CEBPA

Идентификаторы

CEBPA , C / EBP-альфа, CEBP, CCAAT / связывающий белок-энхансер альфа, CCAAT-энхансер-связывающий белок альфа

Внешние идентификаторы

OMIM: 116897 MGI: 99480 HomoloGene: 3211 Генные карты : CEBPA

Расположение гена (человек)

Chr.	Хромосома 19 (человека) ^[1]

Группа	19q13.11	Начинать	33 299 934 п.н. ^[1]
Группа	19q13.11	Конец	33 302 534 п.н. ^[1]

Расположение гена (Мышь)

Chr.	Хромосома 7 (мышь) ^[2]

Группа	7 B2 \| 7 21,02 см	Начинать	35 119 293 п.н. ^[2]
Группа	7 B2 \| 7 21,02 см	Конец	35 121 928 п.н. ^[2]

Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание ДНК • Связывание ДНК, специфичное для последовательности • Активность гомодимеризации белков • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфическая для РНК-полимеразы II • GO: 0001131, ГО: 0001151, ГО: 0001130, ГО: 0001204 ДНК-связывающий фактор активности транскрипции • ГО: 0001105 транскрипции коактиватор активности • транскрипционный фактор связывания • ГО: 0000980 РНК - полимеразы связывания II , цис-регуляторной области ДНК - последовательности конкретного • киназы связывания • GO: 0001948 связывание с белками • активность фактора транскрипции, связывание с дистальной энхансерной последовательностью РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II
Сотовый компонент	• Регулятор транскрипционного комплекс • РНК - полимераза II фактор транскрипция комплексы • ядрышко • ядро клетка • нуклеоплазма • внутриклеточная мембрану ограниченные органеллы
Биологический процесс	• Путь передачи сигналов Notch • транскрипция с промотора РНК-полимеразы I • дифференцировка миелоидных клеток • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • клеточный ответ на ион лития • гомеостаз глюкозы • негативная регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • развитие легких • цитокин • опосредованный сигнальный путь • цикл мочевины • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • клеточный ответ на органическое циклическое соединение • организация митохондрий • развитие эмбриональной плаценты • процесс метаболизма холестерина • негативная регуляция клеточного цикла • негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • созревание клеток • образование метаболитов и энергии-предшественников • транскрипция, ДНК-шаблон • дифференциация макрофагов • развитие многоклеточного организма • положительная регуляция транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция дифференцировки остеобластов • дифференцировка гранулоцитов • регуляция пролиферации клеток • дифференцировка коричневых жировых клеток • липидный гомеостаз • дифференцировка белых жировых клеток • развитие внутреннего уха • развитие печени • вирусный процесс GO: 0022415 • негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • позитивная регуляция дифференцировки жировых клеток • позитивная регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы III промотор • дифференцировка жировых клеток • позитивная регуляция протеасомного убиквитин-зависимого белкового катаболического процесса • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • негативная регуляция пролиферации клеток • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • клеточный ответ на фактор некроза опухоли • позитивная регуляция ДНК-темплатной транскрипции, инициация • позитивная регуляция активации макрофагов • позитивная регуляция воспалительного ответа • сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-6
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


1050


12606

Ансамбль


ENSG00000245848


ENSMUSG00000034957

UniProt


P49715


P53566

RefSeq (мРНК)


NM_004364 NM_001285829 NM_001287424 NM_001287435


NM_001287514 NM_001287515 NM_001287521 NM_001287523 NM_007678

RefSeq (белок)


NP_001272758 NP_001274353 NP_001274364 NP_004355


NP_001274443 NP_001274444 NP_001274450 NP_001274452 NP_031704

Расположение (UCSC)

Chr 19: 33,3 - 33,3 Мб

Chr 7: 35.12 - 35.12 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

CCAAT / энхансер-связывающий белок альфа представляет собой белок , кодируемый CEBPA гена в организме человека. ^[5]^[6] CCAAT / энхансер-связывающий белок альфа является фактором транскрипции, участвующим в дифференцировке определенных клеток крови . ^[7] Подробнее о структурном мотиве CCAAT в энхансерах генов и CCAAT / связывающих белках энхансеров см. На специальной странице .

Функция [ править ]

Белок, кодируемый этим безинтронным геном, представляет собой фактор транскрипции bZIP, который может связываться в качестве гомодимера с определенными промоторами и энхансерами генов . Он также может образовывать гетеродимеры с родственными белками CEBP-beta и CEBP-gamma, а также с отдельными факторами транскрипции, такими как c-Jun . Кодируемый белок является ключевым регулятором адипогенеза (процесса образования новых жировых клеток) и накопления липидов в этих клетках, а также метаболизма глюкозы и липидов в печени. ^[8] Было показано, что белок связывается с промотором и модулирует экспрессию гена, кодирующего лептин., белок, который играет важную роль в гомеостазе массы тела. Кроме того, кодируемый белок может взаимодействовать с CDK2 и CDK4 , тем самым подавляя эти киназы и заставляя культивируемые клетки прекращать деление. ^[9] Кроме того, CEBPA важен для приверженности миелоидному клону и, следовательно, необходим как для образования нормальных зрелых гранулоцитов, так и для развития аномального острого миелоидного лейкоза . ^[10]

Общие мутации [ править ]

Есть две основные категории, на которые можно разделить мутации CEBPA. Одна категория мутаций предотвращает связывание CCAAT / альфа-связывающего белка энхансера с ДНК путем изменения его COOH-концевого основного домена лейциновой молнии. Другая категория мутаций нарушает трансляцию альфа-NH ₂ -конца CCAAT / энхансер-связывающего белка . Мутации CEBPA, которые приводят к снижению альфа-активности CCAAT / энхансер-связывающего белка, вносят вклад в трансформацию миелоидных предшественников. ^[11]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что CEBPA взаимодействует с циклин-зависимой киназой 2 ^[12] и циклин-зависимой киназой 4 . ^[12]

Клиническое значение [ править ]

Было показано, что мутация CEBPA связана с хорошими результатами как у взрослых, так и у детей, больных острым миелоидным лейкозом . ^[13]

Значение при остром миелоидном лейкозе [ править ]

Острый миелоидный лейкоз характеризуется генетическими аномалиями в кроветворных предшественниках. Это включает в себя избыточную пролиферацию бластов и блокируя кроветворение из гранулоцитов . Было показано, что подавление экспрессии CEBPA и блокирование CCAAT / связывающего энхансер белка альфа останавливает дифференцировку миелоидных предшественников. По этой причине роль CCAAT / связывающего энхансера белка альфа во время дифференцировки гранулоцитов и роль CEBPA как гена- супрессора опухоли критически важны для прогноза острого миелоидного лейкоза. ^[14]

Прогностическое значение мутации CEBPA [ править ]

CCAAT / связывающий энхансер белок альфа, фактор транскрипции, который кодируется CEBPA, очень важен для дифференцировки незрелых гранулоцитов. Было показано, что мутация гена CEBPA играет решающую роль в лейкемогенезе и прогнозе у пациентов с острым миелоидным лейкозом. В недавних исследованиях мутации CEBPA были обнаружены у 7–15% пациентов с острым миелоидным лейкозом. Три различных типа мутаций, наблюдаемых у этих пациентов с ОМЛ, включают мутацию N-конца зародышевой линии, мутацию N-терминального сдвига рамки считывания., и С-концевую мутацию. Эти мутации наиболее часто встречаются при остром миелоидном лейкозе M1 или остром миелоидном лейкозе M2. Многие сообщения связывают мутации CEBPA с благоприятным исходом при остром миелоидном лейкозе. Это связано с тем, что эти мутации могут вызывать остановку дифференцировки у этих пациентов. Пациенты с мутациями CEBPA имеют более длительную ремиссию и время выживания, чем пациенты без мутаций. ^[11] Следовательно, наличие мутации CEBPA напрямую связано с более благоприятным течением для прогрессирования заболевания. ^[15]

Значение в солидных опухолях [ править ]

Недавно было показано, что эпигенетическая модификация дистальной области промотора CEBPA приводит к подавлению экспрессии CEBPA в клетках рака поджелудочной железы, раке легких и плоскоклеточной карциноме головы и шеи . ^[16]^[17]

Метилирование CEBPA как прогностический биомаркер у пациентов с ОМЛ [ править ]

Недавнее исследование показало, что более высокие уровни метилирования CEBPA прямо пропорциональны ответу на лечение. Частота полного ответа увеличивалась пропорционально уровню метилирования CEBPA. По этой причине было высказано предположение, что метилирование CEBPA может быть очень полезным биомаркером в прогнозе острого миелоидного лейкоза . ^[18]

См. Также [ править ]

Ccaat-энхансер-связывающие белки

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000245848 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034957 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Szpirer С, Riviere М, Кортезе Р, Т Накамура, ислам MQ, Леван G, J Szpirer (июль 1992). «Хромосомная локализация у человека и крысы генов, кодирующих обогащенные печенью факторы транскрипции C / EBP, DBP и HNF1 / LFB-1 (CEBP, DBP и фактор транскрипции 1, TCF1, соответственно) и фактор роста гепатоцитов / ген фактора рассеяния (HGF) ». Геномика . 13 (2): 293–300. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (92) 90245-N . PMID 1535333 .
↑ Cao Z, Umek RM, McKnight SL (октябрь 1991 г.). «Регулируемая экспрессия трех изоформ C / EBP во время преобразования жировой ткани клеток 3T3-L1» . Genes Dev . 5 (9): 1538–52. DOI : 10,1101 / gad.5.9.1538 . PMID 1840554 .
^ "CEBPA" . Домашний справочник по генетике . 20 апреля 2016 . Проверено 25 апреля 2016 года .
^ Олофссон LE, Orho-Меландер M, Уильям-Олссон L, Sjöholm K, L Sjöström, Groop L, Carlsson B, Carlsson LM, Олссон B (1 декабря 2009). «CCAAT / связывающий энхансер белок альфа (C / EBPalpha) в жировой ткани регулирует гены метаболизма липидов и глюкозы, а генетическая вариация C / EBPalpha связана с уровнями триглицеридов в сыворотке» . Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 93 (12): 4880–4886. DOI : 10.1210 / jc.2008-0574 . PMID 18765514 .
^ «Ген Entrez: CEBPA CCAAT / энхансер связывающий белок (C / EBP), альфа» .
^ Олссон E Шустера MB, Hasemann M, Porse BT (апрель 2016). «Многогранные функции C / EBPalpha при нормальном и злокачественном кроветворении». Лейкоз . 30 (4): 767–75. DOI : 10.1038 / leu.2015.324 . PMID 26601784 . S2CID 24767947 .
^ а б Лин Л.И., Чен С.Й., Лин Д.Т., Цай В., Тан Дж.Л., Йе Ю.К. и др. (2005). « « Характеристика мутаций CEBPA при остром миелоидном лейкозе »большинство пациентов с мутациями CEBPA имеют двуаллельные мутации и демонстрируют отчетливый иммунофенотип лейкозных клеток» . Clin Cancer Res . 11 (4): 1372–9. DOI : 10.1158 / 1078-0432.ccr-04-1816 . PMID 15746035 .
^ a b Wang H, Iakova P, Wilde M, Welm A, Goode T, Roesler WJ, Тимченко Н.А. (октябрь 2001 г.). «C / EBPalpha останавливает пролиферацию клеток за счет прямого ингибирования Cdk2 и Cdk4». Мол. Cell . 8 (4): 817–28. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (01) 00366-5 . PMID 11684017 .
^ Хо П.А., Алонзо Т.А., Gerbing РБ, Поллард Дж, Stirewalt Д.Л., гурвицева С, Heerema Н.А., Hirsch В, Раймонди СК, Ланге Б, Франклин ДЛ, Радич JP, Meshinchi S (июнь 2009 г.). «Распространенность и прогностические последствия мутации CEBPA при остром миелоидном лейкозе у детей (ОМЛ): отчет Детской онкологической группы» . Кровь . 113 (26): 6558–66. DOI : 10.1182 / кровь-2008-10-184747 . PMC 2943755 . PMID 19304957 .
^ Lin TC, Hou HA, Chou WC, Ou DL, Yu SL, Tien HF и др. (2011). «Метилирование CEBPA как прогностический биомаркер у пациентов с острым миелоидным лейкозом de novo » . Лейкоз . 25 (1): 32–40. DOI : 10.1038 / leu.2010.222 . PMID 20927134 .
^ Эль-Шарнуби Дж. А., Ахмед Л. М., Таха А. М., Камаль О. Прогностическое значение мутаций CEBPA и экспрессии BAALC у египетских пациентов с острым миелоидным лейкозом с нормальным кариотипом. Egypt J Immunol. 2010. 15: 131–143.
^ Тада Y, Brena RM, Hackanson B, C Morrison, Otterson Г.А., Plass C (2006). «Эпигенетическая модуляция альфа-активности опухолевого супрессора CCAAT / энхансера связывающего белка при раке легких» . J Natl Cancer Inst . 98 (6): 396–406. DOI : 10,1093 / JNCI / djj093 . PMID 16537832 .
^ Беннетт KL, Hackanson B, Smith LT, Morrison CD, Lang JC, Schuller DE, et al. (2007). «Опухолевая супрессорная активность CCAAT / связывающего энхансера белка альфа эпигенетически подавляется при плоскоклеточной карциноме головы и шеи» . Cancer Res . 67 (10): 4657–4664. DOI : 10,1158 / 0008-5472.can-06-4793 . PMID 17510391 .
^ Lin TC, Hou HA, Chou WC, Ou DL, Yu SL, Tien HF и др. (2011). «Метилирование CEBPA как прогностический биомаркер у пациентов с острым миелоидным лейкозом de novo» . Лейкоз . 25 : 32–40. DOI : 10.1038 / leu.2010.222 . PMID 20927134 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Sladek FM, Дарнелл Дж. Э. (1992). «Механизмы экспрессии генов, специфичных для печени». Curr. Мнение. Genet. Dev . 2 (2): 256–9. DOI : 10.1016 / S0959-437X (05) 80282-5 . PMID 1638120 .
Маркучи Дж., Мрозек К., Bloomfield CD (2005). «Молекулярная гетерогенность и прогностические биомаркеры у взрослых с острым миелоидным лейкозом и нормальной цитогенетикой». Curr. Мнение. Гематол . 12 (1): 68–75. DOI : 10.1097 / 01.moh.0000149608.29685.d1 . PMID 15604894 . S2CID 6183391 .
Леруа Х., Румье С., Хюйге П., Биггио В., Фено П., Преудомма С. (март 2005 г.). «Точечные мутации CEBPA при гематологических злокачественных новообразованиях» . Лейкоз . 19 (3): 329–34. DOI : 10.1038 / sj.leu.2403614 . PMID 15674366 .

Внешние ссылки [ править ]

Расположение генома человека CEBPA и страница сведений о гене CEBPA в браузере генома UCSC .
GeneReviews / NIH / NCBI / UW запись о семейном остром миелоидном лейкозе (AML) с мутированным CEBPA
CEBPA + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , находящийся в открытом доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000245848 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034957 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1535333-5] Szpirer С, Riviere М, Кортезе Р, Т Накамура, ислам MQ, Леван G, J Szpirer (июль 1992). «Хромосомная локализация у человека и крысы генов, кодирующих обогащенные печенью факторы транскрипции C / EBP, DBP и HNF1 / LFB-1 (CEBP, DBP и фактор транскрипции 1, TCF1, соответственно) и фактор роста гепатоцитов / ген фактора рассеяния (HGF) ». Геномика . 13 (2): 293–300. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (92) 90245-N . PMID 1535333 .

[pmid1840554-6] Cao Z, Umek RM, McKnight SL (октябрь 1991 г.). «Регулируемая экспрессия трех изоформ C / EBP во время преобразования жировой ткани клеток 3T3-L1» . Genes Dev . 5 (9): 1538–52. DOI : 10,1101 / gad.5.9.1538 . PMID 1840554 .

[7] "CEBPA" . Домашний справочник по генетике . 20 апреля 2016 . Проверено 25 апреля 2016 года .

[Olofsson2008-8] Олофссон LE, Orho-Меландер M, Уильям-Олссон L, Sjöholm K, L Sjöström, Groop L, Carlsson B, Carlsson LM, Олссон B (1 декабря 2009). «CCAAT / связывающий энхансер белок альфа (C / EBPalpha) в жировой ткани регулирует гены метаболизма липидов и глюкозы, а генетическая вариация C / EBPalpha связана с уровнями триглицеридов в сыворотке» . Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 93 (12): 4880–4886. DOI : 10.1210 / jc.2008-0574 . PMID 18765514 .

[9] «Ген Entrez: CEBPA CCAAT / энхансер связывающий белок (C / EBP), альфа» .

[10] Олссон E Шустера MB, Hasemann M, Porse BT (апрель 2016). «Многогранные функции C / EBPalpha при нормальном и злокачественном кроветворении». Лейкоз . 30 (4): 767–75. DOI : 10.1038 / leu.2015.324 . PMID 26601784 . S2CID 24767947 .

[:0-11] а б Лин Л.И., Чен С.Й., Лин Д.Т., Цай В., Тан Дж.Л., Йе Ю.К. и др. (2005). « « Характеристика мутаций CEBPA при остром миелоидном лейкозе »большинство пациентов с мутациями CEBPA имеют двуаллельные мутации и демонстрируют отчетливый иммунофенотип лейкозных клеток» . Clin Cancer Res . 11 (4): 1372–9. DOI : 10.1158 / 1078-0432.ccr-04-1816 . PMID 15746035 .

[pmid11684017-12] Wang H, Iakova P, Wilde M, Welm A, Goode T, Roesler WJ, Тимченко Н.А. (октябрь 2001 г.). «C / EBPalpha останавливает пролиферацию клеток за счет прямого ингибирования Cdk2 и Cdk4». Мол. Cell . 8 (4): 817–28. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (01) 00366-5 . PMID 11684017 .

[pmid19304957-13] Хо П.А., Алонзо Т.А., Gerbing РБ, Поллард Дж, Stirewalt Д.Л., гурвицева С, Heerema Н.А., Hirsch В, Раймонди СК, Ланге Б, Франклин ДЛ, Радич JP, Meshinchi S (июнь 2009 г.). «Распространенность и прогностические последствия мутации CEBPA при остром миелоидном лейкозе у детей (ОМЛ): отчет Детской онкологической группы» . Кровь . 113 (26): 6558–66. DOI : 10.1182 / кровь-2008-10-184747 . PMC 2943755 . PMID 19304957 .

[14] Lin TC, Hou HA, Chou WC, Ou DL, Yu SL, Tien HF и др. (2011). «Метилирование CEBPA как прогностический биомаркер у пациентов с острым миелоидным лейкозом de novo » . Лейкоз . 25 (1): 32–40. DOI : 10.1038 / leu.2010.222 . PMID 20927134 .

[15] Эль-Шарнуби Дж. А., Ахмед Л. М., Таха А. М., Камаль О. Прогностическое значение мутаций CEBPA и экспрессии BAALC у египетских пациентов с острым миелоидным лейкозом с нормальным кариотипом. Egypt J Immunol. 2010. 15: 131–143.

[16] Тада Y, Brena RM, Hackanson B, C Morrison, Otterson Г.А., Plass C (2006). «Эпигенетическая модуляция альфа-активности опухолевого супрессора CCAAT / энхансера связывающего белка при раке легких» . J Natl Cancer Inst . 98 (6): 396–406. DOI : 10,1093 / JNCI / djj093 . PMID 16537832 .

[17] Беннетт KL, Hackanson B, Smith LT, Morrison CD, Lang JC, Schuller DE, et al. (2007). «Опухолевая супрессорная активность CCAAT / связывающего энхансера белка альфа эпигенетически подавляется при плоскоклеточной карциноме головы и шеи» . Cancer Res . 67 (10): 4657–4664. DOI : 10,1158 / 0008-5472.can-06-4793 . PMID 17510391 .

[18] Lin TC, Hou HA, Chou WC, Ou DL, Yu SL, Tien HF и др. (2011). «Метилирование CEBPA как прогностический биомаркер у пациентов с острым миелоидным лейкозом de novo» . Лейкоз . 25 : 32–40. DOI : 10.1038 / leu.2010.222 . PMID 20927134 .

[1]