Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
CD63
Идентификаторы
ПсевдонимыCD63 , LAMP-3, ME491, MLA1, OMA81H, TSPAN30, молекула CD63
Внешние идентификаторыOMIM : 155740 MGI : 99529 HomoloGene : 37526 GeneCards : CD63
Расположение гена ( человек )
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человека) [1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение CD63
Геномное расположение CD63
Группа12q13.2Начинать55 725 323 п.н. [1]
Конец55 729 707 б.п. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 10 (мышь)
Chr.Хромосома 10 (мышь) [2]
Хромосома 10 (мышь)
Геномное расположение CD63
Геномное расположение CD63
Группа10 D3 | 10 77,19 смНачинать128 900 989 п.н. [2]
Конец128 912 822 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE CD63 200663 в fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание с белком GO: 0001948
Сотовый компонент• неотъемлемого компонент мембраны
• Мультивезикулярные тела
• эндосома
• Мультивезикулярной мембрана
• мембрана
• конец эндосома мембрана
• неотъемлемого компонент плазматической мембрана
• меланосома
• клеточной мембраны
• неотъемлемый компонент плазматическая мембрана
• эндосома лй
• Мультивезикулярного тело, внутренний пузырек
• лизосомальная мембрана
• внеклеточная область
• плотная мембрана гранул тромбоцитов
• лизосома
• мембрана эндосомы
• внеклеточная экзосома
• внеклеточная
• поверхность клетки
• мембрана азурофильных гранул
• поздняя эндосома
Биологический процесс• позитивная регуляция интернализации рецептора
• дегрануляция тромбоцитов
• созревание пигментных гранул
• клеточная локализация белка
• транспорт эндосомы в меланосомы
• транспорт белка
• позитивная регуляция интегрин-опосредованного сигнального пути
• адгезия клеточного матрикса
• миграция клеток
• дегрануляция нейтрофилов
• транспорт
• пигментация
• дифференцировка пигментных клеток
• регуляция сигнального пути фактора роста эндотелия сосудов
• сигнальный путь рецептора клеточной поверхности
• положительная регуляция эндоцитоза
• регуляция трансмембранного транспорта ионов калия
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

967

12512

Ансамбль

ENSG00000135404

ENSMUSG00000025351

UniProt

P08962

P41731

RefSeq (мРНК)
NM_001780
NM_001040034
NM_001257389
NM_001257390
NM_001257391

NM_001257392
NM_001257400
NM_001257401
NM_001267698

NM_001042580
NM_001282966
NM_007653

RefSeq (белок)
NP_001244318
NP_001244319
NP_001244320
NP_001244321
NP_001244329

NP_001244330
NP_001254627
NP_001771

NP_001036045
NP_001269895
NP_031679

Расположение (UCSC)Chr 12: 55.73 - 55.73 МбChr 10: 128,9 - 128,91 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

CD63 антиген представляет собой белок , который, в организме человека, кодируется CD63 гена . [5] CD63 в основном связан с мембранами внутриклеточных везикул, хотя экспрессия на клеточной поверхности может быть индуцирована.

Функция [ править ]

Белок, кодируемый этим геном, является членом суперсемейства трансмембранных 4, также известного как семейство тетраспанинов . Большинство этих членов представляют собой белки клеточной поверхности, для которых характерно наличие четырех гидрофобных доменов. Белки опосредуют события передачи сигнала, которые играют роль в регуляции развития, активации, роста и подвижности клеток. Этот кодируемый белок представляет собой гликопротеин клеточной поверхности, который, как известно, образует комплекс с интегринами. Он может действовать как маркер активации тромбоцитов. Дефицит этого белка связан с синдромом Германского-Пудлака.. Также этот ген был связан с прогрессированием опухоли. Для этого гена было обнаружено использование альтернативных сайтов полиаденилирования. Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскриптов, кодирующих разные белки. [5]

Диагностика аллергии [ править ]

CD63 является хорошим маркером для количественного определения активированных in vitro базофилов проточной цитометрией для диагностики IgE-опосредованной аллергии. Этот тест обычно называют тестом активации базофилов (BAT).

Исследование [ править ]

Первоначально делеционные и точечные мутанты использовали для исследования роли С-конца, который содержит предполагаемый мотив нацеливания на лизосомы / интернализации (GYEVM). С-концевые мутанты показали повышенную поверхностную экспрессию и пониженную внутриклеточную локализацию по сравнению с CD63Wt. Индуцированная антителами интернализация была снижена у мутантов с С-концевой делецией и отменена у мутантов G → A и Y → A, что свидетельствует о решающей роли этих остатков в интернализации.

CD63 широко и по-разному гликозилирован, а область EC2 содержит три потенциальных сайта N-связанного гликозилирования (N130, N150 и N172). Мутанты N130A и N150A были подобны hCD63Wt в отношении внутриклеточной локализации и интернализации. Однако мутант hCD63N172A обнаружил в основном локализацию на клеточной поверхности и низкую интернализацию. Экспрессия мутанта, лишенного всех трех сайтов гликозилирования, была очень нестабильной. Было высказано предположение, что снижение интернализации CD63N172A может быть связано с изменениями его взаимодействия с молекулами клеточной поверхности. Эксперименты по иммунопреципитации показали некоторые доказательства связи белка (100 кДа) с CD63N172A, но это не соответствовало. Однако ассоциация между CD63Wt и интегрином β2 (CD18) была показана совместной интернализацией этих белков.

В клеточной биологии CD63 часто используется в качестве маркера мультивезикулярных телец, которые в некоторых клетках обогащены CD63, [6], а также внеклеточных везикул, высвобождаемых из мультивезикулярного тельца или плазматической мембраны. [7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что CD63 взаимодействует с CD117 [8] и CD82 . [9]

См. Также [ править ]

  • Кластер дифференциации

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000135404 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025351 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b «Ген Энтреза: молекула CD63 CD63» .
  6. ^ Piper RC, Katzmann DJ (2007). «Биогенез и функция мультивезикулярных тел» . Ежегодный обзор клеточной биологии и биологии развития . 23 : 519–47. DOI : 10.1146 / annurev.cellbio.23.090506.123319 . PMC 2911632 . PMID 17506697 .  
  7. ^ Тери C, Витвер KW, Aikawa E, Alcaraz MJ, Anderson JD, Andriantsitohaina R и др. (2018). «Минимальная информация для исследований внеклеточных везикул 2018 (MISEV2018): заявление о позиции Международного общества внеклеточных везикул и обновление руководящих принципов MISEV2014» . Журнал внеклеточных пузырьков . 7 (1): 1535750. DOI : 10,1080 / 20013078.2018.1535750 . PMC 6322352 . PMID 30637094 .  
  8. ^ Anzai N, Ли Y, Youn BS, Фукуда S, Kim YJ, каминные C, M Акаси, Broxmeyer HE (июнь 2002). «C-kit, связанный с трансмембранными 4 белками суперсемейства, составляет функционально отличную субъединицу в гематопоэтических предшественниках человека». Кровь . 99 (12): 4413–21. DOI : 10.1182 / blood.V99.12.4413 . PMID 12036870 . 
  9. ^ Hammond C, Denzin LK, Pan M, Гриффит JM, Гейза HJ, Cresswell P (октябрь 1998). «Белок тетраспана CD82 является резидентом компартментов MHC класса II, где он ассоциируется с молекулами HLA-DR, -DM и -DO». Журнал иммунологии . 161 (7): 3282–91. PMID 9759843 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Мал Г (2012). Исследование клеточных функций тетраспанина CD63 . Германия: LAP LAMBERT Academic Publishing (LAP), GmbH & Co. ISBN 978-3-659-18758-2.
  • Хорейси В., Влчек С. (август 1991 г.). «Новое структурно отличное семейство гликопротеинов на поверхности лейкоцитов, включая CD9, CD37, CD53 и CD63» . Письма FEBS . 288 (1–2): 1–4. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (91) 80988-F . PMID  1879540 . S2CID  26316623 .
  • Бердичевский Ф (декабрь 2001 г.). «Комплексы тетраспанинов с интегринами: больше, чем кажется на первый взгляд». Журнал клеточной науки . 114 (Pt 23): 4143–51. PMID  11739647 .
  • Ван М.Х., Эрли Дж. Дж., Шилдс Дж. А., Доносо Л. А. (март 1992 г.). «Антиген, связанный с меланомой глаза. Молекулярная характеристика». Архив офтальмологии . 110 (3): 399–404. DOI : 10.1001 / archopht.1992.01080150097036 . PMID  1339263 .
  • Хотта Х., Миямото Х., Хара И., Такахаши Н., Хомма М. (май 1992 г.). «Геномная структура гена антигена ME491 / CD63 и функциональный анализ 5'-фланкирующих регуляторных последовательностей». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 185 (1): 436–42. DOI : 10.1016 / S0006-291X (05) 81004-6 . PMID  1599482 .
  • Метцелаар MJ, Wijngaard PL, Peters PJ, Sixma JJ, Nieuwenhuis HK, Clevers HC (февраль 1991 г.). «Антиген CD63. Новый гликопротеин лизосомальной мембраны, клонированный с помощью процедуры скрининга внутриклеточных антигенов в эукариотических клетках». Журнал биологической химии . 266 (5): 3239–45. PMID  1993697 .
  • Рапп Дж., Фройденштейн Дж., Клаудины Дж., Муха Дж., Вемпе Ф., Циммер М., Шайт К. Х. (сентябрь 1990 г.). «Характеристика трех обильных мРНК из клеток гранулезы яичников человека». ДНК и клеточная биология . 9 (7): 479–85. DOI : 10.1089 / dna.1990.9.479 . hdl : 11858 / 00-001M-0000-0013-0D4C-0 . PMID  2171551 .
  • Хотта Х., Такахаши Н., Хомма М. (декабрь 1989 г.). «Усиление транскрипции человеческого гена, кодирующего антиген, связанный с меланомой (ME491), в связи со злокачественной трансформацией» . Японский журнал исследований рака . 80 (12): 1186–91. DOI : 10.1111 / j.1349-7006.1989.tb01653.x . PMC  5917931 . PMID  2516848 .
  • Хотта Х., Росс А.Х., Хюбнер К., Изобе М., Вендеборн С., Чао М.В., Риккарди Р.П., Цудзимото Ю., Кроче С.М., Копровски Х. (июнь 1988 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика антигена, связанного с ранними стадиями прогрессирования опухоли меланомы». Исследования рака . 48 (11): 2955–62. PMID  3365686 .
  • Росс А.Х., Дицшольд Б., Джексон Д.М., Эрли Дж. Дж., Грист Б.Д., Аткинсон Б., Копровски Н. (ноябрь 1985 г.). «Выделение и аминоконцевое секвенирование нового антигена, связанного с меланомой». Архивы биохимии и биофизики . 242 (2): 540–8. DOI : 10.1016 / 0003-9861 (85) 90241-3 . PMID  4062294 .
  • Бердичевский Ф., Баццони Г., Хемлер М.Э. (июль 1995 г.). «Специфическая ассоциация CD63 с интегринами VLA-3 и VLA-6» . Журнал биологической химии . 270 (30): 17784–90. DOI : 10.1074 / jbc.270.30.17784 . PMID  7629079 .
  • Нисибори М., Чам Б., Макникол А., Шалев А., Джайн Н., Джеррард Дж. М. (апрель 1993 г.). «Белок CD63 находится в плотных гранулах тромбоцитов, дефицитен у пациента с синдромом Германского-Пудлака и идентичен гранулофизину» . Журнал клинических исследований . 91 (4): 1775–82. DOI : 10.1172 / JCI116388 . PMC  288158 . PMID  7682577 .
  • Рэдфорд К.Дж., Торн Р.Ф., Херси П. (май 1996 г.). «CD63 ассоциируется с 4 трансмембранными членами суперсемейства CD9 и CD81, а также с интегринами бета 1 в меланоме человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 222 (1): 13–8. DOI : 10.1006 / bbrc.1996.0690 . PMID  8630057 .
  • Гвинн Б., Эйхер Э.М., Питерс Л.Л. (июль 1996 г.). «Генетическая локализация Cd63, члена трансмембранного 4 суперсемейства, выявляет два различных локуса в геноме мыши». Геномика . 35 (2): 389–91. DOI : 10.1006 / geno.1996.0375 . PMID  8661157 .
  • Маннион Б.А., Бердичевски Ф., Крафт С.К., Чен Л.Б., Хемлер М.Э. (сентябрь 1996 г.). «Трансмембранные-4 белки суперсемейства CD81 (ТАРА-1), CD82, CD63 и CD53, специфически связанные с интегрином альфа 4 бета 1 (CD49d / CD29)». Журнал иммунологии . 157 (5): 2039–47. PMID  8757325 .
  • Скубиц К.М., Кэмпбелл К.Д., Иида Дж., Скубиц А.П. (октябрь 1996 г.). «CD63 связывается с активностью тирозинкиназы и CD11 / CD18 и передает сигнал активации в нейтрофилы». Журнал иммунологии . 157 (8): 3617–26. PMID  8871662 .
  • Бердичевский Ф., Толиас К.Ф., Вонг К., Карпентер С.Л., Хемлер М.Э. (январь 1997 г.). «Новая связь между интегринами, белками суперсемейства трансмембранных-4 (CD63 и CD81) и фосфатидилинозитол-4-киназой» . Журнал биологической химии . 272 (5): 2595–8. DOI : 10.1074 / jbc.272.5.2595 . PMID  9006891 .
  • Sincock PM, Mayrhofer G, Ashman LK (апрель 1997 г.). «Локализация трансмембранного 4 члена суперсемейства (TM4SF) PETA-3 (CD151) в нормальных тканях человека: сравнение с интегрином CD9, CD63 и альфа5бета1» . Журнал гистохимии и цитохимии . 45 (4): 515–25. DOI : 10.1177 / 002215549704500404 . PMID  9111230 .
  • Бердичевский Ф., Чанг С., Бодорова Дж., Хемлер М.Э. (ноябрь 1997 г.). «Создание моноклональных антител к интегрин-ассоциированным белкам. Доказательства того, что альфа3бета1 комплексы с EMMPRIN / basigin / OX47 / M6» . Журнал биологической химии . 272 (46): 29174–80. DOI : 10.1074 / jbc.272.46.29174 . PMID  9360995 .
  • Тачибана И., Бодорова Дж., Бердичевский Ф., Зуттер М.М., Хемлер М.Э. (ноябрь 1997 г.). «NAG-2, новый белок суперсемейства трансмембран-4 (TM4SF), который образует комплекс с интегринами и другими белками TM4SF» . Журнал биологической химии . 272 (46): 29181–9. DOI : 10.1074 / jbc.272.46.29181 . PMID  9360996 .

Внешние ссылки [ править ]

  • CD63 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • Расположение генома человека CD63 и страница сведений о гене CD63 в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .