Кальций-транспортная АТФаза 1 плазматической мембраны представляет собой плазматическую мембрану Ca2+АТФазы , фермент , который у человека кодируется ATP2B1 геном . [5] [6] Это транспортный белок , транслоказа , кальциевый насос EC 7.2.2.10 .
Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству АТФаз первичного ионного транспорта P-типа, характеризующимся образованием промежуточного соединения аспартилфосфата во время цикла реакции. Эти ферменты удаляют ионы двухвалентного кальция из эукариотических клеток при очень больших градиентах концентрации и играют решающую роль во внутриклеточном гомеостазе кальция . Изоформы кальциевой АТФазы плазматической мембраны млекопитающих кодируются по крайней мере четырьмя отдельными генами, и разнообразие этих ферментов дополнительно увеличивается за счет альтернативного сплайсинга.стенограмм. Экспрессия различных изоформ и вариантов сплайсинга регулируется в зависимости от развития, тканевого и клеточного типа, что позволяет предположить, что эти насосы функционально адаптированы к физиологическим потребностям конкретных клеток и тканей. Этот ген кодирует изоформу 1 кальциевой АТФазы плазматической мембраны. Были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы. [6]
ATP2B1 является критическим фактором хозяина, поддерживающим цитотоксичность, вызываемую укусами Chironex fleckeri (разновидность коробчатой медузы ). Считается, что блокирование ATP2B1 обладает терапевтическим потенциалом для лечения боли и некроза кожи, вызванных этими укусами. [7]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000070961 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019943 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Olson S, Ван М., Carafoli E, Штрелер EE, McBride OW (апрель 1991). «Локализация двух генов, кодирующих Ca2 (+) - транспортирующих АТФаз плазматической мембраны к хромосомам человека 1q25-32 и 12q21-23». Геномика . 9 (4): 629–41. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (91) 90356-J . PMID 1674727 .
^ a b «Ген Entrez: АТФаза ATP2B1, транспорт Ca ++, плазматическая мембрана 1» .
Расположение генома человека ATP2B1 и страница сведений о гене ATP2B1 в браузере генома UCSC .
Дальнейшее чтение [ править ]
Møller JV, Juul B, le Maire M (май 1996 г.). «Структурная организация, ионный транспорт и передача энергии АТФаз P-типа». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Обзоры биомембран . 1286 (1): 1–51. DOI : 10.1016 / 0304-4157 (95) 00017-8 . PMID 8634322 .
Strehler EE, Zacharias DA (январь 2001 г.). «Роль альтернативного сплайсинга в создании разнообразия изоформ среди кальциевых насосов плазматической мембраны». Физиологические обзоры . 81 (1): 21–50. DOI : 10.1152 / Physrev.2001.81.1.21 . PMID 11152753 .
Strehler EE, Treiman M (май 2004 г.). «Кальциевые насосы плазматической мембраны и внутренней части клетки». Современная молекулярная медицина . 4 (3): 323–35. DOI : 10.2174 / 1566524043360735 . PMID 15101689 .
Кесслер Ф., Фальчетто Р., Хайм Р., Мейли Р., Форхерр Т., Стрелер Е. Е., Карафоли Е. (декабрь 1992 г.). «Исследование связывания кальмодулина с альтернативно сплайсированным C-концевым доменом Ca2 + -помпы плазматической мембраны». Биохимия . 31 (47): 11785–92. DOI : 10.1021 / bi00162a016 . PMID 1332771 .
Ван К.К., Райт Л.К., Мачан С.Л., Аллен Б.Г., Кониграв А.Д., Руфогалис Б.Д. (май 1991 г.). «Протеинкиназа С фосфорилирует карбоксильный конец Са (2 +) - АТФазы плазматической мембраны эритроцитов человека». Журнал биологической химии . 266 (14): 9078–85. PMID 1827443 .
Strehler EE, Strehler-Page MA, Vogel G, Carafoli E (сентябрь 1989 г.). «мРНК для изоформ кальциевого насоса плазматической мембраны, различающихся по своему регуляторному домену, генерируются путем альтернативного сплайсинга, который включает два внутренних донорных сайта в одном экзоне» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 86 (18): 6908–12. Полномочный код : 1989PNAS ... 86.6908S . DOI : 10.1073 / pnas.86.18.6908 . PMC 297959 . PMID 2528729 .
Джеймс PH, Пруши М., Форхерр Т.Э., Пеннистон Д.Т., Карафоли Э. (май 1989 г.). «Первичная структура цАМФ-зависимого сайта фосфорилирования кальциевого насоса плазматической мембраны». Биохимия . 28 (10): 4253–8. DOI : 10.1021 / bi00436a020 . PMID 2548572 .
Verma AK, Filoteo AG, Stanford DR, Wieben ED, Penniston JT, Strehler EE, Fischer R, Heim R, Vogel G, Mathews S (октябрь 1988 г.). «Полная первичная структура Са2 + насоса плазматической мембраны человека». Журнал биологической химии . 263 (28): 14152–9. PMID 2844759 .
Ховард А., Легон С., Уолтерс-младший (ноябрь 1993 г.). "Изоформы кальциевых насосов плазматической мембраны кишечника человека и крысы". Американский журнал физиологии . 265 (5, часть 1): G917-25. DOI : 10.1152 / ajpgi.1993.265.5.G917 . PMID 7694502 .
Штауфер Т.П., Хилфикер Х., Карафоли Э., Стрелер Э.Е. (декабрь 1994 г.). «Количественный анализ альтернативных вариантов сплайсинга генов кальциевого насоса плазматической мембраны человека». Журнал биологической химии . 269 (50): 32022. PMID 7989379 .
Штауфер Т.П., Хилфикер Х., Карафоли Э., Стрелер Э.Е. (декабрь 1993 г.). «Количественный анализ альтернативных вариантов сплайсинга генов кальциевого насоса плазматической мембраны человека». Журнал биологической химии . 268 (34): 25993–6003. PMID 8245032 .
Кумар Р., Хауген Дж. Д., Пеннистон Дж. Т. (апрель 1993 г.). «Молекулярное клонирование кальциевого насоса плазматической мембраны из остеобластов человека». Журнал исследований костей и минералов . 8 (4): 505–13. DOI : 10.1002 / jbmr.5650080415 . PMID 8386431 . S2CID 43674131 .
Хилфикер Х., Стрелер-Пейдж М.А., Штауфер Т.П., Карафоли Э., Стрелер Э.Е. (сентябрь 1993 г.). «Структура гена, кодирующего изоформу 1 кальциевого насоса плазматической мембраны человека». Журнал биологической химии . 268 (26): 19717–25. PMID 8396145 .
Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107–13. DOI : 10.1006 / abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Бенквиц С., Кубиш С., Крафт К., Нейсес Л. (январь 1997 г.). «Исследование обмена Met-267 Arg в изоформе 1 кальциевого насоса плазматической мембраны человека у пациентов с эссенциальной гипертензией с помощью метода сайта рестрикции, созданного амплификацией». Журнал молекулярной медицины . 75 (1): 62–6. DOI : 10.1007 / s001090050088 . PMID 9020386 . S2CID 7041799 .
Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. К., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Д. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геномные исследования . 7 (4): 353–8. DOI : 10.1101 / gr.7.4.353 . PMC 139146 . PMID 9110174 .
Эльсхорст Б., Хенниг М., Ферстерлинг Х., Динер А., Маурер М., Шульте П., Швальбе Х., Гризингер С., Кребс Дж., Шмид Х., Форхерр Т., Карафоли Е. (сентябрь 1999 г.). «Структура раствора ЯМР комплекса кальмодулина со связывающим пептидом Са2 + помпы». Биохимия . 38 (38): 12320–32. DOI : 10.1021 / bi9908235 . PMID 10493800 .