Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Схема путей TC-NER и GG-NER. Эти два пути различаются только распознаванием исходного повреждения ДНК. [1]

Эксцизионная репарация нуклеотидов - это механизм репарации ДНК . [2] Повреждение ДНК происходит постоянно из-за химических веществ (например, интеркалирующих агентов ), радиации и других мутагенов . Существуют три пути эксцизионной репарации для восстановления повреждений одноцепочечной ДНК: эксцизионная репарация нуклеотидов (NER), эксцизионная репарация оснований (BER) и репарация ошибочного спаривания ДНК (MMR). Хотя путь BER может распознавать определенные негабаритные повреждения в ДНК, он может корректировать только поврежденные основания, которые удаляются конкретными гликозилазами . Точно так же путь MMR нацелен только на несовпадающие пары оснований Watson-Crick .

Эксцизионная репарация нуклеотидов (NER) является особенно важным механизмом эксцизии, который устраняет повреждения ДНК, вызванные ультрафиолетовым светом (УФ). Повреждение ДНК ультрафиолетом приводит к образованию объемных аддуктов ДНК - эти аддукты в основном представляют собой димеры тимина и 6,4-фотопродукты. Распознавание повреждения приводит к удалению короткого одноцепочечного сегмента ДНК, содержащего повреждение. Неповрежденная одноцепочечная ДНК остается, и ДНК-полимераза использует ее в качестве матрицы для синтеза короткой комплементарной последовательности . Окончательное лигирование для завершения NER и образования двухцепочечной ДНК выполняется ДНК-лигазой.. NER можно разделить на два подпути: глобальный геномный NER (GG-NER или GGR) и связанный с транскрипцией NER (TC-NER или TCR). Эти два подпути различаются тем, как они распознают повреждение ДНК, но у них одинаковый процесс разреза, восстановления и лигирования поражения.

Важность NER подтверждается тяжелыми заболеваниями человека, которые возникают в результате врожденных генетических мутаций белков NER. Пигментная ксеродермия и синдром Кокейна - два примера заболеваний, связанных с НЭР.

У эукариот [ править ]

Эксцизионная репарация нуклеотидов у эукариот сложнее , чем у прокариот , но общий принцип схож. В NER в клетках млекопитающих участвуют 9 основных белков. Дефицит определенных белков приводит к болезни; названия белков связаны с заболеванием. XPA , XPB , XPC , XPD, XPE , XPF и XPG все происходят от пигментной херодермы, а CSA и CSB представляют собой белки, связанные с синдромом Кокейна. Кроме того, белки ERCC1 , RPA , RAD23A , RAD23B, и другие также участвуют в эксцизионной репарации нуклеотидов. Более полный список белков, участвующих в NER, приведен ниже .

Эукариотическую эксцизионную репарацию нуклеотидов можно разделить на два подпути: глобальный геномный NER (GG-NER) и связанный с транскрипцией NER (TC-NER). Три разных набора белков участвуют в распознавании повреждений ДНК для каждого подпути. После распознавания повреждений три подпути сходятся для этапов двойного разреза, восстановления и лигирования.

Распознавание повреждений [ править ]

Глобальный геномный NER (GG-NER) [ править ]

Схема изображает связывание белков, участвующих в GG-NER. [3]

Глобальный геномный NER восстанавливает повреждения как транскрибируемых, так и нетранскрибированных цепей ДНК в активных и неактивных генах по всему геному. Этот процесс не зависит от транскрипции. В этом пути задействованы несколько белков, «воспринимающих повреждение», в том числе связывающие повреждение ДНК (DDB) и комплексы XPC-Rad23B, которые постоянно сканируют геном и распознают искажения спирали: комплекс XPC -Rad23B отвечает за распознавание искажений, а DDB1 и DDB2 ( XPE) также может распознавать некоторые виды повреждений, вызванных УФ-светом. Кроме того, XPA выполняет функцию распознавания повреждений, которая пока еще плохо определена. После идентификации поврежденного участка последующие репарационные белки затем привлекаются к поврежденной ДНК для проверки наличия повреждения ДНК, вырезают поврежденную ДНК, окружающую поражение, затем заполняют репарационный участок.

Заболевания, связанные с GG-NER [ править ]

Мутации в аппарате GG-NER ответственны за множественные генетические нарушения, включая:

  • Пигментная ксеродермия (XP): серьезная светочувствительность, высокий уровень рака в областях тела, подверженных воздействию солнца (например, кожи)

Восстановление, связанное с транскрипцией (TC-NER) [ править ]

Схема изображает связывание белков, участвующих в TC-NER. [3]

В любой момент времени большая часть генома в организме не подвергается транскрипции; существует разница в эффективности NER между транскрипционно молчащими и транскрипционно активными областями генома. При многих типах повреждений NER восстанавливает транскрибируемые цепи транскрипционно активных генов быстрее, чем восстанавливает нетранскрибируемые цепи и транскрипционно молчащую ДНК.

TC-NER и GG-NER отличаются только начальными этапами распознавания повреждений ДНК. Принципиальное различие между TC-NER и GG-NER состоит в том, что TC-NER не требует белков XPC или DDB для распознавания искажений в клетках млекопитающих. Вместо этого TC-NER инициируется, когда РНК-полимераза останавливается на повреждении в ДНК: заблокированная РНК-полимераза служит сигналом распознавания повреждения, который заменяет потребность в свойствах распознавания искажения комплексов XPC-RAD23B и DDB. Белки CS (CSA и CSB) связывают некоторые типы повреждений ДНК вместо XPC-Rad23B.

Возможны и другие механизмы ремонта, но они менее точны и эффективны.

Заболевания, связанные с TC-NER [ править ]

TC-NER инициируется, когда РНК-полимераза останавливается в повреждении ДНК, после чего белковые комплексы помогают перемещать полимеразу назад. Мутации в аппарате TC-NER ответственны за множественные генетические нарушения, включая:

  • Трихотиодистрофия (TTD): некоторые люди светочувствительны, ихтиоз, умственная / физическая отсталость
  • Синдром Кокейна (CS): светочувствительность, умственная отсталость, прогерии , микроцефалия.

Двойной разрез [ править ]

Фактор транскрипции II H (TFIIH) является ключевым ферментом, участвующим в двойном вырезании. TFIIH и XPG сначала привлекаются к участку повреждения ДНК (XPG стабилизирует TFIIH). Субъединицы TFIIH XPD и XPB действуют как 5'-3 'и 3'-5' геликаза соответственно - они помогают раскручивать ДНК и генерировать соединение между двухцепочечной и одноцепочечной ДНК вокруг пузыря транскрипции . Помимо стабилизации TFIIH, XPG также обладает эндонуклеазной активностью; он сокращает повреждение ДНК на стороне 3 ', в то время как XPF - ERCC1гетеродимерный белок разрезает на 5'-стороне. Двойной разрез приводит к удалению оцДНК с разрывом в одной цепи длиной 25-30 нуклеотидов. Небольшие, вырезанные, содержащие повреждения олигонуклеотиды ДНК (sedDNA) сначала высвобождаются из дуплекса в комплексе с TFIIH, но затем диссоциируют АТФ-зависимым образом и связываются с репликационным белком А (RPA). Ингибирование синтеза ДНК, заполняющего пробелы, и лигирования приводит к накоплению связанных с RPA седДНК в клетке.

Белок репликации А (RPA) и XPA - это два последних белка, связанных с основным комплексом репарации NER. Эти два белка присутствуют до связывания TFIIH, поскольку они участвуют в проверке повреждения ДНК. Они также могут защищать одноцепочечную ДНК. После проверки делается 5-дюймовый боковой разрез, и восстановление ДНК начинается перед 3-дюймовым боковым разрезом. Это помогает уменьшить открытую однонитевую ДНК в процессе восстановления.

Ремонт и перевязка [ править ]

Фактор репликации C ( RFC ) загружает ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA) на цепь ДНК. Это позволяет ДНК-полимеразам, участвующим в репарации (δ, ε и / или κ), копировать неповрежденную цепь посредством транслокации. ДНК - лигазы I и закрылков эндонуклеазы 1 или комплекс лигазы-III-XRCC1 уплотнения ники к полному НЭК.

У прокариот: белки Uvr [ править ]

Дополнительная информация: эндонуклеаза UvrABC
Схематическое изображение моделей пути эксцизионной репарации нуклеотидов, контролируемых белками Uvr. [4]

Процесс нуклеотидной эксцизионной репарации управляется в кишечных палочках самой UvrABC эндонуклеазы ферментного комплекса, который состоит из четырех белков UVR: UvrA, УФОК, UvrC и ДНК хеликазных II (иногда также известный как UvrD в этом комплексе). Во-первых, комплекс UvrA-UvrB сканирует ДНК, при этом субъединица UvrA распознает искажения спирали, вызванные, например, димерами пиримидина . Когда комплекс распознает такое искажение, субъединица UvrA уходит, и белок UvrC входит и связывается с мономером UvrB и, следовательно, образует новый димер UvrBC . UvrB расщепляет фосфодиэфирную связь4 нуклеотида ниже повреждения ДНК, и UvrC расщепляет фосфодиэфирную связь на 8 нуклеотидов выше повреждения ДНК и создает вырезанный сегмент из 12 нуклеотидов. Затем входит ДНК-геликаза II (иногда называемая UvrD) и удаляет вырезанный сегмент, активно разрывая водородные связи между комплементарными основаниями. Образовавшийся пробел затем заполняется с помощью ДНК-полимеразы I и ДНК-лигазы. Основной процесс удаления очень похож на высшие клетки, но эти клетки обычно включают намного больше белков - простой пример - кишечная палочка . [5]

TC-NER также существует в бактериях и опосредуется белком TRCF (Mfd) . TRCF - это SF2- АТФаза, которая использует гидролиз АТФ для транслокации на дцДНК выше транскрипционного пузыря и прямой транслокации РНК-полимеразы, тем самым инициируя диссоциацию тройного элонгационного комплекса РНК-полимеразы. TRCF также задействует механизм эксцизионной репарации нуклеотидов Uvr (A) BC путем прямого физического взаимодействия с субъединицей UvrA.

Рак [ править ]

Пути удаления ДНК работают в тандеме для восстановления повреждений ДНК . Неисправленные повреждения или неисправные белки, связанные с эксцизионной репарацией, могут привести к нерегулируемому росту клеток и раку. [6]

Хотя исторические исследования показали противоречивые результаты, генетические вариации или мутации генов эксцизионной репарации нуклеотидов могут влиять на риск рака , влияя на эффективность репарации. Однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) и несинонимичные кодирующие SNP (nsSNP) присутствуют в очень низких количествах (> 1%) в человеческой популяции. [7] Если такие мутации расположены в генах NER или регуляторных последовательностях, они могут отрицательно повлиять на способность к репарации ДНК, что приведет к увеличению вероятности развития рака. Хотя функциональное влияние всех полиморфизмов не охарактеризовано, некоторые полиморфизмы в генах репарации ДНК или их регуляторных последовательностях действительно вызывают фенотипические изменения и участвуют в развитии рака.[8] Исследование случаев рака легких выявило умеренную связь между полиморфизмом специфичных для NER SNP и риском рака легких. [9] Результаты показывают, что некоторые унаследованные полиморфные вариации генов NER могут приводить к предрасположенности к раку легких и, возможно, другим раковым состояниям.

NER дисфункция результат полиморфизма ДНК [ править ]

Два важных гена в пути NER, для которых полиморфизм показал функциональное и фенотипическое влияние, - это гены XPD и XPC . [10] XPD, также известный как ERCC2, помимо других транскрипционных активностей, служит для открытия ДНК вокруг участка повреждения во время NER. Исследования показали, что полиморфизм экзона 10 (G> A) (Asp312Asn) и экзона 23 (A> T) (Lys751Gln) связан с генетической предрасположенностью к нескольким типам рака. [11] [12]Ген XPC отвечает за белок, который распознает ДНК на ранней стадии пути NER. Этот ген может иметь полиморфизм в интроне 9 и SNP в экзоне 15, которые также коррелируют с риском рака. Исследования показали, что полиморфизм вставки / делеции двуаллельного поли (AT) в интроне 9 XPC связан с повышенным риском рака кожи, груди и простаты [12] [13] [14], особенно в популяциях Северной Индии.

Влияние на прогноз рака [ править ]

Изучение наследственного рака, xeroderma pigmentosum, помогло идентифицировать несколько генов, которые кодируют белки пути NER, два из которых - XPC и XPD. XP вызывается гомозиготной недостаточностью восстановления повреждений ДНК УФ-излучением (GG-NER), что увеличивает риск рака кожи у пациентов в 1000 раз. У гетерозиготных пациентов риск рака носит спорадический характер, но его можно предсказать на основе аналитической оценки полиморфизмов в генах репарации ДНК, связанных с XP, очищенных из лимфоцитов . [15] В исследовании частоты рецидивов колоректального рака II и III стадии высокого риска полиморфизм 2251A> C XPD (ERCC2) значительно коррелировал с ранним рецидивом после химиотерапевтического лечения. [16]Исследования показали, что эффекты полиморфных генов NER являются аддитивными, и чем выше частота вариантов, тем выше риск рака. [15] [16] [17]

Старение [ править ]

У людей и мышей мутации зародышевой линии в генах, задействованных в NER, вызывают признаки преждевременного старения. Эти гены и соответствующие им белки включают ERCC1 ( ERCC1 ), ERCC2 (XPD), ERCC3 ( XPB ), ERCC4 (XPF), ERCC5 (XPG), ERCC6 (CSB) и ERCC8 (CSA).

Мыши- мутанты ERCC1 с дефицитом репарации ДНК демонстрируют признаки ускоренного старения и имеют ограниченную продолжительность жизни. [18] Ускоренное старение мутанта затрагивает множество органов.

Мутации в гене ERCC2 (XPD) могут приводить к различным синдромам: пигментной ксеродермии (XP), трихотиодистрофии (TTD) или комбинации XP и TTD (XPTTD) или комбинации XP и синдрома Кокейна (XPCS). [19] И TTD, и CS демонстрируют признаки преждевременного старения. Эти признаки могут включать сенсоневральную глухоту , дегенерацию сетчатки, гипометилирование белого вещества, кальцификацию центральной нервной системы, снижение роста и кахексию (потерю подкожной жировой ткани). [19] [20] Фибробласты XPCS и TTD из ERCC2(XPD) мутантные люди и мыши демонстрируют доказательства дефектной репарации окислительных повреждений ДНК, которые могут лежать в основе сегментарных прогероидных симптомов (преждевременного старения) [21] (см. Теорию старения повреждений ДНК ).

Мутации в гене ERCC3 (XPB) у человека могут приводить к пигментной ксеродермии (XP) или XP в сочетании с синдромом Кокейна (XPCS). [22]

Дефицит ERCC4 (XPF) у людей приводит к множеству состояний, включая ускоренное старение. [23]

У людей мутационные дефекты в гене ERCC5 (XPG) могут вызывать либо предрасположенное к раку состояние xeroderma pigmentosum (XP) отдельно, либо в сочетании с тяжелым расстройством нервного развития, синдромом Кокейна (CS) или младенческой летальной церебро-окулофасциальной инфекцией. скелетный синдром. [24] ERCC5 (XPG) мутантные мыши модель представляет черты преждевременного старения , включая кахексии и остеопороз с выраженными дегенеративными фенотипами в печени , так и головном мозге. [24] У этих мутантных мышей развивается мультисистемный дегенеративный фенотип преждевременного старения, который, по-видимому, усиливает связь между повреждением ДНК истарение . [24] (см. Теорию старения повреждения ДНК ).

Синдром Кокейна (CS) возникает в результате мутаций зародышевой линии в одном из двух генов: ERCC8 (CSA) или ERCC6 (CSB). Мутации ERCC8 (CSA) обычно вызывают более умеренную форму CS, чем мутации ERCC6 (CSB). [25] Мутации в гене CSA составляют около 20% случаев CS. [26] Для людей с CSA и CSB характерны тяжелый постнатальный рост и умственная отсталость, а также ускоренное старение, ведущее к преждевременной смерти в возрасте от 12 до 16 лет. [27]

Снижение NER с возрастом [ править ]

В обзоре Горбунова и др. [28] исследования NER в различных клетках и тканях молодых и старых людей часто показывают снижение способности NER с возрастом. Это снижение может быть связано со снижением конститутивных уровней белков, используемых в пути NER. [29]

Гены, связанные с NER [ править ]

Человеческий ген (белок)Мышь ОртологДрожжевой ортологМетроФункция в NERВход в GeneCards
CCNH ( Циклин H )CcnhCCL1ОбеСубъединица киназы активатора CDK (CAK)CCNH
CDK7 ( циклинзависимая киназа (CDK) 7) )Cdk7KIN28ОбеСубъединица САКCDK7
CETN2 (Центрин-2)Cetn2НеизвестныйGGRРаспознавание повреждений; образует комплекс с XPCCETN2
DDB1 ( DDB1 )Ddb1НеизвестныйGGRРаспознавание повреждений; образует комплекс с DDB2DDB1
DDB2 ( DDB2 )Ddb2 / XpeНеизвестныйGGRРаспознавание повреждений; набирает XPCDDB2
ERCC1 ( ERCC1 )Ercc1RAD10ОбеВовлечен в разрез на 3 'стороне повреждения; образует комплекс с XPFERCC1
ERCC2 ( XPD )Ercc2RAD3ОбеАТФазная и геликазная активность; субъединица фактора транскрипции II H (TFIIH)ERCC2
ERCC3 ( XPB )Ercc3RAD25ОбеАТФазная и геликазная активность; субъединица фактора транскрипции II H (TFIIH)ERCC3
ERCC4 ( XPF )Ercc4RAD1ОбеВовлечен в разрез на 3 'стороне повреждения; структурно-специфическая эндонуклеазаERCC4
ERCC5 ( XPG )Ercc5RAD2ОбеВовлечен в разрез на 5-дюймовой стороне повреждения; стабилизирует TFIIH; структурно-специфическая эндонуклеазаERCC5
ERCC6 ( CSB )Ercc6RAD26TC-NERФактор элонгации транскрипции; участвует в сцеплении транскрипции и ремоделировании хроматинаERCC6
ERCC8 ( CSA )Ercc8RAD28TC-NERУбиквитинлигазный комплекс; взаимодействует с CSB и p44 TFIIHERCC8
LIG1 ( ДНК- лигаза I )Lig1CDC9ОбеОкончательная перевязкаLIG1
MNAT1 ( MNAT1 )Mnat1TFB3ОбеСтабилизирует комплекс ЦАКMNAT1
MMS19 ( MMS19 )Mms19MET18ОбеВзаимодействует с субъединицами XPD и XPB геликаз TFIIH.MMS19
RAD23A ( RAD23A )Rad23aRAD23GGRРаспознавание повреждений; образует комплекс с XPCRAD23A
RAD23B ( RAD23B )Rad23bRAD23GGRРаспознавание повреждений, образует комплекс с XPCRAD23B
RPA1 ( RPA1 )Rpa1RFA1ОбеПодразделение комплекса РФАRPA1
RPA2 ( RPA2 )Rpa2RFA2ОбеПодразделение комплекса РФАRPA2
TFIIH ( фактор транскрипции II H )Gtf2h1 - 3Tfb1 Ssl1 Tfb4ОбеВовлечен в разрез, образует комплекс вокруг пораженияGTF2H1 GTF2H2 GTF2H3
XAB2 ( XAB2 )Xab2SYF1TC-NERРаспознавание повреждений; взаимодействует с XPA, CSA и CSBXAB2
XPA ( XPA )XpaRAD14ОбеРаспознавание поврежденийXPA
XPC ( XPC )XpcRAD4GGRРаспознавание поврежденийXPC

См. Также [ править ]

  • Базовая эксцизионная пластика (BER)
  • Исправление несоответствия (MMR)

Ссылки [ править ]

  1. ^ Суета JO, Купер PK (июнь 2006). «Ремонт ДНК: динамические защитники от рака и старения» . PLoS Биология . 4 (6): e203. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0040203 . PMC  1475692 . PMID  16752948 .
  2. ^ Кэрролл SB; Wessler SR; Гриффитс AJFl; Левонтин RC (2008). Введение в генетический анализ . Нью-Йорк: WH Freeman and Co., стр. 534. ISBN 978-0-7167-6887-6.
  3. ^ а б Ле Мэй N, Эгли Дж. М., Монета F (2010). «Правдивая ложь: двойная жизнь факторов эксцизионной репарации нуклеотидов при транскрипции и репарации ДНК» . Журнал нуклеиновых кислот . 2010 : 1–10. DOI : 10.4061 / 2010/616342 . PMC 2915888 . PMID 20725631 .  
  4. ^ Морита Р., Накане С., Шимада А. и др. (2010). «Молекулярные механизмы всей системы репарации ДНК: сравнение бактериальной и эукариотической систем» . Журнал нуклеиновых кислот . 2010 : 1–32. DOI : 10.4061 / 2010/179594 . PMC 2957137 . PMID 20981145 .  
  5. ^ Truglio JJ, Croteau DL, Ван Хаутен B, C Kisker (февраль 2006). «Прокариотическая эксцизионная репарация нуклеотидов: система UvrABC». Химические обзоры . 106 (2): 233–252. DOI : 10.1021 / cr040471u . PMID 16464004 . 
  6. ↑ Zhang Y, Rohde LH, Wu H (июнь 2009 г.). «Вовлечение механизмов удаления нуклеотидов и репарации несоответствия в репарации двухцепочечных разрывов» . Текущая геномика . 10 (4): 250–258. DOI : 10.2174 / 138920209788488544 . PMC 2709936 . PMID 19949546 .  
  7. ^ Квок PY, Gu Z (декабрь 1999). «Библиотеки однонуклеотидного полиморфизма: зачем и как мы их создаем?». Молекулярная медицина сегодня . 5 (12): 538–543. DOI : 10.1016 / S1357-4310 (99) 01601-9 . PMID 10562720 . 
  8. ^ Karahalil В, Бор В, D Уилсон (октябрь 2012 г.). «Влияние полиморфизмов ДНК в основных белках эксцизионной репарации ДНК на риск рака» . Человек и экспериментальная токсикология . 31 (10): 981–1005. DOI : 10.1177 / 0960327112444476 . PMC 4586256 . PMID 23023028 .  
  9. ^ Сакода LC, Лумис MM, Доэрти JA, Джулианто L, Барнетт MJ, Neuhouser ML, Thornquist MD, Weiss NS, Goodman GE, Chen C (2012). «Вариации зародышевой линии в генах эксцизионной репарации нуклеотидов и риск рака легких у курильщиков» . Международный журнал молекулярной эпидемиологии и генетики . 3 (1): 1–17. PMC 3316453 . PMID 22493747 .  
  10. ^ Hou SM, Fält S, Angelini S, Yang K, Nyberg F, Lambert B, Hemminki K (апрель 2002). «Аллели варианта XPD связаны с повышенным уровнем аддукта ароматической ДНК и риском рака легких» . Канцерогенез . 23 (4): 599–603. DOI : 10.1093 / carcin / 23.4.599 . PMID 11960912 . 
  11. Перейти ↑ Wang M, Gu D, Zhang Z, Zhou J, Zhang Z (2009). «Полиморфизм XPD, курение сигарет и риск рака мочевого пузыря: метаанализ». Журнал токсикологии и гигиены окружающей среды Часть A . 72 (11–12): 698–705. DOI : 10.1080 / 15287390902841029 . PMID 19492231 . 
  12. ^ a b Mittal RD, Mandal RK (январь 2012 г.). «Генетическая изменчивость генов пути эксцизионной репарации нуклеотидов влияет на восприимчивость к раку простаты и мочевого пузыря у населения Северной Индии» . Индийский журнал генетики человека . 18 (1): 47–55. DOI : 10.4103 / 0971-6866.96648 . PMC 3385179 . PMID 22754221 .  
  13. ^ Бланкенбург С., Кениг И. Р., Месснер Р., Ласпе П., Томс К. М., Крюгер Ю., Хан С. Г., Вестфаль Г., Беркинг С., Волкенанд М., Райх К., Нойман С., Циглер А., Кремер К. Х., Эммерт С. (июнь 2005 г.). «Оценка 3 полиморфизмов гена группы C xeroderma pigmentosum и риска кожной меланомы: исследование случай-контроль» . Канцерогенез . 26 (6): 1085–1090. DOI : 10.1093 / carcin / bgi055 . PMID 15731165 . 
  14. ^ Шору RE, Zeleniuch-Jacquotte А, D Карри, Mohrenweiser Н, Афанасьева Y, Коениг KL, Арслан А.А., Toniolo Р, Wirgin I (май 2008 г.). «Полиморфизмы генов XPC и ERCC2, курение и риск рака груди». Международный журнал рака . 122 (9): 2101–2105. DOI : 10.1002 / ijc.23361 . PMID 18196582 . 
  15. ^ a b Цяо Y, Шпиц М.Р., Го З., Хадэяти М., Гроссман Л., Кремер К.Х., Вэй К. (ноябрь 2002 г.). «Быстрая оценка восстановления ультрафиолетовых повреждений ДНК с помощью модифицированного анализа реактивации клетки-хозяина с использованием репортерного гена люциферазы и корреляции с полиморфизмом генов репарации ДНК в нормальных лимфоцитах человека». Мутационные исследования . 509 (1–2): 165–174. DOI : 10.1016 / S0027-5107 (02) 00219-1 . PMID 12427537 . 
  16. ^ а б Хуанг М.Ю., Фанг В.Й., Ли С.К., Ченг Т.Л., Ван Дж.Й., Лин С.Р. (2008). «Генетический полиморфизм ERCC2 2251A> C сильно коррелировал с ранним рецидивом у пациентов с колоректальным раком II и III стадии высокого риска: предварительное исследование» . BMC Рак . 8 : 50. DOI : 10.1186 / 1471-2407-8-50 . PMC 2262891 . PMID 18267032 .  
  17. ↑ Spitz MR, Wu X, Wang Y, Wang LE, Shete S, Amos CI, Guo Z, Lei L, Mohrenweiser H, Wei Q (февраль 2001 г.). «Модуляция способности репарации эксцизией нуклеотидов полиморфизмами XPD у больных раком легкого». Исследования рака . 61 (4): 1354–1357. PMID 11245433 . 
  18. ^ Vermeij РГ, Долле МЕ, Reiling Е, Jaarsma Д, Пайан-Гомес С, Bombardieri CR, Ву Н, Роксь AJ, Боттер С.М., ван - дер - Eerden BC, Юсеф С.А., Kuiper Р.В., Nagarajah B, ван Oostrom CT, Brandt RM , Барнхорн С., Имхольц С., Пеннингс Дж. Л., де Брюин А., Гьенис А., Потхоф Дж., Вийг Дж., Ван Стиг Х., Hoeijmakers JH (2016). «Ограниченная диета задерживает ускоренное старение и геномный стресс у мышей с дефицитом репарации ДНК» . Природа . 537 (7620): 427–431. DOI : 10,1038 / природа19329 . PMC 5161687 . PMID 27556946 .  
  19. ^ a b Андрессу Дж.О., Hoeijmakers JH, Mitchell JR (2006). «Расстройства эксцизионного восстановления нуклеотидов и баланс между раком и старением» . Клеточный цикл . 5 (24): 2886–8. DOI : 10.4161 / cc.5.24.3565 . PMID 17172862 . 
  20. ^ Суета JO, Tainer JA (2011). «Хеликазы XPB и XPD в TFIIH организуют открытие дуплекса ДНК и верификацию повреждений, чтобы координировать репарацию с транскрипцией и клеточным циклом через киназу САК» . Ремонт ДНК (Amst.) . 10 (7): 697–713. DOI : 10.1016 / j.dnarep.2011.04.028 . PMC 3234290 . PMID 21571596 .  
  21. ^ Andressoo JO, Митчелл JR, де Вит J, Hoogstraten D, Volker M, Туссен W, Speksnijder Е, Beems РБ, ван Steeg H, Jans J, де Зеув CI, Ясперс NG, Raams A, Lehmann AR, Vermeulen W, Hoeijmakers JH, ван дер Хорст GT (2006). «Модель мыши Xpd для комбинированной пигментной ксеродермы / синдрома Кокейна, демонстрирующего предрасположенность к раку и сегментарную прогерию» . Раковая клетка . 10 (2): 121–32. DOI : 10.1016 / j.ccr.2006.05.027 . PMID 16904611 . 
  22. ^ О К.С., Хан С.Г., Ясперс Н.Г., Raams A, Ueda T, Lehmann А, Фридмана PS, Эммерт S, Грачев A, Lachlan K, Lucassan A, Baker CC, Кремер KH (2006). «Фенотипическая гетерогенность в гене геликазы ДНК XPB (ERCC3): пигментная ксеродерма без и с синдромом Кокейна». Гм. Мутат . 27 (11): 1092–103. DOI : 10.1002 / humu.20392 . PMID 16947863 . 
  23. ^ Gregg SQ, Робинсон Р., Niedernhofer LJ (2011). «Физиологические последствия дефектов в эндонуклеазе репарации ДНК ERCC1-XPF» . Ремонт ДНК (Amst.) . 10 (7): 781–91. DOI : 10.1016 / j.dnarep.2011.04.026 . PMC 3139823 . PMID 21612988 .  
  24. ^ a b c Barnhoorn S, Uittenboogaard LM, Jaarsma D, Vermeij WP, Tresini M, Weymaere M, Menoni H, Brandt RM, de Waard MC, Botter SM, Sarker AH, Jaspers NG, van der Horst GT, Cooper PK, Hoeijmakers JH, ван дер Плюйм I (2014). «Клеточно-автономные прогероидные изменения в условных моделях мышей для восстановления дефицита эндонуклеазы XPG» . PLoS Genet . 10 (10): e1004686. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1004686 . PMC 4191938 . PMID 25299392 .  
  25. ^ Iyama Т, Уилсон Д. М. (2016). «Элементы, которые регулируют реакцию на повреждение ДНК белков, дефектных при синдроме Кокейна» . J. Mol. Биол . 428 (1): 62–78. DOI : 10.1016 / j.jmb.2015.11.020 . PMC 4738086 . PMID 26616585 .  
  26. ^ Коха S, Гарсиа Гонсалес О, Assfalg R, Шеллинг А, Шефер Р, Scharffetter-Kochanek К, Iben S (2014). «Белок А синдрома Кокейна является фактором транскрипции РНК-полимеразы I и стимулирует биогенез и рост рибосом» . Клеточный цикл . 13 (13): 2029–37. DOI : 10.4161 / cc.29018 . PMC 4111694 . PMID 24781187 .  
  27. ^ Edifizi Д, Шумахер В (2015). «Нестабильность генома в развитии и старении: выводы из нуклеотидного эксцизионного восстановления у людей, мышей и червей» . Биомолекулы . 5 (3): 1855–69. DOI : 10.3390 / biom5031855 . PMC 4598778 . PMID 26287260 .  
  28. ^ Горбунова В, Seluanov А, Мао Z, Хайн С (2007). «Изменения репарации ДНК при старении» . Nucleic Acids Res . 35 (22): 7466–74. DOI : 10.1093 / NAR / gkm756 . PMC 2190694 . PMID 17913742 .  
  29. ^ Goukassian Д, Гад Ж, Yaar М, Эллер МС, Nehal США, Gilchrest Б.А. (2000). «Механизмы и последствия возрастного снижения способности репарации ДНК». FASEB J . 14 (10): 1325–34. DOI : 10.1096 / fj.14.10.1325 . PMID 10877825 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Элленбергер Т., Фридберг ЕС, Уокер Г.С., Вольфрам С., Вуд Р.Дж., Шульц Р. (2006). Ремонт ДНК и мутагенез . Вашингтон, округ Колумбия: ASM Press. ISBN 978-1-55581-319-2.
  • Satoh MS, Hanawalt PC (сентябрь 1996 г.). «TFIIH-опосредованная эксцизионная репарация нуклеотидов и инициация транскрипции мРНК в оптимизированном анализе внеклеточной репарации ДНК и транскрипции РНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 24 (18): 3576–3582. DOI : 10.1093 / NAR / 24.18.3576 . PMC  146147 . PMID  8836185 . Статья об отношениях между TFIIH и NER
  • Frit P, Kwon K, Coin F, Auriol J, Dubaele S, Salles B, Egly JM (декабрь 2002 г.). «Активаторы транскрипции стимулируют восстановление ДНК» . Мол. Cell . 10 (6): 1391–1401. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (02) 00732-3 . PMID  12504014 .
  • Меллон I (сентябрь 2005 г.). «Транскрипционно-связанный ремонт: дело сложное». Мутат. Res . 577 (1–2): 155–161. DOI : 10.1016 / j.mrfmmm.2005.03.016 . PMID  15913669 .

Внешние ссылки [ править ]

  • СМИ, связанные с эксцизионной репарацией нуклеотидов на Викискладе?