Бисульфосукцинимидил суберат (BS3) представляет собой сшивающий агент, используемый в биологических исследованиях. Это водорастворимая версия суберата дисукцинимидила .
Имена | |
---|---|
Название ИЮПАК 1- [8- (2,5-диоксо-3-сульфопирролидин-1-ил) окси-8-оксооктаноил] окси-2,5-диоксопирролидин-3-сульфоновая кислота | |
Другие названия Суберат дисульфосукцинимидила; Бис (сульфосукцинимидил) суберат; BS3 | |
Идентификаторы | |
3D модель ( JSmol ) | |
ChemSpider | |
ECHA InfoCard | 100.110.895 |
PubChem CID | |
UNII | |
Панель управления CompTox ( EPA ) | |
| |
| |
Характеристики | |
C 16 H 20 N 2 O 14 S 2 | |
Молярная масса | 528,46 г · моль -1 |
Если не указано иное, данные приведены для материалов в их стандартном состоянии (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа). | |
проверить ( что есть ?) | |
Ссылки на инфобоксы | |
Сшивающие агенты
Сшивающие агенты - это химические реагенты, которые играют решающую роль в приготовлении конъюгатов, используемых в биологических исследованиях, особенно в иммунотехнологиях и исследованиях белков. Сшивающие агенты предназначены для ковалентного взаимодействия с интересующими молекулами, что приводит к конъюгации. Ножка , как правило , состоящий из нескольких атомов, разделяет две молекулы, а также характер и длина этого спейсера важно учитывать при разработке анализа с участием выбранного сшивающего агента. Бисульфосукцинимидиловый суберат является примером гомобифункционального сшивающего агента.
Характеристики
Водорастворимый: BS3 является гидрофильным из-за его концевых сульфонильных заместителей и в результате диссоциирует в воде, устраняя необходимость в использовании органических растворителей, которые мешают структуре и функции белка. Поскольку при использовании BS3 в качестве сшивающего агента нет необходимости использовать органические растворители, он идеально подходит для исследований структуры и функции белка в физиологических условиях.
Нерасщепляемый: сшивающий агент BS3 имеет 8-атомный спейсер, не расщепляется, и молекула не проницаема для клеточной мембраны. BS3 необратимо связывается со своими конъюгированными молекулами, а это означает, что, как только BS3 создает ковалентные связи со своими молекулами-мишенями, эти ассоциации нелегко разорвать.
Мембрана непроницаема: поскольку BS3 является заряженной молекулой, он не может свободно проходить через клеточные мембраны, что делает его идеальным сшивающим агентом для белков клеточной поверхности.
Гомобифункциональный: BS3 представляет собой гомобифункциональный сшивающий агент в том смысле, что он имеет две идентичные реакционноспособные группы, то есть сложные эфиры N- гидроксисульфосукцинимида, и для установления сшивания между молекулами конъюгата необходима только одна стадия.
Реактивный с амином: BS3 реагирует с амином в том смысле, что его сложные эфиры N- гидроксисульфосукцинимида (NHS) на каждом конце специфически реагируют с первичными аминами с образованием стабильных амидных связей в реакции типа нуклеофильного ацильного замещения, в которой N- гидроксисульфосукцинимид действует как уходящая группа . BS3 особенно полезен в приложениях, связанных с белками, поскольку он может реагировать с первичными аминами на боковой цепи остатков лизина и на N-конце полипептидных цепей. Этот сшивающий агент также можно использовать для стабилизации белок-белковых взаимодействий для дальнейшего анализа с помощью иммунопреципитации.
Дейтерированный BS3
Дейтерированный сшивающий агент бис (сульфосукцинимидил) 2,2,7,7-суберат-d4 является «тяжелым» сшивающим агентом BS3, который содержит 4 атома дейтерия. При использовании в масс-спектрометрических исследованиях BS3-d4 обеспечивает сдвиг на 4 дальтона по сравнению с белками, сшитыми недейтерированным аналогом (BS3-d 0 ). Таким образом, «тяжелые» и «легкие» аналоги сшивающих агентов могут быть использованы для изотопного мечения белков и пептидов в исследованиях масс-спектрометрии.
Приложения
- Исследования рецепторов-лигандов на клеточной поверхности
- Сшивание биомолекул на клетках
- Фиксация белковых комплексов перед анализом взаимодействия белков
Дисукцинимидил суберат
Дисукцинимидил суберат (DSS) - нерастворимый в воде аналог BS3. DSS и BS3 проявляют одинаковую способность к сшиванию по отношению к первичным аминам. Основное структурное различие между этими двумя молекулами состоит в том, что DSS не содержит сульфонатных заместителей на обоих концах молекулы, и именно это различие отвечает за незаряженную, неполярную природу молекулы DSS. Из-за гидрофобной природы этого сшивающего агента его необходимо растворить в органическом растворителе, таком как диметилсульфоксид, перед добавлением к водному образцу. Благодаря способности DSS проникать через клеточные мембраны, он лучше всего подходит для приложений, где требуется внутриклеточное сшивание.