A transcription factor expressed in the medulla (inner part) of the thymus. It is part of the mechanism which eliminates self-reactive T cells that would cause autoimmune disease.
"AIRE" перенаправляется сюда. Для использования в других целях, см Aire .
Аутоиммунного регулятора ( AIRE ) представляет собой белок , который у человека кодируется AIRE гена . [5] Это ген размером 13kb на хромосоме 21q22.3, содержащий 545 аминокислот. [6] AIRE - фактор транскрипции, экспрессируемый в мозговом веществе (внутренней части) тимуса . Это часть механизма, который устраняет самореактивные Т-клетки, которые могут вызвать аутоиммунное заболевание. Он подвергает Т-клетки воздействию нормальных, здоровых белков из всех частей тела, а Т-клетки, которые реагируют на эти белки, разрушаются.
Каждая Т-клетка распознает определенный антиген, когда он представлен в комплексе с молекулой главного комплекса гистосовместимости (MHC) антигенпрезентирующей клеткой . Это распознавание осуществляется рецепторами Т-клеток, экспрессируемыми на поверхности клетки. Рецепторы Т-клеток генерируются случайным образом перетасованными сегментами генов, что приводит к очень разнообразной популяции Т-клеток, каждая из которых имеет уникальную антигенную специфичность. Впоследствии необходимо удалить Т-клетки с рецепторами, которые распознают собственные белки организма, еще находясь в тимусе. Под действием AIRE медуллярные эпителиальные клетки тимуса(mTEC) экспрессируют основные белки из других частей тела (так называемые «тканеограниченные антигены» - TRA), а Т-клетки, которые отвечают на эти белки, удаляются посредством гибели клеток ( апоптоза ). Таким образом, AIRE управляет негативным отбором самоопознавающихся Т-клеток. [7] При дефекте AIRE Т-клетки, распознающие антигены, обычно вырабатываемые организмом, могут покинуть тимус и войти в кровоток. Это может привести к множеству аутоиммунных заболеваний .
Впервые о гене сообщили две независимые исследовательские группы Aaltonen et al. и Nagamine et al. в 1997 году, которым удалось выделить и клонировать ген из хромосомы 21q22.3 человека. Их работа смогла показать, что мутации в гене AIRE ответственны за патогенез аутоиммунного полигландулярного синдрома типа I. [5] [8] Более глубокое понимание белка Aire было позже предоставлено Heino et al. в 2000 г. Они показали, что белок Aire в основном экспрессируется в эпителиальных клетках мозгового вещества тимуса с использованием иммуногистохимии. [9]
Содержание
1 Функция
2 Структура
3 Механизм
4 Патология
5 взаимодействий
6 См. Также
7 ссылки
8 Дальнейшее чтение
9 Внешние ссылки
Функция [ править ]
В тимусе AIRE вызывает транскрипцию широкого набора органоспецифических генов, которые создают белки , которые обычно экспрессируются только в периферических тканях, создавая «иммунологическую самотень» в тимусе. [10] [11] Важно, чтобы аутореактивные Т-клетки, которые прочно связываются с аутоантигеном, удалялись в тимусе (посредством процесса отрицательной селекции ), иначе они могут позже встретиться и связываться со своими соответствующими аутоантигенами и инициировать аутоиммунную реакцию. Таким образом, экспрессия нелокальных белков AIRE в тимусе снижает угрозу аутоиммунитета , способствуя устранению аутореактивныхТ-клетки , связывающие антигены, которые обычно не обнаруживаются в тимусе. Кроме того, было обнаружено, что AIRE экспрессируется в популяции стромальных клеток, локализованных во вторичных лимфоидных тканях, однако эти клетки, по-видимому, экспрессируют отдельный набор TRA по сравнению с mTEC. [12]
Исследования на мышах с нокаутом показали, что AIRE функционирует, инициируя транскрипцию разнообразного набора аутоантигенов, таких как инсулин , в тимусе . [10] Эта экспрессия затем позволяет созревающим тимоцитам стать толерантными к периферическим органам, тем самым подавляя аутоиммунные заболевания. [11]
Ген AIRE также экспрессируется во многих других тканях. [13] Ген AIRE также экспрессируется в подмножестве 33D1 + дендритных клеток мышей и дендритных клеток человека. [14]
Структура [ править ]
AIRE состоит из многодоменной структуры, которая способна связываться с хроматином и действовать как регулятор транскрипции генов. Специфический состав AIRE включает домен активации и рекрутирования каспаз (CARD), сигнал ядерной локализации (NLS), домен SAND и два пальца гомеодомена растений (PHD). [15] Домен SAND расположен в середине аминокислотной цепи (а.о. 180–280) и опосредует связывание AIRE с фосфатными группами ДНК. [16] Другая потенциальная роль этого домена заключается в закреплении AIRE на гетерологичных белках. [17] Два богатых цистеином пальцевых домена PHD на С-конце AIRE - это PHD1 (аминокислотные остатки 299-340) и PHD2 (аминокислотные остатки 434-475), которые разделены богатой пролином областью аминокислот. [18]Эти домены пальца служат для считывания меток хроматина через степень метилирования в хвосте гистона H3. Более конкретно, PHD1 способен распознавать неметилирование в хвосте H3 как эпигенетическую метку. [19]
Неотъемлемой характеристикой AIRE является его способность гомомеризоваться в димеры и тримеры, что позволяет ему связываться со специфическими олигонуклеотидными мотивами. [20] Это свойство проистекает из области гомогенного окрашивания (HSR), расположенной на N-конце. Из-за α-спиральной структуры пучка с четырьмя спиралями HSR чувствительны к конформационным изменениям гена. [21] Варианты и делеции с участием этого домена вызывают неспособность активировать транскрипцию гена, предотвращая образование олигомеров, и могут привести к APS-1.
Механизм [ править ]
Вместо связывания с консенсусными последовательностями промоторов генов-мишеней, таких как обычные факторы транскрипции, Aire участвует в координированных последовательностях, которые выполняются его мультимолекулярными комплексами. Первым партнером AIRE, который был идентифицирован, является CREB-связывающий белок (CBP), который локализован в ядерных телах и является соактиватором многих факторов транскрипции. [21] Другие партнеры AIRE включают положительный фактор элонгации транскрипции b (P-TEFb) и ДНК-активированную протеинкиназу (DNA-PK). [22] [23] ДНК-ПК, как показано, фосфрилирует AIRE in vitro по Thr68 и Ser156. [23]Другой партнер - ДНК-топоизомераза (DNA-TOP) IIα. Этот фермент изомераза воздействует на топологию ДНК и удаляет положительные и отрицательные суперспирали ДНК, вызывая временные разрывы ДНК. В свою очередь, это вызывает релаксацию локального хроматина и помогает инициировать и пост-инициации транскрипции гена. [24] Выполняя двухцепочечные разрывы ДНК, DNA-TOPIIα привлекает ДНК-PK и поли- (АДФ-рибоза) полимеразу (PARP1), которые участвуют в разрыве и репарации ДНК за счет негомологичного соединения концов. [25]
Патология [ править ]
Ген AIRE мутирован при редком аутоиммунном синдроме аутоиммунной полиэндокринопатии типа 1 (APS-1), также известном как аутоиммунная полиэндокринопатия-кандидоз-эктодермальная дистрофия (APECED). Различные мутации чаще встречаются среди определенных групп населения в мире. [26] Наиболее частые мутации AIRE происходят в экзонах 1, 2, 6, 8 и 10. Экзоны 1 и 2 кодируют HSR, экзон 6 кодирует домен SAND, экзон 8 находится в домене PHD-1, а экзон 10 расположен в богатой пролином области между двумя пальцевыми доменами PHD. [27] Известные мутации в AIRE включают Arg139X, Arg257X и Leu323SerfsX51. [28]
Нарушение AIRE приводит к развитию ряда аутоиммунных заболеваний, наиболее частыми клиническими состояниями синдрома являются гипопаратиреоз , первичная недостаточность коры надпочечников и хронический кожно-слизистый кандидоз . [29]
Нокаут гена мышиного гомолога Aire создал трансгенную модель мыши , которая используется для изучения механизма болезни у больных людей. [30]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что аутоиммунный регулятор взаимодействует со связывающим белком CREB . [21] [31]
См. Также [ править ]
Список человеческих кластеров дифференциации для списка молекул CD
Иммунная система
Иммунная толерантность
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000160224 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000731 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ а б Аалтонен Дж., Бьёрсес П., Перхеентупа Дж., Хорелли-Куйтунен Н., Палоти А., Пелтонен Л. и др. (Финско-немецкий консорциум APECED) (декабрь 1997 г.). «Аутоиммунное заболевание APECED, вызванное мутациями в новом гене, включающем два домена« цинковые пальцы »типа PHD». Генетика природы . 17 (4): 399–403. DOI : 10.1038 / ng1297-399 . PMID 9398840 . S2CID 29785642 .
^ Blechschmidt K, Schweiger M, Wertz K, Poulson R, Christensen HM, Rosenthal A и др. (Февраль 1999 г.). «Ген Aire мыши: сравнительное геномное секвенирование, организация гена и экспрессия» . Геномные исследования . Лаборатория Колд Спринг Харбор Пресс. 9 (2): 158–66. OCLC 678392077 . PMC 310712 . PMID 10022980 .
Перейти ↑ Anderson MS, Su MA (апрель 2011 г.). «Воздух и развитие Т-клеток» . Текущее мнение в иммунологии . 23 (2): 198–206. DOI : 10.1016 / j.coi.2010.11.007 . PMC 3073725 . PMID 21163636 .
^ Нагамин К., Петерсон П., Скотт Х.С., Кудо Дж., Миношима С., Хейно М. и др. (Декабрь 1997 г.). «Позиционное клонирование гена APECED» . Генетика природы . 17 (4): 393–8. DOI : 10.1038 / ng1297-393 . PMID 9398839 . S2CID 1583134 .
^ Heino M, Peterson P, Sillanpää N, Guérin S, Wu L, Anderson G и др. (Июль 2000 г.). «Экспрессия РНК и белка аутоиммунного регулятора мышиного гена (Aire) у нормальных, RelB-дефицитных и у мышей NOD» . Европейский журнал иммунологии . 30 (7): 1884–93. DOI : 10.1002 / 1521-4141 (200007) 30: 7 <:: помощь одна тысяча восемьсот восемьдесят четыре-immu1884> 3.0.co; 2-р . PMID 10940877 .
^ а б Андерсон М.С., Венанци Е.С., Кляйн Л., Чен З., Берзиньш С.П., Терли С.Дж. и др. (Ноябрь 2002 г.). «Проекция иммунологической собственной тени в тимусе белком воздуха». Наука . 298 (5597): 1395–401. Bibcode : 2002Sci ... 298.1395A . DOI : 10.1126 / science.1075958 . PMID 12376594 . S2CID 13989491 .
^ a b Листон А., Лесаж С., Уилсон Дж., Пелтонен Л., Гуднау СС (апрель 2003 г.). «Aire регулирует негативный отбор органоспецифических Т-клеток». Иммунология природы . 4 (4): 350–4. DOI : 10.1038 / ni906 . PMID 12612579 . S2CID 4561402 .
^ Gardner JM, Devoss JJ, Friedman RS, Wong DJ, Tan YX, Zhou X и др. (Август 2008 г.). «Делеционная толерантность, опосредованная экстратимическими Aire-экспрессирующими клетками» . Наука . 321 (5890): 843–7. Bibcode : 2008Sci ... 321..843G . DOI : 10.1126 / science.1159407 . PMC 2532844 . PMID 18687966 .
^ «AIRE Генная экспрессия / диаграмма активности» . BioGPS - ваша система генного портала . Архивировано из оригинала на 2009-12-30 . Проверено 19 декабря 2009 .
^ Линдмарк Э, Чен Й, Георгудаки А.М., Дудзяк Д., Линд Э., Адамс В.К. и др. (Май 2013). «AIRE, экспрессирующая дендритные клетки маргинальной зоны, уравновешивает адаптивный иммунитет и набор Т-фолликулярных хелперных клеток». Журнал аутоиммунитета . 42 : 62–70. DOI : 10.1016 / j.jaut.2012.11.004 . ЛВП : 10616/41469 . PMID 23265639 .
^ Perniola R, G Musco (февраль 2014). «Биофизические и биохимические свойства белка аутоиммунного регулятора (AIRE)» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная основа болезни . 1842 (2): 326–37. DOI : 10.1016 / j.bbadis.2013.11.020 . PMID 24275490 .
^ Gibson TJ, Рама C, Гемюнд C, Осланд R (июль 1998). «Белок полигландулярного аутоиммунного синдрома APECED, AIRE-1, содержит домен SAND и, вероятно, является фактором транскрипции». Направления биохимических наук . 23 (7): 242–4. DOI : 10.1016 / s0968-0004 (98) 01231-6 . PMID 9697411 .
Перейти ↑ Carles CC, Fletcher JC (июль 2010 г.). «Отсутствуют связи между гистонами и РНК Pol II, возникающими из SAND?» . Эпигенетика . 5 (5): 381–5. DOI : 10.4161 / epi.5.5.11956 . PMID 20458168 . S2CID 42505863 .
^ Осланд R, Gibson TJ, Стюарт Ф. (февраль 1995). «Палец PHD: значение для регуляции транскрипции, опосредованной хроматином». Направления биохимических наук . 20 (2): 56–9. DOI : 10.1016 / s0968-0004 (00) 88957-4 . PMID 7701562 .
^ Org T, Chignola F, Hetényi C, Gaetani M, Rebane A, Liiv I и др. (Апрель 2008 г.). «Палец аутоиммунного регулятора PHD связывается с неметилированным гистоном H3K4 для активации экспрессии гена» . EMBO Reports . 9 (4): 370–6. DOI : 10.1038 / embor.2008.11 . PMC 2261226 . PMID 18292755 . S2CID 84265877 .
^ Кумар PG, Laloraya M, Wang CY, Жуань QG, Davoodi-Semiromi А, Kao KJ, она JX (ноябрь 2001). «Аутоиммунный регулятор (AIRE) представляет собой ДНК-связывающий белок» . Журнал биологической химии . 276 (44): 41357–64. DOI : 10.1074 / jbc.M104898200 . PMID 11533054 . S2CID 27962035 .
^ a b c Питкянен Дж., Дукас В., Стернсдорф Т., Накадзима Т., Аратани С., Йенсен К. и др. (Июнь 2000 г.). «Белок аутоиммунного регулятора обладает свойствами транскрипционной трансактивации и взаимодействует с общим коактиватором CREB-связывающим белком» . Журнал биологической химии . 275 (22): 16802–9. DOI : 10,1074 / jbc.m908944199 . PMID 10748110 . S2CID 2518676 .
^ Духовка я, Brdicková N, Когоутека Дж, Vaupotic Т, Нарат М, Peterlin ВМ (декабрь 2007). «AIRE привлекает P-TEFb для удлинения транскрипции целевых генов в медуллярных эпителиальных клетках тимуса» . Молекулярная и клеточная биология . 27 (24): 8815–23. DOI : 10.1128 / MCB.01085-07 . OCLC 456127729 . PMC 2169392 . PMID 17938200 .
^ a b Liiv I, Rebane A, Org T, Saare M, Maslovskaja J, Kisand K и др. (Январь 2008 г.). «DNA-PK способствует фосфорилированию AIRE: важность транскрипционной активности» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток . 1783 (1): 74–83. DOI : 10.1016 / j.bbamcr.2007.09.003 . PMC 2225445 . PMID 17997173 .
^ Pommier Y, Y ВС, Huang С.Н., Nitiss JL (ноябрь 2016). «Роль эукариотических топоизомераз в транскрипции, репликации и стабильности генома» . Обзоры природы. Молекулярная клеточная биология . 17 (11): 703–721. DOI : 10.1038 / nrm.2016.111 . PMID 27649880 . S2CID 39198636 .
^ Žumer K, Low AK, Jiang H, Saksela K, Peterlin BM (апрель 2012 г.). «Немодифицированный гистон H3K4 и ДНК-зависимая протеинкиназа привлекают аутоиммунный регулятор к генам-мишеням» . Молекулярная и клеточная биология . 32 (8): 1354–62. DOI : 10.1128 / mcb.06359-11 . PMC 3318594 . PMID 22310661 .
^ Скотт Х.С., Хейно М., Петерсон П., Миттаз Л., Лалиоти, доктор медицины, Беттерле С. и др. (Август 1998 г.). «Общие мутации у пациентов с аутоиммунной полиэндокринопатией-кандидозом-эктодермальной дистрофией различного происхождения» . Молекулярная эндокринология . 12 (8): 1112–9. DOI : 10.1210 / mend.12.8.0143 . PMID 9717837 .
^ Björses Р, М Халонен, Palvimo JJ, Кольмер М, Аалтонен Дж, Ellonen Р, и др. (Февраль 2000 г.). «Мутации в гене AIRE: влияние на субклеточную локализацию и трансактивационную функцию белка аутоиммунной полиэндокринопатии-кандидоза-эктодермальной дистрофии» . Американский журнал генетики человека . 66 (2): 378–92. DOI : 10.1086 / 302765 . PMC 1288090 . PMID 10677297 .
^ Фарди Голян Ф, Гэми Н, Аббасзадеган М.Р., Дехган Маншади С.Х., Вакили Р., Друли Т.Э. и др. (Ноябрь 2019 г.). «Новая мутация в гене AIRE с аутоиммунным полиэндокринным синдромом 1 типа». Иммунобиология . 224 (6): 728–733. DOI : 10.1016 / j.imbio.2019.09.004 . PMID 31526676 .
^ OMIM
^ Рэмси С, Winqvist О, Пухакка л, Халонен М, Moro А, Kampe О, и др. (Февраль 2002 г.). «Мыши с дефицитом Aire развивают множество признаков фенотипа APECED и демонстрируют измененный иммунный ответ» . Молекулярная генетика человека . 11 (4): 397–409. DOI : 10.1093 / HMG / 11.4.397 . PMID 11854172 .
^ Iioka Т, Furukawa К., Yamaguchi А, Синдо Н, Ямашита S, Tsukazaki Т (август 2003 г.). «P300 / CBP действует как коактиватор гомеопротеина-1 хряща (Cart1), парно-подобного гомеопротеина, посредством ацетилирования консервативного остатка лизина, соседнего с гомеодоменом». Журнал исследований костей и минералов . 18 (8): 1419–29. DOI : 10,1359 / jbmr.2003.18.8.1419 . PMID 12929931 . S2CID 8125330 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Бьорсес П., Аалтонен Дж., Хорелли-Куйтунен Н., Яспо М.Л., Пелтонен Л. (1998). «Генный дефект APECED: новый ключ к аутоиммунитету» . Молекулярная генетика человека . 7 (10): 1547–53. DOI : 10,1093 / hmg / 7.10.1547 . PMID 9735375 .
Хейно М., Петерсон П., Кудо Дж., Симидзу Н., Антонаракис С.Е., Скотт Х.С., Крон К. (сентябрь 2001 г.). «APECED мутации в гене аутоиммунного регулятора (AIRE)». Мутация человека . 18 (3): 205–11. DOI : 10.1002 / humu.1176 . PMID 11524731 . S2CID 40379449 .
Сато К., Накадзима К., Имамура Х., Дегучи Т., Хориноути С., Ямадзаки К. и др. (Декабрь 2002 г.). «Новая миссенс-мутация гена AIRE у пациента с аутоиммунной полиэндокринопатией, кандидозом и эктодермальной дистрофией (APECED), сопровождающейся прогрессирующей мышечной атрофией: отчет о болезни и обзор литературы в Японии» . Эндокринный журнал . 49 (6): 625–33. DOI : 10.1507 / endocrj.49.625 . PMID 12625412 .
Ruan QG, She JX (март 2004 г.). «Аутоиммунный полигландулярный синдром 1 типа и аутоиммунный регулятор». Клиники лабораторной медицины . 24 (1): 305–17. DOI : 10.1016 / j.cll.2004.01.008 . PMID 15157567 .
Холмдал Р. (март 2007 г.). «Вариабельность и толерантность к аутоантигенам». Европейский журнал иммунологии . 37 (3): 598–601. DOI : 10.1002 / eji.200737152 . PMID 17323409 . S2CID 26685751 .
Aaltonen J, Björses P, Sandkuijl L, Perheentupa J, Peltonen L (сентябрь 1994 г.). «Аутосомный локус, вызывающий аутоиммунное заболевание: аутоиммунное полигландулярное заболевание I типа, присвоенное хромосоме 21» (PDF) . Генетика природы . 8 (1): 83–7. DOI : 10.1038 / ng0994-83 . PMID 7987397 . S2CID 20365290 .
Аалтонен Дж., Хорелли-Куйтунен Н., Фан Дж. Б., Бьорсес П., Перхеентупа Дж., Майерс Р. и др. (Август 1997 г.). «Физическое и транскрипционное картирование с высоким разрешением локуса аутоиммунной полиэндокринопатии-кандидоза-эктодермальной дистрофии на хромосоме 21q22.3 с помощью FISH» . Геномные исследования . 7 (8): 820–9. DOI : 10.1101 / gr.7.8.820 . PMID 9267805 .
Нагамин К., Петерсон П., Скотт Х.С., Кудо Дж., Миношима С., Хейно М. и др. (Декабрь 1997 г.). «Позиционное клонирование гена APECED». Генетика природы . 17 (4): 393–8. DOI : 10.1038 / ng1297-393 . PMID 9398839 . S2CID 1583134 .
Скотт Х.С., Хейно М., Петерсон П., Миттаз Л., Лалиоти, доктор медицины, Беттерле С. и др. (Август 1998 г.). «Общие мутации у пациентов с аутоиммунной полиэндокринопатией-кандидозом-эктодермальной дистрофией различного происхождения» . Молекулярная эндокринология . 12 (8): 1112–9. DOI : 10,1210 / me.12.8.1112 . PMID 9717837 .
Хейно М., Скотт Х.С., Чен К., Петерсон П., Мяэбпяя У, Папасаввас М.П. и др. (1999). «Мутационные анализы североамериканских пациентов с APS-1». Мутация человека . 13 (1): 69–74. DOI : 10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1999) 13: 1 <69 :: AID-HUMU8> 3.0.CO; 2-6 . PMID 9888391 .
Björses P, Pelto-Huikko M, Kaukonen J, Aaltonen J, Peltonen L, Ulmanen I. (февраль 1999 г.). «Локализация белка APECED в различных ядерных структурах» . Молекулярная генетика человека . 8 (2): 259–66. DOI : 10.1093 / HMG / 8.2.259 . PMID 9931333 .
Rinderle C, Christensen HM, Schweiger S, Lehrach H, Yaspo ML (февраль 1999 г.). «AIRE кодирует ядерный белок, совместно локализованный с филаментами цитоскелета: измененное субклеточное распределение мутантов, лишенных цинковых пальцев PHD» . Молекулярная генетика человека . 8 (2): 277–90. DOI : 10.1093 / HMG / 8.2.277 . PMID 9931335 .
Бьорсес П., Халонен М., Палвимо Дж. Дж., Колмер М., Аалтонен Дж., Эллонен П. и др. (Февраль 2000 г.). «Мутации в гене AIRE: влияние на субклеточную локализацию и трансактивационную функцию белка аутоиммунной полиэндокринопатии-кандидоза-эктодермальной дистрофии» . Американский журнал генетики человека . 66 (2): 378–92. DOI : 10.1086 / 302765 . PMC 1288090 . PMID 10677297 .
Питкянен Дж., Дукас В., Стернсдорф Т., Накадзима Т., Аратани С., Йенсен К. и др. (Июнь 2000 г.). «Белок аутоиммунного регулятора обладает свойствами транскрипционной трансактивации и взаимодействует с общим коактиватором CREB-связывающим белком» . Журнал биологической химии . 275 (22): 16802–9. DOI : 10.1074 / jbc.M908944199 . PMID 10748110 .
Pitkänen J, Vähämurto P, Krohn K, Peterson P (июнь 2001 г.). «Субклеточная локализация аутоиммунного белка-регулятора. Характеристика ядерного нацеливания и домена активации транскрипции» . Журнал биологической химии . 276 (22): 19597–602. DOI : 10.1074 / jbc.M008322200 . PMID 11274163 .
Saugier-Veber P, Drouot N, Wolf LM, Kuhn JM, Frébourg T, Lefebvre H (апрель 2001 г.). «Идентификация новой мутации в гене аутоиммунного регулятора (AIRE-1) во французской семье с аутоиммунной полиэндокринопатией, кандидозом и эктодермальной дистрофией» . Европейский журнал эндокринологии . 144 (4): 347–51. DOI : 10,1530 / eje.0.1440347 . PMID 11275943 .
Внешние ссылки [ править ]
AIRE + протеин в предметных рубриках Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
Расположение генома человека AIRE и страница сведений о гене AIRE в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O43918 (аутоиммунный регулятор) в PDBe-KB .
vтеPDB галерея
1xwh : структура ЯМР первого пальца phd белка аутоиммунного регулятора (AIRE1): понимание
vтеФакторы транскрипции и внутриклеточные рецепторы
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния ( bZIP )
Активирующий фактор транскрипции
AATF
1
2
3
4
5
6
7
АП-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
с-июн
JUNB
JunD
БАХ
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
ДАД
DDIT3
ГАБПА
GCN4
HLF
MAF
B
F
грамм
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Базовая спираль-петля-спираль ( bHLH )
Группа А
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
РУКА
1
2
MESP2
Миогенные регуляторные факторы
MyoD
Миогенин
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Нейрогенины
1
2
3
ОЛИГ
1
2
Paraxis
TCF15
Склераксис
SLC
LYL1
TAL
1
2
Крутить
Группа B
FIGLA
Мой с
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Группа C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
ЧАСЫ
HIF
1А
EPAS1
3А
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Группа D
BHLH
2
3
9
Pho4
Я БЫ
1
2
3
4
Группа E
HES
1
2
3
4
5
6
7
ПРИВЕТ
1
2
L
Группа F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
АП-4
МАКСИМУМ
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Мой с
SREBP
1
2
USF1
(1.4) НФ-1
NFI
А
B
C
Икс
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
I-SMAD
6
7
4 )
(1.5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
АНК
(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
АП-2
α
β
γ
δ
ε
(2) ДНК-связывающие домены цинкового пальца
(2.1) Ядерный рецептор (Cys 4 )
подсемейство 1
Гормон щитовидной железы
α
β
МАШИНА
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
подсемейство 2
КУП-ТФ
( Я
II
Ухо-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Рецептор яичка
2
4
TLX
подсемейство 3
Стероидный гормон
Андроген
Эстроген
α
β
Глюкокортикоид
Минералокортикоид
Прогестерон
Связанный с эстрогеном
α
β
γ
подсемейство 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
подсемейство 5
LRH-1
SF1
подсемейство 6
GCNF
подсемейство 0
DAX1
SHP
(2.2) Другой Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Общие факторы транскрипции
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
ТФИИФ
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3А
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11А
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Kruppel семьи
1
2
3
ОТДЫХ
S1
S2
YY1
ИК
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
ПРОДАЖА
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7А
7B
ZBTB
11
16
17
20
32
33
40
цинковый палец
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35 год
41 год
43
44
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Чередующийся состав
AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
1
2
4
ДЖАРИД
1А
1B
1С
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Домены спираль-поворот-спираль
(3.1) Гомеодомен
Antennapedia класс Antp
protoHOX Hox-подобный
ParaHox
GSX
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
расширенный Hox: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
Би 2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
metaHOX NK-подобный
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
EN
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
НАТО
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
Другой
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1А
1B
NOBOX
СКАЗКА
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
Я ЕСТЬ
1
2
АТС
1
2
3
PKNOX
1
2
ШЕСТЬ
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
16
17
20
21А
POU домен
PIT-1
БРН-3 : А
B
C
Фактор транскрипции октамера : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Парная коробка
PAX
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
PHOX
2А
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Бикоид
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Головка вилки / крылатая спираль
E2F
1
2
3
4
5
FOX белки
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Факторы теплового удара
HSF
1
2
4
(3.5) Кластеры триптофана
ELF
2
4
5
EGF
ELK
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ЭРГ
СПИБ
ETV
1
4
5
6
FLI1
Факторы регуляции интерферона
1
2
3
4
5
6
7
8
MYB
MYBL2
(3.6) TEA домен
фактор усиления транскрипции
1
2
3
4
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(4.1) Область гомологии Rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
РЕЛА
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) СТАТИСТИКА
СТАТ
1
2
3
4
5
6
(4.3) p53
p53
TBX
1
2
3
5
19
21 год
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
TP63
(4.4) Коробка MADS
Mef2
А
B
C
D
SRF
(4.6) ТАТА-связывающие белки
TBP
TBPL1
(4.7) Высокомобильная группа
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1А
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21 год
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
ТОКС
1
2
3
4
(4.9) Зернистая голова
TFCP2
(4.10) Область холодного удара
CSDA
YBX1
(4.11) Runt
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Другие факторы транскрипции
(0.2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Карманный домен
Руб.
RBL1
RBL2
(0.5) Факторы, связанные с AP-2 / EREBP
Апетала 2
EREBP
B3
(0.6) Разное
ARID
1А
1B
2
3А
3B
4А
КОЛПАЧОК
ЕСЛИ Я
16
35 год
MLL
2
3
Т1
MNDA
NFY
А
B
C
Ро / Сигма
см. также недостаточность фактора транскрипции / корегулятора