядерных включений в головном мозге». Acta Neuropathologica . 96 (6): 547–52. DOI : 10.1007 / s004010050933 . PMID 9845282 . S2CID 12861680 .
- Takiyama Y, Sakoe K, Amaike M, Soutome M, Ogawa T., Nakano I., Nishizawa M (март 1999 г.). «Анализ одиночных сперматозоидов на CAG-повторы в гене дентаторубрально-паллидолизийской атрофии (DRPLA): нестабильность CAG-повторов в гене DRPLA является заметной среди заболеваний, связанных с повторами CAG» . Молекулярная генетика человека . 8 (3): 453–7. DOI : 10.1093 / HMG / 8.3.453 . PMID 9949204 .
- Окамура-Охо Й, Мияшита Т., Оми К., Ямада М. (июнь 1999 г.). «Дентаторубрал-паллидолуизийский атрофический белок взаимодействует через богатую пролином область рядом с полиглутамином с SH3-доменом субстрата тирозинкиназы инсулинового рецептора» . Молекулярная генетика человека . 8 (6): 947–57. DOI : 10.1093 / HMG / 8.6.947 . PMID 10332026 .
- Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верджовски-Алмейда С., Брионес М.Р., Нагаи М.А., да Силва В., Заго М.А., Бордин С., Коста Ф.Ф., Голдман Г.Х., Карвалью А.Ф., Мацукума А., Байя Г.С., Симпсон Д.Х., Брунштейн А., де Оливейра П.С., Бучер П., Джонженель К.В., О'Хара М.Дж., Соарес Ф., Брентани Р.Р., Рейс Л.Ф., де Соуза С.Дж., Симпсон А.Дж. (март 2000 г.). «Shotgun секвенирование человеческого транскриптома с помощью тегов последовательности, экспрессируемой ORF» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (7): 3491–6. DOI : 10.1073 / pnas.97.7.3491 . PMC 16267 . PMID 10737800 .
- Янагисава Х., Бандо М., Мияшита Т., Окамура-Охо Й., Тадокоро К., Токунага К., Ямада М. (май 2000 г.). «Связывание с белками семейства DRPLA посредством повторов дипептида аргинин-глутаминовая кислота усиливается удлиненным полиглутамином» . Молекулярная генетика человека . 9 (9): 1433–42. DOI : 10.1093 / HMG / 9.9.1433 . PMID 10814707 .
Внешние ссылки
- Запись GeneReviews / NCBI / NIH / UW на DRPLA
- atrophin-1 в Национальной медицинской библиотеке США по предметным заголовкам по медицинским предметам (MeSH)
- Расположение генома человека ATN1 и страница сведений о гене ATN1 в браузере генома UCSC .