Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Основные этапы эксцизионной пластики основания

Базовая эксцизионная репарация ( BER ) - это клеточный механизм, изучаемый в области биохимии и генетики , который восстанавливает поврежденную ДНК на протяжении всего клеточного цикла. Он отвечает в первую очередь за удаление небольших, не искажающих спираль повреждений основания генома. Связанный с этим путь эксцизионной репарации нуклеотидов восстанавливает объемные повреждения, искажающие спираль. BER важен для удаления поврежденных оснований, которые в противном случае могли бы вызвать мутации из- за неправильного спаривания или привести к разрывам ДНК во время репликации. BER инициируется ДНК-гликозилазами , которые распознают и удаляют определенные поврежденные или неподходящие основания, образуя AP-сайты.. Затем они расщепляются эндонуклеазой AP . Полученный одноцепочечный разрыв затем может быть обработан либо коротким фрагментом (где заменяется один нуклеотид), либо длинным фрагментом BER (где синтезируются 2–10 новых нуклеотидов). [1]

Поражения, обработанные BER [ править ]

8-оксогуанин образует пару оснований Хугстина с аденином

Одиночные основания в ДНК могут быть химически повреждены множеством механизмов, наиболее распространенными из которых являются дезаминирование, окисление и алкилирование. Эти модификации могут влиять на способность основания образовывать водородные связи, что приводит к неправильному спариванию оснований и, как следствие, к мутациям в ДНК. Например, включение аденина напротив 8-оксогуанина (справа) во время репликации ДНК вызывает G: С пар оснований , чтобы быть заменена на Т: А. Другие примеры повреждений основания, восстановленные с помощью BER, включают:

В дополнение к повреждениям основания, нижележащие этапы BER также используются для восстановления однонитевых разрывов.

Выбор между долгим и коротким исправлением [ править ]

Выбор между коротким и длинным исправлением в настоящее время изучается. Считается, что на это решение влияют различные факторы, включая тип поражения, стадию клеточного цикла и то, является ли клетка окончательно дифференцированной или активно делящейся. [3] Некоторые поражения, такие как окисленные или восстановленные AP-сайты, устойчивы к активности пол-β-лиазы и, следовательно, должны обрабатываться с помощью BER с длинным участком.

Предпочтительные пути также могут различаться у разных организмов. В то время как клетки человека используют BER как с короткими, так и с длинными участками, долгое время считалось , что у дрожжей Saccharomyces cerevisiae отсутствует путь коротких участков, поскольку они не имеют гомологов нескольких белков с короткими участками млекопитающих, включая pol β, ДНК-лигазу III, XRCC1 , и киназный домен PNKP . Недавнее открытие, что поли-A-полимераза Trf4 обладает 5'-dRP-лиазной активностью, поставило под сомнение эту точку зрения. [4]

Белки, участвующие в эксцизионной репарации оснований [ править ]

ДНК гликозилазы [ править ]

Основная статья: ДНК-гликозилаза
Урацил-ДНК-гликозилаза переворачивает остаток урацила из дуплекса, показанный желтым.

ДНК-гликозилазы ответственны за первоначальное распознавание поражения. Они выворачивают поврежденное основание из двойной спирали, как показано на рисунке, и расщепляют N-гликозидную связь поврежденного основания, оставляя AP-сайт . Есть две категории гликозилаз: монофункциональные и бифункциональные. Монофункциональные гликозилазы обладают только гликозилазной активностью, тогда как бифункциональные гликозилазы также обладают активностью AP-лиазы . Следовательно, бифункциональные гликозилазы могут преобразовывать повреждение основания в одноцепочечный разрыв без необходимости в AP-эндонуклеазе . β-Удаление АР-сайта гликозилазой-лиазой дает 3 'α, β-ненасыщенный альдегид, соседний с 5' фосфатом, который отличается от продукта расщепления АР-эндонуклеазой. [5] Некоторые гликозилазы-лиазы могут дополнительно выполнять -элиминирование, которое превращает 3'-альдегид в 3'-фосфат. Широкий спектр гликозилаз эволюционировал для распознавания различных поврежденных оснований. Примеры ДНК-гликозилаз включают Ogg1 , который распознает 8-оксогуанин, Mag1 , который распознает 3-метиладенин, и UNG , который удаляет урацил из ДНК.

Эндонуклеазы AP [ править ]

Основная статья: эндонуклеаза AP

Эндонуклеазы АР расщепляют сайт АР с образованием 3'-гидроксила, соседнего с 5'-дезоксирибозофосфатом (dRP). Эндонуклеазы АР делятся на два семейства на основе их гомологии с предковыми бактериальными эндонуклеазами АР эндонуклеазой IV и экзонуклеазой III . [6] Многие эукариоты имеют представителей обоих семейств, включая дрожжи Saccharomyces cerevisiae , в которых Apn1 является гомологом EndoIV, а Apn2 родственен ExoIII. У человека были идентифицированы две эндонуклеазы АР, APE1 и APE2 . [7] Это член семейства ExoIII.


Ферменты конца обработки [ править ]

Для того, чтобы произошло лигирование, разрыв цепи ДНК должен иметь гидроксил на 3'-конце и фосфат на 5'-конце . У человека полинуклеотидкиназа-фосфатаза ( PNKP) способствует формированию этих концов во время BER. Этот белок имеет киназный домен, который фосфорилирует 5'-концы гидроксила, и фосфатазный домен, который удаляет фосфаты с 3'-концов. Вместе эти действия готовят одноцепочечные разрывы с поврежденными концами для лигирования. Эндонуклеазы AP также участвуют в процессинге 3'-концов. Помимо открытия AP-сайтов, они обладают 3'-фосфодиэстеразной активностью и могут удалять различные 3'-очаги, включая фосфаты, фосфогликолаты и альдегиды. 3'-Процессинг должен произойти до того, как может начаться синтез ДНК, потому что ДНК-полимеразы требуют, чтобы 3'-гидроксил продолжался.

ДНК-полимеразы [ править ]

Основная статья: ДНК-полимераза

Pol β является основной полимеразой человека, которая катализирует BER короткого участка, при этом pol λ способна компенсировать его отсутствие. [8] Эти полимеразы являются членами семейства Pol X и обычно включают только один нуклеотид. В дополнение к полимеразной активности эти ферменты имеют лиазный домен, который удаляет 5'-dRP, ​​оставшийся после расщепления AP-эндонуклеазой. Считается, что во время BER с длинным фрагментом синтез ДНК опосредуется pol δ и pol ε вместе с фактором процессивности PCNA , теми же полимеразами, которые осуществляют репликацию ДНК.. Эти полимеразы осуществляют замещающий синтез, что означает, что нижележащий 5'-конец ДНК «смещается», образуя лоскут (см. Диаграмму выше). Pol β также может выполнять синтез с замещением длинных участков и, следовательно, может участвовать в любом пути BER. [9] Синтез длинных участков обычно включает 2-10 новых нуклеотидов.

Эндонуклеаза лоскута [ править ]

Основная статья: эндонуклеаза лоскута

FEN1 удаляет 5 ' откидную створку, образовавшуюся во время длинного участка BER. Эта эндонуклеаза проявляет сильное предпочтение длинному 5-дюймовому лоскуту, примыкающему к 1-ному 3-дюймовому лоскуту. [10] Гомолог FEN1 у дрожжей - RAD27 . Помимо своей роли в BER с длинными участками, FEN1 расщепляет лоскуты с подобной структурой во время процессинга фрагмента Окадзаки , важного шага в репликации отстающей цепи ДНК .

ДНК-лигаза [ править ]

Основная статья: ДНК-лигаза

ДНК-лигаза III вместе со своим кофактором XRCC1 катализирует стадию запечатывания никеля в коротком участке BER у человека. [11] [12] ДНК-лигаза I лигирует разрыв в длинном участке BER. [13]

Связь с раком [ править ]

Дефекты в различных путях репарации ДНК приводят к предрасположенности к раку, и BER, по-видимому, следует этой схеме. Делеционные мутации в генах BER показали, что они приводят к более высокому уровню мутаций у различных организмов, что подразумевает, что потеря BER может способствовать развитию рака. Действительно, соматические мутации в Pol β были обнаружены в 30% случаев рака человека, и некоторые из этих мутаций приводят к трансформации при экспрессии в клетках мыши. [14] Известно, что мутации в ДНК-гликозилазе MYH повышают восприимчивость к раку толстой кишки . [15]

Эпигенетические нарушения при раке [ править ]

Эпигенетические изменения (эпимутации) в генах эксцизионной репарации оснований только недавно начали оцениваться в некоторых случаях рака, по сравнению с многочисленными предыдущими исследованиями эпимутаций в генах, действующих в других путях репарации ДНК (таких как MLH1 при репарации ошибочного спаривания и MGMT при прямом обращении ). [ необходима цитата ] Некоторые примеры эпимутаций в генах эксцизионной репарации оснований, которые происходят при раке, суммированы ниже.

MBD4 [ править ]

Гидролиз цитозина до урацила

MBD4 (белок 4 метил-CpG-связывающего домена) представляет собой гликозилазу, используемую на начальной стадии эксцизионной репарации оснований. Белок MBD4 предпочтительно связывается с полностью метилированными сайтами CpG и с измененными основаниями ДНК в этих сайтах. Эти измененные основания возникают в результате частого гидролиза цитозина до урацила (см. Изображение) и гидролиза 5-метилцитозина до тимина с образованием пар оснований G: U и G: T. [16] Если неподходящие урацилы или тимины в этих парах оснований не удалить до репликации ДНК, они вызовут переходные мутации . MBD4 специфически катализирует удаление T и U, спаренных с гуанином (G) в сайтах CpG. [17] Это важная функция восстановления, поскольку около 1/3 всех внутригенных мутаций одной пары оснований при раке человека происходит в динуклеотидах CpG и является результатом переходов G: C в A: T. [17] [18] Эти переходы включают наиболее частые мутации при раке человека. Например, почти 50% соматических мутаций гена-супрессора опухолей p53 при колоректальном раке представляют собой переходы G: C в A: T в сайтах CpG. [17] Таким образом, снижение экспрессии MBD4 может вызвать увеличение канцерогенных мутаций.

Выражение MBD4 уменьшается почти во всех колоректальных опухолей за счет метилирования в промоторной области MBD4. [19] Также MBD4 недостаточен из-за мутации примерно в 4% случаев колоректального рака. [20]

Большинство гистологически нормальных полей, окружающих новообразования (аденомы и рак толстой кишки) в толстой кишке, также демонстрируют сниженную экспрессию мРНК MBD4 ( дефект поля ) по сравнению с гистологически нормальной тканью людей, у которых никогда не было новообразований толстой кишки. [19] Это открытие предполагает, что эпигенетическое подавление MBD4 является ранней стадией колоректального канцерогенеза .

В китайской популяции, которая была оценена, полиморфизм MBD4 Glu346Lys был связан примерно с 50% снижением риска рака шейки матки, предполагая, что изменения в MBD4 могут быть важны при раке. [21]

NEIL1 [ править ]

NEIL1 распознает (мишени) и удаляет определенные основания, поврежденные окислением, а затем разрезает абазический сайт посредством β, δ элиминирования, оставляя 3 'и 5' фосфатные концы. NEIL1 распознает окисленные пиримидины , формамидопиримидины, остатки тимина, окисленные по метильной группе, и оба стереоизомера тимингликоля . [22] Лучшими субстратами для человеческого NEIL1, по-видимому, являются поражения гидантоином , гуанидиногидантоин и спироиминодигидантоин, которые являются продуктами дальнейшего окисления 8-oxoG.. NEIL1 также способен удалять повреждения из одноцепочечной ДНК, а также из пузырьковых и разветвленных структур ДНК. Дефицит NEIL1 вызывает усиление мутагенеза на участке пары 8-оксо-Gua: C, при этом большинство мутаций представляют собой трансверсии G: C в T: A. [23]

Исследование 2004 г. показало, что в 46% случаев первичного рака желудка наблюдается снижение экспрессии мРНК NEIL1 , хотя механизм этого снижения неизвестен. [24] Это исследование также показало, что 4% случаев рака желудка имели мутации в NEIL1. Авторы предположили, что низкая активность NEIL1, возникающая из-за снижения экспрессии и / или мутации в NEIL1, часто участвует в канцерогенезе желудка.

Скрининг 145 генов репарации ДНК на аберрантное метилирование промотора был проведен на тканях плоскоклеточной карциномы головы и шеи (HNSCC) у 20 пациентов и на образцах слизистой оболочки головы и шеи у 5 пациентов, не страдающих раком. [25] Этот скрининг показал, что NEIL1, со значительно увеличенным гиперметилированием, имел наиболее существенно различающуюся частоту метилирования. Кроме того, гиперметилирование соответствовало снижению экспрессии мРНК NEIL1. Дальнейшая работа с 135 опухолевыми и 38 нормальными тканями также показала, что 71% образцов ткани HNSCC имели повышенное метилирование промотора NEIL1. [25]

Когда 8 генов репарации ДНК оценивали в опухолях немелкоклеточного рака легкого (NSCLC), 42% были гиперметилированы в промоторной области NEIL1. [26] Это была самая частая аномалия репарации ДНК среди 8 протестированных генов репарации ДНК. NEIL1 также был одним из шести генов репарации ДНК, которые, как было обнаружено, гиперметилированы в их промоторных областях при колоректальном раке . [27]

Связи с познанием [ править ]

Деметилирование 5-метилцитозина (5mC) в ДНК. Согласно обзору в 2018 г. [28] 5mC окисляется семейством диоксигеназ ( TET1 , TET2 , TET3 ) с транслокацией десять-одиннадцать (TET ) с образованием 5-гидроксиметилцитозина (5hmC). На последовательных стадиях ферменты ТЕТ дополнительно гидроксилируют 5hmC с образованием 5-формилцитозина (5fC) и 5-карбоксилцитозина (5caC). Тимин-ДНК-гликозилаза (TDG) распознает промежуточные основания 5fC и 5caC и удаляет гликозидную связь, в результате чего образуется апиримидиновый сайт ( AP-сайт).). В альтернативном пути окислительного дезаминирования 5hmC может подвергаться окислительному дезаминированию под действием индуцированных активностью деаминаз комплекса редактирования мРНК цитидиндезаминазы / аполипопротеина B (AID / APOBEC) с образованием 5-гидроксиметилурацила (5hmU) или 5mC может быть преобразован в тимин (Thy). 5hmU может расщепляться TDG, однонитевой селективной монофункциональной урацил-ДНК-гликозилазой 1 ( SMUG1 ), Nei- подобной ДНК-гликозилазой 1 ( NEIL1 ) или метил-CpG-связывающим белком 4 ( MBD4 ). AP-сайты и несовпадения T: G затем восстанавливаются ферментами эксцизионной репарации оснований (BER) с образованием цитозина (Cyt).

Активное метилирование и деметилирование ДНК необходимо для познавательного процесса формирования и поддержания памяти . [29] У крыс контекстуальная обусловленность страха может вызвать пожизненную память о событии за одно испытание, а изменения метилирования, по-видимому, коррелируют с запуском особенно долгоживущих воспоминаний. [29] С помощью контекстуального кондиционирования страха через 24 часа ДНК, выделенная из области гиппокампа головного мозга крысы, содержала 2097 дифференциально метилированных генов, причем часть из них деметилировалась. [29] Согласно обзору Байрактара и Крейца, [28] Деметилирование ДНК зависит от эксцизионной репарации оснований (см. Рисунок).

Установлено, что физические упражнения благотворно влияют на обучение и память (см. Нейробиологические эффекты физических упражнений ). BDNF - особенно важный регулятор обучения и памяти. [30] Согласно обзору Fernandes et al. [31] у крыс, упражнения усиливают экспрессию в гиппокампе гена Bdnf , который играет важную роль в формировании памяти. Усиленная экспрессия из BDNF происходит через деметилирование своего острова промотора CpG в экзоне IV [31] и деметилировании зависит от базовой эксцизионной репарации (смотрите рисунок). [28]

Снижение BER с возрастом [ править ]

Активность ДНК-гликозилазы, которая удаляет метилированные основания в лейкоцитах человека, снижается с возрастом. [32] Уменьшение удаления метилированных оснований из ДНК предполагает возрастное снижение уровня 3-метиладенин-ДНК-гликозилазы , фермента BER, ответственного за удаление алкилированных оснований. [32]

Молодые крысы (от 4 до 5 месяцев), но не старые крысы (от 24 до 28 месяцев), обладают способностью индуцировать бета-ДНК-полимеразу и эндонуклеазу AP в ответ на окислительное повреждение. [33]

См. Также [ править ]

  • Ремонт несоответствия ДНК
  • Ремонт ДНК
  • Гомологичная рекомбинация
  • Негомологичное соединение концов
  • Эксцизионная репарация нуклеотидов
  • Анализ реактивации клеток-хозяев

Ссылки [ править ]

  1. Перейти ↑ Liu Y, Prasad R, Beard WA, Kedar PS, Hou EW, Shock DD, Wilson SH (2007). «Координация шагов в репарации эксцизии однонуклеотидных оснований, опосредованной апуриновой / апиримидиновой эндонуклеазой 1 и ДНК-полимеразой β» . Журнал биологической химии . 282 (18): 13532–13541. DOI : 10.1074 / jbc.M611295200 . PMC  2366199 . PMID  17355977 .
  2. ^ Jayanta Чоудхури и Фредерик В. Alt (2004). «Рекомбинация с переключением классов: взаимодействие транскрипции, дезаминирования ДНК и репарации ДНК». Обзоры природы Иммунология . 4 (7): 541–552. DOI : 10.1038 / nri1395 . PMID 15229473 . 
  3. ^ Fortini P, Dogliotti E (апрель 2007). «Базовое повреждение и ремонт одноцепочечных разрывов: механизмы и функциональное значение подпути восстановления коротких и длинных участков». Ремонт ДНК . 6 (4): 398–409. DOI : 10.1016 / j.dnarep.2006.10.008 . PMID 17129767 . 
  4. ^ Gellon L, Carson DR, Carson JP, Demple B (февраль 2008). «Внутренняя активность 5'-дезоксирибозо-5-фосфатлиазы в белке Saccharomyces cerevisiae Trf4 с возможной ролью в репарации ДНК с эксцизией оснований» . Ремонт ДНК . 7 (2): 187–98. DOI : 10.1016 / j.dnarep.2007.09.009 . PMC 2258243 . PMID 17983848 .  
  5. ^ Fromme JC, Банерджи A, Verdine GL (февраль 2004). «Распознавание и катализ ДНК-гликозилазы». Curr. Opin. Struct. Биол . 14 (1): 43–9. DOI : 10.1016 / j.sbi.2004.01.003 . PMID 15102448 . 
  6. ^ Аравиндом L, Walker DR, Кунин EV (1999). «Консервативные домены в белках репарации ДНК и эволюция систем репарации» . Исследования нуклеиновых кислот . 27 (5): 1223–1242. DOI : 10.1093 / NAR / 27.5.1223 . PMC 148307 . PMID 9973609 .  
  7. ^ Demple B, Herman T, Chen DS (1991). «Клонирование и экспрессия APE, кДНК, кодирующей главную апуриновую эндонуклеазу человека: определение семейства ферментов репарации ДНК» . PNAS США . 88 (24): 11450–11454. DOI : 10.1073 / pnas.88.24.11450 . PMC 53153 . PMID 1722334 .  
  8. ↑ Braithwaite EK, Prasad R, Shock DD, Hou EW, Beard WA, Wilson SH (май 2005 г.). «ДНК-полимераза лямбда опосредует активность репарации эксцизией резервного основания в экстрактах эмбриональных фибробластов мыши» . J. Biol. Chem . 280 (18): 18469–75. DOI : 10.1074 / jbc.M411864200 . PMID 15749700 . 
  9. ^ Борода WA, Прасад R, Wilson SH (2006). Активность и механизм ДНК-полимеразы бета . Meth. Энзимол . Методы в энзимологии. 408 . С. 91–107. DOI : 10.1016 / S0076-6879 (06) 08007-4 . ISBN 9780121828134. PMID  16793365 .
  10. ^ Као HI, Henricksen LA, Liu Y, Bambara RA (апрель 2002). «Специфичность расщепления эндонуклеазы лоскута 1 Saccharomyces cerevisiae предполагает наличие двойной лоскутной структуры в качестве клеточного субстрата» . J. Biol. Chem . 277 (17): 14379–89. DOI : 10.1074 / jbc.M110662200 . PMID 11825897 . 
  11. Перейти ↑ Cappelli, Enrico (1997). «Вовлечение продуктов генов XRCC1 и ДНК-лигазы III в эксцизионную репарацию оснований ДНК» . Журнал биологической химии . 272 (38): 23970–23975. DOI : 10.1074 / jbc.272.38.23970 . PMID 9295348 . 
  12. Перейти ↑ Caldecott, Keith (1995). «Характеристика комплекса XRCC1-ДНК-лигаза III in vitro и его отсутствие в мутантных клетках хомяка» . Исследования нуклеиновых кислот . 23 (23): 4836–4843. DOI : 10.1093 / NAR / 23.23.4836 . PMC 307472 . PMID 8532526 . Проверено 10 марта 2019 .  
  13. ^ Паскуччи, Барбара (1999). «Эксцизионная репарация длинного патч-основания с очищенной ДНК-лигазой I человеческих белков в качестве медиатора размера патча для ДНК-полимераз δ и ε» . Журнал биологической химии . 274 (47): 33696–33702. DOI : 10.1074 / jbc.274.47.33696 . PMID 10559260 . 
  14. ^ Starcevic D, Dalal S, Sweasy JB (август 2004). «Есть ли связь между бета-ДНК-полимеразой и раком?» . Клеточный цикл . 3 (8): 998–1001. DOI : 10.4161 / cc.3.8.1062 . PMID 15280658 . 
  15. ^ Фаррингтон, SM; Tenesa, A; Барнетсон, Р. Уилтшир, А; Прендергаст, Дж; Портеус, М; Кэмпбелл, H; Данлоп, MG (2005). «Восприимчивость зародышевой линии к колоректальному раку из-за дефектов гена эксцизионной репарации основания» . Американский журнал генетики человека . 77 (1): 112–9. DOI : 10.1086 / 431213 . PMC 1226182 . PMID 15931596 .  
  16. ^ Bellacosa A, Drohat AC (август 2015). «Роль эксцизионной репарации оснований в поддержании генетической и эпигенетической целостности сайтов CpG» . Ремонт ДНК . 32 : 33–42. DOI : 10.1016 / j.dnarep.2015.04.011 . PMC 4903958 . PMID 26021671 .  
  17. ^ a b c Sjolund AB, Senejani AG, Sweasy JB (2013). «MBD4 и TDG: многогранные ДНК-гликозилазы с постоянно расширяющейся биологической ролью» . Мутационные исследования . 743–744: 12–25. DOI : 10.1016 / j.mrfmmm.2012.11.001 . PMC 3661743 . PMID 23195996 .  
  18. ↑ Cooper DN, Youssoufian H (февраль 1988 г.). «Динуклеотид CpG и генетическое заболевание человека». Генетика человека . 78 (2): 151–5. DOI : 10.1007 / bf00278187 . PMID 3338800 . 
  19. ^ a b Ховард Дж. Х., Фролов А., Ценг К. В., Стюарт А., Мидзак А., Маджмундар А., Годвин А., Хеслин М., Беллакоса А., Арнолетти Дж. П. (январь 2009 г.). «Эпигенетическое подавление гена репарации ДНК MED1 / MBD4 при колоректальном раке и раке яичников» . Биология и терапия рака . 8 (1): 94–100. DOI : 10,4161 / cbt.8.1.7469 . PMC 2683899 . PMID 19127118 .  
  20. ^ Tricarico R, Cortellino S, Riccio A, Jagmohan-Changur S, Van der Klift H, Wijnen J, Turner D, Ventura A, Rovella V, Percesepe A, Lucci-Cordisco E, Radice P, Bertario L, Pedroni M, Ponz де Леон М., Манкузо П., Девараджан К., Кай К.К., Кляйн-Сзанто А.Дж., Нери Г., Мёллер П., Виль А., Генуарди М., Фодде Р., Беллакоса А. (октябрь 2015 г.). «Участие инактивации MBD4 в дефектном онкогенезе с репарацией ошибочного спаривания» . Oncotarget . 6 (40): 42892–904. DOI : 10.18632 / oncotarget.5740 . PMC 4767479 . PMID 26503472 .  
  21. ↑ Xiong XD, Luo XP, Liu X, Jing X, Zeng LQ, Lei M, Hong XS, Chen Y (2012). «Полиморфизм Glu346Lys MBD4 связан с риском рака шейки матки у населения Китая». Int. J. Gynecol. Рак . 22 (9): 1552–6. DOI : 10.1097 / IGC.0b013e31826e22e4 . PMID 23027038 . 
  22. ^ Немец А. Уоллес SS, Sweasy JB (октябрь 2010). «Вариант основных белков эксцизионной репарации: факторы нестабильности генома» . Семинары по биологии рака . 20 (5): 320–8. DOI : 10.1016 / j.semcancer.2010.10.010 . PMC 3254599 . PMID 20955798 .  
  23. ^ Сузуки Т, Harashima Н, Н Камия (2010). «Влияние основных белков эксцизионной репарации на мутагенез с помощью 8-оксо-7,8-дигидрогуанина (8-гидроксигуанина) в сочетании с цитозином и аденином». Ремонт ДНК (Amst.) . 9 (5): 542–50. DOI : 10.1016 / j.dnarep.2010.02.004 . ЛВП : 2115/43021 . PMID 20197241 . 
  24. ^ Shinmura К, Тао Н, Гото М, Игараши Н, Танигучи Т, Маекав М, Takezaki Т, Сугимура Н (2004). «Инактивирующие мутации гена эксцизионной репарации человеческого основания NEIL1 при раке желудка» . Канцерогенез . 25 (12): 2311–7. DOI : 10.1093 / carcin / bgh267 . PMID 15319300 . 
  25. ^ a b Чайсаингмонгкол Дж, Попанда О, Варта Р., Дайкхофф Дж., Херпель Е, Гейзельхарт Л., Клаус Р., Ласичка Ф, Кампос Б., Оукс С.С., Бермеджо Дж. Л., Херольд-Менде С., Пласс С., Шмезер П. (2012). «Эпигенетический скрининг генов репарации ДНК человека выявляет аберрантное метилирование промотора NEIL1 при плоскоклеточном раке головы и шеи» . Онкоген . 31 (49): 5108–16. DOI : 10.1038 / onc.2011.660 . PMID 22286769 . 
  26. ^ Ду Н, Вонг NC, Murone С, Т Джон Соломон В, Митчелла PL, Dobrovic А (2014). «Критическая переоценка метилирования промотора гена репарации ДНК в немелкоклеточной карциноме легкого» . Научные отчеты . 4 : 4186. DOI : 10.1038 / srep04186 . PMC 3935198 . PMID 24569633 .  
  27. ^ Фаркаш С.А., Vymetalkova В, Водичкова л, Водичка Р, Nilsson ТК (апрель 2014). «Изменения в метилировании ДНК в генах, часто мутирующих при спорадическом колоректальном раке, а также в генах репарации ДНК и генов сигнального пути Wnt / β-катенина». Эпигеномика . 6 (2): 179–91. DOI : 10.2217 / epi.14.7 . PMID 24811787 . 
  28. ^ a b c Bayraktar G, Kreutz MR (2018). «Роль зависимого от активности деметилирования ДНК в мозге взрослого человека и при неврологических расстройствах» . Front Mol Neurosci . 11 : 169. DOI : 10,3389 / fnmol.2018.00169 . PMC 5975432 . PMID 29875631 .  
  29. ^ a b c Duke CG, Kennedy AJ, Gavin CF, Day JJ, Sweatt JD (июль 2017 г.). «Зависящая от опыта эпигеномная реорганизация в гиппокампе» . Учиться. Mem . 24 (7): 278–288. DOI : 10,1101 / lm.045112.117 . PMC 5473107 . PMID 28620075 .  
  30. ↑ Карпова Н.Н. (январь 2014 г.). «Роль эпигенетики BDNF в зависимой от активности нейрональной пластичности» . Нейрофармакология . 76 Pt C: 709–18. DOI : 10.1016 / j.neuropharm.2013.04.002 . PMID 23587647 . 
  31. ^ a b Фернандес Дж, Арида Р.М., Гомес-Пинилья Ф (сентябрь 2017 г.). «Физические упражнения как эпигенетический модулятор пластичности мозга и познания» . Neurosci Biobehav Rev . 80 : 443–456. DOI : 10.1016 / j.neubiorev.2017.06.012 . PMC 5705447 . PMID 28666827 .  
  32. ^ a b Atamna H, Cheung I, Ames BN (2000). «Метод обнаружения абазических сайтов в живых клетках: возрастные изменения в эксцизионной репарации основания» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 97 (2): 686–91. DOI : 10.1073 / pnas.97.2.686 . PMC 15391 . PMID 10639140 .  
  33. ^ Cabelof DC, Raffoul JJ, Ge Y, Ван Remmen H, Matherly LH, Хейдари AR (2006). «Возрастная потеря реакции репарации ДНК после воздействия окислительного стресса» . J. Gerontol. Биол. Sci. Med. Sci . 61 (5): 427–34. DOI : 10.1093 / Герона / 61.5.427 . PMID 16720738 . 

Внешние ссылки [ править ]

  • База + иссечение + восстановление по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)