Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
"CRP2" перенаправляется сюда. Для аэропорта см. Рестон / РМ аэропорта Пипстоун .
CEBPB
1gtw.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1GTW , 1GU4 , 1GU5 , 1H88 , 1H89 , 1H8A , 1HJB , 1IO4 , 2E42 , 2E43

Идентификаторы
ПсевдонимыCEBPB , C / EBP-beta, IL6DBP, NF-IL6, TCF5, CCAAT / связывающий белок энхансер бета, CCAAT энхансер связывающий протеин бета
Внешние идентификаторыOMIM : 189965 MGI : 88373 HomoloGene : 3807 GeneCards : CEBPB
Расположение гена ( человек )
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человека) [1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное расположение CEBPB
Геномное расположение CEBPB
Группа20q13.13Начинать50 190 830 п.н. [1]
Конец50 192 668 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 2 (мышь)
Chr.Хромосома 2 (мышь) [2]
Хромосома 2 (мышь)
Геномное расположение CEBPB
Геномное расположение CEBPB
Группа2 H3 | 2 87,58 смНачинать167 688 915 п.н. [2]
Конец167 690 418 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание ДНК
• последовательность-специфическая ДНК связывания
• связывания ДНК последовательности специфического РНК - полимераза регуляторной области II
• гомодимеризации активности белка
• GO: 0001131, ГО: 0001151, ГО: 0001130, ГО: 0001204 ДНК-связывающей активность фактора транскрипции
• ГО: 0001077 , GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично
для РНК-полимеразы II • связывание фактора транскрипции
• связывание гистондеацетилазы
• связывание хроматина
• цис-регуляторная область GO: 0000980 РНК-полимеразы II Связывание с последовательностью ДНК
• Связывание киназой
• ГО: 0001948 связывание белка
• гистонацетилтрансфераза связывания
• убиквитин-подобный белок лигазы связывания
• гетеродимеризация активность белка
• фактор транскрипции , активность РНК - полимеразы II дистальный энхансер последовательность-специфического связывания
• РНК - полимеразы основной промотор ДНК последовательности специфических II связывания
• ГО: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, РНК-полимераза II-специфическая
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК-связывающая активность фактора транскрипции, РНК-полимераза II-специфическая
• Связывание с рецептором глюкокортикоидов
Сотовый компонент• цитоплазма
• ядерный матрикс
• комплекс CHOP-C / EBP
• нуклеоплазма
• ядерный хроматин
• ядро клетки
• конденсированная хромосома, центромерная область
• комплекс факторов транскрипции РНК-полимеразы II
Биологический процесс• негативная регуляция апоптотического процесса нейронов
• пролиферация эпителиальных клеток молочной железы
• дифференцировка клеток
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на стресс эндоплазматического ретикулума
• клеточный ответ на органическое циклическое соединение
• эмбриональная плацента развитие
• память
• положительная регуляция продукции интерлейкина-4
• реакция на стресс эндоплазматического ретикулума
• дифференцировка эпителиальных клеток молочной железы
• транскрипция, ДНК-шаблон
• положительная регуляция транскрипции, на основе ДНК
• негативная регуляция пролиферации Т-клеток
• регуляция транскрипции, участвующая в обязательстве клеточной судьбы
• регенерация печени
• позитивная регуляция дифференцировки остеобластов
• пролиферация гепатоцитов
• ответ на липополисахарид
• регуляция дифференцировки остеокластов
• защитный ответ на бактерии
• острофазовый ответ
• иммунный ответ
• дифференцировка нейронов
• клеточный ответ на интерлейкин-1
• дифференцировка коричневых жировых клеток
• клеточный ответ на аминокислоты стимул
• развитие яичников фолликула
• развития печени
• воспалительного ответа
• негативной регуляции транскрипции ДНК-шаблонных
• положительное регулирование жировой дифференциации клеток
• клеточный ответ на липополисахарид
• жира дифференцировки клеток
• положительное регулирование транскрипции с РНК - полимеразы II промотор
• внутренний апоптотический сигнальный путь в ответ на стресс эндоплазматического ретикулума
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы II
• образование гранулемы
• активация Т-хелперов 1 клетки
• отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• регуляция дифференцировки одонтобластов
• позитивная регуляция развития биоминеральной ткани
• позитивная регуляция натрийзависимого транспорта фосфата
• позитивная регуляция воспалительного ответа
• позитивная регуляция термогенеза, вызванного холодом
• регуляция дифференцировки дендритных клеток
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1051

12608

Ансамбль

ENSG00000172216

ENSMUSG00000056501

UniProt

P17676

P28033

RefSeq (мРНК)

NM_005194
NM_001285878
NM_001285879

NM_001287738
NM_001287739
NM_009883

RefSeq (белок)

NP_001272807
NP_001272808
NP_005185

NP_001274667
NP_001274668
NP_034013

Расположение (UCSC)Chr 20: 50.19 - 50.19 МбChr 2: 167.69 - 167.69 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

CCAAT / энхансер-связывающий белок бета представляет собой белок , который у человека кодируется CEBPB гена . [5] [6]

Функция [ править ]

Белок, кодируемый этим безинтронным геном, представляет собой фактор транскрипции bZIP, который может связываться в виде гомодимера с определенными регуляторными участками ДНК. Он также может образовывать гетеродимеры с родственными белками CEBP-alpha , CEBP-delta и CEBP-gamma . Кодируемый белок играет важную роль в регуляции генов, участвующих в иммунных и воспалительных ответах, и было показано, что он связывается с элементом ответа на IL-1 в гене IL-6 , а также с регуляторными областями нескольких генов острой фазы и цитокинов. . Кроме того, кодируемый белок может связываться с промотором и вышестоящим элементом и стимулировать экспрессию гена коллагена I типа .[7]

CEBP-бета является критической для нормальных макрофагов функционирования, важный иммунной клетка подтипа ; у мышей, неспособных экспрессировать CEBP-бета, есть макрофаги, которые не могут дифференцироваться (специализироваться) и, следовательно, не могут выполнять все свои биологические функции, включая опосредованное макрофагами восстановление мышц. [8] Наблюдательное работа показала , что выражение из CEBP-бета в крови лейкоцитов положительно связан с мышечной силы в организме человека , [9] подчеркивает важность системы иммунитета, и особенно макрофаги, в поддержании мышечной функции.

Функцию гена CEBPB можно эффективно исследовать путем нокдауна siRNA на основе независимой проверки. [10]

Целевые гены [ править ]

CEBPB способен увеличивать экспрессию нескольких генов-мишеней. Среди них некоторые играют специфическую роль в нервной системе, например, ген препротахикинина-1 , дающий начало веществу P и нейрокинину A [11], а также холинацетилтрансферазе, ответственной за биосинтез важного нейромедиатора ацетилхолина . [12] Другие мишени включают гены, кодирующие цитокины, такие как IL-6 , [13] IL-4 , [14] IL-5 , [15] и TNF-альфа . [16]Было обнаружено, что гены, кодирующие белки-переносчики, которые придают клеткам множественную лекарственную устойчивость, также активируются CEBPB. К таким генам относятся ABCC2 [17] и ABCB1 . [18]

Взаимодействия [ править ]

CEBPB взаимодействует с:

  • CREB1 , [19]
  • CRSP3 [20]
  • Транскрипт 3 , индуцируемый повреждением ДНК , [21] [22]
  • EP300 , [23]
  • Рецептор эстрогена альфа , [24] [25]
  • Глюкокортикоидный рецептор , [24]
  • HMGA1 , [26]
  • HSF1 , [27]
  • Ядрышковый фосфопротеин p130 , [28]
  • РЕЛА , [29] [30]
  • Фактор сывороточного ответа , [31] [32]
  • SMARCA2 , [33]
  • Фактор транскрипции Sp1 , [26] [34]
  • TRIM28 , [35] [36] и
  • Zif268 . [37]

См. Также [ править ]

  • Ccaat-энхансер-связывающие белки

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000172216 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000056501 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Szpirer С, Riviere М, Кортезе Р, Т Накамура, ислам MQ, Леван G, J Szpirer (июль 1992). «Хромосомная локализация у человека и крысы генов, кодирующих обогащенные печенью факторы транскрипции C / EBP, DBP и HNF1 / LFB-1 (CEBP, DBP и фактор транскрипции 1, TCF1, соответственно) и фактор роста гепатоцитов / ген фактора рассеяния (HGF) ». Геномика . 13 (2): 293–300. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (92) 90245-N . PMID 1535333 . 
  6. ↑ Cao Z, Umek RM, McKnight SL (октябрь 1991 г.). «Регулируемая экспрессия трех изоформ C / EBP во время преобразования жировой ткани клеток 3T3-L1» . Genes Dev . 5 (9): 1538–52. DOI : 10,1101 / gad.5.9.1538 . PMID 1840554 . 
  7. ^ "Энтрез Ген: CEBPB CCAAT / энхансер связывающий белок (C / EBP), бета" .
  8. ^ Ruffell Д, Mourkioti Ж, Gambardella А, Kirstetter Р, Лопес Р. Г. , Розенталь Н, Nerlov С (2009). «Каскад CREB-C / EBPbeta индуцирует экспрессию гена, специфичного для макрофагов M2, и способствует восстановлению мышечных повреждений» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 106 (41): 17475–80. Bibcode : 2009PNAS..10617475R . DOI : 10.1073 / pnas.0908641106 . PMC 2762675 . PMID 19805133 .  
  9. ^ Харриес LW, Пиллинга LC, Hernandez Л.Д., Брэдли-Смит R, Хенли Вт, Singleton AB, Гуральник JM, Бандинелли S, Ферруччи л, Мелзер D (2012). «Экспрессия CCAAT-энхансер-связывающего белка-бета in vivo связана с мышечной силой» . Ячейка старения . 11 (2): 262–8. DOI : 10.1111 / j.1474-9726.2011.00782.x . PMC 3486692 . PMID 22152057 .  
  10. ^ Мункачи, Дьёнджи; Штупински, Жофия; Герман, Петер; Бан, Бенце; Пензвальто, Жофия; Сарвас, Нора; Дьёрфи, Балаж (01.01.2016). «Подтверждение эффективности подавления РНКи с использованием данных массива генов показывает 18,5% отказов в 429 независимых экспериментах» . Молекулярная терапия - нуклеиновые кислоты . 5 (9): e366. DOI : 10.1038 / mtna.2016.66 . ISSN 2162-2531 . PMC 5056990 . PMID 27673562 .   
  11. Перейти ↑ Kovács KA, Steinmann M, Magistretti PJ, Halfon O, Cardinaux JR (сентябрь 2006 г.). «C / EBPbeta связывает передачу сигналов дофамина с экспрессией гена-предшественника вещества P в нейронах полосатого тела». J. Neurochem . 98 (5): 1390–9. DOI : 10.1111 / j.1471-4159.2006.03957.x . PMID 16771829 . S2CID 36225447 .  
  12. ^ Роберт I, Саттер A, Квирин-Стрикер C (октябрь 2002 г.). «Синергетическая активация гена холинацетилтрансферазы человека c-Myb и C / EBPbeta». Brain Res. Мол. Brain Res . 106 (1–2): 124–35. DOI : 10.1016 / S0169-328X (02) 00419-9 . PMID 12393272 . 
  13. ^ Natsuka S, S Akira, Нисио Y, S Хашимото, Сугита Т, Isshiki Н, Kishimoto Т (январь 1992). «Специфическая для дифференцировки макрофагов экспрессия NF-IL6, фактора транскрипции интерлейкина-6» . Кровь . 79 (2): 460–6. DOI : 10.1182 / blood.V79.2.460.460 . PMID 1730090 . 
  14. ↑ Давыдов И.В., Краммер PH, Ли-Вебер М. (декабрь 1995 г.). «Ядерный фактор-IL6 активирует промотор человеческого IL-4 в Т-клетках». J. Immunol . 155 (11): 5273–9. PMID 7594540 . 
  15. ^ Ван Дейк TB, Baltus B, Raaijmakers JA, Lammers JW, Koenderman L, де Гроот RP (сентябрь 1999). «Составной сайт связывания C / EBP необходим для активности промотора гена рецептора бета-c фактора стимуляции колоний IL-3 / IL-5 / гранулоцитов-макрофагов». J. Immunol . 163 (5): 2674–80. PMID 10453008 . 
  16. ^ Greenwel Р, S Танаки, Пенков D, Чжан Вт, оливковый М, Моль J, Винсон С, Ди Liberto МЫ, Рамирес F (февраль 2000 г.). "Фактор некроза опухоли альфа ингибирует синтез коллагена типа I посредством репрессивных белков, связывающих CCAAT / энхансер" . Мол. Клетка. Биол . 20 (3): 912–8. DOI : 10.1128 / MCB.20.3.912-918.2000 . PMC 85208 . PMID 10629048 .  
  17. ^ Танака Т, Учиуми Т, Хиношита Э, Инокучи А, Тох С, Вада М, Такано Х, Коно К., Кувано М (декабрь 1999 г.). «Ген 2-го белка множественной лекарственной устойчивости человека: функциональная характеристика 5'-фланкирующей области и экспрессия в клетках печени». Гепатология . 30 (6): 1507–12. DOI : 10.1002 / hep.510300617 . PMID 10573531 . S2CID 22514353 .  
  18. ^ Chen GK, Продажа S, T Tan, Ermoian RP, Sikic BI (апрель 2004). «CCAAT / связывающий энхансер белок бета (ядерный фактор для интерлейкина 6) трансактивирует человеческий ген MDR1 посредством взаимодействия с перевернутым CCAAT-боксом в раковых клетках человека». Мол. Pharmacol . 65 (4): 906–16. DOI : 10,1124 / mol.65.4.906 . PMID 15044620 . 
  19. ^ Chen Y, Чжуан S, Cassenaer S, Casteel DE, Гуди T, Boss GR, Pilz RB (2003). «Синергизм между кальцием и циклическим GMP в регуляции транскрипции, зависимой от элемента ответа на циклический AMP, требует сотрудничества между CREB и C / EBP-beta» . Мол. Клетка. Биол . 23 (12): 4066–82. DOI : 10.1128 / mcb.23.12.4066-4082.2003 . PMC 156132 . PMID 12773552 .  
  20. ^ Мо Х, Kowenz-Leutz Е, Сюй Н, Leutz А (январь 2004 г.). «Ras индуцирует обмен медиаторного комплекса на C / EBP beta». Мол. Cell . 13 (2): 241–50. DOI : 10.1016 / s1097-2765 (03) 00521-5 . PMID 14759369 . 
  21. ^ Хаттори Т, Ohoka Н, Hayashi Н, Онодзаки К (апрель 2003 г.). «Гомологичный белок C / EBP (CHOP) усиливает транскрипцию IL-6, улавливая отрицательную регулирующую изоформу NF-IL6» . FEBS Lett . 541 (1–3): 33–9. DOI : 10.1016 / s0014-5793 (03) 00283-7 . PMID 12706815 . S2CID 43792576 .  
  22. ↑ Fawcett TW, Eastman HB, Martindale JL, Holbrook NJ (июнь 1996 г.). «Физическая и функциональная связь между GADD153 и CCAAT / энхансер-связывающим белком бета во время клеточного стресса» . J. Biol. Chem . 271 (24): 14285–9. DOI : 10.1074 / jbc.271.24.14285 . PMID 8662954 . 
  23. ^ Mink S, Haenig B, Klempnauer KH (ноябрь 1997 г.). «Взаимодействие и функциональное сотрудничество p300 и C / EBPbeta» . Мол. Клетка. Биол . 17 (11): 6609–17. DOI : 10.1128 / mcb.17.11.6609 . PMC 232514 . PMID 9343424 .  
  24. ^ a b Boruk M, Savory JG, Haché RJ (ноябрь 1998 г.). «AF-2-зависимое усиление бета-опосредованной активации транскрипции связывающего энхансер CCAAT белка с помощью глюкокортикоидного рецептора» . Мол. Эндокринол . 12 (11): 1749–63. DOI : 10.1210 / mend.12.11.0191 . PMID 9817600 . 
  25. Перейти ↑ Stein B, Yang MX (сентябрь 1995 г.). «Репрессия промотора интерлейкина-6 рецептором эстрогена опосредуется NF-каппа B и C / EBP бета» . Мол. Клетка. Биол . 15 (9): 4971–9. DOI : 10.1128 / mcb.15.9.4971 . PMC 230744 . PMID 7651415 .  
  26. ^ а б Фоти Д., Юлиано Р., Чифари Э., Брунетти А. (2003). «Нуклеопротеидный комплекс, содержащий Sp1, C / EBP бета и HMGI-Y, контролирует транскрипцию гена рецептора человеческого инсулина» . Мол. Клетка. Биол . 23 (8): 2720–32. DOI : 10.1128 / mcb.23.8.2720-2732.2003 . PMC 152545 . PMID 12665574 .  
  27. ↑ Xie Y, Chen C, Stevenson MA, Auron PE, Calderwood SK (апрель 2002 г.). «Фактор теплового шока 1 подавляет транскрипцию гена IL-1beta посредством физического взаимодействия с ядерным фактором интерлейкина 6» . J. Biol. Chem . 277 (14): 11802–10. DOI : 10.1074 / jbc.M109296200 . PMID 11801594 . 
  28. ^ Miau LH, Chang CJ, Shen BJ, Tsai WH, Ли SC (апрель 1998). «Идентификация гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина К (hnRNP K) как репрессора активации гена, опосредованного C / EBPbeta» . J. Biol. Chem . 273 (17): 10784–91. DOI : 10.1074 / jbc.273.17.10784 . PMID 9553145 . 
  29. ^ Вебер М, Sydlik С, Quirling М, Nothdurfter С, Zwergal А, Хейсс Р, S Белл, Ноймайер D, Циглера-Heitbrock HW, Марка К (июнь 2003 г.). «Транскрипционное ингибирование экспрессии интерлейкина-8 в клетках, толерантных к фактору некроза опухоли: доказательства участия C / EBP бета» . J. Biol. Chem . 278 (26): 23586–93. DOI : 10.1074 / jbc.M211646200 . PMID 12707271 . 
  30. ↑ Xia C, Cheshire JK, Patel H, Woo P (декабрь 1997 г.). «Перекрестное взаимодействие между факторами транскрипции NF-каппа B и C / EBP в регуляции транскрипции генов». Int. J. Biochem. Cell Biol . 29 (12): 1525–39. DOI : 10.1016 / s1357-2725 (97) 00083-6 . PMID 9570146 . 
  31. Перейти ↑ Hanlon M, Sealy L (май 1999). «Ras регулирует ассоциацию сывороточного фактора ответа и CCAAT / связывающий энхансер белок бета» . J. Biol. Chem . 274 (20): 14224–8. DOI : 10.1074 / jbc.274.20.14224 . PMID 10318842 . 
  32. Перейти ↑ Sealy L, Malone D, Pawlak M (март 1997 г.). «Регулирование элемента ответа сыворотки cfos с помощью C / EBPbeta» . Мол. Клетка. Биол . 17 (3): 1744–55. DOI : 10.1128 / mcb.17.3.1744 . PMC 231899 . PMID 9032301 .  
  33. ^ Kowenz-Leutz E, Leutz A (ноябрь 1999). «Бета-изоформа AC / EBP рекрутирует комплекс SWI / SNF для активации миелоидных генов». Мол. Cell . 4 (5): 735–43. DOI : 10.1016 / s1097-2765 (00) 80384-6 . PMID 10619021 . 
  34. ^ Лю YW, Цзэн HP, Chen LC, Chen BK, Chang WC (июль 2003). «Функциональное взаимодействие фактора 1 промотора вируса обезьяны 40 и CCAAT / связывающего энхансер белка бета и дельта в индуцированной липополисахаридом активации гена IL-10 в макрофагах мыши» . J. Immunol . 171 (2): 821–8. DOI : 10.4049 / jimmunol.171.2.821 . PMID 12847250 . 
  35. ^ Rooney JW, Calame KL (2001). «TIF1beta действует как коактиватор для C / EBPbeta и необходим для индуцированной дифференцировки в линии миеломоноцитарных клеток U937» . Genes Dev . 15 (22): 3023–38. DOI : 10,1101 / gad.937201 . PMC 312827 . PMID 11711437 .  
  36. ↑ Chang CJ, Chen YL, Lee SC (октябрь 1998 г.). «Коактиватор TIF1beta взаимодействует с фактором транскрипции C / EBPbeta и рецептором глюкокортикоидов, вызывая экспрессию гена альфа-1-кислого гликопротеина» . Мол. Клетка. Биол . 18 (10): 5880–7. DOI : 10.1128 / mcb.18.10.5880 . PMC 109174 . PMID 9742105 .  
  37. Перейти ↑ Zhang F, Lin M, Abidi P, Thiel G, Liu J (ноябрь 2003 г.). «Специфическое взаимодействие Egr1 и c / EBPbeta приводит к транскрипционной активации гена рецептора липопротеинов низкой плотности человека» . J. Biol. Chem . 278 (45): 44246–54. DOI : 10.1074 / jbc.M305564200 . PMID 12947119 . 

Внешние ссылки [ править ]

  • Человек CEBPB место генома и CEBPB ген подробно страницу в браузере УСК генома .
  • CEBPB + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • FactorBook CEBPB

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , находящийся в открытом доступе .