Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
ATXN2
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

3КТР

Идентификаторы
ПсевдонимыATXN2 , ASL13 , ATX2, SCA2, TNRC13, атаксин 2
Внешние идентификаторыOMIM : 601517 MGI : 1277223 HomoloGene : 2234 GeneCards : ATXN2
Расположение гена ( человек )
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человека) [1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение ATXN2
Геномное расположение ATXN2
Группа12q24.12Начинать111 443 485 п.н. [1]
Конец111 599 676 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 5 (мышь)
Chr.Хромосома 5 (мышь) [2]
Хромосома 5 (мышь)
Геномное расположение ATXN2
Геномное расположение ATXN2
Группа5 | 5 FНачинать121 711 337 п.н. [2]
Конец121 816 493 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE ATXN2 202622 s на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• рецептора эпидермального фактора роста связывания
• белка С-конец связывания
• GO: связывание белка 0001948
• связывание РНК
Сотовый компонент• цитоплазма
• перинуклеарная область цитоплазмы
• полисом
• сеть транс-Гольджи
• аппарат Гольджи
• стрессовая гранула
• мембрана
• цитозоль
• рибонуклеопротеин
Биологический процесс• регуляция сборки тела цитоплазматической мРНК
• сборка стрессовых гранул
• процесс метаболизма РНК
• регуляция трансляции
• сборка тела цитоплазматической мРНК
• транспорт РНК
• негативная регуляция интернализации рецептора
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

6311

20239

Ансамбль

ENSG00000204842

ENSMUSG00000042605

UniProt

Q99700

O70305

RefSeq (мРНК)

NM_001310121
NM_001310123
NM_002973
NM_001372574

NM_009125
NM_001359153

RefSeq (белок)

NP_001297050
NP_001297052
NP_002964
NP_001359503

NP_033151
NP_001346082

Расположение (UCSC)Chr 12: 111.44 - 111.6 МбChr 5: 121,71 - 121,82 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Атаксина-2 представляет собой белок , который у человека кодируется ATXN2 гена . [5] [6] Мутации в ATXN2 вызывают спиноцеребеллярную атаксию 2 типа (SCA2).

Структура белка [ править ]

Атаксин-2 содержит следующие белковые домены: [7]

  • Два домена LSm , которые, вероятно, позволяют ему связывать РНК
  • Мотив PAM2, предположительно связанный с поли (A) -связывающим белком
  • Полиглутаминовый путь у некоторых видов (расположено вблизи аминоокончанию у приматов , так и между доменами LSM у насекомых) [8]

Описан потенциальный вариант транскрипта, у которого отсутствует внутренний кодирующий экзон; однако его полнометражный характер неизвестен. [9]

Виды, ткани и субклеточное распределение [ править ]

ATXN2 сохраняется у эукариот . У большинства позвоночных есть два ортолога гена (называемые ATXN2 и ATXN2L у людей), за исключением птиц, у которых есть только один. Виды растений имеют от двух до шести ортологов ATXN2 . [8]

ATXN2 повсеместно экспрессируется в разных тканях. Внутри отдельных клеток он локализуется в аппарате Гольджи и стрессовых гранулах . [10]

Функция [ править ]

Атаксин-2 участвует в регуляции трансляции мРНК посредством взаимодействия с поли (A)-связывающим белком. Он также участвует в образовании стрессовых гранул и Р-телец , которые также играют роль в регуляции РНК. [10]

Клиническое значение [ править ]

Спиноцеребеллярная атаксия 2 типа (SCA2) [ править ]

Полиглутаминовый тракт атаксина-2 человека нестабилен и может расширяться по мере передачи из поколения в поколение. Нормальные аллели обычно имеют 22 или 23 повтора, но могут содержать до 31 повтора. Более длительные экспансии могут вызвать спиноцеребеллярную атаксию 2 типа (SCA2), фатальное прогрессирующее генетическое заболевание, при котором нейроны дегенерируют в мозжечке , нижней оливе , мосту и других областях. Симптомы SCA2 включают атаксию (потерю скоординированных движений), паркинсонизм и в некоторых случаях деменцию. [11]Аллель болезни обычно содержит 34-52 повтора CAG, но может содержать всего 32 или более 100 и может увеличиваться в размере при передаче последующим поколениям. Каким образом расширение полиглутамина в атаксине-2 приводит к этим симптомам, неизвестно.

Боковой амиотрофический склероз (БАС) [ править ]

В 2010 году работа с Аароном Gitler и Нэнси Bonini в Университете Пенсильвании обнаружили , что промежуточный размер CAG повторов разложения в значительной степени связано с риском развития бокового амиотрофического склероза (болезнь Шарко). [12]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000204842 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042605 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Gispert S, Twells R, G Ороско, Брис А, Вебер Дж, Heredero л, Scheufler К, Райли В, Allotey R, Nothers С (июль 1993). «Хромосомное отнесение второго локуса аутосомно-доминантной мозжечковой атаксии (SCA2) к хромосоме 12q23-24.1». Генетика природы . 4 (3): 295–9. DOI : 10.1038 / ng0793-295 . PMID 8358438 . S2CID 7387082 .  
  6. ^ Марголис RL, Abraham MR, Гетчелла SB, Li SH, Kidwai AS, Breschel TS, Стин OC, Каллахан C, McInnis MG, Ross CA (июль 1997). «кДНК с длинными тринуклеотидными повторами CAG из человеческого мозга». Генетика человека . 100 (1): 114–22. DOI : 10.1007 / s004390050476 . PMID 9225980 . S2CID 25999127 .  
  7. ^ Albrecht M, Golatta M, Wüllner U, Lengauer T (август 2004). «Структурно-функциональный анализ атаксина-2 и атаксина-3». Европейский журнал биохимии . 271 (15): 3155–70. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.2004.04245.x . PMID 15265035 . 
  8. ^ a b Хименес-Лопес Д., Гусман П. (июль 2014 г.). «Понимание эволюции и доменной структуры белков атаксина-2 у эукариот» . BMC Research Notes . 7 : 453. DOI : 10,1186 / 1756-0500-7-453 . PMC 4105795 . PMID 25027299 .  
  9. ^ «Энтрез Ген: ATXN2 атаксин 2» .
  10. ^ a b Orr HT (апрель 2012 г.). «Клеточная биология спиноцеребеллярной атаксии» . Журнал клеточной биологии . 197 (2): 167–77. DOI : 10,1083 / jcb.201105092 . PMC 3328388 . PMID 22508507 .  
  11. ^ Ссылка, Genetics Home. «SCA2» . Домашний справочник по генетике . Проверено 11 января 2018 .
  12. ^ Элден А.С., Ким Х.Дж., Харт М.П., ​​Чен-Плоткин А.С., Джонсон Б.С., Фанг X, Армакола М, Гесер Ф, Грин Р., Лу ММ, Падманабхан А, Клей-Фальконе Д., МакКласки Л., Элман Л., Джур Д., Грубер П.Дж., Руб У., Обургер Г., Трояновски Дж. К., Ли В.М., Ван Дирлин В.М., Бонини Н.М., Гитлер А.Д. (август 2010 г.). «Полиглутаминовые экспансии атаксина-2 средней длины связаны с повышенным риском БАС» . Природа . 466 (7310): 1069–75. DOI : 10,1038 / природа09320 . PMC 2965417 . PMID 20740007 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Стеванин Г., Дюрр А., Брайс А. (январь 2000 г.). «Клинические и молекулярные достижения в аутосомно-доминантной мозжечковой атаксии: от генотипа к фенотипу и физиопатологии» . Европейский журнал генетики человека . 8 (1): 4–18. DOI : 10.1038 / sj.ejhg.5200403 . PMID  10713882 .
  • Pulst SM, Nechiporuk A, Nechiporuk T, Gispert S, Chen XN, Lopes-Cendes I, Pearlman S, Starkman S, Orozco-Diaz G, Lunkes A, DeJong P, Rouleau GA, Auburger G, Korenberg JR, Figueroa C, Sahba S (ноябрь 1996 г.). «Умеренная экспансия обычно двуаллельного тринуклеотидного повтора при спиноцеребеллярной атаксии 2 типа». Генетика природы . 14 (3): 269–76. DOI : 10.1038 / ng1196-269 . PMID  8896555 . S2CID  12365475 .
  • Санпей К., Такано Х., Игараси С., Сато Т, Ояке М, Сасаки Х, Вакисака А, Таширо К., Исида Й, Икеучи Т, Коиде Р, Сайто М, Сато А, Танака Т, Ханю С., Такияма Й, Нисидзава М. , Симидзу Н., Номура И., Сегава М., Ивабучи К., Эгути И., Танака Х., Такахаши Х., Цудзи С. (ноябрь 1996 г.). «Идентификация гена спиноцеребеллярной атаксии типа 2 с использованием прямой идентификации повторной экспансии и техники клонирования, DIRECT». Генетика природы . 14 (3): 277–84. DOI : 10.1038 / ng1196-277 . PMID  8896556 . S2CID  24971010 .
  • Имберт Дж., Сауду Ф., Иверт Дж., Девис Д., Тротье Й., Гарнье Дж. М., Вебер С., Мандель Дж. Л., Кансанс Дж., Аббас Н., Дюрр А., Дидьерджан О, Стеванин Дж., Агид Й, Брайс А. (ноябрь 1996 г.). «Клонирование гена спиноцеребеллярной атаксии 2 обнаруживает локус с высокой чувствительностью к увеличенным CAG / глютаминовым повторам». Генетика природы . 14 (3): 285–91. DOI : 10.1038 / ng1196-285 . PMID  8896557 . S2CID  9304975 .
  • Сахба С., Нечипорук А., Фигероа К.П., Нечипорук Т., Пульст С.М. (февраль 1998 г.). «Геномная структура человеческого гена спиноцеребеллярной атаксии типа 2 (SCA2) на хромосоме 12q24.1». Геномика . 47 (3): 359–64. DOI : 10.1006 / geno.1997.5131 . PMID  9480749 .
  • Huynh DP, Del Bigio MR, Ho DH, Pulst SM (февраль 1999 г.). «Экспрессия атаксина-2 в головном мозге здоровых людей и пациентов с болезнью Альцгеймера и спиноцеребеллярной атаксией 2». Анналы неврологии . 45 (2): 232–41. DOI : 10.1002 / 1531-8249 (199902) 45: 2 <232 :: АИД-ANA14> 3.0.CO; 2-7 . PMID  9989626 .
  • Хьюнь Д.П., Фигероа К., Хоанг Н., Пульст С.М. (сентябрь 2000 г.). «Ядерная локализация или образование телец включения атаксина-2 не являются необходимыми для патогенеза SCA2 у мышей или людей». Генетика природы . 26 (1): 44–50. DOI : 10.1038 / 79162 . PMID  10973246 . S2CID  14489237 .
  • Аффаитати А., де Кристофаро Т., Фелисиелло А., Варроне С. (апрель 2001 г.). «Идентификация альтернативного сплайсинга гена спиноцеребеллярной атаксии 2 типа». Джин . 267 (1): 89–93. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (01) 00402-4 . PMID  11311558 .
  • Киль Т.Р., Шибата Х., Во Т, Хьюнь Д.П., Пульст С.М. (август 2001 г.). «Идентификация и экспрессия мышиного ортолога A2BP1». Геном млекопитающих . 12 (8): 595–601. DOI : 10.1007 / s00335-001-2056-4 . PMID  11471052 . S2CID  7340712 .
  • Чоудри С., Мукерджи М., Шривастава А.К., Джайн С., Брахмачари С.К. (октябрь 2001 г.). «Нестабильность повторов CAG в локусе SCA2: закрепление прерываний CAA и связанных однонуклеотидных полиморфизмов» . Молекулярная генетика человека . 10 (21): 2437–46. DOI : 10.1093 / HMG / 10.21.2437 . PMID  11689490 .
  • Панг Дж. Т., Джунти П., Чемберлен С., Ан С.Ф., Виталиани Р., Скаравилли Т., Мартиниан Л., Вуд Н. В., Скаравилли Ф., Ансорге О. (март 2002 г.). «Нейрональные внутриядерные включения в SCA2: генетическое, морфологическое и иммуногистохимическое исследование двух случаев» . Мозг . 125 (Pt 3): 656–63. DOI : 10,1093 / мозг / awf060 . PMID  11872620 .
  • Саттерфилд Т.Ф., Джексон С.М., Палланк Л.Дж. (декабрь 2002 г.). «Гомолог гена полиглутаминовой болезни SCA2 у дрозофилы представляет собой чувствительный к дозировке регулятор образования актиновых филаментов» . Генетика . 162 (4): 1687–702. PMC  1462369 . PMID  12524342 .
  • Wiedemeyer R, Westermann F, Wittke I, Nowock J, Schwab M (январь 2003 г.). «Атаксин-2 способствует апоптозу клеток нейробластомы человека» . Онкоген . 22 (3): 401–11. DOI : 10.1038 / sj.onc.1206150 . PMID  12545161 .
  • Паями Х., Натт Дж., Ганчер С., Берд Т., МакНил М.Г., Зельцер В.К., Хасси Дж., Локхарт П., Гвинн-Харди К., Синглтон А.А., Синглтон А.Б., Харди Дж., Фаррер М. (апрель 2003 г.). «SCA2 может проявляться как леводопа-зависимый паркинсонизм». Расстройства движения . 18 (4): 425–9. DOI : 10.1002 / mds.10375 . PMID  12671950 . S2CID  35401117 .
  • Светел М., Джармати А., Драгасевич Н., Савич Д., Кулькович Б., Ромац С., Костич В.С. (сентябрь 2003 г.). «Мутации SCA2 и SCA3 при паркинсонизме, вызванном допа-реакцией в молодом возрасте». Европейский журнал неврологии . 10 (5): 597. DOI : 10,1046 / j.1468-1331.2003.00671.x . PMID  12940846 . S2CID  30076827 .
  • Бреннейс К., Беш С.М., Шокке М., Веннинг Г.К., Поу В. (октябрь 2003 г.). «Паттерн атрофии в SCA2 определяется морфометрией на основе вокселей». NeuroReport . 14 (14): 1799–802. DOI : 10.1097 / 00001756-200310060-00008 . PMID  14534423 . S2CID  26149005 .

Внешние ссылки [ править ]

  • GeneReviews / NIH / NCBI / UW запись о спиноцеребеллярной атаксии 2 типа
  • Расположение генома человека ATXN2 и страница сведений о гене ATXN2 в браузере генома UCSC .