CCL5

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1B3A , 1EQT , 1HRJ , 1RTN , 1RTO , 1U4L , 1U4M , 1U4P , 1U4R , 2L9H , 2VXW , 5CMD , 5DNF , 5COY

Идентификаторы

Псевдонимы

CCL5 , D17S136E, RANTES, SCYA5, SIS-дельта, SISd, TCP228, eoCP, хемокиновый лиганд с мотивом CC 5

Внешние идентификаторы

OMIM : 187011 MGI : 98262 HomoloGene : 2244 GeneCards : CCL5

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 17 (человека) ^[1]

Группа	17q12	Начинать	35 871 491 п.н. ^[1]
Группа	17q12	Конец	35 880 793 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 11 (мышь) ^[2]

Группа	11 C \| 11 50,66 см	Начинать	83 525 778 п.н. ^[2]
Группа	11 C \| 11 50,66 см	Конец	83 530 518 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• CCR5 рецепторов хемокинов связывания • сигнального белка тирозинкиназы рецептора активатора активности • хемокинов активность • белок самоассоциация • CCR4 хемокинов связывания рецептора • фосфатидилинозитол фосфолипазы С активность • активности протеинкиназы • активность цитокинов • CCR1 связывания рецептора хемокина • фосфолипазу активатор активности • хемокиновых рецепторов связывание • белок гомодимеризация активности • антагонистической активностью в отношении рецептора хемокина • GO: связывание белка 0001948 • хемоаттрактантная активность • идентичное связывание с белками • связывание с хемокиновым рецептором CCR
Сотовый компонент	• цитоплазма • внеклеточная область • внеклеточная
Биологический процесс	• адгезия лейкоцитов к клеткам • позитивная регуляция межклеточной адгезии, опосредованная интегрином • регуляция активации Т-клеток • позитивная регуляция миграции клеток гладких мышц • активация активности фосфолипазы D • негативная регуляция репликации вирусного генома • позитивная регуляция ERK1 и Каскад ERK2 • позитивная регуляция врожденного иммунного ответа • клеточный ответ на гамма-интерферон • позитивная регуляция хемотаксиса макрофагов • транспорт ионов кальция • экзоцитоз • позитивная регуляция транспорта ионов кальция • ответ на цитокин • регуляция секреции инсулина • хемокин-опосредованный сигнальный путь • позитивная регуляция клеточного биосинтеза • ответ на вирус • позитивная регуляция хемотаксиса моноцитов • клеточный ответ на стимул фактора роста фибробластов • хемотаксис нейтрофилов • ответ на фактор некроза опухоли • отрицательная регуляция процесса апоптоза Т-клеток • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • отрицательная регуляция процесса апоптоза макрофагов • положительное регулирование пролиферации Т-клеток • положительное регулирование фосфорилирования • воспалительный ответ • положительное регулирование инициации трансляции • ответ на токсичное вещество • положительное регулирование пролиферации эпителиальных клеток • положительное регулирование фосфорилирования тирозина белка STAT • клеточный ответ на органическое циклическое соединение • клеточный гомеостаз ионов кальция • тетрамеризация белков • хемотаксис • положительная регуляция гомотипической межклеточной адгезии • клеточный ответ на интерлейкин-1 • иммунный ответ • положительная регуляция репликации вирусного генома • позитивная регуляция каскада JAK-STAT • сигнальный путь, опосредованный липополисахаридами • позитивная регуляция миграции Т-клеток • регуляция хронического воспалительного ответа • позитивная регуляция пролиферации гладкомышечных клеток • активация нейтрофилов • протеинкиназа Передача сигналов B • позитивная регуляция миграции клеток • позитивная регуляция хемотаксиса естественных клеток-киллеров • передача сигналов между клетками • хемотаксис эозинофилов • хемотаксис дендритных клеток • каскад MAPK • хемотаксис макрофагов • позитивная регуляция хемотаксиса Т-клеток • регуляция гибели нейронов • позитивная регуляция передачи сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы • негативная регуляция пути передачи сигналов рецепторного белка, связанного с G-белком • позитивная регуляция апоптотического процесса Т-клеток • позитивная регуляция клеточной адгезии • негативная регуляция хемокин-опосредованного сигнального пути • хемотаксис моноцитов • позитивный хемотаксис • позитивная регуляция активности протеинтирозинкиназы • клеточный ответ на фактор некроза опухоли • положительная регуляция активации активности киназы Януса • регуляция активности рецепторов • сигнальный путь рецептора, связанный с G-белком • цитокин-опосредованный сигнальный путь • хемотаксис лимфоцитов
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


6352


20304

Ансамбль


ENSG00000271503 ENSG00000274233


ENSMUSG00000035042

UniProt


P13501


P30882

RefSeq (мРНК)


NM_002985 NM_001278736


NM_013653

RefSeq (белок)


NP_001265665 NP_002976


NP_038681

Расположение (UCSC)

Chr 17: 35,87 - 35,88 Мб

Chr 11: 83,53 - 83,53 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Хемокинов (CC мотив) лигандом 5 (также CCL5 ) представляет собой белок , который у человека кодируется CCL5 гена . ^[5] Он также известен как RANTES (регулируется при активации, нормальные Т-клетки экспрессируются и секретируются).

Функция [ править ]

CCL5 представляет собой белок 8 кДа, классифицируемый как хемотаксический цитокин или хемокин . CCL5 является хемотаксиком для Т-клеток , эозинофилов и базофилов и играет активную роль в привлечении лейкоцитов к участкам воспаления. С помощью определенных цитокинов (например, IL-2 и IFN-γ ), которые выделяются Т-клетками , CCL5 также индуцирует пролиферацию и активацию определенных естественных киллеров ( NK ) с образованием CHAK (CC-Chemokine-Activated killer). ) клетки. ^[6] Это тоже ВИЧ-супрессивный фактор, высвобождаемый CD8 + Т-клетками ^[7] Этот хемокин локализован на хромосоме 17 у человека. ^[5]

RANTES был впервые идентифицирован при поиске генов, экспрессирующихся «поздно» (3-5 дней) после активации Т-клеток . Впоследствии было установлено, что он является хемокином СС и экспрессируется более чем в 100 человеческих заболеваниях. Экспрессия RANTES регулируется в Т-лимфоцитах Kruppel-подобным фактором 13 ( KLF13 ). ^[8]^[9]^[10]^[11] RANTES, наряду с родственными хемокинами MIP-1alpha и MIP-1beta, был идентифицирован как естественный фактор подавления ВИЧ, секретируемый активированными CD8 + Т-клетками и другими иммунными клетками. ^[7] Недавно был разработан белок RANTES для in vivoпродуцируется бактериями Lactobacillus, и этот раствор превращается в возможный местный микробицид, ингибирующий проникновение ВИЧ. ^[12]

Взаимодействия [ править ]

CCL5 взаимодействует с CCR3 , ^[13]^[14] CCR5 ^[14]^[15]^[16] ^[17] и CCR1 . ^[14]^[16]

CCL5 также активирует рецептор GPR75, связанный с G-белком . ^[18]

См. Также [ править ]

Хемотаксис
Хемокин

Ссылки [ править ]

^ a b c ENSG00000274233 GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000271503, ENSG00000274233 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035042 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ a b Донлон Т.А., Кренски А.М., Уоллес М.Р., Коллинз Ф.С., Ловетт М., Клейбергер С. (март 1990 г.). «Локализация гена, специфичного для Т-клеток человека, RANTES (D17S136E), в хромосоме 17q11.2-q12» (PDF) . Геномика . 6 (3): 548–53. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (90) 90485-D . ЛВП : 2027,42 / 28717 . PMID 1691736 .
^ Maghazachi AA, Al-Aoukaty A, Schall TJ (февраль 1996). «Хемокины CC вызывают образование клеток-киллеров из клеток CD56 +». Евро. J. Immunol . 26 (2): 315–9. DOI : 10.1002 / eji.1830260207 . PMID 8617297 .
^ a b Cocchi F, DeVico AL, Garzino-Demo A, Arya SK, Gallo RC, Lusso P (декабрь 1995 г.). «Идентификация RANTES, MIP-1 альфа и MIP-1 бета как основных факторов подавления ВИЧ, продуцируемых CD8 + Т-клетками» . Наука . 270 (5243): 1811–5. DOI : 10.1126 / science.270.5243.1811 . PMID 8525373 . S2CID 84062618 .
^ Шалл т, J Jongstra, Дайер BJ, Джордженсен Дж, Clayberger С, Дэвис М., Krensky М. (август 1988 г.). «Молекула, специфичная для Т-клеток человека, является членом нового семейства генов» . J. Immunol . 141 (3): 1018–25. PMID 2456327 .
^ Алан М. Кренски (1995). Биология хемокинов в Рантесе (отдел молекулярной биологии) . ISBN компании RG Landes Co. 978-1-57059-253-9.
^ Песня A, Chen YF, Thamatrakoln K, Storm TA, Krensky AM (январь 1999). «RFLAT-1: новый фактор транскрипции цинкового пальца, который активирует экспрессию гена RANTES в Т-лимфоцитах». Иммунитет . 10 (1): 93–103. DOI : 10.1016 / S1074-7613 (00) 80010-2 . PMID 10023774 .
^ Песня А, Никольчева Т, Кренский AM (октябрь 2000 г.). «Транскрипционная регуляция экспрессии RANTES в Т-лимфоцитах». Иммунол. Ред . 177 : 236–45. DOI : 10.1034 / j.1600-065X.2000.17610.x . PMID 11138780 . S2CID 30184294 .
Перейти ↑ Vangelista L, Secchi M, Liu X, Bachi A, Jia L, Xu Q, Lusso P (июль 2010 г.). «Разработка Lactobacillus jensenii для секретирования RANTES и аналога антагониста CCR5 в качестве живых блокаторов ВИЧ-1» . Антимикробный. Агенты Chemother . 54 (7): 2994–3001. DOI : 10,1128 / AAC.01492-09 . PMC 2897324 . PMID 20479208 . Краткое содержание - Science Daily .
^ Догерти Б.Л., Сицилиано С.Дж., ДеМартино Дж. А., Малковиц Л., Сиротина А., Спрингер М. С. (май 1996 г.). «Клонирование, экспрессия и характеристика человеческого эозинофильного рецептора эотаксина» . J. Exp. Med . 183 (5): 2349–54. DOI : 10,1084 / jem.183.5.2349 . PMC 2192548 . PMID 8642344 .
^ a b c Struyf S, Menten P, Lenaerts JP, Put W, D'Haese A, De Clercq E, Schols D, Proost P, Van Damme J (июль 2001 г.). «Различная связывающая способность природных изоформ LD78beta макрофагального воспалительного протеина-1альфа с хемокиновыми рецепторами CC 1, 3 и 5 влияет на их активность против ВИЧ-1 и хемотаксические способности нейтрофилов и эозинофилов» . Евро. J. Immunol . 31 (7): 2170–8. DOI : 10.1002 / 1521-4141 (200107) 31: 7 <2170 :: АИД-IMMU2170> 3.0.CO; 2-Д . PMID 11449371 .
^ Slimani Н, Charnaux Н, Mbemba Е, Саффара л, Vassy Р, Вита С, Gattegno л (октябрь 2003 г.). «Взаимодействие RANTES с синдеканом-1 и синдеканом-4, экспрессируемым первичными макрофагами человека». Биохим. Биофиз. Acta . 1617 (1–2): 80–8. DOI : 10.1016 / j.bbamem.2003.09.006 . PMID 14637022 .
^ a b Proudfoot AE, Fritchley S, Borlat F, Shaw JP, Vilbois F, Zwahlen C, Trkola A, Marchant D, Clapham PR, Wells TN (апрель 2001 г.). «Мотив BBXB в RANTES является основным сайтом связывания гепарина и контролирует селективность рецептора» . J. Biol. Chem . 276 (14): 10620–6. DOI : 10.1074 / jbc.M010867200 . PMID 11116158 .
^ Laplana M, Fibla J (апрель 2012). «Распределение функциональных полиморфных вариантов генов RANTES и CCR5, связанных с воспалением, у долгоживущих людей» . Цитокин . 58 (1): 10–13. DOI : 10.1016 / j.cyto.2011.12.021 . PMID 22265023 .
↑ Игнатов А., Роберт Дж, Грегори-Эванс С., Шаллер ХК (ноябрь 2006 г.). «RANTES стимулирует мобилизацию Ca2 + и образование трифосфата инозитола (IP3) в клетках, трансфицированных G-белком рецептором 75» . Br. J. Pharmacol . 149 (5): 490–7. DOI : 10.1038 / sj.bjp.0706909 . PMC 2014 681 . PMID 17001303 .

Внешние ссылки [ править ]

Расположение генома человека CCL5 и страница сведений о гене CCL5 в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P13501 (хемокин 5 с мотивом CC) в PDBe-KB .

Дальнейшее чтение [ править ]

Muthumani K, Desai BM, Hwang DS, Choo AY, Laddy DJ, Thieu KP, Rao RG, Weiner DB (2004). «ВИЧ-1 Vpr и противовоспалительная активность». ДНК Cell Biol . 23 (4): 239–47. DOI : 10,1089 / 104454904773819824 . PMID 15142381 .
Чжао Р.Ю., старейшина RT (2005 г.). «Вирусные инфекции и регуляция клеточного цикла G2 / M» . Cell Res . 15 (3): 143–9. DOI : 10.1038 / sj.cr.7290279 . PMID 15780175 .
Чжао Р.Ю., Букринский М., Старейшина RT (2005). «Вирусный белок R (Vpr) ВИЧ-1 и клеточные ответы хозяина». Indian J. Med. Res . 121 (4): 270–86. PMID 15817944 .
Li L, Li HS, Pauza CD, Bukrinsky M, Zhao RY (2006). «Роль вспомогательных белков ВИЧ-1 в вирусном патогенезе и взаимодействиях хозяин-патоген» . Cell Res . 15 (11–12): 923–34. DOI : 10.1038 / sj.cr.7290370 . PMID 16354571 .
Игнатов А., Роберт Дж., Грегори-Эванс К., Шаллер ХК (ноябрь 2006 г.). «RANTES стимулирует мобилизацию Ca2 + и образование трифосфата инозитола (IP3) в клетках, трансфицированных G-белком рецептором 75» . Br J Pharmacol . 149 (5): 490–7. DOI : 10.1038 / sj.bjp.0706909 . PMC 2014 681 . PMID 17001303 .

[refGRCh38Ensembl-1] ENSG00000274233 GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000271503, ENSG00000274233 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035042 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1691736-5] Донлон Т.А., Кренски А.М., Уоллес М.Р., Коллинз Ф.С., Ловетт М., Клейбергер С. (март 1990 г.). «Локализация гена, специфичного для Т-клеток человека, RANTES (D17S136E), в хромосоме 17q11.2-q12» (PDF) . Геномика . 6 (3): 548–53. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (90) 90485-D . ЛВП : 2027,42 / 28717 . PMID 1691736 .

[pmid8617297-6] Maghazachi AA, Al-Aoukaty A, Schall TJ (февраль 1996). «Хемокины CC вызывают образование клеток-киллеров из клеток CD56 +». Евро. J. Immunol . 26 (2): 315–9. DOI : 10.1002 / eji.1830260207 . PMID 8617297 .

[pmid8525373-7] Cocchi F, DeVico AL, Garzino-Demo A, Arya SK, Gallo RC, Lusso P (декабрь 1995 г.). «Идентификация RANTES, MIP-1 альфа и MIP-1 бета как основных факторов подавления ВИЧ, продуцируемых CD8 + Т-клетками» . Наука . 270 (5243): 1811–5. DOI : 10.1126 / science.270.5243.1811 . PMID 8525373 . S2CID 84062618 .

[pmid2456327-8] Шалл т, J Jongstra, Дайер BJ, Джордженсен Дж, Clayberger С, Дэвис М., Krensky М. (август 1988 г.). «Молекула, специфичная для Т-клеток человека, является членом нового семейства генов» . J. Immunol . 141 (3): 1018–25. PMID 2456327 .

[isbn1-57059-253-5-9] Алан М. Кренски (1995). Биология хемокинов в Рантесе (отдел молекулярной биологии) . ISBN компании RG Landes Co. 978-1-57059-253-9.

[pmid10023774-10] Песня A, Chen YF, Thamatrakoln K, Storm TA, Krensky AM (январь 1999). «RFLAT-1: новый фактор транскрипции цинкового пальца, который активирует экспрессию гена RANTES в Т-лимфоцитах». Иммунитет . 10 (1): 93–103. DOI : 10.1016 / S1074-7613 (00) 80010-2 . PMID 10023774 .

[pmid11138780-11] Песня А, Никольчева Т, Кренский AM (октябрь 2000 г.). «Транскрипционная регуляция экспрессии RANTES в Т-лимфоцитах». Иммунол. Ред . 177 : 236–45. DOI : 10.1034 / j.1600-065X.2000.17610.x . PMID 11138780 . S2CID 30184294 .

[pmid20479208-12] Перейти ↑ Vangelista L, Secchi M, Liu X, Bachi A, Jia L, Xu Q, Lusso P (июль 2010 г.). «Разработка Lactobacillus jensenii для секретирования RANTES и аналога антагониста CCR5 в качестве живых блокаторов ВИЧ-1» . Антимикробный. Агенты Chemother . 54 (7): 2994–3001. DOI : 10,1128 / AAC.01492-09 . PMC 2897324 . PMID 20479208 . Краткое содержание - Science Daily .

[pmid8642344-13] Догерти Б.Л., Сицилиано С.Дж., ДеМартино Дж. А., Малковиц Л., Сиротина А., Спрингер М. С. (май 1996 г.). «Клонирование, экспрессия и характеристика человеческого эозинофильного рецептора эотаксина» . J. Exp. Med . 183 (5): 2349–54. DOI : 10,1084 / jem.183.5.2349 . PMC 2192548 . PMID 8642344 .

[pmid11449371-14] Struyf S, Menten P, Lenaerts JP, Put W, D'Haese A, De Clercq E, Schols D, Proost P, Van Damme J (июль 2001 г.). «Различная связывающая способность природных изоформ LD78beta макрофагального воспалительного протеина-1альфа с хемокиновыми рецепторами CC 1, 3 и 5 влияет на их активность против ВИЧ-1 и хемотаксические способности нейтрофилов и эозинофилов» . Евро. J. Immunol . 31 (7): 2170–8. DOI : 10.1002 / 1521-4141 (200107) 31: 7 <2170 :: АИД-IMMU2170> 3.0.CO; 2-Д . PMID 11449371 .

[pmid14637022-15] Slimani Н, Charnaux Н, Mbemba Е, Саффара л, Vassy Р, Вита С, Gattegno л (октябрь 2003 г.). «Взаимодействие RANTES с синдеканом-1 и синдеканом-4, экспрессируемым первичными макрофагами человека». Биохим. Биофиз. Acta . 1617 (1–2): 80–8. DOI : 10.1016 / j.bbamem.2003.09.006 . PMID 14637022 .

[pmid11116158-16] Proudfoot AE, Fritchley S, Borlat F, Shaw JP, Vilbois F, Zwahlen C, Trkola A, Marchant D, Clapham PR, Wells TN (апрель 2001 г.). «Мотив BBXB в RANTES является основным сайтом связывания гепарина и контролирует селективность рецептора» . J. Biol. Chem . 276 (14): 10620–6. DOI : 10.1074 / jbc.M010867200 . PMID 11116158 .

[pmid_22265023-17] Laplana M, Fibla J (апрель 2012). «Распределение функциональных полиморфных вариантов генов RANTES и CCR5, связанных с воспалением, у долгоживущих людей» . Цитокин . 58 (1): 10–13. DOI : 10.1016 / j.cyto.2011.12.021 . PMID 22265023 .

[pmid17001303-18] Игнатов А., Роберт Дж, Грегори-Эванс С., Шаллер ХК (ноябрь 2006 г.). «RANTES стимулирует мобилизацию Ca2 + и образование трифосфата инозитола (IP3) в клетках, трансфицированных G-белком рецептором 75» . Br. J. Pharmacol . 149 (5): 490–7. DOI : 10.1038 / sj.bjp.0706909 . PMC 2014 681 . PMID 17001303 .

[1]