Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
BACH1
Белок BACH1 PDB 2ihc.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2IHC

Идентификаторы
ПсевдонимыBACH1 , BACH-1, BTBD24, домен BTB и гомолог 1 с ЧПУ
Внешние идентификаторыOMIM : 602751 MGI : 894680 HomoloGene : 916 GeneCards : BACH1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 21 (человека)
Chr.Хромосома 21 (человека) [1]
Хромосома 21 (человека)
Геномное расположение BACH1
Геномное расположение BACH1
Группа21q21.3Начинать29 194 071 п.н. [1]
Конец29 630 751 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 16 (мышь)
Chr.Хромосома 16 (мышь) [2]
Хромосома 16 (мышь)
Геномное расположение BACH1
Геномное расположение BACH1
Группа16 | 16 C3.3Начинать87 698 945 п.н. [2]
Конец87 733 346 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE BACH1 210818 s в формате fs.png

PBB GE BACH1 204194 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• ГО: 0000980 РНК - полимеразы II цис-регуляторной области последовательности-специфической ДНК связывания
• ДНК связывания
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 ДНК-связывающий фактор активности транскрипции
• убиквитин-протеин трансферазы активности
• GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, РНК-полимераза II-специфическая
• GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ДНК-связывающая активность активатора транскрипции, РНК-полимераза II-специфический
• Связывание с белком GO: 0001948
• связывание с гемом
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК-связывающий фактор транскрипции, специфический к РНК-полимеразе II
Сотовый компонент• цитоплазма
• цитозоль
• убиквитинлигазный комплекс Cul3-RING
• ядро клетки
Биологический процесс• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• регуляция транскрипции, участвующая в G1 / S-переходе митотического клеточного цикла
• транскрипция, ДНК-шаблон
• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на гипоксия
• репарация ДНК
• положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• регуляция транскрипции, участвующая в переходе G2 / M митотического клеточного цикла
• убиквитинирование белка
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы II
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

571

12013

Ансамбль

ENSG00000156273

ENSMUSG00000025612

UniProt

O14867

P97302

RefSeq (мРНК)

NM_001011545
NM_001186
NM_206866

NM_007520

RefSeq (белок)

NP_001177
NP_996749

NP_031546

Расположение (UCSC)Chr 21: 29.19 - 29.63 МбChr 16: 87,7 - 87,73 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Транскрипция регулятор белок BACH1 является белком , который в организме человека кодируется BACH1 геном . [5] [6] [7]

Функция [ править ]

Этот ген кодирует фактор транскрипции, который принадлежит к типу cap'n'collar семейства факторов лейциновой молнии основной области (CNC-bZip). Кодируемый белок содержит широкий комплекс, tramtrack, bric-a-brac / poxvirus и домены цинкового пальца (BTB / POZ), что нетипично для членов семейства CNC-bZip. Эти домены BTB / POZ способствуют межбелковым взаимодействиям и образованию гомо- и / или гетероолигомеров. С-конец белка представляет собой лейциновую застежку bzip_maf.семья. Когда этот белок образует гетеродимер с MafK, он действует как репрессор распознающего элемента Maf (MARE), и транскрипция репрессируется. Для этого гена было идентифицировано множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов. Некоторые экзоны этого гена перекрываются с некоторыми экзонами гена C21orf41, который транскрибируется в противоположной ориентации по отношению к этому гену, но, по-видимому, не кодирует белок. [7]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000156273 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025612 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Blouin JL, Duriaux Sail G, M Guipponi, Росье C, Pappasavas MP, Antonarakis SE (март 1998). «Выделение гена регулятора транскрипции BACH1 человека, который отображается на хромосоме 21q22.1». Генетика человека . 102 (3): 282–8. DOI : 10.1007 / s004390050692 . PMID 9544839 . S2CID 9494442 .  
  6. ^ Охир М, Н Секите, Нагас Т, Ишикав К, Nomura N, O Охара (январь 1998). «Характеристика человеческого гомолога (BACH1) гена Bach1 мыши, кодирующего фактор транскрипции лейциновой молнии BTB, и его картирование на хромосоме 21q22.1». Геномика . 47 (2): 300–6. DOI : 10.1006 / geno.1997.5080 . PMID 9479503 . 
  7. ^ a b «Ген Entrez: BACH1 BTB и гомология CNC 1, основной фактор транскрипции лейциновой молнии 1» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Ozono R (апрель 2006 г.). «Новые биотехнологические методы для снижения окислительного стресса в сердечно-сосудистой системе: фокусировка на пути Bach1 / гемоксигеназа-1». Текущая фармацевтическая биотехнология . 7 (2): 87–93. DOI : 10.2174 / 138920106776597630 . PMID  16724942 .
  • Ояке Т., Ито К., Мотохаси Х., Хаяси Н., Хосино Х., Нисидзава М., Ямамото М., Игараси К. (ноябрь 1996 г.). «Белки Баха принадлежат к новому семейству основных факторов транскрипции лейциновой молнии BTB, которые взаимодействуют с MafK и регулируют транскрипцию через сайт NF-E2» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (11): 6083–95. DOI : 10.1128 / mcb.16.11.6083 . PMC  231611 . PMID  8887638 .
  • Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID  8889548 .
  • Кобаяси А., Ямагива Х., Хосино Х., Муто А., Сато К., Морита М., Хаяси Н., Ямамото М., Игараси К. (март 2000 г.). «Комбинаторный код для экспрессии гена, генерируемый фактором транскрипции Bach2 и MAZR (фактор, связанный с MAZ) через домен BTB / POZ» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (5): 1733–46. DOI : 10.1128 / MCB.20.5.1733-1746.2000 . PMC  85356 . PMID  10669750 .
  • Канезаки Р., Токи Т., Йокояма М., Йомогида К., Сугияма К., Ямамото М., Игараси К., Ито Э. (март 2001 г.). «Фактор транскрипции BACH1 рекрутируется в ядро ​​своей новой альтернативной сплайсированной изоформой» . Журнал биологической химии . 276 (10): 7278–84. DOI : 10.1074 / jbc.M004227200 . PMID  11069897 .
  • Cantor SB, Bell DW, Ganesan S, Kass EM, Drapkin R, Grossman S, Wahrer DC, Sgroi DC, Lane WS, Haber DA, Livingston DM (апрель 2001 г.). «BACH1, новый похожий на геликазу белок, напрямую взаимодействует с BRCA1 и способствует его функции репарации ДНК». Cell . 105 (1): 149–60. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (01) 00304-X . PMID  11301010 . S2CID  15966253 .
  • Китамуро Т., Такахаши К., Огава К., Удоно-Фуджимори Р., Такеда К., Фуруяма К., Накаяма М., Сан Дж., Фудзита Х., Хида В., Хаттори Т., Сирато К., Игараси К., Шибахара С. (март 2003 г.). «Bach1 действует как индуцируемый гипоксией репрессор гена гемоксигеназы-1 в клетках человека» . Журнал биологической химии . 278 (11): 9125–33. DOI : 10.1074 / jbc.M209939200 . PMID  12511571 .
  • Сузуки Х, Таширо С., Сун Дж., Дои Х, Сатоми С., Игараси К. (декабрь 2003 г.). «Кадмий индуцирует ядерный экспорт Bach1, репрессора транскрипции гена гемоксигеназы-1» . Журнал биологической химии . 278 (49): 49246–53. DOI : 10.1074 / jbc.M306764200 . PMID  14504288 .
  • Тахара Т., Сун Дж., Наканиши К., Ямамото М., Мори Х., Сайто Т., Фудзита Х., Игараси К., Такетани С. (февраль 2004 г.). «Гем положительно регулирует экспрессию бета-глобина в области контроля локуса через фактор транскрипции Bach1 в эритроидных клетках» . Журнал биологической химии . 279 (7): 5480–7. DOI : 10.1074 / jbc.M302733200 . PMID  14660636 .
  • Шим К.С., Феррандо-Мигель Р., Любек Г. (2004). Аберрантная экспрессия белков транскрипционных факторов BACH1 и ERG, кодируемых на хромосоме 21, в головном мозге пациентов с синдромом Дауна и болезнью Альцгеймера . Журнал нейронной передачи. Дополнение . Журнал Neural Transmission Supplement 67. 67 . С. 39–49. DOI : 10.1007 / 978-3-7091-6721-2_3 . ISBN 978-3-211-40776-9. PMID  15068237 .
  • Феррандо-Мигель Р., Чхон М.С., Ян Дж. В., Любек Г. (2004). «Сверхэкспрессия фактора транскрипции BACH1 в мозге плода с синдромом Дауна». Достижения в исследованиях синдрома Дауна . Журнал нейронной передачи. Дополнение . Журнал Neural Transmission Supplement 67. 67 . С. 193–205. DOI : 10.1007 / 978-3-7091-6721-2_17 . ISBN 978-3-211-40776-9. PMID  15068251 .
  • Сузуки Х, Таширо С., Хира С., Сан Дж., Ямадзаки С., Зенке Й, Икеда-Сайто М., Йошида М., Игараси К. (июль 2004 г.). «Гем регулирует экспрессию генов, запуская Crm1-зависимый ядерный экспорт Bach1» . Журнал EMBO . 23 (13): 2544–53. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7600248 . PMC  449764 . PMID  15175654 .
  • Тахара Т., Сун Дж., Игараши К., Такетани С. (ноябрь 2004 г.). «Гем-зависимая регуляция экспрессии гена альфа-глобина с помощью репрессора транскрипции Bach1 в эритроидных клетках» (PDF) . Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 324 (1): 77–85. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2004.09.022 . PMID  15464985 .
  • Шан Й., Ламбрехт Р.В., Газиани Т., Донохью С.Е., Бонковски Х.Л. (декабрь 2004 г.). «Роль Bach-1 в регуляции гемоксигеназы-1 в клетках печени человека: выводы из исследований с небольшими интерферирующими RNAS» . Журнал биологической химии . 279 (50): 51769–74. DOI : 10.1074 / jbc.M409463200 . PMID  15465821 .
  • Токи Т., Кацуока Ф., Канезаки Р., Сюй Джи, Куротаки Х., Сан Дж., Камио Т., Ватанабэ С., Тандай С., Теруи К., Ягихаси С., Комацу Н., Игараси К., Ямамото М., Ито Э (апрель 2005 г.). «Трансгенная экспрессия фактора транскрипции BACH1 приводит к нарушению мегакариоцитов». Кровь . 105 (8): 3100–8. DOI : 10.1182 / кровь-2004-07-2826 . PMID  15613547 .

Внешние ссылки [ править ]

  • BACH1 + белок, + человеческий по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • Расположение генома человека BACH1 и страница сведений о гене BACH1 в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , которая находится в свободном доступе .