• Аппарат Гольджи • внеклеточная область • везикула • внеклеточная
Биологический процесс
• развитие скелетной системы • дифференцировка клеток • оссификация • разборка внеклеточного матрикса • протеолиз • развитие многоклеточных организмов • развитие хряща • позитивная регуляция развития хряща • конденсация хряща • сборка липопротеиновых частиц высокой плотности • регуляция активности рецепторов • передача сигнала
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
649
12153
Ансамбль
ENSG00000168487
ENSMUSG00000022098
UniProt
P13497
P98063
RefSeq (мРНК)
NM_001199 NM_006128 NM_006129 NM_006130 NM_006131
NM_006132
NM_009755 NM_001360021
RefSeq (белок)
NP_001190 NP_006120
NP_033885 NP_001346950
Расположение (UCSC)
Chr 8: 22.17 - 22.21 Мб
Chr 14: 70,47 - 70,52 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Костный морфогенетический белок 1 , также известный как BMP1 , является белком , который в организме человека кодируется BMP1 геном . [5] [6] Существует семь изоформ белка, созданных альтернативным сплайсингом .
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
2 Структура
3 ссылки
4 Дальнейшее чтение
5 Внешние ссылки
Функция [ править ]
BMP1 принадлежит к семейству костных морфогенетических белков (BMP) пептидазы M12A . Он способствует развитию костей и хрящей. В отличие от других BMP, он не принадлежит к суперсемейству TGFβ . Первоначально было обнаружено, что он действует подобно другим BMP, стимулируя развитие костей и хрящей. Это , однако, является металлопротеазой , что расщепляет С-концом из проколлагена I , II и III . Он имеет астацин- подобный протеазный домен.
Было показано, что он расщепляет ламинин 5 и локализуется в базальном эпителиальном слое кожи крупного рогатого скота .
Локус BMP1 кодирует белок, способный индуцировать образование хряща in vivo. Хотя другие морфогенетические белки костей являются членами суперсемейства TGF-бета, BMP1 кодирует белок, который не имеет близкого родства с другими известными факторами роста. Белок BMP1 и проколлагеновая протеиназа С (PCP), секретируемая металлопротеиназа, требующая кальция и необходимая для образования хрящей и костей, идентичны. Белок PCP или BMP1 расщепляет C-концевые пропептиды проколлагена I, II и III, и его активность увеличивается за счет белка-усилителя C-эндопептидазы проколлагена. Ген BMP1 экспрессируется в виде альтернативно сплайсированных вариантов, которые имеют общий N-концевой домен протеазы, но различаются по своей C-концевой области [5]
Структура [ править ]
Структура BMP1 была определена с помощью дифракции рентгеновских лучей с разрешением 1,27 Å. [7] Эксперименты по кристаллизации проводились путем диффузии пара при pH 7,5. Это важно, потому что он близок к pH человеческого тела, где BMP1 находится in vivo. BMP1 имеет длину 202 остатка. Его вторичная структура состоит из 30% спиралей, или 10 спиралей, длиной 61 остаток и 15% бета-листов, или 11 цепей, длиной 32 остатка. Он содержит лиганды ацетильной группы и ион цинка.
Рамачандрана участок был построен для BMP. [8] Этот график показывает, что BMP1 больше всего предпочитает углы Phi и Psi (Phi, Psi) около (-60 °, -45 °) и (-60 °, 140 °). Эти предпочтительные углы являются оценкой наиболее сгруппированных данных графика Рамачандрана. Предпочтительный регион намного больше по диапазону. 97% остатков находились в предпочтительных областях и 100% остатков находились в разрешенной области, без выбросов.
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000168487 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022098 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ a b «Ген Entrez: костный морфогенетический белок 1 BMP1» .
^ PDB : 3EDG ; Мак Суини А., Гил-Паррадо С., Винзенц Д., Бернарди А., Хайн А., Бодендорф Ю., Эрбель П., Логель С., Герхартц Б. (декабрь 2008 г.). «Структурная основа субстратной специфичности костного морфогенетического белка 1 / толлоид-подобных металлопротеиназ». J. Mol. Биол . 384 (1): 228–39. DOI : 10.1016 / j.jmb.2008.09.029 . PMID 18824173 .
^ "MolProbity Ramachandran анализ 3EDG, модель 1" (PDF) . www.rcsb.org. Архивировано из оригинального (PDF) 12 октября 2012 года.
Дальнейшее чтение [ править ]
Табас Дж. А., Заслофф М., Васмут Дж. Дж. И др. (1991). «Костный морфогенетический белок: хромосомная локализация человеческих генов BMP1, BMP2A и BMP3». Геномика . 9 (2): 283–9. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (91) 90254-C . PMID 2004778 .
Возни Дж. М., Розен В., Селеста А. Дж. И др. (1989). «Новые регуляторы костеобразования: молекулярные клоны и активность». Наука . 242 (4885): 1528–34. DOI : 10.1126 / science.3201241 . PMID 3201241 .
Такахара К., Lyons GE, Greenspan DS (1995). «Костный морфогенетический белок-1 и толлоидный гомолог млекопитающих (mTld) кодируются транскриптами с альтернативным сплайсингом, которые по-разному экспрессируются в некоторых тканях». J. Biol. Chem . 269 (51): 32572–8. PMID 7798260 .
Йошиура К., Тамура Т., Хонг Х.С. и др. (1993). «Картирование гена костного морфогенетического белка 1 (BMP1) на 8p21: удаление BMP1 из кандидатуры костного заболевания при синдроме Лангера-Гедиона». Cytogenet. Cell Genet . 64 (3–4): 208–9. DOI : 10.1159 / 000133577 . PMID 8404039 .
Такахара К., Ли С., Вуд С., Гринспен Д.С. (1996). «Структурная организация и генетическая локализация человеческого костного морфогенетического белка 1 / гена толлоида млекопитающих». Геномика . 29 (1): 9–15. DOI : 10.1006 / geno.1995.1209 . PMID 8530106 .
Кесслер Э., Такахара К., Биняминов Л. и др. (1996). «Костный морфогенетический протеин-1: проколлагеновая С-протеиназа I типа». Наука . 271 (5247): 360–2. DOI : 10.1126 / science.271.5247.360 . PMID 8553073 . S2CID 26378870 .
Ли С.В., Сьерон А.Л., Фертала А. и др. (1996). «C-протеиназа, которая перерабатывает проколлагены в фибриллярные коллагены, идентична белку, ранее идентифицированному как костный морфогенный белок-1» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 93 (10): 5127–30. DOI : 10.1073 / pnas.93.10.5127 . PMC 39418 . PMID 8643539 .
Janitz M, Heiser V, Böttcher U, et al. (1998). «Три альтернативно сплайсированных варианта гена, кодирующего морфогенетический белок-1 кости человека». J. Mol. Med . 76 (2): 141–6. DOI : 10.1007 / s001090050202 . PMID 9500680 . S2CID 26374071 .
Скотт И.К., Блитц И.Л., Паппано В.Н. и др. (1999). «BMP-1 / Толлоид-родственные металлопротеиназы млекопитающих, включая нового члена семейства Толлоид-подобных 2 млекопитающих, обладают различными ферментативными активностями и распределениями экспрессии, соответствующими формированию паттерна и скелетогенезу». Dev. Биол . 213 (2): 283–300. DOI : 10,1006 / dbio.1999.9383 . PMID 10479448 .
Амано С., Скотт И.С., Такахара К. и др. (2000). «Костный морфогенетический белок 1 является внеклеточным процессирующим ферментом цепи ламинина 5 гамма 2» . J. Biol. Chem . 275 (30): 22728–35. DOI : 10.1074 / jbc.M002345200 . PMID 10806203 .
Scott IC, Blitz IL, Pappano WN и др. (2001). «Гомологи витой гаструляции являются внеклеточными кофакторами в антагонизме передачи сигналов BMP». Природа . 410 (6827): 475–8. DOI : 10.1038 / 35068572 . PMID 11260715 . S2CID 4392365 .
Гарриг-Антар Л., Баркер К., Кадлер К. Э. (2001). «Идентификация аминокислотных остатков в костном морфогенетическом протеине-1, важном для активности проколлагеновой С-протеиназы» . J. Biol. Chem . 276 (28): 26237–42. DOI : 10.1074 / jbc.M010814200 . PMID 11283002 .
Unsöld C, Pappano WN, Imamura Y, et al. (2002). «Биосинтетический процессинг гетеротримера коллагена про-альфа 1 (V) 2 про-альфа 2 (V) с помощью костного морфогенетического белка-1 и фурин-подобных пропротеиновых конвертаз» . J. Biol. Chem . 277 (7): 5596–602. DOI : 10.1074 / jbc.M110003200 . PMID 11741999 .
Раттенхолл А., Паппано В.Н., Кох М. и др. (2002). «Протеиназы семейства костных морфогенетических белков-1 превращают проколлаген VII в зрелый заякоренный фибрилльный коллаген» . J. Biol. Chem . 277 (29): 26372–8. DOI : 10.1074 / jbc.M203247200 . PMID 11986329 .
Гарриг-Антар Л., Хартиган Н., Кадлер К. Э. (2003). «Посттрансляционная модификация костного морфогенетического белка-1 необходима для секреции и стабильности белка» . J. Biol. Chem . 277 (45): 43327–34. DOI : 10.1074 / jbc.M207342200 . PMID 12218058 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Хартиган Н., Гарриг-Антар Л., Кадлер К. Э. (2003). «Костный морфогенетический белок-1 (BMP-1). Идентификация минимальной доменной структуры для активности проколлагеновой С-протеиназы» . J. Biol. Chem . 278 (20): 18045–9. DOI : 10.1074 / jbc.M211448200 . PMID 12637537 .
Лейтон М, Кадлер К.Э. (2003). «Парное расщепление основной / фурин-подобной пропротеин конвертазой Pro-BMP-1 в сети транс-Гольджи» . J. Biol. Chem . 278 (20): 18478–84. DOI : 10.1074 / jbc.M213021200 . PMID 12637569 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID 14702039 .
Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). «Недооцененная роль надзора за РНК» . Genome Biol . 5 (2): R8. DOI : 10.1186 / GB-2004-5-2-r8 . PMC 395752 . PMID 14759258 .
Внешние ссылки [ править ]
кость + морфогенетический + белок + 1 в медицинских предметных рубриках Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
Расположение генома человека BMP1 и страница сведений о гене BMP1 в браузере генома UCSC .
Расположение генома человека PCP2 и страница сведений о гене PCP2 в браузере генома UCSC .
Merops онлайновой базы данных для пептидазы и их ингибиторов: M12.005
