Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
CD6
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

5A2E

Идентификаторы
ПсевдонимыCD6 , TP120, молекула CD6
Внешние идентификаторыOMIM : 186720 MGI : 103566 HomoloGene : 4893 GeneCards : CD6
Расположение гена ( человек )
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человека) [1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение CD6
Геномное расположение CD6
Группа11q12.2Начинать60 971 680 п.н. [1]
Конец61 020 377 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 19 (мышь)
Chr.Хромосома 19 (мышь) [2]
Хромосома 19 (мышь)
Геномное расположение CD6
Геномное расположение CD6
Группа19 А | 19 7,16 смНачинать10 789 341 п.н. [2]
Конец10 830 058 п.н. [2]
Генная онтология
Молекулярная функция• липополисахарид связывание
• липотейхоевой кислоты связывания
• активности рецептора поглотителя
• GO: связывание белка 0001948
• связывание белка идентичного
Сотовый компонент• неотъемлемый компонент мембраны
• мембрана
• внутренний компонент плазматической мембраны
• плазматическая мембрана
• интегральный компонент плазматической мембраны
• Т-клеточный рецепторный комплекс
• внеклеточная область
• иммунологический синапс
• внешняя сторона плазматической мембраны
Биологический процесс• положительное регулирование производства цитокинов , участвующих в воспалительной реакции
• гетерофильных межклеточной адгезии с помощью адгезивных молекул с плазматической мембраной клеток
• адаптационная реакция иммунной
• системный процесс иммунной
• острые воспалительные реакции на антигенный стимул
• рецептор-опосредованного эндоцитоза
• ответ на липополисахарид
• клеточная адгезия
• положительная регуляция пролиферации Т-клеток
• врожденный иммунный ответ
• формирование иммунологических синапсов
• липополисахаридный сигнальный путь
• опосредованный везикулами транспорт
• эндоцитоз
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

923

12511

Ансамбль

ENSG00000013725

ENSMUSG00000024670

UniProt

P30203

Q61003

RefSeq (мРНК)

NM_001254750
NM_001254751
NM_006725

NM_001037801
NM_009852

RefSeq (белок)

NP_001241679
NP_001241680
NP_006716

NP_001032890
NP_033982

Расположение (UCSC)Chr 11: 60.97 - 61.02 МбChr 19: 10.79 - 10.83 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

CD6 ( С блеском D ifferentiation 6) представляет собой человеческий белок , кодируемый CD6 ген . [5] [6]

Функция [ править ]

Этот ген кодирует белок, обнаруженный на внешней мембране Т-лимфоцитов, а также некоторых других иммунных клеток. Кодируемый белок содержит три домена, богатых цистеином (SRCR) рецептора-скавенджера, и сайт связывания для активированной молекулы адгезии лейкоцитарных клеток . Продукт гена важен для продолжения активации Т-клеток . [5]

Клиническое значение [ править ]

Некоторые аллели этого гена могут быть связаны с предрасположенностью к рассеянному склерозу . [7] [8]

См. Также [ править ]

  • Кластер дифференциации

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000013725 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024670 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b "Ген Энтреза: CD6 молекула CD6" .
  6. ↑ Bowen MA, Patel DD, Li X, Modrell B, Malacko AR, Wang WC, Marquardt H, Neubauer M, Pesando JM, Francke U (1995). «Клонирование, картирование и характеристика активированной молекулы адгезии лейкоцитов и клеток (ALCAM), лиганда CD6» . J. Exp. Med . 181 (6): 2213–20. DOI : 10,1084 / jem.181.6.2213 . PMC 2192054 . PMID 7760007 .  
  7. ↑ De Jager PL, Jia X, Wang J, de Bakker PI, Ottoboni L, Aggarwal NT, Piccio L, Raychaudhuri S, Tran D, Aubin C, Briskin R, Romano S, Baranzini SE, McCauley JL, Pericak-Vance MA, Haines JL, Gibson RA, Naeglin Y, Uitdehaag B, Matthews PM, Kappos L, Polman C, McArdle WL, Strachan DP, Evans D, Cross AH, Daly MJ, Compston A, Sawcer SJ, Weiner HL, Hauser SL, Hafler DA , Оксенберг-младший (2009). «Мета-анализ сканирования генома и репликации идентифицирует CD6, IRF8 и TNFRSF1A как новые локусы восприимчивости к рассеянному склерозу» . Nat. Genet . 41 (7): 776–82. DOI : 10.1038 / ng.401 . PMC 2757648 . PMID 19525953 .  
  8. ^ Kofler DM, Северсон CA, Mousissian N, De Jager PL, Hafler DA (2011). «Аллель предрасположенности к рассеянному склерозу CD6 связан с изменениями пролиферации CD4 + Т-клеток» . J. Immunol . 187 (6): 3286–91. DOI : 10.4049 / jimmunol.1100626 . PMID 21849685 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Аруффо А, Мельник МБ, Линсли П.С., Сид В (1991). «Гликопротеин лимфоцитов CD6 содержит повторяющуюся доменную структуру, характерную для нового семейства клеточной поверхности и секретируемых белков» . J. Exp. Med . 174 (4): 949–52. DOI : 10,1084 / jem.174.4.949 . PMC  2118957 . PMID  1919444 .
  • Swack JA, Mier JW, Romain PL, Hull SR, Rudd CE (1991). «Биосинтез и посттрансляционная модификация CD6, молекулы, передающей сигнал Т-клетки». J. Biol. Chem . 266 (11): 7137–43. PMID  2016320 .
  • Цуге И., Уцуми К.Р., Уэда Р., Такамото С., Такахаши Т. (1985). «Присвоение гена, кодирующего антиген дифференцировки человеческих Т-клеток, Tp120, хромосоме 11». Сомат. Cell Mol. Genet . 11 (3): 217–22. DOI : 10.1007 / BF01534678 . PMID  3923629 . S2CID  39343360 .
  • Whitney GS, Starling GC, Bowen MA, Modrell B, Siadak AW, Aruffo A (1995). «Богатый цистеином домен CD6, проксимальный к мембране рецептора скавенджера, содержит активированный сайт связывания молекулы адгезии лейкоцитов» . J. Biol. Chem . 270 (31): 18187–90. DOI : 10.1074 / jbc.270.31.18187 . PMID  7543097 .
  • Робинсон У.Х., Нойман де Вегвар Х.Э., Прохаска СС, Ри Дж. У., Парнес-младший (1995). «CD6 человека обладает большим цитоплазматическим доменом с альтернативным сплайсингом». Евро. J. Immunol . 25 (10): 2765–9. DOI : 10.1002 / eji.1830251008 . PMID  7589069 . S2CID  8996113 .
  • Wee S, Schieven GL, Kirihara JM, Tsu TT, Ledbetter JA, Aruffo A (1993). «Фосфорилирование CD6 тирозином путем стимуляции CD3: увеличение с помощью корецепторов CD4 и CD2» . J. Exp. Med . 177 (1): 219–23. DOI : 10,1084 / jem.177.1.219 . PMC  2190871 . PMID  7678115 .
  • Bowen MA, Whitney GS, Neubauer M, Starling GC, Palmer D, Zhang J, Nowak NJ, Shows TB, Aruffo A (1997). «Структура и хромосомное расположение гена CD6 человека: обнаружение пяти изоформ CD6 человека». J. Immunol . 158 (3): 1149–56. PMID  9013954 .
  • Кобарг Дж., Уитни Г.С., Палмер Д., Аруффо А., Боуэн М.А. (1998). «Анализ фосфорилирования тирозина и флюсинга кальция изоформ CD6 человека с различными цитоплазматическими доменами». Евро. J. Immunol . 27 (11): 2971–80. DOI : 10.1002 / eji.1830271133 . PMID  9394826 . S2CID  20897222 .
  • Певица NG, Mitra R, Lialios F, Richardson BC, Marks RM, Pesando JM, Fox DA, Nickoloff BJ (1998). «CD6-зависимые взаимодействия Т-клеток и кератиноцитов: функциональные доказательства наличия второго лиганда CD6 на кератиноцитах, активированных гамма-интерфероном». Иммунол. Lett . 58 (1): 9–14. DOI : 10.1016 / S0165-2478 (97) 02707-7 . PMID  9436462 .
  • Гимферрер I, Фарнос М., Кальво М., Миттельбрунн М., Энрих С., Санчес-Мадрид Ф., Вивес Дж., Лозано Ф. (2003). «Дополнительные молекулы CD5 и CD6 связываются на мембране лимфоидных Т-клеток» . J. Biol. Chem . 278 (10): 8564–71. DOI : 10.1074 / jbc.M209591200 . PMID  12473675 .
  • Шин Б.К., Ван Х., Йим А.М., Ле Наур Ф., Брихори Ф., Джанг Дж.Х., Чжао Р., Пуравс Э., Тра Дж., Майкл К.В., Мисек Д.Э., Ханаш С.М. (2003). «Глобальное профилирование протеома клеточной поверхности раковых клеток раскрывает множество белков с функцией шаперона» . J. Biol. Chem . 278 (9): 7607–16. DOI : 10.1074 / jbc.M210455200 . PMID  12493773 .
  • Гимферрер И., Ибаньес А., Фарнос М., Сарриас М. Р., Фенутрия Р., Роселло С., Циммерманн П., Дэвид Г., Вивес Дж., Серра-Пажес С., Лозано Ф. (2005). «Рецептор лимфоцитов CD6 взаимодействует с синтенином-1, каркасным белком, содержащим домены PDZ» . J. Immunol . 175 (3): 1406–14. DOI : 10.4049 / jimmunol.175.3.1406 . PMID  16034076 .
  • Като Й, Танака Й, Хаяси М., Окава К., Минато Н. (2006). «Участие CD166 в активации человеческих гамма-дельта Т-клеток опухолевыми клетками, сенсибилизированными непептидными антигенами» . J. Immunol . 177 (2): 877–84. DOI : 10.4049 / jimmunol.177.2.877 . PMID  16818742 .
  • Ибаньес А., Сарриас М.Р., Фарнос М., Гимферрер И., Серра-Пажес С., Вивес Дж., Лозано Ф. (2006). «Активация митоген-активируемого пути протеинкиназы поверхностным рецептором лимфоцитов CD6» . J. Immunol . 177 (2): 1152–9. DOI : 10.4049 / jimmunol.177.2.1152 . PMID  16818773 .
  • Хассан Н.Дж., Симмондс С.Дж., Кларксон Н.Г., Ханрахан С., Пуклавец М.Дж., Бомба М., Барклай А.Н., Браун М.Х. (2006). «CD6 регулирует ответы Т-клеток посредством зависимого от активации рекрутирования положительного регулятора SLP-76» . Мол. Клетка. Биол . 26 (17): 6727–38. DOI : 10.1128 / MCB.00688-06 . PMC  1592849 . PMID  16914752 .
  • Кастро М.А., Оливейра М.И., Нуньес Р.Дж., Фабр С., Барбоса Р., Пейшото А., Браун М.Х., Парнес Дж. Р., Висмут Г., Морейра А., Роча Б., Кармо А.М. (2007). «Внеклеточные изоформы CD6, полученные путем альтернативного сплайсинга, регулируют нацеливание CD6 на иммунологический синапс» . J. Immunol . 178 (7): 4351–61. DOI : 10.4049 / jimmunol.178.7.4351 . PMID  17371992 .
  • Сарриас М.Р., Фарнос М., Мота Р., Санчес-Барберо Ф., Ибанес А., Гимферрер И., Вера Дж., Фенутрия Р., Казальс С., Йеламос Дж., Лозано Ф. (2007). «CD6 связывается с патоген-ассоциированными молекулярными структурами и защищает от LPS-индуцированного септического шока» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 104 (28): 11724–9. Bibcode : 2007PNAS..10411724S . DOI : 10.1073 / pnas.0702815104 . PMC  1913855 . PMID  17601777 .

Внешние ссылки [ править ]

  • CD6 + белок, + человеческий по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • Человек CD6 место генома и CD6 ген подробно страницу в браузере УСК генома .
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P30203 (антиген дифференцировки Т-клеток человека CD6) в PDBe-KB .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .


  • v
  • т
  • е