• протеин С-конец связывание • нуклеотида связывания • ГО: 0004003 ДНК хеликаз активность • протеинкиназа активность • гидролазная активность • АТФаза ДНК-зависимая • белок N-конец связывание • GO: 0043140 3'-5' хеликаз активности ДНК • связывания АТФ • поврежденная ДНК - связывающий • связывания ДНК • транскрипционного фактора связывания • GO: 0001948 связывания с белками • GO: 0008026 хеликаза активность • РНК - полимераза II , домен киназой карбоксиконцевой активности • активности АТФазы • ДНК-транслоказная активность
Сотовый компонент
• GO: 0000441 основной комплекс TFIIH • ядро клетки • нуклеоплазма • комплекс holo TFIIH • комплекс фактора транскрипции TFIID • комплекс фактора репарации 3 нуклеотида и эксцизионного фактора • комплекс преинициации транскрипции
Биологический процесс
• ответ на гипоксию • прекращение транскрипции РНК-полимеразы I • развитие эмбриональных органов • транскрипция, ДНК-шаблон • ответ на УФ • кэппирование мРНК 7-метилгуанозина • эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК • регуляция фазового перехода митотического клеточного цикла • апоптотический процесс • положительная регуляция апоптоза процесса • фосфорилирование белков • волосковых клеток дифференцировка • ответ на окислительный стресс • УФ - защита • клеточный ответ на повреждения ДНК стимул • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • глобальная эксцизионная репарация нуклеотидов генома • локализация белка • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции с помощью ДНК-шаблона • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • топологическое изменение ДНК • инициация транскрипции от РНК - полимеразы I промотор • транскрипции от РНК - полимеразы II промотора • транскрипции-связанной ремонт нуклеотид-эксцизионной • ремонт нуклеотид-эксцизионной • нуклеотид-эксцизионной ремонта, комплексной стабилизации preincision • репарация ДНК • вирусный процесс GO: 0022415 • эксцизионная репарация нуклеотидов, сборка комплекса перед разрезом • эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК, 5'-к повреждению • эксцизионная репарация нуклеотидов, раскручивание дуплекса ДНК • регулирование митотической рекомбинации • клиренс промотора от Промотор РНК-полимеразы II • образование открытого транскрипционного комплекса на промоторе РНК-полимеразы II • регуляция транспозиции, опосредованная РНК • фосфорилирование С-концевого домена РНК-полимеразы II • регуляция связывания ДНК, специфичного для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК, 3'-к повреждению • удлинение транскрипции с промотора РНК-полимеразы I.
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
2071
13872
Ансамбль
ENSG00000163161
ENSMUSG00000024382
UniProt
P19447
P49135
RefSeq (мРНК)
NM_000122 NM_001303416 NM_001303418
NM_133658
RefSeq (белок)
NP_000113 NP_001290345 NP_001290347
NP_598419
Расположение (UCSC)
Chr 2: 127.26 - 127.29 Мб
Chr 18: 32,24 - 32,27 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
XPB ( xeroderma pigmentosum type B) представляет собой АТФ- зависимую ДНК- геликазу у человека, которая является частью комплекса факторов транскрипции TFIIH .
СОДЕРЖАНИЕ
1 Структура
2 Функция
3 расстройства
4 взаимодействия
5 Низкомолекулярные ингибиторы
6 См. Также
7 ссылки
8 Дальнейшее чтение
9 Внешние ссылки
Структура [ править ]
Трехмерная структура архейного гомолога XPB была решена с помощью рентгеновской кристаллографии доктором Джоном Тайнером и его группой в Исследовательском институте Скриппса . [5]
Функция [ править ]
XPB играет важную роль в нормальной базальной транскрипции, связанной с транскрипцией репарации (TCR) и эксцизионной репарации нуклеотидов (NER). Было показано, что очищенный XPB раскручивает ДНК с полярностью 3'-5 '.
Функция белка XPB (ERCC3) в NER заключается в том, чтобы способствовать раскручиванию двойной спирали ДНК после первоначального распознавания повреждения. NER - это многоступенчатый путь, который устраняет широкий спектр различных повреждений ДНК, которые нарушают нормальное спаривание оснований. Такие повреждения включают объемные химические аддукты, УФ-индуцированные димеры пиримидина и несколько форм окислительного повреждения . Мутации в гене XPB (ERCC3) могут приводить у людей к пигментной ксеродермии (XP) или XP в сочетании с синдромом Кокейна (XPCS). [6] Мутантные клетки XPB от людей с фенотипом XPCS чувствительны к УФ-облучению и острому окислительному стрессу. [7]
Заболевания [ править ]
Мутации в XPB и других родственных группах комплементации, XPA-XPG, приводят к ряду генетических нарушений, таких как пигментная ксеродермия , синдром Кокейна и трихотиодистрофия .
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что XPB взаимодействует с:
Ген BCR , [8]
CDK7 , [9] [10] [11]
ERCC2 , [9] [12] [13] [14]
GTF2H1 , [9] [10] [12]
GTF2H2 , [9] [12]
GTF2H4 , [9] [12]
GTF2H5 , [9]
P53 , [15]
PSMC5 , [16] и
XPC . [17]
Ингибиторы малых молекул [ править ]
Сильные, биоактивные природные продукты, такие как триптолид, которые ингибируют транскрипцию млекопитающих посредством ингибирования субъединицы XPB общего фактора транскрипции TFIIH, недавно были описаны в качестве конъюгата глюкозы для нацеливания на гипоксические раковые клетки с повышенной экспрессией переносчика глюкозы. [18]
См. Также [ править ]
XP
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000163161 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024382 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Вентилятор L, Arvai А.С., Купер PK, Иваи S, Ханаока F, Tainer JA (апрель 2006). «Консервативная структура ядра XPB и мотивы для разматывания ДНК: последствия для выбора пути транскрипции или эксцизионной репарации». Молекулярная клетка . 22 (1): 27–37. DOI : 10.1016 / j.molcel.2006.02.017 . PMID 16600867 .
^ О К.С., Хан С.Г., Ясперс Н.Г., Raams A, Ueda T, Lehmann А, Фридмана PS, Эммерт S, Грачев A, Lachlan K, Lucassan A, Baker CC, Кремер KH (2006). «Фенотипическая гетерогенность в гене геликазы ДНК XPB (ERCC3): пигментная ксеродермия без и с синдромом Кокейна». Гм. Мутат . 27 (11): 1092–103. DOI : 10.1002 / humu.20392 . PMID 16947863 . S2CID 22852219 .
^ Andressoo JO, Weeda G, де Вит J, Mitchell JR, Beems RB ван Steeg H, ван дер Хорст GT, Hoeijmakers JH (2009). «Модель мыши Xpb для комбинированной пигментной ксеродермы и синдрома кокейна обнаруживает прогероидные особенности при дальнейшем ослаблении репарации ДНК» . Мол. Клетка. Биол . 29 (5): 1276–90. DOI : 10.1128 / MCB.01229-08 . PMC 2643825 . PMID 19114557 .
Перейти ↑ Takeda N, Shibuya M, Maru Y (январь 1999 г.). «Онкобелок BCR-ABL потенциально взаимодействует с белком группы B xeroderma pigmentosum» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 96 (1): 203–7. DOI : 10.1073 / pnas.96.1.203 . PMC 15117 . PMID 9874796 .
^ Б с д е е Giglia-Мари G, монета F, Ranish JA, Hoogstraten D, Theil A, Wijgers N, Ясперса Н.Г., Raams А, Арджентини М, ван - дер - Spek PJ, Ботта E, Stefanini M, Egly JM, Aebersold R, Hoeijmakers JH, Vermeulen W. (июль 2004 г.). «Новая десятая субъединица TFIIH отвечает за синдром репарации ДНК трихотиодистрофии группы А» . Nat. Genet . 36 (7): 714–9. DOI : 10.1038 / ng1387 . PMID 15220921 .
^ a b Rossignol M, Kolb-Cheynel I, Egly JM (апрель 1997 г.). «Субстратная специфичность cdk-активирующей киназы (САК) изменяется при ассоциации с TFIIH» . EMBO J . 16 (7): 1628–37. DOI : 10.1093 / emboj / 16.7.1628 . PMC 1169767 . PMID 9130708 .
↑ Yee A, Nichols MA, Wu L, Hall FL, Kobayashi R, Xiong Y (декабрь 1995 г.). «Молекулярное клонирование связанного с CDK7 человеческого MAT1, фактора сборки циклин-зависимой киназы-активирующей киназы (САК)». Cancer Res . 55 (24): 6058–62. PMID 8521393 .
^ a b c d Маринони Дж. К., Рой Р., Вермёлен В., Миниу П., Лутц И., Вида Дж., Сероз Т., Гомес Д. М., Хоймейкерс Дж. Х., Эгли Дж. М. (март 1997 г.). «Клонирование и характеристика p52, пятой субъединицы ядра фактора транскрипции / репарации ДНК TFIIH» . EMBO J . 16 (5): 1093–102. DOI : 10.1093 / emboj / 16.5.1093 . PMC 1169708 . PMID 9118947 .
^ Drapkin R, Риардон JT, Ансари А, Хуанг JC, Zawel л, Ahn К, Sancar А, Reinberg D (апрель 1994 г.). «Двойная роль TFIIH в эксцизионной репарации ДНК и в транскрипции с помощью РНК-полимеразы II». Природа . 368 (6473): 769–72. DOI : 10.1038 / 368769a0 . PMID 8152490 . S2CID 4363484 .
^ Айер N, Рейган MS, В KJ, Канагараджа B, Фридберг EC (февраль 1996). «Взаимодействия с участием комплекса транскрипции / эксцизионной репарации РНК-полимеразы II человека TFIIH, белка эксцизионной репарации нуклеотидов XPG и белка группы B синдрома Кокейна (CSB)». Биохимия . 35 (7): 2157–67. DOI : 10.1021 / bi9524124 . PMID 8652557 .
↑ Wang XW, Yeh H, Schaeffer L, Roy R, Moncollin V, Egly JM, Wang Z, Freidberg EC, Evans MK, Taffe BG (июнь 1995 г.). «Модуляция p53 TFIIH-связанной активности эксцизионной репарации нуклеотидов» . Nat. Genet . 10 (2): 188–95. DOI : 10.1038 / ng0695-188 . hdl : 1765/54884 . PMID 7663514 . S2CID 38325851 .
^ Weeda G, Rossignol M, Fraser RA, Winkler GS, Vermeulen W, van 't Veer LJ , Ma L, Hoeijmakers JH, Egly JM (июнь 1997 г.). «Субъединица XPB фактора репарации / транскрипции TFIIH напрямую взаимодействует с SUG1, субъединицей протеасомы 26S и предполагаемым фактором транскрипции» . Nucleic Acids Res . 25 (12): 2274–83. DOI : 10.1093 / NAR / 25.12.2274 . PMC 146752 . PMID 9173976 .
^ Ёкои М, Masutani С, Маекава Т, Sugasawa К, Ohkuma Y, Ханаока F (март 2000 г.). «Белковый комплекс XPC-HR23B группы C xeroderma pigmentosum играет важную роль в привлечении фактора транскрипции IIH к поврежденной ДНК» . J. Biol. Chem . 275 (13): 9870–5. DOI : 10.1074 / jbc.275.13.9870 . PMID 10734143 .
^ Датан E, Minn I, Peng X, он QL, Ahn H, Ю.Б., Pomper М.Г., Liu Jo (2020). «Конъюгат глюкоза-триптолид селективно нацелен на раковые клетки в условиях гипоксии» . iScience . 23 (9). DOI : 10.1016 / j.isci.2020.101536 . PMID 33083765 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Джанг К.Т. (1998). «Tat, Tat-ассоциированная киназа и транскрипция». J. Biomed. Sci . 5 (1): 24–7. DOI : 10.1007 / BF02253352 . PMID 9570510 .
Кливер Дж. Э., Томпсон Л. Х., Ричардсон А. С., Штаты JC (1999). «Краткое изложение мутаций в заболеваниях, чувствительных к ультрафиолету: пигментная ксеродермия, синдром Кокейна и трихотиодистрофия». Гм. Мутат . 14 (1): 9–22. DOI : 10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1999) 14: 1 <9 :: AID-HUMU2> 3.0.CO; 2-6 . PMID 10447254 .
Ма Л., Вида Дж., Йохемсен А.Г., Бутсма Д., Хоймейкерс Дж. Х., ван дер Эб А. Дж. (1992). «Молекулярный и функциональный анализ промотора XPBC / ERCC-3: транскрипционная активность зависит от целостности сайта связывания Sp1» . Nucleic Acids Res . 20 (2): 217–24. DOI : 10.1093 / NAR / 20.2.217 . PMC 310357 . PMID 1741247 .
Weeda G, Wiegant J, van der Ploeg M, Geurts van Kessel AH, van der Eb AJ, Hoeijmakers JH (1991). «Локализация гена ERCC3, корректирующего группу B ксеродермы пигментных, в хромосоме 2q21 человека» . Геномика . 10 (4): 1035–1040. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (91) 90195-K . ЛВП : 1765/3025 . PMID 1916809 .
Weeda G, Ma LB, ван Хэм RC, ван дер Эб AJ, Hoeijmakers JH (1991). «Структура и экспрессия человеческого гена XPBC / ERCC-3, участвующего в нарушениях репарации ДНК, xeroderma pigmentosum и синдроме Кокейна» . Nucleic Acids Res . 19 (22): 6301–6308. DOI : 10.1093 / NAR / 19.22.6301 . PMC 329143 . PMID 1956789 .
Вида Г., ван Хэм Р.С., Мазурель Р., Вестервельд А., Одийк Х., де Вит Дж., Бутсма Д., ван дер Эб А.Дж., Хоймейкерс Дж. Х. (1990). «Молекулярное клонирование и биологическая характеристика человеческого гена эксцизионной репарации ERCC-3» . Мол. Клетка. Биол . 10 (6): 2570–2581. DOI : 10,1128 / MCB.10.6.2570 . PMC 360615 . PMID 2111438 .
Вида Г., Ван Хэм Р.С., Вермёлен В., Бутсма Д., ван дер Эб А.Дж., Хоймейкерс Дж. Х. (1990). «Предполагаемая ДНК-геликаза, кодируемая ERCC-3, участвует в нарушениях восстановления ксеродермы у человека и синдроме Кокейна» . Cell . 62 (4): 777–91. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (90) 90122-U . ЛВП : 1765/3020 . PMID 2167179 . S2CID 31743602 .
Максон М.Э., Гудрич Дж. А., Тьян Р. (1994). «Фактор транскрипции IIE связывается преимущественно с РНК-полимеразой IIa и рекрутирует TFIIH: модель клиренса промотора» . Genes Dev . 8 (5): 515–24. DOI : 10,1101 / gad.8.5.515 . PMID 7926747 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Драпкин Р., Рирдон Дж. Т., Ансари А., Хуанг Дж. К., Завел Л., Ан К., Санкар А., Рейнберг Д. (1994). «Двойная роль TFIIH в эксцизионной репарации ДНК и в транскрипции с помощью РНК-полимеразы II». Природа . 368 (6473): 769–72. DOI : 10.1038 / 368769a0 . PMID 8152490 . S2CID 4363484 .
ван Вуурен А.Дж., Вермёлен В., Ма Л., Вида Г., Аппелдорн Э., Ясперс Н.Г., ван дер Эб А.Дж., Бутсма Д., Хоймейкерс Дж. Х., Хумберт С. (1994). «Коррекция дефекта репарации пигментной ксеродермы с помощью базального фактора транскрипции BTF2 (TFIIH)» . EMBO J . 13 (7): 1645–1653. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06428.x . PMC 394995 . PMID 8157004 .
Шеффер Л., Монколлин В., Рой Р., Стауб А., Меззина М., Сарасин А., Вида Г., Хоймейкерс Дж. Х., Эгли Дж. М. (1994). «Белок репарации ERCC2 / ДНК связан с фактором транскрипции BTF2 / TFIIH класса II» . EMBO J . 13 (10): 2388–2392. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06522.x . PMC 395103 . PMID 8194528 .
Гуздер С.Н., Сунг П., Байи В., Пракаш Л., Пракаш С. (1994). «RAD25 - это ДНК-геликаза, необходимая для репарации ДНК и транскрипции РНК-полимеразы II». Природа . 369 (6481): 578–81. DOI : 10.1038 / 369578a0 . PMID 8202161 . S2CID 4332757 .
Вермёлен В., Скотт Р.Дж., Роджерс С., Мюллер Х.Д., Коул Дж., Арлетт С.Ф., Клейджер В.Дж., Бутсма Д., Хоймейкерс Дж. «Клиническая гетерогенность в пределах пигментной ксеродермы, связанная с мутациями в гене репарации ДНК и транскрипции ERCC3» . Являюсь. J. Hum. Genet . 54 (2): 191–200. PMC 1918172 . PMID 8304337 .
Скотт Р.Дж., Итин П., Клейджер В.Дж., Колб К., Арлетт С., Мюллер Х. (1993). «Комплекс синдрома Xeroderma pigmentosum-Cockayne у двух пациентов: отсутствие опухолей кожи, несмотря на серьезный дефицит эксцизионной репарации ДНК». Варенье. Акад. Дерматол . 29 (5 Pt 2): 883–9. DOI : 10.1016 / 0190-9622 (93) 70263-S . PMID 8408834 .
Айер Н., Рейган М.С., Ву К.Дж., Канагараджа Б., Фридберг ЕС (1996). «Взаимодействия с участием комплекса транскрипции / эксцизионной репарации РНК-полимеразы II человека TFIIH, белка эксцизионной репарации нуклеотидов XPG и белка группы B синдрома Кокейна (CSB)». Биохимия . 35 (7): 2157–2167. DOI : 10.1021 / bi9524124 . PMID 8652557 .
Hwang JR, Moncollin V, Vermeulen W., Seroz T., van Vuuren H, Hoeijmakers JH, Egly JM (1996). «Дефект геликазы 3 '-> 5' XPB в факторе репарации / транскрипции TFIIH группы B xeroderma pigmentosum влияет как на репарацию ДНК, так и на транскрипцию» . J. Biol. Chem . 271 (27): 15898–904. DOI : 10.1074 / jbc.271.27.15898 . PMID 8663148 .
Внешние ссылки [ править ]
GeneReviews / NIH / NCBI / UW запись о Xeroderma Pigmentosum
Белок XPBC-ERCC-3 + в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
