• эксцизионная репарация нуклеотидов • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • деубиквитинирование, связанное с K48, • позитивная регуляция пути ERAD • транскрипция, ДНК-шаблон • развитие нервной системы • протеолиз • деубиквитинирование, связанное с K63 • организация цитоскелета промежуточных филаментов • белок локализация в цитозольном протеасомном комплексе, участвующем в пути ERAD • организация цитоскелета микротрубочек • организация актинового цитоскелета • химическая синаптическая передача • Белок deubiquitination • убиквитин-зависимого белок процесс катаболического • контроля качества белка для неправильно свернутых или не полностью синтезируемых белков • регуляций клеточного субстрата адгезии • клеточного ответа на тепло • monoubiquitinated белка deubiquitination • протеасомы-опосредованные убиквитин-зависимого процесс белка катаболического • клеточного ответ на неправильно свернутый белок • исследовательское поведение • деацетилирование гистона H3
Атаксина-3 представляет собой белок , который у человека кодируется ATXN3 гена . [5] [6]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Клиническое значение
2 взаимодействия
3 Модельные организмы
4 ссылки
5 Дальнейшее чтение
6 Внешние ссылки
Клиническое значение [ править ]
Болезнь Мачадо-Джозефа , также известная как спиноцеребеллярная атаксия-3, является аутосомно-доминантным неврологическим заболеванием. Белок, кодируемый геном ATXN3, содержит (CAG) n повторы в кодирующей области, и увеличение этих повторов с нормальных 13-36 до 68-79 является причиной болезни Мачадо-Джозефа . Существует обратная корреляция между возрастом начала и количеством повторов CAG. Для этого гена описаны альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы. [6]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что атаксин 3 взаимодействует с:
RAD23A , [7]
RAD23B , [7] и
VCP . [8] [9]
Модельные организмы [ править ]
Модельные организмы использовались при изучении функции ATXN3. Линия условно нокаутных мышей под названием Atxn3 tm1a (KOMP) Wtsi была создана в Wellcome Trust Sanger Institute . [10] Самцы и самки животных прошли стандартизированный фенотипический скрининг [11] для определения эффектов делеции. [12] [13] [14] [15] Проведены дополнительные исследования: - Углубленное иммунологическое фенотипирование [16] - Углубленное фенотипирование костей и хрящей [17]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000066427 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021189 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Takiyama Y, Нишизав М, Танака Н, Кавасим S, Сакамото Н, Карубе Y, Шимазаки Н, Soutome М, Эндо К, S Охты (июль 1993). «Ген болезни Мачадо-Джозефа отображается на хромосоме 14q человека». Генетика природы . 4 (3): 300–4. DOI : 10.1038 / ng0793-300 . PMID 8358439 . S2CID 27424416 .
^ a b «Ген энтреса: атаксин 3 ATXN3» .
^ a b Wang G, Sawai N, Kotliarova S, Kanazawa I, Nukina N (июль 2000 г.). «Атаксин-3, продукт гена MJD1, взаимодействует с двумя человеческими гомологами белка репарации дрожжевой ДНК RAD23, HHR23A и HHR23B» . Молекулярная генетика человека . 9 (12): 1795–803. DOI : 10,1093 / hmg / 9.12.1795 . PMID 10915768 .
^ Doss-Pepe EW, Stenroos ES, Johnson WG, Мадура K (сентябрь 2003). «Взаимодействие атаксина-3 с rad23 и валозин-содержащим белком и его ассоциации с убиквитиновыми цепями и протеасомой согласуются с ролью в убиквитин-опосредованном протеолизе» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (18): 6469–83. DOI : 10.1128 / MCB.23.18.6469-6483.2003 . PMC 193705 . PMID 12944474 .
↑ Wang Q, Li L, Ye Y (март 2008 г.). «Ингибирование p97-зависимой деградации белка Eeyarestatin I» . Журнал биологической химии . 283 (12): 7445–54. DOI : 10.1074 / jbc.M708347200 . PMC 2276333 . PMID 18199748 .
^ Gerdin AK (2010). «Программа генетики мышей Сэнгера: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica . 88 : 925–7. DOI : 10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x . S2CID 85911512 .
^ a b «Международный консорциум по фенотипированию мышей» .
^ Skarnes туалет, Розен В, Уэст А.П., Koutsourakis М, Бушелл Вт, Ийер В, Мухика А.О., Томас М, борона Дж, Кокс Т, Джексон D, Северин Дж, Биггс Р, фу Дж, Нефедов М, де - Jong PJ, Стюарт А.Ф., Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс с условным нокаутом для полногеномного исследования функции генов мыши» . Природа . 474 (7351): 337–42. DOI : 10,1038 / природа10163 . PMC 3572410 . PMID 21677750 .
^ Долгин E (июнь 2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут" . Природа . 474 (7351): 262–3. DOI : 10.1038 / 474262a . PMID 21677718 .
^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (январь 2007). «Мышь по всем причинам». Cell . 128 (1): 9–13. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.12.018 . PMID 17218247 . S2CID 18872015 .
^ Белый Ю.К., Gerdin А.К., Карп Н.А., Райдера Е, Булян М, Bussell Ю.Н., Salisbury Дж, Clare S, Ингам штат Нью - Джерси, Podrini С, Houghton R, Estabel J, Боттомли JR, Мелвин Д.Г., Сунтер D, Адамс Северная Каролина, Зангер Институт генетики мышей Project, Таннахилл Д., Логан Д.В., Макартур Д.Г., Флинт Дж., Махаджан В.Б., Цанг С.Х., Смит I, Ватт FM, Скарнес В.К., Дуган Г., Адамс DJ, Рамирес-Солис Р., Брэдли А., Сталь КП (2013 г. ). «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов» . Cell . 154 (2): 452–64. DOI : 10.1016 / j.cell.2013.06.022 . PMC 3717207 . PMID 23870131 .
^ a b «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)» .
^ a b «Консорциум OBCD» .
Дальнейшее чтение [ править ]
Гото Дж., Ватанабэ М., Итикава Й., Йи С.Б., Ихара Н., Эндо К., Игараси С., Такияма Й., Гаспар С., Масиэль П., Цудзи С., Руло Г.А., Канадзава И. (август 1997 г.). «Продукты гена болезни Мачадо-Джозефа, несущие различные карбоксильные окончания». Неврологические исследования . 28 (4): 373–7. DOI : 10.1016 / S0168-0102 (97) 00056-4 . PMID 9274833 . S2CID 27241785 .
Schöls L, Vieira-Saecker AM, Schöls S, Przuntek H, Epplen JT, Riess O (июнь 1995 г.). «Экспансия тринуклеотидов в гене MJD1 клинически проявляется как спиноцеребеллярная атаксия и чаще всего встречается у немецких пациентов с SCA». Молекулярная генетика человека . 4 (6): 1001–5. DOI : 10.1093 / HMG / 4.6.1001 . PMID 7655453 .
Стеванин Дж., Кансел Дж., Дюрр А., Чнейвайс Х., Дубург О., Вайссенбах Дж., Канн Х. М., Аджид Й., Брайс А. (январь 1995 г.). «Ген спинномозговой атаксии 3 (SCA3) расположен в области примерно 3 сМ на хромосоме 14q24.3-q32.2» . Американский журнал генетики человека . 56 (1): 193–201. PMC 1801316 . PMID 7825578 .
Кавагути Ю., Окамото Т., Таниваки М., Аидзава М., Иноуэ М., Катаяма С., Каваками Х., Накамура С., Нисимура М., Акигучи И. (ноябрь 1994 г.). «Расширения CAG в новом гене болезни Мачадо-Джозефа на хромосоме 14q32.1». Генетика природы . 8 (3): 221–8. DOI : 10.1038 / ng1194-221 . PMID 7874163 . S2CID 29188685 .
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Икеда Х., Ямагути М., Сугай С., Азе Й., Нарумия С., Какидзука А. (июнь 1996 г.). «Расширенный полиглутамин в белке болезни Мачадо-Джозефа вызывает гибель клеток in vitro и in vivo». Генетика природы . 13 (2): 196–202. DOI : 10,1038 / NG0696-196 . PMID 8640226 . S2CID 21966287 .
Paulson HL, Das SS, Crino PB, Perez MK, Patel SC, Gotsdiner D, Fischbeck KH, Pittman RN (апрель 1997 г.). «Продукт гена болезни Мачадо-Джозефа представляет собой цитоплазматический белок, широко экспрессирующийся в головном мозге». Анналы неврологии . 41 (4): 453–62. DOI : 10.1002 / ana.410410408 . PMID 9124802 . S2CID 43460483 .
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Wellington CL, Ellerby LM, Hackam AS, Margolis RL, Trifiro MA, Singaraja R, McCutcheon K, Salvesen GS, Propp SS, Bromm M, Rowland KJ, Zhang T, Rasper D, Roy S, Thornberry N, Pinsky L, Kakizuka A , Росс Калифорния, Николсон Д.В., Бредесен Д.Е., Хайден М.Р. (апрель 1998 г.). «Расщепление каспазой продуктов генов, связанных с нарушениями триплетной экспансии, дает усеченные фрагменты, содержащие полиглутаминовый тракт» . Журнал биологической химии . 273 (15): 9158–67. DOI : 10.1074 / jbc.273.15.9158 . PMID 9535906 .
Tait D, Riccio M, Sittler A, Scherzinger E, Santi S, Ognibene A, Maraldi NM, Lehrach H, Wanker EE (июнь 1998 г.). «Атаксин-3 транспортируется в ядро и связывается с ядерным матриксом» . Молекулярная генетика человека . 7 (6): 991–7. DOI : 10.1093 / HMG / 7.6.991 . PMID 9580663 .
Ван Г., Савай Н., Котлярова С., Канадзава И., Нукина Н. (июль 2000 г.). «Атаксин-3, продукт гена MJD1, взаимодействует с двумя человеческими гомологами белка репарации дрожжевой ДНК RAD23, HHR23A и HHR23B» . Молекулярная генетика человека . 9 (12): 1795–803. DOI : 10,1093 / hmg / 9.12.1795 . PMID 10915768 .
Итикава Ю., Гото Дж., Хаттори М., Тойода А., Исии К., Чон С.Ю., Хашида Н., Масуда Н., Огата К., Касаи Ф., Хираи М., Масиэль П., Руло Г.А., Сакаки Ю., Канадзава И. (2001). «Геномная структура и экспрессия MJD, гена болезни Мачадо-Джозефа» . Журнал генетики человека . 46 (7): 413–22. DOI : 10.1007 / s100380170060 . PMID 11450850 .
Чай Й., Шао Дж., Миллер В.М., Уильямс А., Полсон Х.Л. (июль 2002 г.). «Визуализация живых клеток выявляет дивергентную внутриклеточную динамику белков полиглутаминовой болезни и поддерживает модель патогенеза секвестрации» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (14): 9310–5. Bibcode : 2002PNAS ... 99.9310C . DOI : 10.1073 / pnas.152101299 . PMC 123137 . PMID 12084819 .
Ёсида Х., Ёсизава Т., Шибасаки Ф., Сёдзи С., Канадзава И. (июль 2002 г.). «Химические шапероны уменьшают образование агрегатов и гибель клеток, вызванные усеченным продуктом гена болезни Мачадо-Джозефа с расширенным полиглутаминовым участком». Нейробиология болезней . 10 (2): 88–99. DOI : 10.1006 / nbdi.2002.0502 . PMID 12127147 . S2CID 25183307 .
Ли Ф, Макфарлан Т., Питтман Р.Н., Чакраварти Д. (ноябрь 2002 г.). «Атаксин-3 - это гистон-связывающий белок с двумя независимыми транскрипционными корепрессорами» . Журнал биологической химии . 277 (47): 45004–12. DOI : 10.1074 / jbc.M205259200 . PMID 12297501 .
Альбрехт М., Хоффманн Д., Эверт Б.О., Шмитт И., Вюлльнер Ю., Ленгауэр Т. (февраль 2003 г.). «Структурное моделирование атаксина-3 показывает отдаленную гомологию адаптинам». Белки . 50 (2): 355–70. DOI : 10.1002 / prot.10280 . PMID 12486728 .
Маршал С., Шехи Е., Харрикейн М.К., Фузи П., Хейтц Ф., Тортора П., Ланге Р. (август 2003 г.). «Структурная нестабильность и фибриллярная агрегация нерасширенного человеческого атаксина-3, выявленная под высоким давлением и температурой» . Журнал биологической химии . 278 (34): 31554–63. DOI : 10.1074 / jbc.M304205200 . PMID 12766160 .
Внешние ссылки [ править ]
GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о спиноцеребеллярной атаксии 3 типа
Расположение генома человека ATXN3 и страница сведений о гене ATXN3 в браузере генома UCSC .
vтеPDB галерея
1yzb : структура раствора джозефина домена атаксина-3
2aga : Деубиквитинирующая функция атаксина-3: выводы из структуры раствора домена Джозефина
