Аннексин А7 является белком , который в организме человека кодируется ANXA7 геном . [5] [6]
ANXA7 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | ANXA7 , ANX7, SNX, SYNEXIN, аннексин A7 | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 186360 MGI : 88031 HomoloGene : 36149 GeneCards : ANXA7 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 10: 73,38 - 73,41 Мб | Chr 14: 20.46 - 20.48 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
Аннексин VII является членом семейства аннексинов кальций-зависимых фосфолипид-связывающих белков. Ген аннексина VII содержит 14 экзонов и охватывает приблизительно 34 т.п.н. ДНК. An альтернативного сплайсинга результаты экзонов кассеты в двух транскриптов мРНК 2,0 и 2,4 т.п.н. , которые предсказанных для создания двух белковых изоформ , отличающихся по их N-концевого домена. Альтернативное событие сплайсинга тканеспецифично, и мРНК, содержащая экзон кассеты, преобладает в головном мозге, сердце и скелетных мышцах. Транскрипты также различаются своими 3'-некодирующими областями за счет использования двух альтернативных сигналов поли (А). Выбор сигналов поли (А) не зависит от паттерна сплайсинга мРНК. ~ Аннексин VII кодирует белок с молекулярной массой приблизительно 51 кДа с уникальным высокогидрофобным N-концевым доменом из 167 аминокислот и консервативной С-концевой областью из 299 аминокислот. Последний домен состоит из чередующихся гидрофобных и гидрофильных сегментов. Структурный анализ белка предполагает, что Аннексин VII представляет собой мембранно-связывающий белок с различными свойствами, включая активность чувствительных к напряжению кальциевых каналов, ионную селективность и слияние мембран. [6]
Взаимодействия
Было показано, что ANXA7 взаимодействует с ALG2 [7] и SRI . [8]
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000138279 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021814 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Ширван А., Шривастава М., Ван М.Г., Культраро С., Магендзо К., МакБрайд О.В., Поллард Н.Б., Бернс А.Л. (июль 1994 г.). «Дивергентная структура гена синексина человека (аннексина VII) и отнесение к хромосоме 10». Биохимия . 33 (22): 6888–901. DOI : 10.1021 / bi00188a019 . PMID 7515686 .
- ^ а б «Entrez Gene: ANXA7, аннексин A7» .
- ^ Сато, Хирокадзу; Накано Йошими; Шибата Хидеки; Маки Масатоши (ноябрь 2002 г.). «Пента-EF-домен ALG-2 взаимодействует с аминоконцевыми доменами как аннексина VII, так и аннексина XI Са2 + -зависимым образом». Биохим. Биофиз. Acta . Нидерланды. 1600 (1-2): 61-7. DOI : 10.1016 / S1570-9639 (02) 00445-4 . ISSN 0006-3002 . PMID 12445460 .
- ^ Браунауэлл, AM; Creutz CE (август 1997 г.). «Кальций-зависимое связывание сорцина с N-концевым доменом синексина (аннексина VII)» . J. Biol. Chem . СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 272 (35): 22182–90. DOI : 10.1074 / jbc.272.35.22182 . ISSN 0021-9258 . PMID 9268363 .
Внешние ссылки
- Расположение генома человека ANXA7 и страница сведений о гене ANXA7 в браузере генома UCSC .
дальнейшее чтение
- Creutz CE, Moss S, Edwardson JM и др. (1992). «Дифференциальное распознавание секреторных пузырьков аннексинами. Курс Европейской организации молекулярной биологии« Продвинутые методы изучения секрета » ». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 184 (1): 347–52. DOI : 10.1016 / 0006-291X (92) 91199-Z . PMID 1533123 .
- Magendzo K, Shirvan A, Cultraro C и др. (1991). «Альтернативный сплайсинг мРНК синексина человека в головном мозге, сердечной мышце и скелетных мышцах изменяет уникальный N-концевой домен». J. Biol. Chem . 266 (5): 3228–32. PMID 1825209 .
- Бернс А.Л., Магендзо К., Ширван А. и др. (1989). «Активность кальциевых каналов очищенного синексина человека и структура гена синексина человека» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 86 (10): 3798–802. Bibcode : 1989PNAS ... 86.3798B . DOI : 10.1073 / pnas.86.10.3798 . PMC 287228 . PMID 2542947 .
- Селберт С., Фишер П., Понграц Д. и др. (1995). «Экспрессия и локализация аннексина VII (синексина) в мышечных клетках». J. Cell Sci . 108 (1): 85–95. PMID 7738119 .
- Zhang-Keck ZY, Srivastava M, Kozak CA, et al. (1994). «Геномная организация и хромосомная локализация гена синексина мыши» . Biochem. Дж . 301 (Pt 3): 835–45. DOI : 10.1042 / bj3010835 . PMC 1137063 . PMID 8053909 .
- Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
- Brownawell AM, Creutz CE (1997). «Кальций-зависимое связывание сорцина с N-концевым доменом синексина (аннексина VII)» . J. Biol. Chem . 272 (35): 22182–90. DOI : 10.1074 / jbc.272.35.22182 . PMID 9268363 .
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
- Клемен К.С., Хофманн А., Зампарелли С., Ноегель А.А. (2000). «Экспрессия и локализация изоформ аннексина VII (синексина) в дифференцирующих миобластах». J. Muscle Res. Клетка. Мотил . 20 (7): 669–79. DOI : 10,1023 / A: 1005524623337 . PMID 10672515 . S2CID 20610226 .
- Caohuy H, Pollard HB (2001). «Активация аннексина 7 протеинкиназой C in vitro и in vivo» . J. Biol. Chem . 276 (16): 12813–21. DOI : 10.1074 / jbc.M008482200 . PMID 11278415 .
- Шривастава М., Бубендорф Л., Срикантан В. и др. (2001). «ANX7, кандидатный ген-супрессор рака простаты» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 98 (8): 4575–80. Bibcode : 2001PNAS ... 98.4575S . DOI : 10.1073 / pnas.071055798 . PMC 31876 . PMID 11287641 .
- Клемен С.С., Герр С., Ли А.А. и др. (2001). «Аннексин VII: астроглиальный белок, проявляющий Ca2 + -зависимое субклеточное распределение». NeuroReport . 12 (6): 1139–44. DOI : 10.1097 / 00001756-200105080-00018 . PMID 11338180 . S2CID 28417182 .
- Ю Ф, Финли Р., Раз А, Ким Х. Р. (2002). «Галектин-3 перемещается к перинуклеарным мембранам и ингибирует высвобождение цитохрома с из митохондрий. Роль синексина в транслокации галектина-3» . J. Biol. Chem . 277 (18): 15819–27. DOI : 10.1074 / jbc.M200154200 . PMID 11839755 .
- Caohuy H, Pollard HB (2002). «Протеинкиназа С и гуанозинтрифосфат усиливают кальций-зависимое слияние мембран, управляемое аннексином 7» . J. Biol. Chem . 277 (28): 25217–25. DOI : 10.1074 / jbc.M202452200 . PMID 11994295 .
- Сато Х., Накано Й., Сибата Х., Маки М (2002). «Пента-EF-домен ALG-2 взаимодействует с аминоконцевыми доменами как аннексина VII, так и аннексина XI Са2 + -зависимым образом». Биохим. Биофиз. Acta . 1600 (1-2): 61-7. DOI : 10.1016 / S1570-9639 (02) 00445-4 . PMID 12445460 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M . DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
- Castle J, Garrett-Engele P, Armor CD и др. (2004). «Оптимизация массивов олигонуклеотидов и протоколов амплификации РНК для анализа структуры транскриптов и альтернативного сплайсинга» . Genome Biol . 4 (10): R66. DOI : 10.1186 / GB-2003-4-10-R66 . PMC 328455 . PMID 14519201 .
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта кДНК полной длины NIH: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
- Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети белок-белкового взаимодействия человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .