Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с BMAL1 )
Перейти к навигации Перейти к поиску
ARNTL
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

4H10

Идентификаторы
ПсевдонимыARNTL , BMAL1, BMAL1c, JAP3, MOP3, PASD3, TIC, bHLHe5, ядерный транслокатор рецептора арильных углеводородов, такой как
Внешние идентификаторыOMIM : 602550 MGI : 1096381 HomoloGene : 910 GeneCards : ARNTL
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 7 (мышь)
Chr.Хромосома 7 (мышь) [1]
Хромосома 7 (мышь)
Геномное расположение ARNTL
Геномное расположение ARNTL
Группа7 F1 | 7 59,17 смНачинать113 207 465 п.н. [1]
Конец113 314 126 п.н. [1]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE ARNTL 209824 s в формате fs.png

PBB GE ARNTL 210971 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание с ДНК
• Связывание с белком Hsp90
• Активность димеризации белка
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• Связывание с арилуглеводородным рецептором
• Связывание с белком GO: 0001948
• GO: 0000975 транскрипция цис -regulatory область связывания
• транскрипционный фактор активности, РНК - полимеразы II , основной промотор проксимальная область последовательности-специфического связывания
• ДНК - последовательности конкретного ядра промотора связывания
• bHLH связывания фактора транскрипции
• последовательность ДНК-специфическое связывание
• белок гетеродимеризация активности
• Связывание с E-боксом
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично
для РНК-полимеразы II • GO: 0000980 Связывание ДНК цис-регуляторной области РНК-полимеразы II, специфичное для последовательности
• GO: 0001077, GO : 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II
Сотовый компонент• цитоплазма
• тело ПМЛ
• внутриклеточная мембраносвязанная органелла
• комплекс регуляторов транскрипции
• нуклеоплазма
• ядро
• ядерное тело
• хроматоидное тело
Биологический процесс• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• ритмический процесс
• транскрипция, ДНК-шаблон
• регулирование цикла волос
• транскрипция РНК-полимеразой II
• сперматогенез
• циркадный ритм
• негативная регуляция передачи сигналов TOR
• циркадная регуляция экспрессии генов
• регуляция катаболизма белков процесс
• положительная регуляция циркадного ритма
• опосредованный протеасомами убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс
• негативная регуляция дифференцировки жировых клеток
• негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• позитивная регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II
• регуляция нейрогенеза
• регуляция секреции инсулина
• регуляция клеточного цикла
• ответ на окислительно-восстановительное состояние
• материнский процесс, участвующий в роды
• положительная регуляция канонического пути передачи сигналов Wnt
• преждевременное старение, вызванное окислительным стрессом
• регуляция развития клеток поджелудочной железы типа B
• негативная регуляция пути передачи сигналов глюкокортикоидных рецепторов
• регуляция клеточного старения
• позитивная регуляция дифференцировки клеток скелетных мышц
• позитивная регуляция ацетилирования белка
• негативная регуляция индуцированного холодом термогенеза
• импорт протеина в ядро
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

406

11865

Ансамбль

ENSG00000133794

ENSMUSG00000055116

UniProt

O00327

Q9WTL8

RefSeq (мРНК)
NM_001030272
NM_001030273
NM_001178
NM_001297719
NM_001297722

NM_001297724

NM_001243048
NM_007489
NM_001357070
NM_001368412
NM_001374642

RefSeq (белок)
NP_001025443
NP_001025444
NP_001169
NP_001284648
NP_001284651

NP_001284653
NP_001338733
NP_001338734
NP_001338735
NP_001338736
NP_001338737
NP_001338738
NP_001338739
NP_001338740
NP_001338741
NP_001338742
NP_001338743
NP_001338744
NP_001338745
NP_001338746
NP_001338747
NP_001338748
NP_001338749
NP_001338750
NP_001338751
NP_001338752
NP_001338753

NP_001229977
NP_031515
NP_001343999
NP_001355341
NP_001361571

Расположение (UCSC)н / дChr 7: 113.21 - 113.31 Мб
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Арил углеводородного рецептора ядерного транслокатор-подобный белок 1 (ARNTL) или головном мозге и мышцах ARNT-Like 1 (BMAL1) представляет собой белок , который у человека кодируется BMAL1 геном , также известный как ARNTL , MOP3 , и, реже, BHLHE5, BMAL, BMAL1C, JAP3, PASD3 и TIC.

BMAL1 кодирует фактор транскрипции с основной спиралью-петлей-спиралью (bHLH) и двумя доменами PAS . Ген Arntl человека имеет предполагаемые 24 экзона и расположен на полосе p15 11-й хромосомы . [4] Белок BMAL1 состоит из 626 аминокислот и играет ключевую роль в качестве одного из положительных элементов в саморегулирующейся петле обратной связи (TTFL) млекопитающих, которая отвечает за формирование молекулярных циркадных ритмов . Исследования показали, что Bmal1является единственным часовым геном, без которого циркадные часы не могут функционировать у человека. [5] BMAL1 также был идентифицирован как ген - кандидат для восприимчивости к гипертензии , диабета и ожирения , [6] [7] и мутации в BMAL1 были связаны с бесплодием , глюконеогенеза и липогенеза проблем, и измененными сна шаблонов. [8] BMAL1, согласно полногеномному профилированию, нацелен на более чем 150 сайтов в геноме человека, включая все гены часов и гены, кодирующие белки, регулирующие метаболизм.[9]

История [ править ]

Ген Arntl был первоначально открыт в 1997 году двумя группами исследователей: John B. Hogenesch et al. в марте под названием Mop3 [10] и Ikeda и Nomura в апреле [11] как часть суперсемейства факторов транскрипции домена PAS. [10] В 1998 году дополнительная характеристика MOP3, проведенная Хогенешем, показала, что его роль в качестве партнера фактора транскрипции bHLH-PAS CLOCK важна для функции циркадных часов млекопитающих. [12] Было обнаружено, что белок MOP3, как он был первоначально известен группой Hogenesch, димеризуется под действием MOP4, CLOCK и факторов, индуцируемых гипоксией .[10] Названия BMAL1 и ARNTL были приняты в более поздних статьях. Одним из первых открытых функций ARNTL белка в регуляции циркадного была связана с ЧАСЫ-BMAL1 (ЧАСЫ-ARNTL) гетеродимера , который будет связываться через Е-бокс энхансерчтобы активировать транскрипцию в гене AVP , который кодирует вазопрессина . [13] Однако важность гена в циркадных ритмах не была полностью осознана до тех пор, пока нокаут гена у мышей не показал полную потерю циркадных ритмов в локомоции и других формах поведения. [14]

Генетика [ править ]

Регулирование активности Bmal1 [ править ]

SIRT1 регулирует деградацию белка PER путем ингибирования транскрипционной активности гетеродимера BMAL1: CLOCK циркадным образом посредством деацетилирования . [15] Распад белков PER предотвращает образование большого белкового комплекса и, таким образом, подавляет транскрипционную активность гетеродимера BMAL1: CLOCK . Белок CRY также сигнализирует о деградации за счет полиубиквитинирования из белка FBXL3, что приводит к растормаживанию активности гетеродимера BMAL1: CLOCK . [16]

В дополнении к циркадной регуляторной петле TTFL, BMAL1 транскрипция регулируются с помощью конкурентного связывания с кислотой ретиноевым о связанных рецепторах сиротого отклика элемента-связывающего сайт (RORE) в пределах промотора BMAL1 . Гетеродимер CLOCK / BMAL1 также связывается с элементами E-бокса в промоторных областях генов Rev-Erbα и RORα / ß, повышая регуляцию транскрипции и трансляции белков REV-ERB и ROR. Белки REV-ERBα и ROR регулируют экспрессию BMAL1 через вторичную петлю обратной связи и конкурируют за связывание с элементами ответа Rev-Erb / ROR в Bmal1.промотор, в результате чего экспрессия BMAL1 подавляется REV-ERBα и активируется белками ROR. Другие ядерные рецепторы одних и тех же семейств ( NR1D2 ( Rev-ERB-β ); NR1F2 (ROR-β), и NR1F3 (ROR-γ)), также было показано, действуют на BMAL1 транскрипционной активности аналогичным образом. [17] [18] [19] [20]

Несколько посттрансляционных модификаций BMAL1 диктуют синхронизацию петель обратной связи CLOCK / BMAL1. Фосфорилирование BMAL1 нацелено на убиквитинирование и деградацию, а также на деубиквитинирование и стабилизацию. Ацетилирование BMAL1 задействует CRY1 для подавления трансактивации CLOCK / BMAL1. [21] сумоилирование из BMAL1 небольшого убиквитин связанного модификатора 3 сигналов его убиквитинирование в ядре, что приводит к трансактивации от ЧАСЫ / BMAL1 гетеродимер. [22] Трансактивация CLOCK / BMAL1, [23]активируется фосфорилированием казеинкиназой 1ε и ингибируется фосфорилированием MAPK. [24] Фосфорилирование CK2α регулирует внутриклеточную локализацию BMAL1 [25], а фосфорилирование GSK3B контролирует стабильность BMAL1 и настраивает его для убиквитинирования . [26]

В 2004 году было обнаружено , что Rora является активатором транскрипции Bmal1 в супрахиазматическом ядре (SCN), регулируемой его основными часами. [27] Было обнаружено, что Rora необходим для нормальной экспрессии Bmal1, а также для консолидации ежедневной двигательной активности. [27] Это говорит о том, что противоборствующие деятельность сирота ядерных рецепторов Rora и REV-ERBα, последний из которых репрессирует BMAL1 выражения, играют важную роль в поддержании циркадного функции часов. [27] В настоящее время Рора исследуется на предмет связи с аутизмом , что может быть следствием его функции в качестве регулятора циркадных ритмов.[28]

Резюме регулирования активности Bmal1
Регулятор / модификатор Bmal1Положительный или отрицательный регуляторПрямой или косвенныйМеханизмИсточник (и)
SIRT1ОтрицательныйПрямойBMAL1: ЧАСЫ гетеродимерного деацетилирования[15]
FBLX3ПоложительныйКосвенныйПолиубиквитинирование PER способствует деградации PER[16]
REV-ERBα / βОтрицательныйПрямойРепрессия путем связывания промотора Bmal1[18] [19] [20]
ROR-α / β / γПоложительныйПрямойАктивация путем связывания промотора Bmal1[17] [18] [19] [27]
АцетилированиеОтрицательныйПрямойРекрутирует CRY1 для ингибирования гетеродимера BMAL1: CLOCK[21]
Малый модификатор, связанный с убиквитином 3ПоложительныйПрямойСумоилирование BMAL1[22]
Казеинкиназа 1εПоложительныйПрямойФосфорилирование гетеродимера CLOCK / BMAL1[23]
MAPKПоложительныйПрямойФосфорилирование гетеродимера CLOCK / BMAL1[24]
CK2αНеясноПрямойФосфорилирование BMAL1[25]
GSK3BПоложительныйПрямойФосфорилирование BMAL1[26]

Распространение видов [ править ]

Наряду с млекопитающими , такими как люди и мышей, ортологи по Arntl гену также найдены в рыбе (AF144690.1), [29] птицы ( Arntl ), [30] рептилии, амфибии (XI.2098), и Drosophila ( цикл , который кодирует белок, у которого отсутствует гомологичный C-концевой домен, но все еще димеризуется с белком CLOCK). [31] В отличие от Arntl млекопитающих , у которых циркадные ритмы регулируются, цикл (ген) дрозофилы экспрессируется конститутивно. [32] У человека были обнаружены три варианта транскрипта, кодирующие две разные изоформы этого гена. [11] Важность этих вариантов транскрипта неизвестна.

Мутации и болезни [ править ]

Ген Arntl расположен в локусах предрасположенности к гипертонии хромосомы 1 у крыс. Изучение однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) в этих локусах обнаружило два полиморфизма, которые встречаются в последовательности, кодирующей Arntl, и были связаны с диабетом типа II и гипертонией . При переводе с модели на крысах на модель человека это исследование предполагает причинную роль вариации гена Arntl в патологии диабета типа II. [33] Недавние данные фенотипа также предполагают, что этот ген [34] и его партнер Clock [35] играют роль в регуляции гомеостаза глюкозы.и метаболизм, который при нарушении может привести к гипоинсулинемии или диабету. [36]

Что касается других функций, другое исследование показывает, что комплекс CLOCK / BMAL1 активирует активность промотора LDLR человека , предполагая, что ген Arntl также играет роль в гомеостазе холестерина . [37] Кроме того, было показано, что BMAL1 влияет на возбудимость и судорожный порог. [38] Кроме того, было обнаружено , что экспрессия гена Arntl , наряду с экспрессией других генов основных часов, ниже у пациентов с биполярным расстройством , что указывает на проблемы с циркадной функцией у этих пациентов. [39] SNP в Bmal1 был идентифицирован как имеющий связь с биполярным расстройством. [40] Арнтл, Npas2 и Per2 также были связаны с сезонным аффективным расстройством у людей. [41] Пациенты с болезнью Альцгеймера имеют разные ритмы метилирования BMAL1, что позволяет предположить, что его неправильная регуляция способствует когнитивному дефициту. [42] Исследования также показали, что BMAL1 и другие гены часов управляют экспрессией генов, контролируемых часами, которые связаны с расстройством аутистического спектра (РАС). [43] Наконец, Arntl был идентифицирован посредством функционального генетического скрининга в качестве предполагаемого регулятора пути опухолевого супрессора p53, что позволяет предположить потенциальное участие в циркадных ритмах, проявляемых раковыми клетками.[44]

На животных моделях рассеянного склероза (РС), а именно на модели экспериментального аутоиммунного энцефаломиелита (EAE), было показано, что суточные циркадные ритмы могут играть важную роль в патологии заболевания. [45] Индуцирование EAE посредством активной иммунизации мышей пептидом миелинового олигодендроцитарного гликопротеина (MOG) во время фазы покоя более эффективно по сравнению с таковой во время активной фазы. [46] Неравенство в индукции EAE критически зависит от экспрессии BMAL1 в Т-клетках и миелоидных клетках . Т-клеточная или миелоид-специфическая делеция Bmal1было показано, что он вызывает более тяжелую патологию и достаточен для отмены эффекта покоя по сравнению с активным индукционным эффектом. [46]

Структура [ править ]

Белок BMAL1 содержит четыре домена в соответствии с его кристаллографической структурой: домен bHLH , два домена PAS, называемые PAS-A и PAS-B, и трансактивирующий домен . Димеризация белков CLOCK: BMAL1 включает сильные взаимодействия между доменами bHLH, PAS A и PAS B как CLOCK, так и BMAL1 и формирует асимметричный гетеродимер с тремя различными интерфейсами белков. Взаимодействие PAS-A между CLOCK и BMAL1 включает взаимодействие, при котором α-спираль CLOCK PAS-A и ß-лист BMAL1 PAS-A, а также мотив α-спирали домена PAS-A BMAL1 и ß-лист ЧАСОВ ПАС-А. [47]Домены CLOCK и BMAL1 PAS-B складываются параллельно, что приводит к сокрытию различных гидрофобных остатков на ß-листе BMAL1 PAS-B и спиральной поверхности CLOCK PAS-B, таких как Tyr 310 и Phe 423. [ 47] Ключевые взаимодействия со специфическими аминокислотными остатками, особенно с CLOCK His 84 и BMAL1 Leu 125, важны в димеризации этих молекул. [48]

Функция [ править ]

Циркадные часы [ править ]

Белок, кодируемый геном Bmal1 у млекопитающих, связывается со вторым белком bHLH-PAS через домен PAS, CLOCK (или его паралог, NPAS2 ), с образованием гетеродимера в ядре. [16] Через свой домен BHLH этот гетеродимер связывается с элементами ответа E-box [16] в промоторных областях генов Per ( Per1 и Per2 ) и Cry ( Cry1 и Cry2 ). [16] Это связывание активирует транскрипцию Per1 , Per2 , Cry1 иМРНК Cry2.

Петли TTFL активности Bmal1

После того, как белки PER и CRY накапливаются до достаточного уровня, они взаимодействуют своими мотивами PAS с образованием большого репрессорного комплекса, который перемещается в ядро, чтобы ингибировать транскрипционную активность гетеродимера CLOCK: BMAL1 [49]. Это ингибирует гетеродимерную активацию транскрипция генов Per и Cry и вызывает снижение уровня белков PER и CRY. Эта петля отрицательной обратной связи транскрипции-трансляции (TTFL) модулируется в цитоплазме путем фосфорилирования белков PER казеинкиназой 1ε или δ ( CK1 ε или CK1 δ), нацеливая эти белки на деградацию протеасомой 26S. [16] [50]Петля TTFL ночных мышей, уровни транскрипции гена Bmal1 достигают пика на CT18 в середине субъективной ночи, противофазно уровням транскрипции Per , Cry и других генов контроля часов, которые достигают пика на CT6 в середине периода. субъективный день. Этот процесс происходит с периодом около 24 часов и подтверждает представление о ритмичности этого молекулярного механизма. [51]

Исследования нокаутов [ править ]

Ген Arntl является важным компонентом регуляторной сети генов часов млекопитающих. Это точка чувствительности в сети, поскольку это единственный ген, единичный нокаут которого в мышиной модели вызывает аритмичность как на молекулярном, так и на поведенческом уровнях. [14] В дополнение к дефектам часов, эти Arntl- нулевые мыши также имеют проблемы с репродукцией, [52] малы ростом, быстро стареют [53] и имеют прогрессирующую артропатию [54], что приводит к снижению общей двигательной активности. чем у мышей дикого типа. Однако недавние исследования показывают, что может быть некоторая избыточность в циркадной функции Arntl с его паралогом.Bmal2 . [55] BMAL1 KO не является эмбрионально летальным, и мыши с BMAL1, удаленным во взрослом возрасте, не проявляют симптомов мышей BMAL1 KO. [56]

Связывание BMAL1 тканеспецифично регулируется множеством факторов, включая не циркадные. [57] Далее тканеспецифичные КО вызывают уникальные эффекты. Было показано, что BMAL1 играет важную роль в метаболизме костей, поскольку остеобласты мышей BMAL1 KO имеют меньшую костную массу, чем их аналоги дикого типа. [58] Это также важно для энергетического метаболизма, поскольку BMAL1 модулирует регуляцию метаболитов в печени, секрецию инсулина и пролиферацию островков поджелудочной железы, а также дифференцировку адипоцитов и липогенез. [42] Любопытно, что глобальный KO BMAL1 не влияет на активность упреждающего приема пищи (FAA) у мышей, но делеции BMAL1 в определенных областях гипоталамуса за пределами SCN устраняют FAA.[59] Нокаут-исследования показали, что BMAL1 является ключевым посредником между циркадными часами и реакцией иммунной системы. Потерярегуляции Ccl2 , BMAL1 KO в миелоидных клетках приводит к затрудненномурекрутированию моноцитов , клиренсу патогенов и противовоспалительному ответу (в соответствии с фенотипом артропатии). [60] Иммунные клетки, такие как TNF-α и IL-1β,  реципрокно репрессируют активность BMAL1. [60] Наконец, взаимодействия BMAL1 с HSF1 запускают синхронизацию часов и высвобождение факторов, способствующих выживанию, подчеркивая вклад BMAL1 в клеточный стресс и реакции на выживание. [61]

BMAL1- дефицитные кардиомиоциты, производные hESC, проявляли типичные фенотипы дилатационной кардиомиопатии, включая ослабленную сократительную способность, дисрегуляцию кальция и дезорганизованные миофиламенты. Кроме того, деление митохондрий и митофагия подавлялись в hESC-кардиомиоцитах с дефицитом BMAL1 , что приводило к значительному ослаблению окислительного фосфорилирования митохондрий и нарушению функции кардиомиоцитов. [62]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что Arntl взаимодействует с:

  • Арилуглеводородный рецептор [10]
  • ЧАСЫ [63] [64] [65]
  • CREBBP [66] [67]
  • CRY1 [67]
  • EP300 [67]
  • EPAS1 [63]
  • HIF1A [63]
  • NPAS2 [63] [65]
  • SUMO3 [22]
  • БНИП3 [62]

См. Также [ править ]

  • Arntl2 - Arntl2 (Bmal2) является паралогом Arntl (Bmal1), который кодирует фактор транскрипции основного домена PAS спираль-петля-спираль. Было показано, что он также играет циркадную роль, поскольку его белок BMAL2 образует транскрипционно активный гетеродимер с белком CLOCK. Это также может сыграть роль в гипоксии. [68]
  • Цикл - Цикл является ортологом Arntl Drosophila melanogaster .

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000055116 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "ARNTL арилуглеводородный рецептор, подобный ядерному транслокатору [Homo sapiens (человек)]" . Национальный центр биотехнологической информации .
  5. ^ Репперт SM, Weaver DR (август 2002). «Координация суточного ритма у млекопитающих». Природа . 418 (6901): 935–41. Bibcode : 2002Natur.418..935R . DOI : 10,1038 / природа00965 . PMID 12198538 . S2CID 4430366 .  
  6. ^ Pappa К.И., Gazouli M, Anastasiou E, Iliodromiti Z, Antsaklis A, Anagnou NP (февраль 2013 г. ). «Главный циркадный кардиостимулятор ARNT-подобный протеин-1 (BMAL1) связан с предрасположенностью к гестационному сахарному диабету». Исследования диабета и клиническая практика . 99 (2): 151–7. DOI : 10.1016 / j.diabres.2012.10.015 . PMID 23206673 . 
  7. ^ Richards J, Diaz А.Н., Gumz ML (октябрь 2014). «Гены часов при гипертонии: новые идеи на моделях грызунов» . Мониторинг артериального давления . 19 (5): 249–54. DOI : 10.1097 / MBP.0000000000000060 . PMC 4159427 . PMID 25025868 .  
  8. ^ "Ген ARNTL" . Генные карты: Сборник генома человека . Lifemap Sciences, Inc.
  9. ^ Хатанак Р, Мацубар С, Мен Дж, Yoritaka Т, Камимура Н, Цуцуе С, и др. (Декабрь 2010 г.). «Полногеномное профилирование основных тактовых белков-мишеней BMAL1 показывает тесную связь с метаболизмом» . Молекулярная и клеточная биология . 30 (24): 5636–48. DOI : 10.1128 / MCB.00781-10 . PMC 3004277 . PMID 20937769 .  
  10. ^ a b c d Hogenesch JB, Chan WK, Jackiw VH, Brown RC, Gu YZ, Pray-Grant M, et al. (Март 1997 г.). «Характеристика подмножества суперсемейства basic-helix-loop-helix-PAS, которое взаимодействует с компонентами пути передачи сигналов диоксина» . Журнал биологической химии . 272 (13): 8581–93. DOI : 10.1074 / jbc.272.13.8581 . PMID 9079689 . 
  11. ^ а б Икеда М., Номура М. (апрель 1997 г.). «Клонирование кДНК и тканеспецифическая экспрессия нового основного белка спираль-петля-спираль / PAS (BMAL1) и идентификация альтернативно сплайсированных вариантов с использованием альтернативного сайта инициации трансляции». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 233 (1): 258–64. DOI : 10.1006 / bbrc.1997.6371 . PMID 9144434 . 
  12. Перейти ↑ Ko CH, Takahashi JS (октябрь 2006 г.). «Молекулярные компоненты циркадных часов млекопитающих» . Молекулярная генетика человека . 15 Спец. № 2 (прил_2): Р271-7. DOI : 10,1093 / HMG / ddl207 . PMID 16987893 . 
  13. Перейти ↑ Jin X, Shearman LP, Weaver DR, Zylka MJ, de Vries GJ, Reppert SM (январь 1999 г.). «Молекулярный механизм, регулирующий ритмический выход супрахиазматических циркадных часов». Cell . 96 (1): 57–68. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80959-9 . PMID 9989497 . S2CID 6916996 .  
  14. ^ a b Bunger MK, Wilsbacher LD, Moran SM, Clendenin C, Radcliffe LA, Hogenesch JB и др. (Декабрь 2000 г.). «Mop3 является важным компонентом главного кардиостимулятора циркадных ритмов у млекопитающих» . Cell . 103 (7): 1009–17. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 00205-1 . PMC 3779439 . PMID 11163178 .  
  15. ^ а б Ашер Г., Гатфилд Д., Стратманн М., Рейнке Х., Дибнер С., Креппель Ф. и др. (Июль 2008 г.). «SIRT1 регулирует экспрессию гена циркадных часов посредством деацетилирования PER2». Cell . 134 (2): 317–28. DOI : 10.1016 / j.cell.2008.06.050 . PMID 18662546 . S2CID 17267748 .  
  16. ^ Б с д е е Buhr ED, Takahashi JS (2013). «Молекулярные компоненты циркадных часов млекопитающих». Циркадные часы . Справочник по экспериментальной фармакологии. 217 . С. 3–27. DOI : 10.1007 / 978-3-642-25950-0_1 . ISBN 978-3-642-25949-4. PMC  3762864 . PMID  23604473 .
  17. ^ a b Акаси М., Такуми Т. (май 2005 г.). «Орфанный ядерный рецептор RORalpha регулирует циркадную транскрипцию основных часов Bmal1 млекопитающих». Структурная и молекулярная биология природы . 12 (5): 441–8. DOI : 10.1038 / nsmb925 . PMID 15821743 . S2CID 20040952 .  
  18. ^ a b c Guillaumond F, Dardente H, Giguère V, Cermakian N (октябрь 2005 г.). «Дифференциальный контроль циркадной транскрипции Bmal1 с помощью ядерных рецепторов REV-ERB и ROR». Журнал биологических ритмов . 20 (5): 391–403. DOI : 10.1177 / 0748730405277232 . PMID 16267379 . S2CID 33279857 .  
  19. ^ а б в Уэда Х.Р., Хаяши С., Чен В., Сано М., Мачида М., Шигеоши Ю. и др. (Февраль 2005 г.). «Идентификация на системном уровне транскрипционных схем, лежащих в основе циркадных часов млекопитающих». Генетика природы . 37 (2): 187–92. DOI : 10.1038 / ng1504 . PMID 15665827 . S2CID 18112337 .  
  20. ^ a b Лю А.С., Тран Х.Г., Чжан Э.Э., Священник А.А., Валлийский округ Колумбия, Кей С.А. (февраль 2008 г.). «Избыточная функция REV-ERBalpha и beta и несущественная роль для цикла Bmal1 в регуляции транскрипции внутриклеточных циркадных ритмов» . PLoS Genetics . 4 (2): e1000023. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1000023 . PMC 2265523 . PMID 18454201 .  
  21. ^ a b Хираяма Дж, Сахар С., Гримальди Б., Тамару Т., Такамацу К., Накахата Ю., Сассоне-Корси П. (декабрь 2007 г.). «ЧАСОВО-опосредованное ацетилирование BMAL1 контролирует циркадную функцию». Природа . 450 (7172): 1086–90. Bibcode : 2007Natur.450.1086H . DOI : 10,1038 / природа06394 . PMID 18075593 . S2CID 4340848 .  
  22. ^ a b c Ли Дж, Ли Й, Ли MJ, Пак Э, Кан Ш., Чунг Ч. и др. (Октябрь 2008 г.). «Двойная модификация BMAL1 с помощью SUMO2 / 3 и убиквитина способствует циркадной активации комплекса CLOCK / BMAL1» . Молекулярная и клеточная биология . 28 (19): 6056–65. DOI : 10.1128 / MCB.00583-08 . PMC 2546997 . PMID 18644859 .  
  23. ^ a b Eide EJ, Vielhaber EL, Hinz WA, Virshup DM (май 2002 г.). «Циркадные регуляторные белки BMAL1 и криптохромы являются субстратами казеинкиназы Iepsilon» . Журнал биологической химии . 277 (19): 17248–54. DOI : 10,1074 / jbc.m111466200 . PMC 1513548 . PMID 11875063 .  
  24. ^ a b Санада К., Окано Т., Фукада Y (январь 2002 г.). «Активированная митогеном протеинкиназа фосфорилирует и отрицательно регулирует основной фактор транскрипции« спираль-петля-спираль-PAS »BMAL1» . Журнал биологической химии . 277 (1): 267–71. DOI : 10,1074 / jbc.m107850200 . PMID 11687575 . 
  25. ^ a b Тамару Т., Хираяма Дж, Исодзима Ю., Нагаи К., Нориока С., Такамацу К., Сассоне-Корси П. (апрель 2009 г.). «CK2alpha фосфорилирует BMAL1 для регулирования часов млекопитающих» . Структурная и молекулярная биология природы . 16 (4): 446–8. DOI : 10.1038 / nsmb.1578 . PMC 6501789 . PMID 19330005 .  
  26. ^ а б Сахар С., Зоччи Л., Киношита С., Боррелли Е., Сассоне-Корси П. (январь 2010 г.). «Регулирование стабильности белка BMAL1 и циркадной функции посредством GSK3beta-опосредованного фосфорилирования» . PLOS ONE . 5 (1): e8561. Bibcode : 2010PLoSO ... 5.8561S . DOI : 10.1371 / journal.pone.0008561 . PMC 2797305 . PMID 20049328 .  
  27. ^ a b c d Sato TK, Panda S, Miraglia LJ, Reyes TM, Rudic RD, McNamara P и др. (Август 2004 г.). «Стратегия функциональной геномики показывает Rora как компонент циркадных часов млекопитающих». Нейрон . 43 (4): 527–37. DOI : 10.1016 / j.neuron.2004.07.018 . PMID 15312651 . S2CID 8938983 .  
  28. Перейти ↑ Nguyen A, Rauch TA, Pfeifer GP, Hu VW (август 2010). «Глобальное профилирование метилирования линий лимфобластоидных клеток выявляет эпигенетический вклад в расстройства аутистического спектра и новый ген-кандидат аутизма, RORA, белковый продукт которого снижен в головном мозге аутистов» . Журнал FASEB . 24 (8): 3036–51. DOI : 10.1096 / fj.10-154484 . PMC 2909294 . PMID 20375269 .  
  29. ^ Cermakian N, D Уитмор, Foulkes Н.С., Sassone-Корси P (апрель 2000). «Асинхронные колебания двух партнеров ЧАСОВ рыбок данио показывают дифференциальное управление и функцию часов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (8): 4339–44. Bibcode : 2000PNAS ... 97.4339C . DOI : 10.1073 / pnas.97.8.4339 . ЧВК 18243 . PMID 10760301 .  
  30. ^ Окано Т., Ямамото К., Окано К., Хирота Т., Касахара Т., Сасаки М. и др. (Сентябрь 2001 г.). «Гены часов шишковидной железы курицы: участие BMAL2 как двунаправленного регулятора в колебаниях циркадных часов». Гены в клетки . 6 (9): 825–36. DOI : 10.1046 / j.1365-2443.2001.00462.x . PMID 11554928 . 
  31. ^ Rutila JE, Suri V, Le M, так WV, Rosbash M, Hall JC (май 1998). «CYCLE - это второй часовой белок bHLH-PAS, необходимый для циркадной ритмичности и транскрипции периода дрозофилы и вне времени». Cell . 93 (5): 805–14. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81441-5 . PMID 9630224 . S2CID 18175560 .  
  32. ^ Мейрелеш-Filho AC, Amoretty PR, Souza Н.А., Kyriacou CP, Пейкшото AA (октябрь 2006). «Ритмическая экспрессия гена цикла в векторе гематофаговых насекомых» . BMC Molecular Biology . 7 : 38. DOI : 10,1186 / 1471-2199-7-38 . PMC 1636064 . PMID 17069657 .  
  33. ^ Вун PY, Kaisaki PJ, Bragança J, Bihoreau MT, Леви JC, Farrall M, Gauguier D (сентябрь 2007). «Ядерный транслокатор рецептора арилуглеводородов (BMAL1) связан с предрасположенностью к гипертонии и диабету 2 типа» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (36): 14412–7. Bibcode : 2007PNAS..10414412W . DOI : 10.1073 / pnas.0703247104 . PMC 1958818 . PMID 17728404 .  
  34. ^ Рудик RD, Макнамара P, Curtis AM, Boston RC, Panda S, Hogenesch JB, Fitzgerald Г.А. (ноябрь 2004). «BMAL1 и CLOCK, два важных компонента циркадных часов, участвуют в гомеостазе глюкозы» . PLoS Биология . 2 (11): e377. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0020377 . PMC 524471 . PMID 15523558 .  
  35. ^ Турек Ф.В., Джошу С., Косака А., Линь Е., Иванова Г., МакДирмон Е. и др. (Май 2005 г.). «Ожирение и метаболический синдром у мутантных мышей по циркадным часам» . Наука . 308 (5724): 1043–5. Bibcode : 2005Sci ... 308.1043T . DOI : 10.1126 / science.1108750 . PMC 3764501 . PMID 15845877 .  
  36. ^ Марчева Б., Рэмси К.М., Бур ЭД, Кобаяши Ю., Су Х, Ко Ч. и др. (Июль 2010 г.). «Нарушение работы компонентов часов CLOCK и BMAL1 приводит к гипоинсулинемии и диабету» . Природа . 466 (7306): 627–31. Bibcode : 2010Natur.466..627M . DOI : 10,1038 / природа09253 . PMC 2920067 . PMID 20562852 .  
  37. ^ Ли YJ, Хан DH, Пак Ю.К., Cho SH (ноябрь 2012). «Циркадная регуляция активности промотора рецептора липопротеинов низкой плотности с помощью CLOCK / BMAL1, Hes1 и Hes6» . Экспериментальная и молекулярная медицина . 44 (11): 642–52. DOI : 10.3858 / emm.2012.44.11.073 . PMC 3509181 . PMID 22913986 .  
  38. ^ Хан S, Нобили л, Хатами Р, Т Loddenkemper, Cajochen С, Дейк ди - джей, Эриксон SH (декабрь 2018). «Циркадный ритм и эпилепсия». Ланцет. Неврология . 17 (12): 1098–1108. DOI : 10.1016 / S1474-4422 (18) 30335-1 . PMID 30366868 . S2CID 53101791 .  
  39. ^ Ян S, Ван Донген HP, Ван K, Berrettini W, Bućan M (февраль 2009). «Оценка циркадной функции фибробластов у пациентов с биполярным расстройством» . Молекулярная психиатрия . 14 (2): 143–55. DOI : 10.1038 / mp.2008.10 . PMID 18301395 . 
  40. ^ Шаррье А, Olliac В, Р Roubertoux, Tordjman S (апрель 2017 г.). «Гены часов и измененные ритмы сна и бодрствования: их роль в развитии психических расстройств» . Международный журнал молекулярных наук . 18 (5): 938. DOI : 10,3390 / ijms18050938 . PMC 5454851 . PMID 28468274 .  
  41. ^ Партонен Т., Трейтлейн Дж, Альпман А., Франк Дж., Йоханссон С., Депнер М. и др. (2007). «Три гена циркадных часов Per2, Arntl и Npas2 способствуют зимней депрессии». Анналы медицины . 39 (3): 229–38. DOI : 10.1080 / 07853890701278795 . PMID 17457720 . S2CID 36387074 .  
  42. ^ a b Maiese K (25 августа 2017 г.). «Переход к ритму с генами часов (циркадных), аутофагией, mTOR и SIRT1 при дегенеративных заболеваниях и раке» . Текущие нейрососудистые исследования . 14 (3): 299–304. DOI : 10.2174 / 1567202614666170718092010 . PMC 5600856 . PMID 28721811 .  
  43. ^ Geoffray М.М., Николя А, Сперанс М, Н Georgieff (ноябрь 2016). «Являются ли циркадные ритмы новыми путями для понимания расстройства аутистического спектра?». Журнал физиологии, Париж . 110 (4 Pt B): 434–438. DOI : 10.1016 / j.jphysparis.2017.06.002 . PMID 28625682 . S2CID 28295989 .  
  44. ^ Mullenders Дж, Фабия AW, Madiredjo М, Бернардс R, Beijersbergen RL (2009). «Широкомасштабный экран штрих-кода shRNA идентифицирует компонент циркадных часов ARNTL как предполагаемый регулятор пути подавления опухоли p53» . PLOS ONE . 4 (3): e4798. Bibcode : 2009PLoSO ... 4.4798M . DOI : 10.1371 / journal.pone.0004798 . PMC 2653142 . PMID 19277210 .  
  45. ^ Druzd Д, Матвеева О, Инс л, Харрисон U, он Вт, Шмаль С. и др. (Январь 2017 г.). «Циркадные часы лимфоцитов контролируют перемещение лимфатических узлов и адаптивные иммунные ответы» . Иммунитет . 46 (1): 120–132. DOI : 10.1016 / j.immuni.2016.12.011 . PMC 5263259 . PMID 28087238 .  
  46. ^ а б Де Сомма Э, Джайн Р. В., Пун К. В., Тресиддер К. А., Сегал Дж. П., Гасемлу Н. (май 2018 г.). «Хронобиологическая регуляция психосоциальных и физиологических исходов при рассеянном склерозе». Неврология и биоповеденческие обзоры . 88 : 73–83. DOI : 10.1016 / j.neubiorev.2018.03.011 . PMID 29548931 . S2CID 3910164 .  
  47. ^ а б Хуанг Н., Челлия И, Шан И, Тейлор К.А., Ю Ш, Партч С. и др. (Июль 2012 г.). «Кристаллическая структура гетеродимерного комплекса транскрипционных активаторов CLOCK: BMAL1» . Наука . 337 (6091): 189–94. Bibcode : 2012Sci ... 337..189H . DOI : 10.1126 / science.1222804 . PMC 3694778 . PMID 22653727 .  
  48. Перейти ↑ Wang Z, Wu Y, Li L, Su XD (февраль 2013 г.). «Межмолекулярное распознавание, выявленное сложной структурой основных доменов спираль-петля-спираль человека CLOCK-BMAL1 с E-box ДНК» . Клеточные исследования . 23 (2): 213–24. DOI : 10.1038 / cr.2012.170 . PMC 3567813 . PMID 23229515 .  
  49. ^ Боллинджер Т, Schibler U (2014). «Циркадные ритмы - от генов до физиологии и болезней» . Швейцарский медицинский еженедельник . 144 : w13984. DOI : 10.4414 / smw.2014.13984 . PMID 25058693 . 
  50. ^ Maywood ES, Чешам JE, Smyllie NJ, Hastings MH (апрель 2014). «Тау-мутация казеинкиназы 1ε устанавливает период пейсмекера млекопитающих посредством регуляции тактовых белков Period1 или Period2» . Журнал биологических ритмов . 29 (2): 110–8. DOI : 10.1177 / 0748730414520663 . PMC 4131702 . PMID 24682205 .  
  51. ^ Ueda HR, Chen W, Adachi A, Wakamatsu H, Hayashi S, Takasugi T и др. (Август 2002 г.). «Элемент ответа фактора транскрипции для экспрессии генов в течение суточной ночи». Природа . 418 (6897): 534–9. Bibcode : 2002Natur.418..534U . DOI : 10,1038 / природа00906 . PMID 12152080 . S2CID 4406987 .  
  52. ↑ Boden MJ, Kennaway DJ (сентябрь 2006 г.). «Циркадные ритмы и воспроизведение» . Репродукция . 132 (3): 379–92. DOI : 10,1530 / rep.1.00614 . PMID 16940279 . 
  53. ↑ Кондратов Р.В. (май 2007 г.). «Роль циркадной системы и циркадных белков в старении». Обзоры исследований старения . 6 (1): 12–27. DOI : 10.1016 / j.arr.2007.02.003 . PMID 17369106 . S2CID 5910503 .  
  54. ^ Bunger MK, Walisser JA, Sullivan R, Manley PA, Moran SM, Kalscheur VL и др. (Март 2005 г.). «Прогрессирующая артропатия у мышей с целевым нарушением локуса Mop3 / Bmal-1». Бытие . 41 (3): 122–32. DOI : 10.1002 / gene.20102 . PMID 15739187 . 
  55. ↑ Shi S, Hida A, McGuinness OP, Wasserman DH, Yamazaki S, Johnson CH (февраль 2010 г.). «Ген циркадных часов Bmal1 не является существенным; функциональная замена его паралогом, Bmal2» . Текущая биология . 20 (4): 316–21. DOI : 10.1016 / j.cub.2009.12.034 . PMC 2907674 . PMID 20153195 .  
  56. ^ Dierickx P, Ван Laake LW, Geijsen N (январь 2018). «Циркадные часы: от стволовых клеток к гомеостазу и регенерации тканей» . EMBO Reports . 19 (1): 18–28. DOI : 10.15252 / embr.201745130 . PMC 5757216 . PMID 29258993 .  
  57. ↑ Shostak A, Brunner M (март 2019). «Помощь моих друзей - сотрудничество BMAL1 с нециркадными факторами транскрипции» . Гены и развитие . 33 (5–6): 255–257. DOI : 10,1101 / gad.324046.119 . PMC 6411012 . PMID 30824531 .  
  58. ↑ Song C, Wang J, Kim B, Lu C, Zhang Z, Liu H и др. (27.09.2018). «Понимание роли циркадных ритмов в метаболизме костей: многообещающая цель вмешательства?» . BioMed Research International . 2018 : 9156478. дои : 10,1155 / 2018/9156478 . PMC 6180976 . PMID 30363685 .  
  59. ^ Каба М, J Мендоса (2018-05-24). «Поведение предвкушения пищи у новорожденных кроликов и грызунов: обновленная информация о роли генов часов» . Границы эндокринологии . 9 : 266. DOI : 10,3389 / fendo.2018.00266 . PMC 5976783 . PMID 29881373 .  
  60. ^ a b Curtis AM, Bellet MM, Sassone-Corsi P, O'Neill LA (февраль 2014 г.). «Белки циркадных часов и иммунитет» . Иммунитет . 40 (2): 178–86. DOI : 10.1016 / j.immuni.2014.02.002 . PMID 24560196 . 
  61. ^ Тамара Т, М Икеда (июль 2016). «Циркадная адаптация к стрессам повреждения клеток: важнейшее взаимодействие BMAL1 и HSF1». Журнал физиологических наук . 66 (4): 303–6. DOI : 10.1007 / s12576-016-0436-5 . PMID 26910317 . S2CID 5171959 .  
  62. ^ а б Ли Э, Ли Х, Хуанг Дж., Сюй Ц., Лян Ц., Рен К. и др. (Сентябрь 2020 г.). «BMAL1 регулирует деление митохондрий и митофагию через митохондриальный белок BNIP3 и имеет решающее значение в развитии дилатационной кардиомиопатии» . Белки и клетки . 11 (9): 661–679. DOI : 10.1007 / s13238-020-00713-х . PMC 7452999 . PMID 32277346 .  
  63. ^ a b c d Hogenesch JB, Gu YZ, Jain S, Bradfield CA (май 1998 г.). «Базовая спираль-петля-спираль-PAS сирота MOP3 образует транскрипционно активные комплексы с циркадными факторами и факторами гипоксии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (10): 5474–9. Bibcode : 1998PNAS ... 95.5474H . DOI : 10.1073 / pnas.95.10.5474 . PMC 20401 . PMID 9576906 .  
  64. ^ УНО N, Saito K, Миками N, Nakatuka I, Канеко H (январь 2004). «Идентификация нового основного фактора спираль-петля-спираль-PAS, NXF, выявляет конкурентную, позитивную регуляторную роль Sim2 в экспрессии гена дребрина, модулятора дендритного цитоскелета» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (2): 608–16. DOI : 10.1128 / MCB.24.2.608-616.2004 . PMC 343817 . PMID 14701734 .  
  65. ^ a b Макнамара П., Сео С.Б., Рудик Р.Д., Сегал А., Чакраварти Д., Фитцджеральд Г.А. (июнь 2001 г.). «Регулирование ЧАСОВ и MOP4 рецепторами ядерных гормонов в сосудистой сети: гуморальный механизм для сброса периферических часов». Cell . 105 (7): 877–89. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (01) 00401-9 . PMID 11439184 . S2CID 6251321 .  
  66. ^ Такахата S, Озаки Т, Мимура Дж, Кикучи Y, Sogawa К, Фуджи-Курияма Y (сентябрь 2000 г.). «Механизмы трансактивации факторов транскрипции часов мыши, mClock и mArnt3». Гены в клетки . 5 (9): 739–47. DOI : 10.1046 / j.1365-2443.2000.00363.x . PMID 10971655 . 
  67. ^ a b c Xu H, Gustafson CL, Sammons PJ, Khan SK, Parsley NC, Ramanathan C и др. (Июнь 2015 г.). «Криптохром 1 регулирует циркадные часы посредством динамического взаимодействия с С-концом BMAL1» . Структурная и молекулярная биология природы . 22 (6): 476–484. DOI : 10.1038 / nsmb.3018 . PMC 4456216 . PMID 25961797 .  
  68. ^ Hogenesch JB, Gu YZ, Moran С.М., Шимомура K, Рэдклифф Л.А., Takahashi JS, Bradfield CA (июль 2000). «Основной белок MOP9 спираль-петля-спираль-PAS является специфическим для мозга гетеродимерным партнером циркадных факторов и факторов гипоксии» . Журнал неврологии . 20 (13): RC83. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.20-13-j0002.2000 . PMC 6772280 . PMID 10864977 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • Человек ARNTL место генома и ARNTL ген подробно страницу в браузере УСК генома .
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O00327 (белок 1, подобный ядерному транслокатору человеческого арилуглеводородного рецептора) в PDBe-KB .
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9WTL8 (белок 1, подобный ядерному транслокатору мышиного арилуглеводородного рецептора) в PDBe-KB .