Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
BCL6
Белок BCL6 PDB 1r28.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1R28 , 1R29 , 1R2B , 2EN2 , 2EOS , 2LCE , 2YRM , 3BIM , 3E4U , 3LBZ , 4CP3 , 4U2M

Идентификаторы
ПсевдонимыBCL6 , BCL5, BCL6A, LAZ3, ZBTB27, ZNF51, B-клеточный CLL / лимфома 6, B-клеточный CLL / лимфома 6, репрессор транскрипции, репрессор транскрипции BCL6
Внешние идентификаторыOMIM : 109565 MGI : 107187 HomoloGene : 7640 GeneCards : BCL6
Расположение гена ( человек )
Хромосома 3 (человек)
Chr.Хромосома 3 (человек) [1]
Хромосома 3 (человек)
Геномное расположение BCL6
Геномное расположение BCL6
Группа3q27.3Начинать187 721 377 п.н. [1]
Конец187 745 725 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 16 (мышь)
Chr.Хромосома 16 (мышь) [2]
Хромосома 16 (мышь)
Геномное расположение BCL6
Геномное расположение BCL6
Группа16 B1 | 16 15,26 смНачинать23 965 052 п.н. [2]
Конец23 988 852 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК


Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• последовательности конкретного связывания ДНК
• ДНК связывания
• РНК - полимераза регуляторной область ДНК последовательности специфических II связывание
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 ДНК-связывающей активность фактора транскрипции
• интронная транскрипция регуляторной область последовательность конкретные ДНК - связывающий
• хроматина связывания
• ион металла связывания
• GO: 0001948 связывание белка
• GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающий репрессор активности транскрипции РНК - полимеразы II , специфичные
• связывание нуклеиновых кислот
• связывание хроматина ДНК
• идентичные белок переплет
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II
Сотовый компонент• вилка репликации
• ядро клетки
• нуклеоплазма
• аппарат Гольджи
Биологический процесс• регуляция образования зародышевого центра
• позитивная регуляция деацетилирования гистонов
• негативная регуляция дифференцировки Т-хелперов 2 клеток
• локализация белка
• негативная регуляция продукции цитокинов тучными клетками
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• процесс иммунной системы
• GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 регуляция активности GTPase
• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• негативная регуляция дифференцировки клеток
• формирование зародышевого центра
• отрицательная регуляция передачи сигнала белка Rho
• негативная регуляция переключения изотипа на изотипы IgE
• негативная регуляция апоптотического процесса
• негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция, ДНК-шаблон
• иммунный ответ 2-го типа
• клеточный ответ на стимул повреждения ДНК
• негативная регуляция адгезии клеточного матрикса
• регуляция клеточной пролиферации
• позитивная регуляция пролиферации B-клеток
• негативная регуляция роста клеток
• передача сигнала Rho-белка
• клеточный морфогенез
• сперматогенез
• регуляция дифференцировки Т-клеток памяти
• позитивная регуляция дифференцировки нейронов
• регуляция воспалительного ответа
• регуляция иммунного ответа
• позитивная регуляция апоптотического процесса
• негативная регуляция иммунного ответа 2 типа
• негативная регуляция процесса апоптоза В-клеток
• позитивная регуляция клеточного компонента движения
• дифференцировки в - клеток
• воспалительная реакция
• отрицательная регуляция транскрипции ДНК-шаблонный
• актинового цитоскелета организация
• негативная регуляция клеточной пролиферации
• негативная регуляция сигнального пути Notch
• развитие эритроцитов
• негативная регуляция клеточного старения
• регуляция апоптотического процесса
• негативная регуляция репликации ДНК митотического клеточного цикла
• позитивная регуляция регуляторной дифференцировки Т-клеток
• сигнальный путь, опосредованный цитокинами
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

604

12053

Ансамбль

ENSG00000113916

ENSMUSG00000022508

UniProt

P41182

P41183

RefSeq (мРНК)

NM_001130845
NM_001134738
NM_001706
NM_138931

NM_009744
NM_001348026

RefSeq (белок)

NP_001124317
NP_001128210
NP_001697

NP_001334955
NP_033874

Расположение (UCSC)Chr 3: 187,72 - 187,75 МбChr 16: 23.97 - 23.99 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

В-клеточная лимфома 6 белок представляет собой белок , который у человека кодируется BCL6 гена . [5] Подобно BCL2 , BCL3 , BCL5 , BCL7A, BCL9 и BCL10 , он имеет клиническое значение при лимфоме .

Функция [ править ]

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой эволюционно консервативный фактор транскрипции « цинковые пальцы» и содержит N-концевой домен POZ / BTB. Этот белок действует как специфичный для последовательности репрессор транскрипции и, как было показано, модулирует STAT-зависимые ответы В-клеток на интерлейкин 4 (IL-4) . Этот белок может взаимодействовать с несколькими корепрессорными комплексами, подавляя транскрипцию . Обнаружено, что этот ген часто транслоцируется и гипермутируется при диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфоме (DLBCL) [6] [7] [8]и способствует патогенезу DLBCL. Вариант сплайсинга с пропуском экзона 7 кодирует более короткую форму белка, в которой отсутствуют первые два цинковых пальца ДНК-связывающего домена . [9]

Физиологически BCL6 является основным фактором транскрипции, который ведет к дифференцировке наивных хелперных Т-клеток в фолликулярные хелперные Т-клетки (клетки TFH). [10] Его действие негативно регулируется геном PRDM1, кодирующим фактор транскрипции Blimp-1. [11]

Утилита диагностики [ править ]

Присутствие BCL6 можно продемонстрировать на срезах тканей с помощью иммуногистохимии . Он присутствует исключительно в B-клетках как здоровых, так и неопластических зародышевых центров . Следовательно, он демонстрирует как реактивную гиперплазию в лимфатических узлах, так и ряд лимфом, происходящих из фолликулярных B-клеток, таких как лимфома Беркитта , фолликулярная лимфома и преобладающий подтип узловых лимфоцитов болезни Ходжкина . Его часто используют вместе с антителами к антигену Bcl-2, чтобы отличить неопластические фолликулы от фолликулов, обнаруженных при доброкачественной гиперплазии, для которых Bcl-2 отрицательный. [12]

Взаимодействия [ править ]

BCL6 взаимодействует с

  • BCOR , [13]
  • C-июн , [14]
  • HDAC1 , [15] [16]
  • HDAC4 , [17]
  • HDAC7A , [17]
  • HDAC5 , [17]
  • IRF4 , [18]
  • NCOR2 , [13] [16] [19]
  • SMRT , [15] [19]
  • ZBTB7A [20]
  • Т-бет , [21]
  • ZBTB16 [22]

См. Также [ править ]

  • Лимфома Ходжкина с преобладанием узловых лимфоцитов
  • Диффузная В-крупноклеточная лимфома

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000113916 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022508 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ «Ген Entrez: BCL6 B-клеточный CLL / лимфома 6 (белок цинкового пальца 51)» .
  6. ↑ Ye BH, Lista F, Lo Coco F, Knowles DM, Offit K, Chaganti RS, Dalla-Favera R (октябрь 1993 г.). «Изменения гена, кодирующего цинковый палец, BCL-6, при диффузной крупноклеточной лимфоме». Наука . 262 (5134): 747–50. Bibcode : 1993Sci ... 262..747Y . DOI : 10.1126 / science.8235596 . PMID 8235596 . 
  7. ^ Kerckaert ДП, Deweindt С, Тилли Н, Quief S, Лекок G, полуторный С (сентябрь 1993). «LAZ3, новый ген, кодирующий цинковый палец, нарушается повторяющимися транслокациями хромосомы 3q27 в лимфомах человека». Генетика природы . 5 (1): 66–70. DOI : 10.1038 / ng0993-66 . PMID 8220427 . S2CID 12575122 .  
  8. ^ Migliazza A, Маринотти S, Chen W, Фуско C, Е. BH, Knowles DM, Offit K, Chaganti RS, Далла-Favera R (декабрь 1995). «Частая соматическая гипермутация 5'-некодирующей области гена BCL6 при В-клеточной лимфоме» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (26): 12520–4. Bibcode : 1995PNAS ... 9212520M . DOI : 10.1073 / pnas.92.26.12520 . PMC 40389 . PMID 8618933 .  
  9. ^ Shen Y, Се В, Ramachandrareddy Н, McKeithan Т, Чан туалет (октябрь 2008 г.). «Альтернативный сплайсинг генерирует короткую изоформу BCL6 (BCL6S), кодирующую компактный репрессор» . Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 375 (2): 190–3. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2008.07.116 . PMC 2573862 . PMID 18675787 .  
  10. ^ Нуриева Р.И., Чунг Й., Мартинес Г.Дж., Ян ХО, Танака С., Мацкевич Т.Д., Ван Й.Х., Донг С. (август 2009 г.). «Bcl6 опосредует развитие Т-фолликулярных хелперов» . Наука . 325 (5943): 1001–5. Bibcode : 2009Sci ... 325.1001N . DOI : 10.1126 / science.1176676 . PMC 2857334 . PMID 19628815 .  
  11. ^ Джонстон RJ, Poholek AC, DiToro D, Yusuf I, Eto D, Barnett B, Dent AL, Craft J, Crotty S (август 2009). «Bcl6 и Blimp-1 являются реципрокными и антагонистическими регуляторами дифференцировки Т-фолликулярных клеток-помощников» . Наука . 325 (5943): 1006–10. Bibcode : 2009Sci ... 325.1006J . DOI : 10.1126 / science.1175870 . PMC 2766560 . PMID 19608860 .  
  12. ^ Леонг, Энтони SY; Купер, Кумарасон; Леонг, Ф. Джоэл WM (2003). Руководство по диагностической цитологии (2-е изд.). Гринвич Медикал Медиа, Лтд. Стр. 29. ISBN 978-1-84110-100-2.
  13. ^ a b Huynh KD, Fischle W, Verdin E, Bardwell VJ (июль 2000 г.). «BCoR, новый корепрессор, участвующий в репрессии BCL-6» . Гены и развитие . 14 (14): 1810–23. doi : 10.1101 / gad.14.14.1810 (неактивный 2021-01-14). PMC 316791 . PMID 10898795 .  CS1 maint: DOI неактивен с января 2021 г. ( ссылка )
  14. ^ Vasanwala FH, Кусам S, Тоуни LM, Dent AL (август 2002). «Подавление функции AP-1: механизм регуляции экспрессии Blimp-1 и дифференцировки B-лимфоцитов протоонкогеном B-клеточной лимфомы-6» . Журнал иммунологии . 169 (4): 1922–9. DOI : 10.4049 / jimmunol.169.4.1922 . PMID 12165517 . 
  15. ^ а б Дэвид Дж., Алланд Л., Хонг Ш., Вонг С. В., ДеПиньо Р. А., Дежан А. (май 1998 г.). «Гистоновая деацетилаза, связанная с mSin3A, опосредует репрессию белком PLZF, ассоциированным с острым промиелоцитарным лейкозом» . Онкоген . 16 (19): 2549–56. DOI : 10.1038 / sj.onc.1202043 . PMID 9627120 . 
  16. ^ a b Deltour S, Guerardel C, Leprince D (декабрь 1999 г.). «Рекрутирование комплексов, репрессирующих SMRT / N-CoR-mSin3A-HDAC, не является общим механизмом для репрессоров транскрипции BTB / POZ: случай HIC-1 и gammaFBP-B» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (26): 14831–6. Bibcode : 1999PNAS ... 9614831D . DOI : 10.1073 / pnas.96.26.14831 . PMC 24733 . PMID 10611298 .  
  17. ^ a b c Lemercier C, Brocard MP, Puvion-Dutilleul F, Kao HY, Albagli O, Khochbin S (июнь 2002 г.). «Гистоновые деацетилазы класса II напрямую задействуются репрессором транскрипции BCL6» . Журнал биологической химии . 277 (24): 22045–52. DOI : 10.1074 / jbc.M201736200 . PMID 11929873 . 
  18. Перейти ↑ Gupta S, Jiang M, Anthony A, Pernis AB (декабрь 1999 г.). «Клон-специфическая модуляция передачи сигналов интерлейкина 4 с помощью фактора регуляции 4 интерферона» . Журнал экспериментальной медицины . 190 (12): 1837–48. DOI : 10,1084 / jem.190.12.1837 . PMC 2195723 . PMID 10601358 .  
  19. ↑ a b Wong CW, Privalsky ML (октябрь 1998 г.). «Компоненты корепрессорного комплекса SMRT проявляют отличительные взаимодействия с онкобелками POZ домена PLZF, PLZF-RARalpha и BCL-6» . Журнал биологической химии . 273 (42): 27695–702. DOI : 10.1074 / jbc.273.42.27695 . PMID 9765306 . 
  20. ^ Дэвис Дж. М., Хаве Н., Кабаровски Дж., Хуанг К. Х., Чжу Дж., Брэнд Нью-Джерси, Лепринс Д., Дхордайн П., Кук М., Моррисс-Кей Дж., Зелент А. (январь 1999 г.). «Новый белок цинкового пальца с доменом BTB / POZ, LRF, является потенциальной мишенью для онкогена LAZ-3 / BCL-6» . Онкоген . 18 (2): 365–75. DOI : 10.1038 / sj.onc.1202332 . PMID 9927193 . 
  21. ^ Oestreich KJ, Хуан AC, Weinmann AS (май 2011). «Факторы, определяющие происхождение T-bet и Bcl-6, взаимодействуют, чтобы регулировать паттерны экспрессии гена Th1» . Журнал экспериментальной медицины . 208 (5): 1001–13. DOI : 10,1084 / jem.20102144 . PMC 3092354 . PMID 21518797 .  
  22. ^ Dhordain Р, Albagli О, Оноре Н, Guidez Ж, Lantoine Д, Schmid м, HD, Zelent А, Koken МН (декабрь 2000). «Совместная локализация и гетеромеризация между двумя человеческими онкогенными POZ / белками цинкового пальца, LAZ3 (BCL6) и PLZF» . Онкоген . 19 (54): 6240–50. DOI : 10.1038 / sj.onc.1203976 . PMID 11175338 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Уэда К., Акасака Т., Оно Х (июль 2002 г.). «Слияние гена неиммуноглобулина / BCL6 в диффузной большой B-клеточной лимфоме: прогностические последствия». Лейкемия и лимфома . 43 (7): 1375–81. DOI : 10.1080 / 10428190290033305 . PMID  12389616 . S2CID  27096971 .
  • Ниу Х (декабрь 2002 г.). «Протоонкоген BCL-6 в развитии нормальных и злокачественных В-клеток». Гематологическая онкология . 20 (4): 155–66. DOI : 10.1002 / hon.689 . PMID  12469325 . S2CID  24245607 .
  • Токухиса Т. (декабрь 2002 г.). «[Роль Bcl6 в развитии иммунной памяти]». Танпакушицу Какусан Косо. Белок, нуклеиновая кислота, фермент . 47 (16 Suppl): 2306–12. PMID  12518453 .
  • Оно Х (апрель 2004 г.). «Патогенетическая роль транслокации BCL6 в В-клеточной неходжкинской лимфоме». Гистология и гистопатология . 19 (2): 637–50. PMID  15024721 .
  • Паскуалуччи Л., Берещенко О., Берещенко О., Ню Х., Кляйн Ю., Бассо К., Гульельмино Р., Катторетти Г., Далла-Фавера Р. (2004). «Молекулярный патогенез неходжкинской лимфомы: роль Bcl-6». Лейкемия и лимфома . 44 Дополнение 3: S5–12. DOI : 10.1080 / 10428190310001621588 . PMID  15202519 . S2CID  25565667 .
  • Жардин Ф., Румини П., Ублюдок С., Тилли Х. (февраль 2007 г.). «Протоонкоген BCL6: ведущая роль в развитии зародышевого центра и лимфомагенезе». Патология-Биология . 55 (1): 73–83. DOI : 10.1016 / j.patbio.2006.04.001 . PMID  16815642 .

Внешние ссылки [ править ]

  • BCL6 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • Расположение генома человека BCL6 и страница сведений о гене BCL6 в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , которая находится в свободном доступе .