Эроусмит - это основанная на литературе система открытий , созданная Доном Р. Свенсоном с использованием концепции неоткрытых общедоступных знаний . Он назвал это «Эроусмит»: «Интеллектуальное приключение» [1].
"Представьте себе, что части головоломки разрабатываются и создаются независимо друг от друга, и что при извлечении и сборке они затем обнаруживают образец - незапланированный, непреднамеренный и никогда ранее не замеченный, но образец, вызывающий интерес и побуждающий к интерпретации. , Я утверждаю, что независимо созданные части знания могут содержать невидимые, неизвестные и непреднамеренные закономерности. Таким образом, мир записанных знаний может давать поистине новые открытия ».
- Дон Р. Суонсон, Swanson DR: «Неизвестные общественные знания». Ежеквартальная библиотека , 1986, 56: 103–118. [2]
Вступление
Инструмент имеет режим поиска, который помогает пользователю искать элементы или концепции, которые могут быть общими в двух различных наборах статей. Другой контекст для использования режима поиска - это когда пользователь хочет найти информацию, которая присутствует в одном поле и может иметь отношение к другому полю запроса. Пользователь будет проведен через два поиска PubMed для получения биомедицинских статей из базы данных MEDLINE : первый поиск определяет «литературу A», а второй - «литературу C.» Затем программа генерирует «B-список» слов и фраз, содержащихся в названиях обоих сборников литературы.
B-список отображается ранжированным по релевантности и может быть ограничен определенными семантическими категориями (например, анатомическими областями, расстройствами или лекарствами ). Для каждого интересующего термина B можно просмотреть заголовки, содержащие A и B («заголовки AB»), рядом с заголовками, содержащими B и C («заголовки BC»). Таким образом, можно легко оценить, существует ли биологически значимая общность или взаимосвязь между двумя наборами статей. [3]
История
Свонсон искал базы данных MEDLINE, когда он нашел ветку о болезни Рейно и диетическом рыбьем жире , которая заставила его задуматься, полезен ли рыбий жир для лечения болезни Рейно. Позже эта гипотеза подтвердилась клинически. Затем Суонсон выдвинул гипотезу о связи между мигренью и дефицитом магния , существование которой также было клинически доказано.
Заинтригованные этими открытиями, Суонсон и Нил Смалхейзер из Университета Иллинойса в Чикаго разработали Arrowsmith, программу для выявления связей между двумя статьями в Medline. Названный в честь романа Синклера Льюиса 1925 года , он был направлен на создание систематического и вычислительного метода поиска возможных связей между статьями. [1]
Влияние
Модель Эроусмит доказала влияние, и подход Swanson и Smalheiser разработан был адаптирован для изучения корреляций из генов с заболеваниями и найти новое возможные способы применения лекарственных препаратов . [1]
Связанные проекты
- Авторство: укажите статьи в MEDLINE, написанные конкретным человеком.
- Энн О'Тейт : обобщение, детализация и просмотр результатов запроса PubMed
- WETLAB: электронный лабораторный блокнот с открытым исходным кодом
- ADAM : еще одна база сокращений в MEDLINE [3]
Смотрите также
Рекомендации
- ^ a b c "Дон Р. Свонсон, пионер информатики, 1924–2012 | Новости Чикаго" .
- ^ Smalheiser, Neil R; Торвик, Ветле I; Бишофф-Грет, Аманда; Бурханс, Лорен Б; Габриэль, Михаил; Хомаюни, Рамин; Кашеф, Алиреза; Martone, Maryann E; Перкинс, Гай А; Прайс, Диана Л. Говорите, Эндрю С; Уэст, Рут (1 января 2006 г.). «Совместная разработка двухузлового поискового интерфейса Arrowsmith, предназначенного для лабораторных исследователей» . Журнал биомедицинских открытий и сотрудничества . 1 (1): 8. DOI : 10,1186 / 1747-5333-1-8 . PMC 1559644 . PMID 16817965 .
- ^ а б "ArrowSmith" .