• нуклеотид-иссечение ремонт • регулирование фазового перехода митотического клеточного цикла • ремонт нуклеотид иссечения, распознавание повреждений ДНК • внутри S повреждения ДНК контрольной точки • клеточный ответ на повреждения ДНК стимул • глобальный геном нуклеотид-эксцизионной репарации • ответ на звуковой раздражитель • несоответствие репарация • ответ на УФ-В • эксцизионная репарация при УФ-повреждении • репарация ДНК • ответ на лекарство • эксцизионная репарация нуклеотидов, сборка комплекса до надреза • эксцизионная репарация нуклеотидов, раскручивание дуплекса ДНК
Пигментная ксеродерма, комплементационная группа С , также известный как XPC , представляет собой белок , который у человека кодируется XPC гена . XPC участвует в распознавании объемных аддуктов ДНК при эксцизионной репарации нуклеотидов . [4] Он расположен на хромосоме 3. [5]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
2 Клиническое значение
2.1 Рак
3 взаимодействия
4 ссылки
5 Дальнейшее чтение
6 Внешние ссылки
Функция [ править ]
Этот ген кодирует компонент пути эксцизионной репарации нуклеотидов (NER). В путь NER вовлечены несколько компонентов, включая Xeroderma pigmentosum (XP) AG и V, синдром Кокейна (CS) A и B, трихотиодистрофию (TTD) группы A и т. Д. Этот компонент, XPC, играет важную роль в на ранних этапах NER глобального генома, особенно в распознавании повреждений, образовании открытых комплексов и образовании репаративных белковых комплексов. [4]
Комплекс XPC-RAD23B является исходным фактором распознавания повреждений в глобальной эксцизионной репарации геномных нуклеотидов (GG-NER). [6] XPC-RAD23B распознает широкий спектр повреждений, которые термодинамически дестабилизируют дуплексы ДНК, включая УФ-индуцированные фотопродукты (димеры циклопиримидина и 6-4 фотопродукты), аддукты, образованные мутагенами окружающей среды, такими как бензо [a] пирен или различные ароматические амины, определенные окислительные эндогенные поражения, такие как циклопурины и аддукты, образованные химиотерапевтическими препаратами против рака, такими как цисплатин. Присутствие XPC-RAD23B необходимо для сборки других основных факторов NER и прохождения пути NER как in vitro, так и in vivo. [7]Хотя большинство исследований было выполнено с XPC-RAD23B, он является частью тримерного комплекса с центрином-2, кальций-связывающим белком семейства кальмодулинов. [7]
Клиническое значение [ править ]
Мутации в этом гене или некоторых других компонентах NER приводят к Xeroderma pigmentosum , редкому аутосомно-рецессивному заболеванию, характеризующемуся повышенной чувствительностью к солнечному свету с развитием карцином в раннем возрасте. [4]
Рак [ править ]
Повреждение ДНК, по-видимому, является основной причиной рака [8], а дефицит генов репарации ДНК, вероятно, лежит в основе многих форм рака. [9] [10] Если репарация ДНК недостаточна, повреждения ДНК имеют тенденцию к накоплению. Такое избыточное повреждение ДНК может увеличивать мутации из-за подверженного ошибкам синтеза трансфузии . Избыточное повреждение ДНК также может увеличивать эпигенетические изменения из-за ошибок во время восстановления ДНК. [11] [12] Такие мутации и эпигенетические изменения могут вызвать рак .
Снижение экспрессии генов репарации ДНК (обычно вызванное эпигенетическими изменениями, такими как гиперметилирование промотора) очень часто встречается при раке и обычно встречается гораздо чаще, чем мутационные дефекты генов репарации ДНК при раке. [ необходима цитата ] Приведенная ниже таблица показывает, что экспрессия XPC часто эпигенетически снижалась при раке мочевого пузыря, а также при немелкоклеточном раке легкого, а также показывает, что XPC чаще снижалась на более поздних стадиях этих видов рака.
Частота снижения экспрессии XPC при раке, при этом стадии рака указываются отдельно
Рак
Частота
Ref.
Рак мочевого пузыря
50%
[13]
Папиллярное уротелиальное новообразование с низким потенциалом злокачественности
35%
[13]
Папиллярный рак мочевого пузыря низкой степени злокачественности
42%
[13]
Папиллярный рак мочевого пузыря высокой степени
65%
[13]
Немелкоклеточный рак легкого (НМРЛ)
70%
[14]
НМРЛ I стадии
62%
[14]
НМРЛ II-III стадии
77%
[14]
Хотя было показано, что эпигенетическое гиперметилирование промоторной области гена XPC связано с низкой экспрессией XPC, [13] другой способ эпигенетической репрессии XPC может также происходить за счет сверхэкспрессии микроРНК miR-890. [15]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что XPC (ген) взаимодействует с ABCA1 , [16] CETN2 [17] и XPB . [18]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030094 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ a b c «Ген Entrez: XPC xeroderma pigmentosum, группа комплементации C» .
^ "Запись OMIM - # 278720 - XERODERMA PIGMENTOSUM, ГРУППА ДОПОЛНЕНИЙ C; XPC" . Проверено 12 декабря 2014 .
^ Sugasawa K, Ng JM, Masutani C, S Иваи, ван дер Spek PJ, Eker А.П., Ханаока F, D, Бутсма Hoeijmakers JH (1998). «Белковый комплекс группы C Xeroderma pigmentosum является инициатором глобальной эксцизионной репарации нуклеотидов в геноме». Мол. Cell . 2 (2): 223–32. DOI : 10.1016 / s1097-2765 (00) 80132-X . PMID 9734359 .
↑ a b Schärer OD (октябрь 2013 г.). «Эксцизионная репарация нуклеотидов у эукариот» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 5 (10): a012609. DOI : 10.1101 / cshperspect.a012609 . PMC 3783044 . PMID 24086042 .
^ Kastan MB (2008). «Реакции на повреждение ДНК: механизмы и роли в человеческих болезнях: Лекция 2007 ГСГ Мемориала Клоуза» . Мол. Cancer Res . 6 (4): 517–24. DOI : 10.1158 / 1541-7786.MCR-08-0020 . PMID 18403632 .
^ Harper JW, Elledge SJ (2007). «Реакция на повреждение ДНК: десять лет спустя». Мол. Cell . 28 (5): 739–45. DOI : 10.1016 / j.molcel.2007.11.015 . PMID 18082599 .
^ Dietlein F, Reinhardt HC (2014). «Молекулярные пути: использование специфических для опухолей молекулярных дефектов в путях репарации ДНК для точной терапии рака» . Clin. Cancer Res . 20 (23): 5882–7. DOI : 10.1158 / 1078-0432.CCR-14-1165 . PMID 25451105 .
^ О'Хаган HM Мохаммад HP, Baylin SB (2008). «Двухцепочечные разрывы могут инициировать сайленсинг генов и SIRT1-зависимое начало метилирования ДНК в экзогенном промоторном островке CpG» . PLOS Genetics . 4 (8): e1000155. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1000155 . PMC 2491723 . PMID 18704159 .
^ Куоззо С, Porcellini А, Angrisano Т, Морано А, Ли В, Ди Пардо А, Мессина S, Iuliano R, Фуско А, Сантилло М. Р., Мюллер МТ, Chiariotti л, Готтесман МЕ, Avvedimento Е.В. (июль 2007). «Повреждение ДНК, гомологически направленная репарация и метилирование ДНК» . PLOS Genetics . 3 (7): e110. DOI : 10.1371 / journal.pgen.0030110 . PMC 1913100 . PMID 17616978 .
↑ a b c d e Ян Дж., Сюй З., Ли Дж., Чжан Р., Чжан Г., Джи Х, Сон Б., Чен З (2010). «Эпигенетическое молчание XPC в сочетании с изменением p53 оказывает значительное влияние на исход рака мочевого пузыря». J. Urol . 184 (1): 336–43. DOI : 10.1016 / j.juro.2010.03.044 . PMID 20488473 .
^ a b c Yeh KT, Wu YH, Lee MC, Wang L, Li CT, Chen CY, Lee H (2012). «Уровень мРНК XPC может предсказать рецидив у некурящих с немелкоклеточным раком легких». Анна. Surg. Онкол . 19 (3): 734–42. DOI : 10,1245 / s10434-011-1992-9 . PMID 21861227 . S2CID 19154489 .
^ Хатано К, Кумар В, Чжан У, Коултер JB, Hedayati М, Мирс В, Ni Х, Kudrolli Т.А., Чоудхури WH, Родригес R, DeWeese TL, Lupold SE (2015). «Функциональный скрининг выявляет миРНК, которые ингибируют репарацию ДНК и повышают чувствительность клеток рака простаты к ионизирующему излучению» . Nucleic Acids Res . 43 (8): 4075–86. DOI : 10.1093 / NAR / gkv273 . PMC 4417178 . PMID 25845598 .
^ Shimizu Y, Иваи S, Ханаока F, Sugasawa K (январь 2003). «Белок группы C Xeroderma pigmentosum физически и функционально взаимодействует с тиминовой ДНК-гликозилазой» . EMBO J . 22 (1): 164–73. DOI : 10,1093 / emboj / cdg016 . PMC 140069 . PMID 12505994 .
↑ Араки М., Масутани С., Такемура М., Учида А., Сугасава К., Кондо Дж., Окума Ю., Ханаока Ф (июнь 2001 г.). «Центросомный белок центрин 2 / кальтрактин 1 является частью комплекса группы C xeroderma pigmentosum, который инициирует глобальную эксцизионную репарацию генома» . J. Biol. Chem . 276 (22): 18665–72. DOI : 10.1074 / jbc.M100855200 . PMID 11279143 .
^ Ёкои М, Masutani С, Маекава Т, Sugasawa К, Ohkuma Y, Ханаока F (март 2000 г.). «Белковый комплекс XPC-HR23B группы C xeroderma pigmentosum играет важную роль в привлечении фактора транскрипции IIH к поврежденной ДНК» . J. Biol. Chem . 275 (13): 9870–5. DOI : 10.1074 / jbc.275.13.9870 . PMID 10734143 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Кливер Дж. Э., Томпсон Л. Х., Ричардсон А. С., Штаты JC (1999). «Краткое изложение мутаций в заболеваниях, чувствительных к ультрафиолету: пигментная ксеродермия, синдром Кокейна и трихотиодистрофия». Гм. Мутат . 14 (1): 9–22. DOI : 10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1999) 14: 1 <9 :: AID-HUMU2> 3.0.CO; 2-6 . PMID 10447254 .
Сугасава К. (2007). «УФ-индуцированное убиквитилирование комплекса XPC, УФ-DDB-убиквитин-лигазный комплекс и репарация ДНК». J. Mol. Histol . 37 (5–7): 189–202. DOI : 10.1007 / s10735-006-9044-7 . PMID 16858626 . S2CID 817898 .
Легерски Р., Петерсон С. (1993). «Экспрессионное клонирование гена репарации ДНК человека, участвующего в группе C xeroderma pigmentosum» . Природа . 360 (6404): 610. DOI : 10.1038 / 360610b0 . PMID 1461286 .
Легерски Р., Петерсон С. (1992). «Экспрессионное клонирование гена репарации ДНК человека, участвующего в группе C xeroderma pigmentosum». Природа . 359 (6390): 70–3. Bibcode : 1992Natur.359 ... 70L . DOI : 10.1038 / 359070a0 . PMID 1522891 . S2CID 34276965 .
Легерски Р.Дж., Лю П., Ли Л., Петерсон К.А., Чжао Ю., Лич Р.Дж., Нейлор С.Л., Сицилиано М.Дж. (1994). «Отнесение гена группы C (XPC) к xeroderma pigmentosum к хромосоме 3p25». Геномика . 21 (1): 266–9. DOI : 10.1006 / geno.1994.1256 . PMID 8088800 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Масутани К., Сугасава К., Янагисава Дж., Сонояма Т., Уи М., Эномото Т., Такио К., Танака К., ван дер Спек П. Дж., Бутсма Д. (1994). «Очистка и клонирование комплекса нуклеотидной эксцизионной репарации, включающего белок группы С xeroderma pigmentosum и человеческий гомолог дрожжевого RAD23» . EMBO J . 13 (8): 1831–43. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06452.x . PMC 395023 . PMID 8168482 .
Ли Л., Бейлз Э.С., Петерсон К.А., Легерски Р.Дж. (1994). «Характеристика молекулярных дефектов в пигментной ксеродерме группы C». Nat. Genet . 5 (4): 413–7. DOI : 10.1038 / ng1293-413 . PMID 8298653 . S2CID 24923699 .
Ли Л., Петерсон С., Легерски Р. (1996). «Последовательность кДНК XPC мыши и геномная структура гена XPC человека» . Nucleic Acids Res . 24 (6): 1026–8. DOI : 10.1093 / NAR / 24.6.1026 . PMC 145764 . PMID 8604333 .
ван дер Спек П.Дж., Экер А., Радемакерс С., Виссер С., Сугасава К., Масутани С., Ханаока Ф., Бутсма Д., Хоймейкерс Дж. Х. (1996). «XPC и человеческие гомологи RAD23: внутриклеточная локализация и связь с другими комплексами эксцизионной репарации нуклеотидов» . Nucleic Acids Res . 24 (13): 2551–9. DOI : 10.1093 / NAR / 24.13.2551 . PMC 145966 . PMID 8692695 .
Ли Л., Лу Х, Петерсон С., Легерски Р. (1997). «XPC взаимодействует как с HHR23B, так и с HHR23A in vivo». Мутат. Res . 383 (3): 197–203. DOI : 10.1016 / s0921-8777 (97) 00002-5 . PMID 9164480 .
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Zeng L, Quilliet X, Chevallier-Lagente O, Eveno E, Sarasin A, Mezzina M (1998). «Ретровирус-опосредованный перенос гена корректирует дефект репарации ДНК клеток xeroderma pigmentosum групп комплементации A, B и C» . Gene Ther . 4 (10): 1077–84. DOI : 10.1038 / sj.gt.3300495 . PMID 9415314 .
Хан С.Г., Леви Х.Л., Легерски Р., Квакенбуш Э., Рирдон Дж. Т., Эммерт С., Санкар А., Ли Л., Шнайдер Т. Д., Кливер Д. Э., Кремер К. Х. (1998). «Мутация сплайсинга группы C Xeroderma pigmentosum, связанная с аутизмом и гипоглицинемией». J. Invest. Дерматол . 111 (5): 791–6. DOI : 10.1046 / j.1523-1747.1998.00391.x . PMID 9804340 .
Ёкои М., Масутани С., Маэкава Т., Сугасава К., Окума Ю., Ханаока Ф. (2000). «Белковый комплекс XPC-HR23B группы C xeroderma pigmentosum играет важную роль в привлечении фактора транскрипции IIH к поврежденной ДНК» . J. Biol. Chem . 275 (13): 9870–5. DOI : 10.1074 / jbc.275.13.9870 . PMID 10734143 .
Бэтти Д., Рэпик-Отрин В., Левин А.С., Вуд Р.Д. (2000). «Стабильное связывание человеческого комплекса XPC с облученной ДНК обеспечивает сильную дискриминацию поврежденных участков». J. Mol. Биол . 300 (2): 275–90. DOI : 10.1006 / jmbi.2000.3857 . PMID 10873465 .
Араужо С.Дж., Нигг Е.А., Вуд Р.Д. (2001). «Сильные функциональные взаимодействия TFIIH с XPC и XPG в эксцизионной репарации нуклеотидов ДНК человека без предварительно собранной репарасомы» . Мол. Клетка. Биол . 21 (7): 2281–91. DOI : 10.1128 / MCB.21.7.2281-2291.2001 . PMC 86862 . PMID 11259578 .
Араки М., Масутани С., Такемура М., Учида А., Сугасава К., Кондо Дж., Окума Ю., Ханаока Ф. (2001). «Центросомный белок центрин 2 / кальтрактин 1 является частью комплекса группы C xeroderma pigmentosum, который инициирует глобальную эксцизионную репарацию генома» . J. Biol. Chem . 276 (22): 18665–72. DOI : 10.1074 / jbc.M100855200 . PMID 11279143 .
Внешние ссылки [ править ]
GeneReviews / NIH / NCBI / UW запись о Xeroderma Pigmentosum
