Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
CD1D
Белок CD1D PDB 1zt4.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

4WO4 , 1ZT4 , 2PO6 , 3HUJ , 3SDX , 3TZV , 3U0P , 3VWJ , 3VWK , 4EN3 , 4LHU , 4MNG , 4MQ7 , 4WW2

Идентификаторы
ПсевдонимыCD1D , CD1A, R3, R3G1, молекула CD1d
Внешние идентификаторыOMIM : 188410 MGI : 107674 HomoloGene : 1337 GeneCards : CD1d
Расположение гена ( человек )
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человека) [1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение CD1D
Геномное расположение CD1D
Группа1q23.1Начинать158 178 030 п.н. [1]
Конец158 186 427 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 3 (мышь)
Chr.Хромосома 3 (мышь) [2]
Хромосома 3 (мышь)
Геномное расположение CD1D
Геномное расположение CD1D
Группа3 F1 | 3 37,91 смНачинать86 995 834 п.н. [2]
Конец86 999 441 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• бета-2-микроглобулин связывание
• связывание липопептидного
• связывание гистона
• эндогенного липида антигенсвязывающего
• липидного антигенсвязывающий
• экзогенного липидный связывания антиген
• при клеточной адгезии связывающей молекулы
• GO: 0001948 связывания белка
Сотовый компонент• цитоплазма
• составной компонент мембраны
• эндосома
• мембрана эндоплазматического ретикулума
• мембрана
• интегральный компонент плазматической мембраны
• поверхность клетки
• лизосомальная мембрана
• базолатеральная плазматическая мембрана
• лизосома
• мембрана эндосомы
• клеточная мембрана
• эндоплазматический ретикулум
• внеклеточная
• внешняя сторона плазматической мембраны
Биологический процесс• процесс иммунной системы
• отбор Т-клеток
• гетеротипическая клеточная адгезия
• позитивная регуляция пролиферации Т-клеток
• обнаружение бактерий
• позитивная регуляция врожденного иммунного ответа
• процессинг и презентация антигена, экзогенный липидный антиген через MHC класса Ib
• врожденная иммунная система
• GO: 0022415 вирусный процесс
• процессинг и презентация антигена, эндогенный липидный антиген посредством MHC класса Ib
• регуляция иммунного ответа
• положительная регуляция цитотоксичности, опосредованной Т-клетками
• иммунный ответ
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

912

12479

Ансамбль

ENSG00000158473

ENSMUSG00000028076

UniProt

P15813

P11609

RefSeq (мРНК)

NM_001766
NM_001319145
NM_001371761
NM_001371762
NM_001371763

NM_007639
NM_001379501
NM_001379502
NM_001379503

RefSeq (белок)

NP_001306074
NP_001757
NP_001358690
NP_001358691
NP_001358692

NP_031665
NP_001366430
NP_001366431
NP_001366432

Расположение (UCSC)Chr 1: 158.18 - 158.19 МбChr 3: 87 - 87 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

CD1d является человеческий ген , который кодирует белок CD1d , [5] член CD1 (кластер дифференцировки 1) семейства гликопротеинов , экспрессируемых на поверхности различных человеческих антиген-представляющих клеток . Они не являются классическими MHC белки, относящиеся к классу I MHC белков и участвуют в презентации липидных антигенов к Т - клеткам . CD1d является единственным членом группы 2 молекул CD1.

Биологическое значение [ править ]

Липидные антигены, представленные CD1d, активируют особый класс Т-клеток, известный как естественные Т-клетки- киллеры (NKT) , посредством взаимодействия с рецептором Т-клеток, присутствующим на мембранах NKT. [5] При активации NKT-клетки быстро продуцируют цитокины Th1 и Th2 , обычно представленные выработкой гамма-интерферона и интерлейкина 4 .

Номенклатура [ править ]

CD1d также известен как R3G1

Лиганды [ править ]

Некоторые из известных лигандов CD1d:

  • α - галактозилцерамид (α-GalCer), соединение, первоначально полученное из морской губки Agelas mauritanius [6], не имеющее физиологической роли, но имеющее большую исследовательскую ценность.
  • α- glucuronyl- и α- galacturonyl- церамида , семейство соединений микробного происхождения , которые можно найти, например, на клеточную стенку из Sphingomonas , повсеместно грамотрицательной бактерии . [7] Родственный β-D- глюкопиранозилцерамид накапливается в антигенпрезентирующих клетках после заражения, где он служит для активации инвариантных NKT (iNKT), особого вида NKT.
  • iGb3 , аутоантиген , который использовался при отборе iNKT. [8]
  • HS44, синтетический аналог аминоциклитолического церамида, который имеет меньший контакт с TCR, активирует iNKT более ограниченным образом, чем α-GalCer (особенно в отношении продукции цитокинов Th2), и, таким образом, более интересен для терапевтического использования. [9]

Тетрамеры CD1d [ править ]

Тетрамеры CD1d представляют собой белковые конструкции, состоящие из четырех молекул CD1d, соединенных вместе и обычно флуоресцентно меченных, используемых для идентификации NKT-клеток или других CD1d-реактивных клеток. В частности, ими окрашиваются NKT-клетки I типа и некоторые NKT-клетки II типа. Дифференциация этих двух типов может быть получена у человека с помощью антитела против цепи Vα24 TCR, которая специфична для NKT-клеток I типа. [10]

Хотя они являются наиболее широко используемыми олигомерами CD1d, иногда вместо них используются димеры CD1d (две единицы) или пентамеры (пять единиц). [10]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000158473 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028076 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b "P15813 (CD1D_HUMAN)" . Uniprot . Проверено 1 марта 2013 года .
  6. ^ Франк, Ричард В. (1 января 2012 г.). «C-Галактозилцерамид: синтез и иммунология» . Comptes Rendus Chimie . 15 (1): 46–56. DOI : 10.1016 / j.crci.2011.05.006 . PMC 3293403 . PMID 22408579 .  
  7. ^ Bendelac, A; Savage PB; Тейтон I (2007). «Биология NKT-клеток». Ежегодный обзор иммунологии . 25 (1): 297–336. DOI : 10.1146 / annurev.immunol.25.022106.141711 . PMID 17150027 . 
  8. ^ Чжоу, D (август 2006). «Иммунологическая функция iGb3». Современная наука о белках и пептидах . 7 (4): 325–333. DOI : 10.2174 / 138920306778018007 . PMID 16918447 . 
  9. ^ J. Kerzerho; Е. Ю.; CM Barra; Э. Алари-Пахисса; Э. Жирарди; Ю. Харрак; П. Лаузурица; А. Ллебария; Д. Зайонц; О. Акбари; А. Р. Кастаньо (2012). «Структурная и функциональная характеристика нового негликозидного агониста iNKT с иммуномодулирующими свойствами» . Журнал иммунологии . 188 (5): 2254–2265. DOI : 10.4049 / jimmunol.1103049 . PMC 3288653 . PMID 22301545 .  
  10. ^ a b Терабе, Масаки; Берзофски, Джей А. (2008). «Роль NKT-клеток в опухолевом иммунитете» . Adv Cancer Res . 101 : 277–348. DOI : 10.1016 / S0065-230X (08) 00408-9 . PMC 2693255 . PMID 19055947 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Мелиан А., Бекман Э.М., Порчелли С.А., Бреннер МБ (1996). «Презентация антигена молекулами класса I, кодируемыми CD1 и MHC». Curr. Opin. Иммунол . 8 (1): 82–88. DOI : 10.1016 / S0952-7915 (96) 80109-9 . PMID  8729450 .
  • Джойс С (2001). «CD1d и естественные Т-клетки: как их свойства запускают иммунную систему». Клетка. Мол. Life Sci . 58 (3): 442–469. DOI : 10.1007 / PL00000869 . PMID  11315191 . S2CID  29982004 .
  • Скёльд М., Бехар С.М. (2003). «Роль CD1d-ограниченных NKT-клеток в микробном иммунитете» . Заразить. Иммун . 71 (10): 5447–5455. DOI : 10.1128 / IAI.71.10.5447-5455.2003 . PMC  201095 . PMID  14500461 .
  • Бригл М., Бреннер МБ (2004). «CD1: презентация антигена и функция Т-клеток». Анну. Rev. Immunol . 22 (1): 817–890. DOI : 10.1146 / annurev.immunol.22.012703.104608 . PMID  15032598 .
  • Плита V, Верхассельт B (2006). «Моделирование эффектов Nef ВИЧ-1 в тимусе». Curr. HIV Res . 4 (1): 57–64. DOI : 10.2174 / 157016206775197583 . PMID  16454711 .
  • Бруткевич Р.Р. (2006). «Лиганды CD1d: хорошие, плохие и уродливые» . J. Immunol . 177 (2): 769–775. DOI : 10.4049 / jimmunol.177.2.769 . PMID  16818729 .
  • Блумберг Р.С., Терхорст С., Блейхер П. и др. (1991). «Экспрессия неполиморфной молекулы, подобной MHC класса I, CD1D, эпителиальными клетками кишечника человека». J. Immunol . 147 (8): 2518–2524. PMID  1717564 .
  • Балк С.П., Блейхер П.А., Терхорст С. (1989). «Выделение и характеристика кДНК и гена, кодирующего четвертую молекулу CD1» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 86 (1): 252–256. Полномочный код : 1989PNAS ... 86..252B . DOI : 10.1073 / pnas.86.1.252 . PMC  286442 . PMID  2463622 .
  • Калаби Ф., Джарвис Дж. М., Мартин Л., Мильштейн С. (1989). «Два класса генов CD1». Евро. J. Immunol . 19 (2): 285–292. DOI : 10.1002 / eji.1830190211 . PMID  2467814 . S2CID  31384394 .
  • Ю. CY, Мильштейн C (1990). «Физическая карта, связывающая пять генов антигена дифференцировки тимоцитов человека CD1» . EMBO J . 8 (12): 3727–3732. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1989.tb08548.x . PMC  402056 . PMID  2583117 .
  • Мартин Л.Х., Калаби Ф., Мильштейн С. (1987). «Выделение генов CD1: семейство основных дифференцировочных антигенов, связанных с комплексом гистосовместимости» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 83 (23): 9154–9158. DOI : 10.1073 / pnas.83.23.9154 . PMC  387093 . PMID  3097645 .
  • Балк С.П., Бурк С., Полищук Ю.Е. и др. (1994). «Бета 2-микроглобулиннезависимая молекула MHC класса Ib, экспрессируемая эпителием кишечника человека». Наука . 265 (5169): 259–262. Bibcode : 1994Sci ... 265..259B . DOI : 10.1126 / science.7517575 . PMID  7517575 .
  • Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–174. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–156. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Кавано Т., Цуй Дж., Коэдзука Ю. и др. (1997). «CD1d-ограниченная и TCR-опосредованная активация valpha14 NKT-клеток гликозилцерамидами». Наука . 278 (5343): 1626–1629. Bibcode : 1997Sci ... 278.1626K . DOI : 10.1126 / science.278.5343.1626 . PMID  9374463 .
  • Катабами С., Мацуура А., Чен Х.З. и др. (1998). «Структурная организация крысиного CD1 типична для эволюционно консервативных генов класса CD1D». Иммуногенетика . 48 (1): 22–31. DOI : 10.1007 / s002510050396 . PMID  9601940 . S2CID  6715203 .
  • Somnay-Wadgaonkar K, Nusrat A, Kim HS, et al. (1999). «Иммунолокализация CD1d в эпителиальных клетках кишечника человека и идентификация формы, связанной с бета2-микроглобулином» . Int. Иммунол . 11 (3): 383–392. DOI : 10.1093 / intimm / 11.3.383 . PMID  10221650 .
  • Кэмпбелл Н.А., Ким Х.С., Блумберг Р.С., Майер Л. (1999). «Неклассическая молекула класса I CD1d ассоциируется с новым лигандом CD8 gp180 на эпителиальных клетках кишечника» . J. Biol. Chem . 274 (37): 26259–26265. DOI : 10.1074 / jbc.274.37.26259 . PMID  10473580 .
  • Хан М., Ханник Л., ДиБрино М., Робинсон М.А. (2000). «Полиморфизм генов CD1 человека» . Тканевые антигены . 54 (2): 122–127. DOI : 10.1034 / j.1399-0039.1999.540202.x . PMID  10488738 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Антиген CD1d + в медицинских предметных рубриках Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • Расположение генома человека CD1A и страница сведений о гене CD1A в браузере генома UCSC .
  • Расположение генома человека CD1D и страница сведений о гене CD1D в браузере генома UCSC .