• цитоплазма • цитозоль • боковая плазматическая мембрана • мембрана • клеточная мембрана • перинуклеарная область цитоплазмы • цитоплазматический пузырек • ядро клетки • комплекс деструкции бета-катенина • периферия клетки
Биологический процесс
• спецификация переднего / заднего паттернов переднего мозга • негативная регуляция дифференцировки жировых клеток • позитивная регуляция фосфорилирования белков • образование обонятельных плакод • позитивная регуляция катаболического процесса протеина • активация активности киназы JUN • позитивная регуляция канонического пути передачи сигналов Wnt • морфогенез эмбрионального глаза • негативная регуляция сигнального пути Wnt • позитивная регуляция каскада JNK • негативная регуляция элонгации транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • позитивная регуляция фосфорилирования пептидил-серина • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие многоклеточного организма • формирование оптических плакод • определение левой / правой симметрии • канонический сигнальный путь Wnt, участвующий в формировании переднего / заднего паттерна нервной пластинки • позитивная регуляция убиквитина -активность протеинтрансферазы • позитивная регуляция фосфорилирования пептидил-треонина • позитивная регуляция убиквитинирования протеина, участвующего в убиквитин-зависимом катаболическом процессе протеина • организация цитоплазматических микротрубочек • канонический путь передачи сигналов Wnt • морфогенез скелетных суставов эмбриона • формирование аксиальной мезодермы • положительная регуляция убиквитинирования белков • активация активности протеинкиназы • развитие мышечных клеток • сигнальный путь, активируемый Wnt, вовлеченный в обязательство судьбы нейронов переднего мозга • негативная регуляция канонического пути передачи сигналов Wnt • передача сигнала • апоптотический процесс • разборка комплекса деструкции бета-катенина • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • Сигнальный путь Wnt • Сборка комплекса деструкции бета-катенина • Регулирование сигнального пути Wnt • Регулирование внутриклеточного пути передачи сигналов рецептора эстрогена • Сборка клеточного макромолекулярного комплекса
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
8312
12005
Ансамбль
ENSG00000103126
ENSMUSG00000024182
UniProt
O15169
O35625
RefSeq (мРНК)
NM_003502 NM_181050
NM_001159598 NM_009733
RefSeq (белок)
NP_003493 NP_851393
NP_001153070 NP_033863
Расположение (UCSC)
Chr 16: 0,29 - 0,35 Мб
Chr 17: 26.14 - 26,2 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Axin-1 представляет собой белок , который у человека кодируется AXIN1 гена . [5]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
2 Структура
3 взаимодействия
4 ссылки
5 Дальнейшее чтение
6 Внешние ссылки
Функция [ править ]
Этот ген кодирует цитоплазматический белок, который содержит домен регуляции передачи сигналов G-белка (RGS) и домен растрепанного аксина (DIX). Кодируемый белок взаимодействует с аденоматозным полипозом кишечной палочки, катенином (кадгерин-ассоциированным белком) бета 1, гликогенсинтазной киназой 3 бета, протеинфосфатазой 2 и самим собой. Этот белок функционирует как негативный регулятор в семействе сайтов интеграции MMTV бескрылого типа, член 1 ( WNT) сигнальный путь и может вызывать апоптоз. Кристаллическая структура части этого белка, отдельно и в комплексе с другими белками, была решена. Мутации в этом гене были связаны с гепатоцеллюлярной карциномой, гепатобластомами, эндометриоидными аденокарциномами яичников и медуллобластомами. Для этого гена были идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. [6]
Структура [ править ]
Полноразмерный человеческий белок содержит 862 аминокислоты с (предсказанной) молекулярной массой 96 кДа. N-концевой домен RGS, пептид Axin1, взаимодействующий с киназой GSK3, и гомологи C-концевых доменов DIX были решены с атомарным разрешением. Большие центральные области, подавляющие WNT, были охарактеризованы как изначально неупорядоченные с помощью биофизических экспериментов и биоинформатического анализа. [7] Биофизическая дестабилизация свернутого домена RGS индуцирует образование наноагрегатов, которые обнажают и локально концентрируют внутренне неупорядоченные области, которые, в свою очередь, неправильно регулируют передачу сигналов Wnt. Многие другие крупные IDP (внутренне нарушенные белки) затронуты миссенс-мутациями, такими как BRCA1 , аденоматозный полипоз кишечной палочки ,CREB-связывающий белок / (CBP) и может быть затронут аналогичным образом миссенс-мутациями их свернутых доменов. [8]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что AXIN1 взаимодействует с:
БТР , [9]
CTNNB1 , [9] [10]
CSNK1E , [11]
CSNK1A1 , [11]
DVL1 , [12] [13]
GSK3B , [9] [14]
LRP5 , [12] [15]
MAP3K1 , [11] [16]
PPP2R5A , [17]
RNF43 , [18] и
TSC2 . [14]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000103126 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024182 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Цзэн л, фагот Р, Т Жанг, Хсу Вт, Vasicek TJ, Перри WL, Ли Дж, Тилгман С.М., Gumbiner БМ, Костантини F (август 1997 г.). «Локус Fused мыши кодирует Axin, ингибитор пути передачи сигналов Wnt, который регулирует формирование эмбриональной оси». Cell . 90 (1): 181–92. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80324-4 . PMID 9230313 . S2CID 10565695 .
^ "Entrez Gene: AXIN1 аксин 1" .
^ Noutsou М, Дуарти А.М., Anvarian Z, Диденко Т, Minde ДП, я Купер, де - Ridder I, Oikonomou C, Фридлер A, R, Boelens Рюдигер С.Г., Maurice MM (2011). «Критические области каркаса опухолевого супрессора Axin1 изначально развернуты». J Mol Biol . 405 (3): 773–86. DOI : 10.1016 / j.jmb.2010.11.013 . PMID 21087614 .
^ Anvarian Z, Нодзима Н, ван Каппель ЕС, Madl Т, Кос М, Viertler М, Jordens я, низкий TY, ван Scherpenzeel RC, Kuper я, Рихтер К, Хек AJ, Boelens R, Винсент ДП, Рюдигер С.Г., Морис М.М. (2016). «Раковые мутанты Axin образуют наноагрегаты для перепрограммирования сигнальной сети Wnt» . Nat Struct Mol Biol . 23 (4): 324–32. DOI : 10.1038 / nsmb.3191 . PMID 26974125 . S2CID 30761541 .
^ a b c Накамура Т., Хамада Ф., Ишидате Т., Анаи К., Кавахара К., Тоошима К., Акияма Т. (июнь 1998 г.). «Аксин, ингибитор пути передачи сигналов Wnt, взаимодействует с бета-катенином, GSK-3beta и APC и снижает уровень бета-катенина» . Гены Клетки . 3 (6): 395–403. DOI : 10.1046 / j.1365-2443.1998.00198.x . PMID 9734785 . S2CID 10875463 .
^ Хосевар BA, Моу F, Rennolds JL, Моррис М., Купер JA, Howe PH (июнь 2003). «Регулирование пути передачи сигналов Wnt с помощью disabled-2 (Dab2)» . EMBO J . 22 (12): 3084–94. DOI : 10,1093 / emboj / cdg286 . PMC 162138 . PMID 12805222 .
^ a b c Чжан Ю., Цю В.Дж., Чан С.К., Хань Дж., Хэ Икс, Лин СК (май 2002 г.). «Казеинкиназа I и казеинкиназа II по-разному регулируют функцию аксина в путях Wnt и JNK» . J. Biol. Chem . 277 (20): 17706–12. DOI : 10.1074 / jbc.M111982200 . PMID 11884395 .
^ Б Ким MJ, Chia IV, Костантини F (ноябрь 2008). «Сайты-мишени SUMOylation на С-конце защищают аксин от убиквитинирования и придают стабильность белку» . FASEB J . 22 (11): 3785–94. DOI : 10.1096 / fj.08-113910 . PMC 2574027 . PMID 18632848 .
↑ Li L, Yuan H, Weaver CD, Mao J, Farr GH, Sussman DJ, Jonkers J, Kimelman D, Wu D (август 1999). «Axin и Frat1 взаимодействуют с dvl и GSK, соединяя Dvl с GSK в Wnt-опосредованной регуляции LEF-1» . EMBO J . 18 (15): 4233–40. DOI : 10.1093 / emboj / 18.15.4233 . PMC 1171499 . PMID 10428961 .
^ a b Мак BC, Takemaru K, Kenerson HL, Moon RT, Yeung RS (февраль 2003 г.). «Комплекс туберин-гамартин отрицательно регулирует сигнальную активность бета-катенина» . J. Biol. Chem . 278 (8): 5947–51. DOI : 10.1074 / jbc.C200473200 . PMID 12511557 .
^ Мао Дж, Ван Дж, Лю Б, пан Вт, Farr GH, Флинн С, Юань Н, Такада S, Кимельман D, Ли L, Ву D (апрель 2001 г.). «Белок-5, связанный с рецептором липопротеинов низкой плотности, связывается с аксином и регулирует канонический путь передачи сигналов Wnt». Мол. Cell . 7 (4): 801–9. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (01) 00224-6 . PMID 11336703 .
Перейти ↑ Zhang Y, Neo SY, Han J, Lin SC (август 2000 г.). «Выбор димеризации контролирует способность аксина и растрепанного активировать c-Jun N-концевую киназу / стресс-активируемую протеинкиназу» . J. Biol. Chem . 275 (32): 25008–14. DOI : 10.1074 / jbc.M002491200 . PMID 10829020 .
^ Ямамото Н, Hinoi Т, Michiue Т, Фукуи А, Усуи Н, Янсенс В, Ван Хоф С, Горисский Дж, Asashima М, Кикучи А (июль 2001 г.). «Ингибирование пути передачи сигнала Wnt субъединицей PR61 протеинфосфатазы 2A» . J. Biol. Chem . 276 (29): 26875–82. DOI : 10.1074 / jbc.M100443200 . PMID 11297546 .
^ Плевать, Морин; Фендерико, Никола; Джорденс, Ингрид; Радашкевич, Томаш; Lindeboom, Rik GH; Bugter, Jeroen M; Кристобаль, Альба; Отес, Ларс; ван Ош, Макс; Янссен, Элин; Бунекамп, Ким Э; Ханакова, Катерина; Потесил, Давид; Здрахал, Збынек; Бой, Сильвия Ф; Медема, Ян Пол; Брыя, Витезслав; Ку, Бон-Кён; Vermeulen, Michiel; Морис, Маделон М (15 сентября 2020 г.). «Усечения RNF 43 улавливают CK 1, чтобы управлять независимым от ниш самообновлением при раке» . Журнал EMBO . 39 (18). DOI : 10.15252 / embj.2019103932 . PMID 32965059 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Сегдицас S, Томлинсон I (2007). «Колоректальный рак и генетические изменения пути Wnt» . Онкоген . 25 (57): 7531–7. DOI : 10.1038 / sj.onc.1210059 . PMID 17143297 .
Флинт Дж., Томас К., Миклем Дж., Рейнхем Х, Кларк К., Доггетт Н.А., Кинг А., Хиггс Д.Р. (1997). «Взаимосвязь между структурой хромосом и функцией в теломерной области человека». Nat. Genet . 15 (3): 252–7. DOI : 10.1038 / ng0397-252 . PMID 9054936 . S2CID 20630444 .
Икеда С., Кишида С., Ямамото Х., Мураи Х., Кояма С., Кикучи А. (1998). «Аксин, негативный регулятор пути передачи сигналов Wnt, образует комплекс с GSK-3beta и бета-катенином и способствует GSK-3beta-зависимому фосфорилированию бета-катенина» . EMBO J . 17 (5): 1371–84. DOI : 10.1093 / emboj / 17.5.1371 . PMC 1170485 . PMID 9482734 .
Харт М.Дж., де лос Сантос Р., Альберт И.Н., Рубинфельд Б., Полакис П. (1998). «Подавление бета-катенина аксином человека и его связь с супрессором опухолей APC, бета-катенином и GSK3 бета». Curr. Биол . 8 (10): 573–81. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (98) 70226-X . PMID 9601641 . S2CID 2863360 .
Накамура Т., Хамада Ф., Ишидате Т., Анаи К., Кавахара К., Тоошима К., Акияма Т. (1998). «Аксин, ингибитор пути передачи сигналов Wnt, взаимодействует с бета-катенином, GSK-3beta и APC и снижает уровень бета-катенина» . Гены Клетки . 3 (6): 395–403. DOI : 10.1046 / j.1365-2443.1998.00198.x . PMID 9734785 . S2CID 10875463 .
Сюй В., Цзэн Л., Константини Ф. (1999). «Идентификация домена Axin, который связывается с серин / треониновой протеинфосфатазой 2A и самосвязывающимся доменом» . J. Biol. Chem . 274 (6): 3439–45. DOI : 10.1074 / jbc.274.6.3439 . PMID 9920888 .
Китагава М., Хатакеяма С., Сиране М., Мацумото М., Исида Н., Хаттори К., Накамичи И., Кикучи А., Накаяма К., Накаяма К. (1999). «Белок F-бокса, FWD1, опосредует убиквитин-зависимый протеолиз бета-катенина» . EMBO J . 18 (9): 2401–10. DOI : 10.1093 / emboj / 18.9.2401 . PMC 1171323 . PMID 10228155 .
Фаготто Ф., Джо Э, Зенг Л., Курт Т., Джоос Т., Кауфманн К., Костантини Ф. (1999). «Домены аксина, участвующие в белок-белковых взаимодействиях, ингибировании пути Wnt и внутриклеточной локализации» . J. Cell Biol . 145 (4): 741–56. DOI : 10,1083 / jcb.145.4.741 . PMC 2133179 . PMID 10330403 .
Кодама С., Икеда С., Асахара Т., Кишида М., Кикучи А. (1999). «Аксин напрямую взаимодействует с плакоглобином и регулирует его стабильность» . J. Biol. Chem . 274 (39): 27682–8. DOI : 10.1074 / jbc.274.39.27682 . PMID 10488109 .
Jho Eh, Lomvardas S, Costantini F (2000). «Сайт фосфорилирования GSK3beta в аксине модулирует взаимодействие с бета-катенином и экспрессию гена, опосредованную Tcf». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 266 (1): 28–35. DOI : 10.1006 / bbrc.1999.1760 . PMID 10581160 .
Икеда С., Кишида М., Мацуура Ю., Усуи Х., Кикучи А. (2000). «GSK-3beta-зависимое фосфорилирование продукта гена аденоматозного полипоза coli может модулироваться бета-катенином и протеинфосфатазой 2A в комплексе с аксином» . Онкоген . 19 (4): 537–45. DOI : 10.1038 / sj.onc.1203359 . PMID 10698523 .
Satoh S, Daigo Y, Furukawa Y, Kato T, Miwa N, Nishiwaki T, Kawasoe T, Ishiguro H, Fujita M, Tokino T, Sasaki Y, Imaoka S, Murata M, Shimano T, Yamaoka Y, Nakamura Y (2000) . «Мутации AXIN1 в гепатоцеллюлярной карциноме и подавление роста раковых клеток посредством вирусной передачи AXIN1». Nat. Genet . 24 (3): 245–50. DOI : 10.1038 / 73448 . PMID 10700176 . S2CID 27531668 .
Чжан Ю., Нео С.Ю., Хань Дж., Лин С.К. (2000). «Выбор димеризации контролирует способность аксина и растрепанного активировать c-Jun N-концевую киназу / стресс-активируемую протеинкиназу» . J. Biol. Chem . 275 (32): 25008–14. DOI : 10.1074 / jbc.M002491200 . PMID 10829020 .
Дэниэлс Р.Дж., Педен Дж. Ф., Ллойд С., Хорсли С. В., Кларк К., Туфарелли С., Кирни Л., Пряжка В. Дж., Доггетт Н. А., Флинт Дж., Хиггс Д. Р. (2001). «Последовательность, структура и патология полностью аннотированного терминала 2 Mb короткого плеча хромосомы 16 человека» . Гм. Мол. Genet . 10 (4): 339–52. DOI : 10.1093 / HMG / 10.4.339 . PMID 11157797 .
Ямамото Х., Хинои Т., Мичиуэ Т, Фукуи А., Усуи Х., Янссенс В., Ван Хоф С., Горис Дж., Асашима М., Кикучи А. (2001). «Ингибирование пути передачи сигнала Wnt субъединицей PR61 протеинфосфатазы 2A» . J. Biol. Chem . 276 (29): 26875–82. DOI : 10.1074 / jbc.M100443200 . PMID 11297546 .
Мао Дж., Ван Дж., Лю Б., Пан В., Фарр Г. Х., Флинн С., Юань Х, Такада С., Кимелман Д., Ли Л., Ву Д. (2001). «Белок-5, связанный с рецептором липопротеинов низкой плотности, связывается с аксином и регулирует канонический путь передачи сигналов Wnt». Мол. Cell . 7 (4): 801–9. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (01) 00224-6 . PMID 11336703 .
Фурухаши М., Яги К., Ямамото Х., Фурукава Й., Шимада С., Накамура Ю., Кикучи А., Миядзоно К., Като М. (2001). «Аксин способствует активации Smad3 в сигнальном пути трансформирующего фактора роста бета» . Мол. Клетка. Биол . 21 (15): 5132–41. DOI : 10.1128 / MCB.21.15.5132-5141.2001 . PMC 87238 . PMID 11438668 .
Рубинфельд Б., Тайс Д.А., Полакис П. (2001). «Аксин-зависимое фосфорилирование белка аденоматозного полипоза coli, опосредованное казеинкиназой 1-эпсилон» . J. Biol. Chem . 276 (42): 39037–45. DOI : 10.1074 / jbc.M105148200 . PMID 11487578 .
Внешние ссылки [ править ]
Расположение генома человека AXIN1 и страница сведений о гене AXIN1 в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O15169 (Axin-1) в PDBe-KB .
vтеPDB галерея
1dk8 : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА RGS-ГОМОЛОГИЧЕСКОГО ОБЛАСТИ АКСИНА
1emu : СТРУКТУРА AXIN RGS-ОДНОРОДНОГО ДОМЕНА В КОМПЛЕКСЕ С ПОВТОРОМ SAMP ОТ APC
1wsp : Кристаллическая структура домена аксин-дикс
2d5g : Структура мутанта убиквитинфолд-белка R767E